Bilan du programme STOC-EPS en région PACA : tendances, statuts des espèces et les indicateurs de biodiversité pour la période

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1 CEEP Conservatoire - Etudes des Ecosystèmes de Provence - Alpes du Sud Association agréée de protection de la nature dans un cadre régional Bilan du programme STOC-EPS en région PACA : tendances, statuts des espèces et les indicateurs de biodiversité pour la période Année 2008 Nicolas VINCENT-MARTIN Conservatoire - Etudes des Ecosystèmes de Provence / Alpes du sud Ecomusée de la Crau Boulevard de Provence Saint Martin de Crau

2 SOMMAIRE 1. Introduction Participation Méthode d analyse des données Variation d abondance Tendance Carte d abondance relative Résultats Variation et tendance depuis Carte d abondance relative, quelques exemples Les indicateurs de biodiversité Autres analyses des différents cortèges d espèces D après le statut réglementaire D après le statut migratoire D après le régime alimentaire Conclusion et perspectives Remerciements Bibliographie Comment participer Plus d infos et plus de résultats Illustration 1 ère page : photo du haut Marc Thibault, photo du bas Frank Dhermain. CEEP - 1 -

3 1. Introduction Le programme de Suivi Temporel des Oiseaux Communs (STOC) permet d'estimer les variations d'effectifs d'une année à l'autre mais aussi d'estimer les tendances d'évolution des espèces sur le long terme. Chaque année des centaines d'observateurs assurent le suivi de points d'écoute et de station de baguage dans le cadre de ce programme, dont la coordination est assurée par le Centre de Recherches par le Baguage des Populations d'oiseaux (CRBPO), au sein du Muséum National d'histoire Naturelle. Le STOC rentre dans le cadre du programme Vigie nature qui à pour objectif de surveiller l évolution de la biodiversité. Le programme STOC se décompose en deux volets. Le premier est basé sur le baguage des oiseaux sur un site donné pendant plusieurs années de suite (STOC-capture). Le baguage permet d'individualiser les oiseaux et d'obtenir des indices sur le succès de reproduction de chaque espèce, d'estimer la survie des oiseaux et le recrutement au sein d'une station. Le second volet du programme STOC est basé sur des points d'écoute ou échantillonnage ponctuel simple (STOC-EPS). Il permet d'obtenir une évaluation des tendances d'évolution des effectifs pour 175 espèces communes nicheuses en France. Si le programme STOC-capture permet d'obtenir des informations sur la structure des populations d'oiseaux, le STOC-EPS permet d'effectuer des échantillonnages sur un plus grand nombre d'espèces et de sites. Ce dernier est ouvert au plus grand nombre d'observateurs grâce à un protocole simple. Le CEEP a en charge la coordination du programme STOC-EPS pour la région PACA et vous propose ici les résultats régionaux. 2. Participation Depuis 2001, au total, 113 sites ont été suivis avec le protocole STOC sur les 6 départements de la région (Figure 1). Le nombre moyen de carrés réalisés en PACA est de 44 avec un minimum de 13 carrés pour 2001 et un maximum de 57 pour 2007 (Figure 2). En 2008, nous enregistrons une baisse du nombre de carrés réalisés avec 49 carrés réalisés. A cela nous pouvons ajouter les sites suivis avec le même protocole mais adapté à des espaces particuliers (STOC-Site). Ils sont au nombre de 18, dont 14 ont été réalisés cette année (Réserves Naturelles, Parcs Naturels Régionaux et certains sites du CEEP). La légère baisse du nombre de carrés suivis cette année est en partie due aux conditions météorologiques de ce printemps particulièrement pluvieux. CEEP - 2 -

4 Figure 1 : Distribution des 96 carrés EPS (en bleu) et 18 STOC-site (en rouge) réalisés au moins une fois de 2001 à Figure 2 : Evolution du nombre de carrés suivis en PACA depuis Méthode d analyse des données 3.1. Variation d abondance Les variations d abondances sont calculées en utilisant les carrés réalisés avec la même pression d observation les deux années consécutives, soit 59 carrés (EPS et Site). Pour chaque carré, nous prenons en compte le nombre maximal d individus contactés par point lors de l un ou l autre des passages. Puis c est la somme des individus par carré qui est utilisée. Le choix des espèces est déterminé arbitrairement par un nombre moyen minimum de 25 individus recensés annuellement et sur au moins cinq carrés par an. CEEP - 3 -

