Université Pierreet-Marie-Curie

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1 Université Pierreet-Marie-Curie

2 Un portail d entrée : JUBIL Informations : bibliothèques, leurs horaires et leur accès, collections. Accès aux catalogues (BUPMC, SUDOC) Accès aux bases de données, listes e-books et revues électroniques Guides de recherche, Archives ouvertes (HAL-UPMC), etc.

3 Plan de la séance PubMed = base de 1. données biomédicale Zotero = logiciel de gestion 2. de bibliographie

4

5 PubMed = moteur de recherche Medline = Base de données MedLine = le contenu principal = 23 millions de références d articles, tirés de revues, depuis les années

6 Savoir si une revue est recherchable via Pubmed

7 Pratique Ces revues sont-elles sur PubMed : Le journal français d ophtalmologie Archives d'ophtalmologie Cornea

8 PubMed via JUBIL PubMed est accessible gratuitement sur Internet mais si on passe par JUBIL pour s y connecter : On garde l interface classique + résolveur de lien vers texte intégral si nos bibliothèques sont abonnées 8

9 PubMed via JUBIL Bases de données > faire dérouler jusqu à PubMed 9

10 PubMed via JUBIL 10

11 Pubmed via Jubil lien vers accès UPMC à l article en ligne si abonné Attention : l icône UPMC = savoir si l UPMC a l article en ligne. 11

12 Une centaine de titres français DONC l interrogation se fait TOUJOURS EN ANGLAIS 12 Source :

13 Pratique Dans PubMed combien de résultats pour : Fond de l œil Fundus oculi fundus oculi injuries "Fundus Oculi/injuries"[Mesh]

14 PubMed : stopwords Mots courants non indexés : Utilisation optimale documentation médicale 14

15 Qu est-ce que le MeSH? -Plus de termes - Hiérarchisés en thésaurus (arborescence de termes génériques et spécifiques, synonymes et renvois). Vocabulaire normé. - Mise à jour annuelle -Traduction française par l INSERM -Chaque article est indexé avec entre 5-20 mots MeSH 15

16 PubMed : pourquoi le MeSH? MeSH = Medical Subject Headings = mots-clés normalisés pour décrire le sujet de l article 1. Trop de résultats spinal cord (directement) : articles "spinal cord" : + de articles Spinal cord[mesh] : articles "Spinal Cord/injuries"[Mesh] :

17 PubMed : pourquoi le Mesh? 2- Les synonymes Trisomy 21 = Down Syndrome = Mongolism 3- Ciblage sur un aspect (qualificatif subheading) «spinal cord [MeSH]» : articles Avec un qualificatif «"Spinal Cord/surgery"[Mesh]» : articles

18 Comment ça marche? Par zigazou76 Source Flickr

19 Le MeSH est accessible via PubMed 19

20 Détail d un terme MeSH Terme et champ d application Qualificatifs possibles Explosion et pondération Permettent de préciser la recherche Synonymes Termes associés Hiérarchie

21 Pour connaître les termes MeSH : le CiSMeF

22 CiSMeF : traduction du MeSH et détails

23 Pratique Remplissez ce tableau grâce au Cismef Concepts retenus Termes anglais Termes plus spécifique Termes voisin Cecité Dépistage visuel Déficience visuelle

24 Détail d un terme MeSH

25 Choix du qualificatif et construction de la requête

26 Combinaison avec un autre terme PubMed retient l historique de votre recherche 26

27 Les limites / Filtres additionnels Langages Ages Sexe Humain/animal Cas clinique Review Méta-analyse Etude comparative etc Attention! Les filtres restent sélectionnés jusqu à ce qu on les 27 enlève

28 Rechercher dans PubMed Étape 1 : trouver le mot-clef de départ en français ( > fenêtre du bas) Étape 2 : choix des qualificatifs (subheadings) Étape 3 : dans PubMed on recherche le terme Mesh traduit, on le combine avec d autres termes (Mesh ou pas) et on lance sa requête Etape 4 : on rajoute des filtres pour préciser sa requête

29 Pratique Faites une recherche sur les reviews traitant de : la prévention des accidents vasculaires cérébraux par le traitement de l hypertension artérielle

30 Changer d affichage Par défaut : Summary = auteurs + titre + PMID + niveau d indexation Abstract : résumé + lien vers PDF MEDLINE : export vers bibliographie (EndNote, Zotero ) 30

