INRA-DRH numconcours externes 2011

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1 INRA-DRH numconcours externes Page 1 of 2 09/02/2011 IR Ingénieur en biologie profil n : IR11-SA-2 emploi-type n : A1A23 Tours concours : IRA04 Lieu du concours (Centre Organisateur): Paris ::::::::::::::::::::::::::::: FICHE DE PROFIL Concours Externes INRA 2011 ::::::::::::::::::::::::::::: L'ingénieur en biologie conçoit, développe et expérimente de nouvelles méthodologies dans le cadre de thématiques de recherche en biologie.... Domaine professionnel : Biologie/ BAP A Sciences du vivant Département : Dpt Santé Animale unité n 1282 IASP Infectiologie Animale et Santé Publique personne(s) à contacter : Nathalie Winter nathalie.winter@tours.inra.fr... Environnement : La personne recrutée s'intégrera dans l'équipe travaillant sur les mycobactéries, composée de 8 titulaires. Il(elle) travaillera en binôme avec une technicienne sous l'encadrement du directeur de recherche et participera à l'encadrement de Masters et/ou doctorants. Il(elle) sera en interface avec les chercheurs de l'unité Infectiologie Animale et Santé Publique (IASP) désireux d'utiliser les techniques d'imagerie en fluorescence. L'unité IASP est adossée à une Unité d'etude (UE), la Plate-Forme d'infectiologie Expérimentale (PFIE) permettant l'infection de souris ou d'animaux de rente en confinement L3 où les infections expérimentales par M. tuberculosis/bovis seront réalisées. Les équipements nécessaires aux études de cellules utilisant des marqueurs fluorescents sont disponibles à IASP (cytométie en flux) ou dans l'environnement proche (microscope confocal Université de Tours). IASP prévoit de s'équiper de microscope confocal sous la responsabilité de l'ingénieur de recherche. L'équipe est établie dans le domaine des mycobactéries (paratuberculose et tuberculose) est reconnue. Elle bénéficie de plusieurs contrats de recherche nationaux, ANR (MIE2008, 17MycImPac) transversalité AFSSA-INRA), prévalorisation INRA-Transfert, et contrats Européens, projet intégré MUVAPRED (FP6 N LHSP-CT ) et AC (Venomyc) ainsi participation dans un STREP ParaTBTools (FP6). Elle a établi de nombreuses collaborations avec les chercheurs de la communauté européenne sur la tuberculose (dans le cadre de projets européens) avec les chercheurs de l'institut Pasteur à Paris, une unité de l'institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, l'institut Pasteur de Lille et le laboratoire de Microbiolgie Cellulaire à Rio de Janeiro au Brésil. La personne recrutée développera les modèles animaux, notamment la souris, de l'infection par les mycobactéries pathogènes pour l'animal et pour l'homme (pathogènes de classe 2 et 3). Il(elle) sera impliqué(e) dans l'étude de la réponse immunitaire à l'infection. Il(elle) développera également les techniques d'imagerie en fluorescence nécessaires à l'étude des interactions hôte/pathogène dans l'unité. Adresse WEB de l'unité : Activités : Déterminer l'ensemble cohérent de techniques de la biologie nécessaires à la réalisation expérimentale d'un projet scientifique Connaissance générale des approches méthodologiques appliquée à la biologie Connaissance générale des disciplines voisines : mathématiques, physique, chimie Connaître les communautés scientifiques et technologiques du domaine Connaître les réglementations du domaine en hygiène et sécurité Connaître les principes éthiques et les réglementations afférentes Concevoir des protocoles expérimentaux dans le cadre d'un projet scientifique Développer une expertise scientifique et technologique Intégrer son activité dans les projets scientifiques de l'unité Maîtriser les outils informatiques de recueil et de traitement des données Maîtriser les techniques de présentations (orales et écrites) et d'animation de réunion Maîtrise de l'anglais oral et écrit Notions de base en informatique appliquée Notions de base sur les règles budgétaires et le cadre des marchés publics Mobiliser ou motiver une équipe autour d'un projet commun Appliquer et transmettre les «bonnes pratiques» de laboratoire Communiquer et gérer les relations avec les interlocuteurs internes et externes Adapter des contenus pédagogiques au niveau et aux attentes de ses interlocuteurs Compétences : Connaissance approfondie de la biologie Concevoir le développement et conduire en spécialiste, la réalisation d'un projet méthodologique dans un domaine de la biologie (biochimie, génétique, biologie moléculaire, biologie cellulaire et morphologique, physiologie animale ou humaine, transgénèse)

2 INRA-DRH numconcours externes Page 2 of 2 09/02/2011 Conseiller, dans le cadre d'un projet scientifique, les options techniques, évaluer et valider les choix Valider et interpréter les résultats dans le domaine de l'expérimentation biologique Diffuser et valoriser les résultats de développements méthodologiques sous forme de rapport technique, présentation orale, publication, brevet Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en oeuvre des techniques de l'expérimentation en biologie, encadrer les utilisateurs Coordonner la mise en oeuvre méthodologique d'un projet scientifique Organiser la veille scientifique et technologique Evaluer et mobiliser les ressources nécessaires aux expérimentations Gérer les moyens techniques, humains et financiers alloués aux activités d'expérimentation Expérimenter de nouvelles technologies et établir des protocoles inédits Capacités personnelles : Doctorat, Ingénieur gde Ecoles ou assimil. La maîtrise des techniques immunologiques classiques est nécessaire : cytométrie en flux, ELISA, ELIspot, qrt-pcr, Western Blot. La connaissance de la microcopie confocale et de techniques d'imagerie dynamique serait appréciée. La mise en place du génotypage, dans la cadre du développement d'animaux transgéniques ou «knock-out» (souris ou animaux de rente) serait un atout supplémentaire. La personne recrutée devra participer à la mise en place d'une plate forme technique de microscopie confocale et /ou d'imagerie dynamique pour les analyses de cellules recrutées dans des tissus infectés par un pathogène de classe 3. Sa capacité à se mettre au service de la collectivité sera donc indispensable. Des qualités pédagogiques, de formateur et d'animateur scientifiques seraient appréciées. Témoignage/Portrait : conception et réalisation : DRH - DSI