5 3.2. Tendance Tous les carrés réalisés au moins deux années avec la même pression d observation sont utilisés pour le calcul des tendances. Nous avons pris en compte indifféremment les STOC- EPS et les STOC-Site, ainsi nous utilisons 85 sites échantillons pour ces analyses. Comme pour les variations d abondance (cf. 3.1), nous prenons en compte le nombre maximal d individus contactés par point lors de l un ou l autre des passages. Puis c est la somme des individus par carré qui est utilisée. Le choix des espèces est déterminé arbitrairement par un nombre moyen minimum de 25 individus recensés annuellement et sur au moins cinq carrés par an. Au final, il nous est possible d estimer les tendances de 76 espèces pour la région PACA. Pour certaines d entres-elles les tendances sont calculées à partir de 2002 au lieu de Les raisons sont, soit qu elles n étaient pas échantillonnées par absence de carré dans leur aire de distribution au début du suivi, soit que le nombre d individus ou de carrés avec présence de l espèce n étaient pas assez important en Les analyses de tendance ont été réalisées avec le logiciel TRIM 3.53 (Pannekoek & van Strine 2001) Carte d abondance relative La couverture relativement homogène de la région PACA par des carrés STOC-EPS permet d interpoler l abondance des espèces communes à tout le territoire de la région. La mesure de l abondance des espèces est très simple car il s agit de la somme du nombre d individus par carré, comme précédemment (cf. 3.1 et 3.2). Pour optimiser la couverture de la région, nous prenons en compte tous les carrés réalisés au moins une fois depuis Dans le cas où des relevés ont été fait plusieurs années sur un même carré, nous prenons en considération la moyenne annuelle du nombre d individus. A partir de ces valeurs d abondances relatives géoréférencées, nous utilisons des outils de statistiques spatiales pour calculer l abondance relative sur tout le territoire de la région. Nous obtenons ainsi des cartes d abondances relatives par espèce qui permettent de mettre en évidence les bastions des espèces communes. Pour plus de lisibilité des cartes, nous avons choisi seulement cinq classes déterminées par seuils naturels (Jenks). Plus la couleur est foncée plus l espèce est abondante. Mais l espèce n est pas forcément absente des zones les plus claires. Elle peut être présente en faible densité ou non détectée par absence de relevés. 4. Résultats 4.1. Variation et tendance depuis 2001 Le tableau 1 présente les variations d abondance et les tendances depuis 2001 pour 76 espèces communes de notre région. Cette année nous avons modifié la définition des statuts des espèces d après les tendances pour qu ils correspondent à ceux données au niveau national (voir attribution des statuts à la fin du tableau). CEEP - 4 -

6 Tableau 1 : Variation d abondance , tendance d évolution de 2001 à 2008 et statut de 76 espèces communes recensées dans le cadre du programme STOC-EPS en région PACA. Espèce Variation Tendance moyen terme Statut (*) Aigrette garzette Non significatif Alouette des champs 7-10 Non significatif Alouette lulu Augmentation Bergeronnette grise Non significatif, Stable Bergeronnette printanière Stable Bouscarle de Cetti Non significatif Bruant fou Non évalué 109 Non significatif, Stable Bruant jaune Non significatif Bruant ortolan 7-1 Stable Bruant proyer Non significatif Bruant zizi Non significatif Caille des blés 78 Non évalué Canard colvert Diminution Chardonneret élégant Non significatif Choucas des tours 53-6 Non significatif Cisticole des joncs Non significatif Cochevis huppé Non significatif, Stable Corneille noire 10 5 Stable Coucou gris Augmentation Etourneau sansonnet Non significatif, Stable Faisan de Colchide Non significatif Faucon crécerelle Non significatif, Stable Fauvette à tête noire Diminution Fauvette mélanocéphale Non significatif Fauvette passerinette Non significatif, Stable Fauvette pitchou Non significatif, Stable Foulque macroule 7-38 Non significatif, Stable Geai des chênes 7 33 Non significatif, Stable Goéland leucophée Non significatif Grand Corbeau Non évalué -33 Non significatif, Stable Grimpereau des jardins Stable Grive draine Augmentation Guêpier d'europe Augmentation Héron cendré Non significatif Héron garde-bœufs Non significatif Hirondelle de fenêtre Diminution Hirondelle de rocher Stable Hirondelle rustique Non significatif Huppe fasciée Stable Hypolaïs polyglotte Stable Linotte mélodieuse Non significatif, Stable Loriot d'europe 4 12 Stable Martinet noir Stable Merle noir -2-9 Stable Mésange à longue queue 3 2 Stable Mésange bleue Stable Mésange boréale Non évalué 140 Non significatif, Stable Mésange charbonnière 3 30 Augmentation Mésange huppée Non significatif, Stable Mésange noire Stable Milan noir Stable Moineau domestique Non significatif CEEP - 5 -

