Institut Fédératif de Recherche Ingénierie et Biologie Cellulaire et Tissulaire IFR 133. Créé le 1er Janvier 2004

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1 Institut Fédératif de Recherche Ingénierie et Biologie Cellulaire et Tissulaire IFR 133 Créé le 1er Janvier 2004

2 Le contexte lors de la création La recherche biomédicale à Besançon L Université de Franche-Comté (UFC) université multi-disciplinaire secteur Biologie/Santé/Environnement:2 pôles ingénierie/biologie cellulaire environnement/santé Le CHU de Besançon / l Université / l EFS BFC axe prioritaire: transplantation / ingénierie et thérapie cellulaire L Inserm ingénierie cellulaire et immunomodulation (E0119 puis U645) EFS BFC: production, qualification et distribution de produits de thérapies cellulaires et tissulaire L Inserm / le CHU / la Ville / l Université / la Région: un bâtiment recherche Université / la Région les micro et nanotechnologies

3 Efforts de structuration et d organisation préalable Emergence d une thématique transversale d ingénierie cellulaire Pôle fort de transplantation et de thérapie cellulaire CHUB/Université/EFS Présence d une unité de thérapie cellulaire, tissulaire et génique (UTCG) (EFS) permettant la production de produits à usage thérapeutique Mise en place d une structures fédérative (Institut d Etudes et Transferts de Gènes) localisée dans un bâtiment entièrement dévolu à la recherche, cédée par l INSERM à la ville Besançon et co-géré par l Université le CHUB et l EFS BFC Mise en évidence et valorisation de convergences thématiques entre plusieurs équipe les domaines de l ingénierie cellulaire et transplantation, des cellules souches et de la régulation de l expression génique

4 IFR Ingénierie et Biologie Cellulaire et Tissulaire (IBCT) Partenaires: L Université de Franche-Comté L Inserm Le Centre Hospitalier Universitaire de Besançon (CHU) L Etablissement Français du Sang Bourgogne-Franche Comté Sites d implantations : Université de Franche-Comté Centre Hospitalier Universitaire Etablissement Français du Sang Unités constituantes : 9 Effectifs: 214 dont 92 U et/ou H, 3 chercheurs EPST, 69 ITA et 92 étudiants Structures communes : Bâtiment de recherche Laboratoire P3 EFS BFC Plateau d Imagerie Fonctionnelle CHU Centre intégré de Recherche Clinique en Biothérapie (en projet)

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6 Les Objectifs de l IFR IBCT élaborer et mettre en œuvre une politique scientifique fondée sur une cohérence et une synergie entre les équipes de recherche / renforcer la visibilité de l'activité de recherche permettre un développement et une utilisation optimale des moyens intellectuels et matériels mettre en place une politique d animation scientifique, de diffusion de l information, et de formation favoriser le développement de partenariats avec le tissu environnant et s'impliquer dans le développement économique.

7 Gouvernance de l'ifr IBCT Un comité de direction composé du directeur de l'ifr, du directeur du Conseil Scientifique et des directeurs des unités constituantes Définit la politique de l IFR définit et met en œuvre la politique scientifique Un bureau du comité de direction (Christiane Mougin, Michèle Jouvenot, Claudine Botteri, Dominique Fellmann, Pierre Tiberghien) met en œuvre la politique de l'ifr assure la direction et gestion des moyens mis en commun, avec le concours du comité de direction organise l'animation scientifique, la valorisation, la formation et l'accès à l'information assure la représentation de l'ifr Un conseil Scientifique (Dominique Fellmann) oriente et anime l activité scientifique Des comités de gestion Vie du bâtiment IBCT (Christiane Mougin) Animalerie / H et S (Philippe Saas) Animation / Formation (Regis Delage-Mouroux, Jean-Luc Prêtet)

8 Les Objectifs de l IFR IBCT élaborer et mettre en œuvre une politique scientifique fondée sur une cohérence et une synergie entre les équipes de recherche / renforcer la visibilité de l'activité de recherche permettre un développement et une utilisation optimale des moyens intellectuels et matériels mettre en place une politique d animation scientifique, de diffusion de l information, et de formation favoriser le développement de partenariats avec le tissu environnant et s'impliquer dans le développement économique.