31 Chercher un auteur Rentrer son nom et l initiale de son prénom PubMed comprend qu on cherche une personne 31

32 Recherches très spécifiques avec des termes absents du MeSH Utiliser [TIAB] = recherche du terme dans les titres et résumés des articles Ex. : dose intégrale en radiothérapie : «integral dose» "integral dose" [TIAB] : 338 résultats "integral dose" [TIAB] AND radiosurgery [MH] : 29 résultats 32

33

34 Qu est-ce qu un logiciel de gestion bibliographique? SUDOC Traitement de texte PubMed Revues élec Sites web Etc. Références Les références sont insérées et mise en forme automatiquement Importation des données en un clic Insertion automatique des références

35 Une courte vidéo en anglais (1min53) sur le principe du logiciel Vidéo sur Youtube :

36 Guide complet et à jour de la BIU Santé

37 = Un plug-in Firefox + plug-in pour le traitement de texte (Word, OpenOffice) = Un équivalent en logiciel libre et gratuit de services payant (EndNote, Refworks) 37

38 = bibliothèque de références que l on peut partager (travail de groupe) = des fonctionnalités : organiser ses références, annoter pages web et pdf, etc. 38

39 Source : Troed sur Flickr 2. Installation

40 1) Aller sur : 2) Téléchargez le plug-in Firefox et le plug-in Word ou OpenOffice

41 Autorisez l installation du plug-in Firefox 41

42 Installez le Plug-In Word (ou Open Office selon le traitement texte que vous utilisez)

43 Zotero Une fois installé une icone Zotero apparaît en haut à droite pour les versions les plus récentes. Cliquez dessus pour développer Zotero

44 4 zones dans Zotero Barre d outils Liste des dossiers, marqueurs et recherches Références du répertoire, du marqueur ou de la recherche sélectionné 44 Détails de la référence sélectionnée

45 Zotero : comment collecter des références 1 Collecte en ligne Import d un fichier de références 3 Saisie manuelle d une référence : différents types de document disponibles 5 4 Création d un élément : lien vers la page Web en cours Recherche d une référence par son identifiant (PMID, DOI, ISBN, etc.) 45

46

47 Collecter des références en ligne Dans Zotero : 47

48 Pratique Consultez sur base EM-Premium (Jubil > Ressources en ligne > livres numériques > EM Premium) Le traité EMC > «Ophtalmologie» le chapitre «Analyses statistiques de l'acuité visuelle» et importez la référence dans Zotero.

49 Zotero fonctionne avec : - Amazon - BIU Santé - Bibliothèque nationale de France (BnF) - Google Books - Google Scholar - Pubmed - Science Direct - SUDOC (inclus la BIUM et l UPMC) Liste des sites compatibles : 49

50 Exploiter les références : plug-in Word/LibreOffice (1/4) Insérer des références et créer des bibliographies dans un document Word ou LibreOffice 50

51 Icône Word dans OpenOffice et Word 2003

52 Icônes Zotero dans Word 2007/

53 Icônes Zotero dans Word pour Mac 53

54 Autres icônes Zotero dans Word/OpenOffice Éditer une citation insérée dans le document Générer une bibliographie à partir de tous les éléments référencés (NB : si le style l autorise) Éditer une bibliographie insérée dans le document (ajouter une référence non citée dans le texte par ex.) Refresh : mise à jour des citations et de la bibliographie pour répercuter les modifications faites dans la bibliothèque Afficher les préférences du document pour changer le style 54

55 Insérer une référence, puis créer une bibliographie rassemblant toutes les références citées Présentation du fonctionnement de l insertion de citation : Vidéo de l URFIST PACA.

56 Exploiter les références : plug-in Word/LibreOffice (3/4) Insérer une référence Choix du style Choix de la référence et prévisualisation 56

57 2 normes de référence - Système Harvard (auteur année dans le texte) - Système Vancouver (par ordre d apparition dans le texte, avec numérotation) 57

58 Retrouver ce diaporama et d autres Jubil > Formation et guides de recherche > Médecine et paramédical > Orthoptie

59 Besoin d aide? N hésitez pas à demander de l aide pour vos recherches auprès des personnels de bibliothèque! Le service en ligne Rue des Facs vous indique des pistes pour vos recherches bibliographiques

60 Avant de partir Un questionnaire d évaluation de la séance :

61 FIN Merci de votre attention

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