3 DRH - SRM C O N C O U R S E X T E R N E S I T S E S S I O N CONCOURS N IRA04 INGENIEUR DE RECHERCHES Ingénieur en biologie EPREUVE ECRITE D ADMISSION : DOSSIER TECHNIQUE Date : 06/06/2011 Durée : 4 heures Coefficient : 3 Consignes générales : A lire attentivement L épreuve étant anonyme, aucun signe distinctif ne devra être porté sur les copies d examen (signature, inscription de votre nom et votre prénom ailleurs que dans le cadre réservé à cet effet, etc ). Veuillez vérifier que votre questionnaire est complet. L usage de la calculatrice n est pas autorisé. Composition de l épreuve : Partie points Partie points Partie points TOTAL points

4 EPREUVE ECRITE D ADMISSION : DOSSIER TECHNIQUE Partie I - Rédaction d un résumé (40 points) A partir de l article joint intitulé «Mycobacterium tuberculosis infects dendritic cells with high frequency and impairs their function in vivo» par A.J. Wolf et al, vous rédigerez un résumé en français de 300 mots maximum. Partie II Rédaction d un protocole (10 points) Vous rédigerez un protocole à destination des utilisateurs de la plateforme d imagerie cellulaire pour l examen par microscopie confocale des populations cellulaires constituant un granulome au sein du tissu pulmonaire de souris infectées par Mycobacterium tuberculosis. Partie III - Questions diverses (10 points, 1 point par question) 1. Quelle(s) association(s) de fluorochromes choisiriez-vous pour l analyse de trois paramètres et de la viabilité cellulaire en cytométrie de flux : A. FITC/PE/7AAD/A494 B. A488/TRITC/7AAD/A647 C. A488/PE/PI/APC D. FITC/PE/7AAD/A Dans la liste de marqueurs suivante, choisir les plus pertinents pour identifier par cytométrie en flux les types cellulaires indiqués ci-dessous : CD56, CD25, DX5, CD11c, CD11b, CD4, CD205, OX40, CD40, CD16, A. Les lymphocytes T régulateurs B. Les cellules dendritiques conventionnelles C. Les cellules NK 3. En expérimentation animale, que signifie la règle des 3R? 4. Quel est le temps nécessaire à une colonie de Mycobacterium tuberculosis pour atteindre une taille de 3 mm sur un milieu de Löwenstein-Jensen? 5. Parmi les techniques ci-dessous, indiquer celle(s) qui permettent d invalider définitivement et complètement un gène spécifique dans des cellules de lapin avec une fréquence de 1 à 20% dans une population clonale : A. Recombinaison homologue B. Transfection avec un vecteur shrna C. Transfection avec des zinc finger nucléases D. Transfection de sirna E. Manipulation impossible

5 6. La paratuberculose est une infection qui touche les espèces de ruminants. Les lésions associées à la forme clinique de la maladie sont localisées : A. Dans le poumon B. Dans la glande mammaire C. Dans l iléon D. Sur la peau 7. Parmi les agents infectieux suivants, indiquer ceux qui doivent être manipulés dans des locaux de niveau de biosécurité III : A. Coagulase-négative Staphylococcus B. Mycobacterium smegmatis C Brucella abortus D. LPAI H5N1 E. Mycobacterium bovis 8. Que signifie l abréviation EOPS s agissant du statut sanitaire d un animal de laboratoire? 9. Parmi les techniques citées, quelles sont celles couramment utilisées pour la quantification des cytokines? A. PCR B. ELISA C. Southern Blot D. Cytométrie en flux D. Microscopie confocale E. Séquençage F. Western Blot 10. Parmi la liste ci-dessous, quels sont les aspects techniques et pratiques requis pour une animalerie de confinement A3. A. Accès au laboratoire par un SAS B. Maintien d une pression positive dans le laboratoire par rapport aux zones voisines C. Maintien d une pression négative dans le laboratoire par rapport aux zones voisines D. Un poste de sécurité biologique de type III E. Un poste de sécurité biologique de type II F. Utilisation de scaphandres autonomes G. Des douches pour décontaminer les utilisateurs H. Un autoclave dans le bâtiment I. Un autoclave double-entrée dans le laboratoire J. Un système d inactivation des effluents : éviers et douches

6 DRH - SRM C O N C O U R S E X T E R N E S I T S E S S I O N CONCOURS N IRA04 INGENIEUR DE RECHERCHES Ingénieur en biologie EPREUVE ORALE D ADMISSION Temps de préparation : 15 minutes Durée : 35 minutes coefficient : 3 Question à préparer par les candidats : Expliquer, interpréter et commenter les documents joints (figure et légende) au cours d une présentation d une durée totale de 5 minutes. Vous ne devez présenter qu'une seule des trois figures. Temps de l exposé devant le jury : 5 minutes maximum (inclus dans les 35 minutes)