9 Thématiques scientifiques de l IFR Ingénierie et Biologie Cellulaire et Tissulaire Immunomodulation, immunothérapie cellulaire allogénique et autologue Immunomodulation de la relation hôtegreffon Immunothérapies cellulaires adoptives anti-virales allogéniques ou autologues Développements de plate-formes de biothérapie Cellules souches, tissus et médecine régénérative Cellules souches mésenchymateuses médullaires et plasticité Cellules souches neuronales et signaux de différentiation Hépatocytes et régénération hépatique Cryoconservation, apoptose et micromanipulation des cellules germinales et embryonnaires Ingénierie cutanée et dermes équivalents Signalisation et régulation cellulaire et tissulaire Régulation de l angiogenèse Régulation de l apoptose Facteurs de neurogenèse, différentiation et neuroprotection Régulation génique et résistance aux antibiotiques

10 Unités constituantes de l IFR Ingénierie et Biologie Cellulaire et Tissulaire Immunomodulation, immunothérapie cellulaire allogénique et autologue INSERM E0119 / EA 2284 Interactions Hôte-Greffon et Ingénierie Cellulaire et Génique en Transplantation, Pierre Tiberghien EA 479, Physiopathologie cardiovasculaire et prévention, Jacques Regnard EA 481, Neurogenèse et processus intégratifs dans l olfaction, Claudine Botteri EA Optimisation Metabolique et Cellulaire, Alain Berthelot EA 3181, Carcinogenèse épithéliale : marqueurs prédictifs et pronostiques, Christiane Mougin EA 3183, Ingénierie et biologie cutanée, Philippe Humbert EA 3185, Génétique et reproduction : qualité des gamètes et du conceptus, Jean- Luc Bresson EA 3186, Pathogénie, épidémiologie, résistance des Agents Infectieux, Patrick Plesiat EA 3922 Estrogènes, Expression Génique et Pathologies du Système Nerveux Central, Michèle Jouvenot Cellules souches, tissus et médecine régénérative Signalisation et régulation cellulaire et tissulaire

11 IFR Ingénierie et Biologie Cellulaire et Tissulaire Unité de Thérapie Cellulaire,Tissulaire et Génique EFS BFC Centre d Investigation Clinique intégré en Biothérapie CHU (projet) Immunomodulation, immunothérapie cellulaire allogénique et autologue Immunomodulation de la relation hôtegreffon hématopoïétique Immunomodulation de la relation hôtegreffon d organe ou de tissu Immunothérapies cellulaires adoptives anti-virales allogéniques ou autologues Développements de plate-formes de biothérapie Cellules souches, tissus et médecine régénérative Cellules souches mésenchymateuses médullaires et plasticité Cellules souches neuronales et signaux de différentiation Hépatocytes et régénération hépatique Cryoconservation, apoptose et micromanipulation des cellules germinales et embryonnaires Ingénierie cutanée et dermes équivalents Signalisation et régulation cellulaire et tissulaire Régulation de l angiogenèse Régulation de l apoptose Facteurs de neurogenèse, différentiation et neuroprotection Régulation génique et résistance aux antibiotiques

12 Les Objectifs de l IFR IBCT élaborer et mettre en œuvre une politique scientifique fondée sur une cohérence et une synergie entre les équipes de recherche / renforcer la visibilité de l'activité de recherche permettre un développement et une utilisation optimale des moyens intellectuels et matériels mettre en place une politique d animation scientifique, de diffusion de l information, et de formation favoriser le développement de partenariats avec le tissu environnant et s'impliquer dans le développement économique.

13 Développement de plateaux techniques mutualisés : le bâtiment IBCT Bâtiment 500 m2 CHUB Partenariat CHUB, UFC, EFS BFC, EFS BFC, Ville de Besançon, Région de Franche-Comté Animalerie 3 zones d'élevage / expérimentation Laverie / Laboratoire L1 Bio-imager (Berthold technology) Agrément n A25121 Laboratoires L1 et L2 Biochimie/Biologie Moléculaire Cytométrie (trieur de cellules, en cours de renouvellement) Coordination / développement: recrutement d un ingénieur d étude Microscopie et d un adjoint confocale technique (Olympus (UFC) FV1000) Fluorimétrie Fonctionnement/Utilisation (Delphia) Equipements: trois techniciens (Inserm, EFS, UFC) Salle Gestion: de réunion, assistante Bibliothèque gestionnaire (Inserm) Secrétariat Salle commune

14 Outils de développement, de production et d évaluation clinique et biologique des produits de Thérapie Tissulaire et Cellulaire (PTC) Laboratoires L1, L2 et L3 / animalerie: développements pré-cliniques / transfert Un centre de prélèvement / cytaphérèse: prélèvements en vue de production l UTCG : production, qualification, stockage, distribution et traçabilité des PTC Un réseau de contrôle-qualité / monitoring En projet: Un centre d investigation clinique intégré en biothérapie (CIC-B) pour assurer la promotion, la mise en place et l évaluation des études cliniques impliquant des PTC Une plateforme de biomonitoring Le développement des nouvelles méthodologies de qualification / diagnostic biologique