7 Tableau 1 suite : Variation d abondance , tendance d évolution de 2001 à 2008 et statut de 76 espèces communes recensées dans le cadre du programme STOC-EPS en région PACA. Espèce Variation Tendance moyen terme Statut sur le moyen terme Moineau friquet Non significatif Outarde canepetière -39 Non évalué Perdrix rouge Diminution Pic épeiche 6-11 Stable Pic vert Non significatif, Stable Pie bavarde Stable Pigeon bizet (féral) Non significatif Pigeon ramier Augmentation Pinson des arbres -5-7 Stable Pipit des arbres 3-28 Non significatif, Stable Pipit rousseline Stable Pouillot de Bonelli Stable Pouillot véloce Non significatif Roitelet à triple bandeau Non évalué 41 Non significatif, Stable Rollier d'europe -41 Non évalué Rossignol philomèle 5-11 Stable Rougegorge famillier Stable Rougequeue à front blanc Non significatif, Stable Rougequeue noir Stable Rousserolle effarvatte Non significatif Serin cini Stable Sitelle torchepots 3 21 Stable Tadorne de Belon 16 Non évalué Tarier pâtre Diminution Tourterelle des bois Stable Tourterelle turque Augmentation Troglodyte mignon Diminution Verdier d'europe Non significatif, Stable (*) Détail de l'attribution des statuts (d après Jiguet 2008) : Déclin : tendance linéaire négative significative (P<0.05) sur le long terme (plus de 10 ans de suivi nécessaire) Diminution : tendance linéaire négative significative (P<0.05) sur le moyen terme ( ) Augmentation : tendance linéaire positive significative (P<0.05) sur le long ou le moyen terme Non significatif : tendance linéaire non significative (P>0.05) Stable : tendance linéaire non significative et pas de variations inter-annuelles significatives. Sur les 76 espèces pour lesquelles nous pouvons donner un statut, 43 apparaissent stables dont 18 subissent de fortes variations inter-annuelles (Non significatifs, Stable), 20 présentent des tendances non significatives, dont 15 seraient en diminution plus ou moins marquée. Enfin, 7 espèces sont en augmentation et 6 en diminution significatives (Figure 3 et 4). Par rapport aux résultats , la Mésange boréale n apparaît plus en augmentation significative, mais quatre autres espèces sont ajoutées à cette catégorie : la Mésange charbonnière, le Coucou gris, la Grive draine et le Guêpier d Europe. Inversement, deux espèces ont un statut moins préoccupant cette année à cause de variations inter-annuelles fortes, il s agit du Bruant proyer et du Chardonneret élégant. Part contre, la Fauvette à tête noire, l Hirondelle de fenêtre et le Canard colvert rejoignent le groupe d espèces en diminution significative comprenant déjà l an passé la Perdrix rouge, le Tarier pâtre et le Troglodyte mignon. CEEP - 6 -

8 Figure 3 : Evolution de l indice d abondance des 7 espèces en augmentation présentant une tendance significative (Tableau 1). Figure 4 : Evolution de l indice d abondance des 6 espèces en diminution présentant une tendance significative (Tableau 1) Carte d abondance relative, quelques exemples L échantillonnage avec un protocole standardisé sur l ensemble de la région permet d interpoler les abondances relevées à l ensemble du territoire (Figures page suivante). Il faut cependant être prudent dans la lecture des cartes car la distance entre chaque relevé va influencer la taille des zones de forte ou faible abondance (Figure 1). Ainsi, si la basse Provence est relativement bien couverte par un fort réseau de carrés STOC, les Alpes le sont beaucoup moins. Nous perdons donc de la précision sur la répartition réelle des espèces dans cette zone. Nous obtenons tout de même des cartes très intéressantes qui peuvent être mise en relation avec la biologie des espèces et les grands types d habitat de notre région. CEEP - 7 -

9 Perdrix rouge : le bastion de l espèce apparaît dans le centre du 13 en particulier les garrigues de Lançon et la Crau. Martinet noir : la carte montre bien l affinité de ce martinet au zone urbaine et rupestre comme le Verdon. Corneille noire : cette espèce affectionne les zones agricoles, en particulier la vallée du Rhône. Rollier d Europe : considéré comme rare il est tout de même possible de produire une carte d abondance pour le rollier. Bruant ortolan : le bastion de l ortolan en France ce situe dans les Alpes du sud. Mésange charbonnière : elle est moins abondante dans les zones «arides» (Crau et Valensole) et de hautes altitudes. Fauvette à tête noire : elle affectionne les secteurs plus humides de notre région. Fauvette mélanocéphale : strictement méditerranéenne, cette fauvette reste localisée à l étage mésoméditerranéen. Figure 5 : exemple de cartes d abondances relatives issues du programme STOC-EPS en PACA. CEEP - 8 -

10 5. Les indicateurs de biodiversité Le CRBPO produit 4 indicateurs, regroupant les espèces selon leur spécialisation par rapport à trois grands types d habitat. Ces indicateurs sont ceux des espèces spécialistes des milieux agricoles, espèces spécialistes des milieux forestiers, espèces spécialistes des milieux bâtis et des espèces généralistes. Le degré de spécialisation est calculé à partir de la répartition des effectifs de l espèce dans les trois grands types d habitats, en proportion de leurs disponibilités. Ainsi pour la France 66 espèces sont prises en compte contre 39 pour la région PACA. Le nombre d espèces dans notre région est plus faible, d une part, car notre échantillon est réduit et d autre part, parce que le degré de spécialisation des espèces est différent au niveau régional par rapport au niveau national. En PACA, elles se répartissent de la manière suivante : - Espèces généralistes (9) : Bruant zizi, Pic épeiche, Rossignol philomèle, Mésange charbonnière, Fauvette à tête noire, Huppe fasciée, Pigeon ramier, Serin cini et Merle noir. - Espèces spécialistes des milieux agricoles (14) : Alouette des champs, Perdrix rouge, Linotte mélodieuse, Corneille noire, Choucas des tours, Faucon crécerelle, Cochevis huppé, Guêpier d Europe, Milan noir, Pie bavarde, Etourneau sansonnet, Alouette lulu, Bruant proyer et Tourterelle des bois. - Espèces spécialistes des milieux forestiers (12) : Grimpereau des jardins, Rougegorge familier, Geai des chênes, Faisan de Colchide, Pouillot de Bonelli, Pouillot véloce, Roitelet à triple bandeau, Fauvette passerinette, Troglodyte mignon, Grive musicienne, Pinson des arbres et Fauvette mélanocéphale. - Espèces spécialistes des milieux bâtis (8) : Verdier d Europe, Pigeon biset (féral), Hirondelle de fenêtre, Bergeronnette grise, Moineau domestique, Rougequeue noir, Tourterelle turque et Martinet noir. L'année de référence (indice d'abondance de 1) a été fixée à l'année 2002, car en 2001, année de redémarrage du programme, certaines espèces de ces indicateurs n'ont pas été détectées par manque de relevés. Les analyses statistiques sont réalisées par le CEEP pour PACA. Ainsi, on note une légère augmentation globale de +12% de 2001 à 2008 pour les 76 espèces suivies (Figure 6), mais tous les indicateurs affichent une baisse plus ou moins marquée. Les moins préoccupants sont ceux des espèces généralistes avec 0,2%, suivis des espèces spécialistes des milieux forestiers avec 1%. L indicateur des milieux agricoles se redresse légèrement cette année avec 6% contre 10% l an dernier. Par contre, la baisse de l indicateur des milieux bâtis se confirme malgré les fortes variations inter-annuelles, passant de 11% en 2007 à 20% en CEEP - 9 -

11 Figure 6 : Evolution de 2001 à 2008 des indicateurs régionaux de biodiversité issus du programme STOC en PACA. Comme chaque année (Vincent-Martin 2008), nous calculons ces mêmes indicateurs pour la région mais avec les espèces identifiées comme spécialistes au niveau national (Jiguet & Julliard 2006). Ainsi la baisse de l indicateur des espèces spécialistes des milieux agricoles à tendance à se stabiliser depuis trois, mais atteint tout de même une baisse record de 43% en seulement huit ans. La tendance des autres indicateurs est aussi à la baisse. Celui des milieux bâtis est identique à 2007 avec 15%. Les espèces spécialistes des milieux forestiers subissent des variations inter-annuelles relativement importantes, mais la baisse se confirme passant de 20% en 2006 à 4% en 2007 puis à 13% en Les espèces généralistes sont soumises à des variations nettement moins importantes passant de 3% en 2007 à 1% cette année (Figure 7). Figure 7 : Evolution de 2001 à 2008 des indicateurs nationaux de biodiversité issus du programme STOC en PACA. CEEP

12 6. Autres analyses des différents cortèges d espèces Nous pouvons produire des analyses sur la même base que les indicateurs de biodiversité mais en classant les espèces sur d autres critères. Nous proposons ici trois classements analysés indépendamment les uns des autres, en fonction de leur statut réglementaire (gibier ou protégée), de leur régime alimentaire (granivore, insectivore, polyphage et autre) et des mouvements inter-nuptiaux (migrateur, migrateur partiel et sédentaire) dans notre région. Si le statut réglementaire des espèces est clairement établi par les textes, les statuts biologiques comme la migration ou le régime alimentaire peuvent être discutables car souvent nos connaissances sont insuffisantes. Ainsi, une espèce considérée ici comme sédentaire peut réaliser des déplacements difficilement détectables. Une espèce granivore va généralement s alimenter ou nourrir sa progéniture avec des insectes au printemps. Malgré ces imprécisions, plus ou moins marquées selon les espèces, nous pouvons dégager des tendances par cortège qui pourront à terme mettre en évidence des problèmes de conservation D après le statut réglementaire Sur les 76 espèces prisent en compte, 15 d entres elles sont classées comme gibier contre 61 classées comme espèce protégée. Les moyennes géométriques des deux groupes montrent une baisse légèrement plus importante des espèces chassables (-7%) par rapport aux espèces protégées (-4%, figure 8). Figure 8 : Evolution des cortèges d espèces en fonction de leur statut réglementaire (espèces protégées, espèces gibiers). La régression du cortège des espèces gibiers est fortement influencée par 5 espèces dont la Perdrix rouge et le Canard colvert qui affichent tous deux une baisse significative de leurs effectifs sur la période considérée. Nous pouvons donc nous demander si les mesures de gestions réalisées sont pertinentes pour ces espèces. Cependant, les conditions météorologiques des deux dernières années ne leur ont pas été favorables. CEEP

13 6.2. D après le statut migratoire Il est surprenant de voir sur la figure 9, la progression des espèces migratrices. Cette catégorie est essentiellement composée de migrateurs trans-saharien, donc des migrateurs au long cours qui subissent à la fois les contraintes climatiques sur leur lieu de nidification (ici la PACA), sur leur route pour l Afrique et sur les lieux d hivernage. La catégorie des migrateurs est composée de 19 espèces dont seulement l Hirondelle de fenêtre affiche une baisse significative de ses effectifs. Globalement les migrateurs pris en compte pour notre région doivent bénéficier du réchauffement climatique contrairement aux sédentaires et migrateurs partiels, qui se dispersent dans notre région et plus largement dans le sud de l Europe. Ces deux catégories affichent une baisse marquée sur la période considérée. Figure 9 : Evolution des cortèges d espèces en fonction de leur statut migratoire (migrateur, migrateur partiel et sédentaire) D après le régime alimentaire Il est généralement convenu que les espèces insectivores sont en régression, or pour PACA et avec le jeu de données dont nous disposons, celles-ci apparaissent stables (Figure 10). Ce sont généralement des espèces migratrices (cf. 6.2). Par contre, les espèces granivores et les espèces classées comme «autre», principalement des prédateurs ou opportunistes, affichent une baisse très forte depuis Pour cette catégorie, on note tout de même de forte variations. Celles-ci sont généralement calées sur les cycles d abondances de leur proies comme les micro-mammifères. Il faudra certainement attendre encore plusieurs années pour confirmer cette hypothèse. Par contre, la baisse des granivores est régulière. On peut alors se demander si ces espèces là ne pâtiraient pas des traitements réalisés dans les cultures. Les polyphages changent de régime alimentaire au cours de l année, passant généralement d un régime insectivore en été à un régime végétarien en hiver. Comme les insectivores, ils se portent plutôt bien avec une tendance à la hausse. CEEP

14 Figure 10 : Evolution des cortèges d espèces en fonction de leur régime alimentaire (granivore, insectivore, polyphage et autre). 7. Conclusion et perspectives Grâce à l investissement de nombreux bénévoles un nombre relativement important de carrés est suivi chaque année et permet l estimation de tendances de nombreuses espèces communes de notre région. Bien qu inscrit dans le réseau national, le programme STOC est décliné ici en un véritable observatoire de l avifaune régionale avec des tendances pour plus de 70 espèces depuis deux ans. Cependant, il apparaît important de compléter la couverture régionale afin d améliorer le suivi et d avoir une vue d ensemble de notre avifaune. D autre part, l implication dans ce programme de plus en plus de gestionnaires d espaces protégés montre l intérêt de ce suivi. Certains d entre eux bénéficient déjà d un nombre d années de suivi intéressant permettant de comparer leur données à l ensemble du réseau ou de produire des indicateurs propres à leur site. Remerciements Ce suivi ne pourrait exister sans la participation de nombreux bénévoles des associations naturalistes de la région et la coordination locale réalisée par certains d entre eux comme Cédric Denis, Matthieu Lascève, Olivier Hameau et Amine Flitti. Nous remercions aussi le CRBPO qui fait vivre ce programme en assurant la coordination nationale et Guillaume Paulus pour la mise a jour de la page sur le STOC-EPS du site internet du CEEP. La coordination régionale de se programme est rendu possible grâce au soutien du Conseil Régional PACA et de la DIREN PACA. CEEP

15 Bibliographie Jiguet F. et Julliard R. (2006). Suivi temporel des oiseaux communs. Bilan du programme STOC pour la France en Ornithos Jiguet F (2008). Les résultats nationaux du programme STOC de 1989 à www2.mnhn.fr/vigie-nature Pannekoek J. and van Strine A. (2001) TRIM 3 Manual (Trends & Indices for Monitoring data). Research paper no Statisitcs Netherlands, Voorburg. Vincent-Martin N. (2006) Suivi temporel des oiseaux communs en PACA, Bilan Rapport CEEP. Vincent-Martin N. (2008) Bilan du programme STOC-EPS en région PACA : tendances, statuts des espèces et les indicateurs de biodiversité pour la période Faune de Provence, Vol Comment participer Pour participer, il suffit de bien connaître les oiseaux de sa région et de contacter le coordinateur régional. L'échantillonnage est réalisé sur un carré de 2 x 2 km où l'observateur réparti 10 points d'observation. Les carrés sont tirés au sort dans un rayon de 10 km autour d'un point fourni par l'observateur (nom de commune). Le tirage aléatoire des sites prospectés est obligatoire pour obtenir une bonne représentativité des différents habitats disponibles. Depuis la relance en 2001 du programme STOC-EPS par le CRBPO ( ), le CEEP ( a pris en main la coordination de ce programme pour la région PACA. Nicolas Vincent-Martin (tél. : ou par mail : nicolas.vincent-martin at ceep.asso.fr) assure la centralisation des demandes de nouveaux carrés et des données avant leur envoi au CRBPO, ainsi que la synthèse annuelle pour PACA. Télécharger le protocole Télécharger gratuitement le logiciel de saisi sur : Plus d infos et plus de résultats Sur le programme STOC au niveau national : Au niveau régional : CEEP