15 Le CIC-Biothérapie Inauguré le 27 Avril 2006 de Besançon Partenaires: CHUB, Inserm, UFC, EFS,Agence de la Biomédecine Missions: coordination et mise à disposition de moyens pour l organisation, la réalisation, les suivis d études cliniques en transplantation, en thérapie cellulaire et en immunothérapie suivi à long terme de cohortes de patients greffés (cellules, tissus, organes) permettant une évaluation clinique et biologique continue de l efficacité et des complications résultant notamment des interactions hôte-greffon et de l immunosuppression mise en œuvre d une activité de biovigilance permettant de favoriser une prise en charge coordonnée et adaptée à des risques connus ou inconnus associés à l administration de produits biologiques au sein - aussi bien qu en dehors- d'études cliniques prospectives.

16 Plateforme de BioMonitoring EFS BFC / U 645 / CIC BT IFR 133 Objectifs : - Monitoring biologique - études de biothérapies (CIC-B, sociétés pharmaceutiques, ) - cohortes de patients transplantés - Qualification immuno / hemato des produits de thérapie cellulaire et tissulaire Moyens: - 4 ETP - Cytométrie de flux, ELIspot, Biologie Moléculaire, Immunologie Cellulaire, Culture de progéniteurs Soutien: EFS, Inserm, PHRC, INCA/CGE, Sociétés biotechnologies Exemples d études en cours: Suivi long-terme patients étudetko Effet du G-CSF chez le donneur sain (EFG/ABM) Lymphopénie et pathologie du transplanté (PHRC)

17 CIC Biothérapie / Plateforme de BioMonitoring Deletions within the HSV-tk transgene in long-lasting circulating gene-modified T-cells infused with a hematopoietic graft Marina Deschamps et al. Blood, in press

18 Les Objectifs de l IFR IBCT élaborer et mettre en œuvre une politique scientifique fondée sur une cohérence et une synergie entre les équipes de recherche. permettre une utilisation optimale des moyens intellectuels et matériels pour développer des projets scientifiques fédérateurs favoriser l'animation scientifique et la formation établir des relations avec le tissu environnant et s'impliquer dans le développement de partenariat social et économique.

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20 Implication de l IFR IBCT dans les actions de formation l Ecole Doctorale Homme Environnement Santé (ED HES N 369)(Estelle Seilles) Transplantation, Ingénierie cellulaire et génique, nanobiotechnologies / Naissance, vie et mort de la cellule 70 doctorants /an dans le cadre de l IFR 133 Masters Santé Ingénierie et biologie cellulaire et tissulaire (Patrick Hervé, Pierre Tiberghien, Philippe Saas) Relation hôte-greffon (Recherche) Ingénierie cellulaire et tissulaire (Pro) Biochimie, Biologie cellulaire et moléculaire (Michèle Jouvenot) l Institut Supérieur d Ingénieurs de Franche-comte Filière Biomédicale

21 Les objectifs de l IFR IBCT élaborer et mettre en œuvre une politique scientifique fondée sur une cohérence et une synergie entre les équipes de recherche / renforcer la visibilité de l'activité de recherche permettre un développement et une utilisation optimale des moyens intellectuels et matériels mettre en place une politique d animation scientifique, de diffusion de l information, et de formation favoriser le développement de partenariats avec le tissu environnant et s'impliquer dans le développement économique.

22 Institut FEMTO-ST (UFC, CNRS, UTBM, ENSMM) INGENIERIE BIOMEDICALE MICRO-NANO SYSTEMES POLE de COMPETITIVITE microtechniques Immunomodulatio, immunothérapie cellulaire allogénique et autologue Cellules souches, tissus et médecine régénérative Signalisation et régulation cellulaire et tissulaire CANCEROPÔLE GRAND EST COLLABORATION DIJON IFR 100 COLLABORATIONS TRANSFRONTALIERES

23 Partenariat IFR IBCT / FEMTO-ST L'institut FEMTO-ST: UMR CNRS (UMR 6174) UFC, Ecole Nationale Supérieur de Mécanique et de Microtechniques (ENSMM), et l Université Technologique de Belfort-Montbéliard (UTBM) Fusion 5 laboratoires actifs dans les domaines de la mécanique, de l'optique et des télécommunications, de l'électronique, du temps-fréquence, de l'énergétique et de la "Lames fluidique de microscope / Un effectif avec d'environ référence 350 personnes de position dont intégrée: 200 permanents application à l'étude de l'apoptose" "Source laser accordable pour la microscopie confocale de fluorescence: application à l'observation Objectifs du de synapses partenariat immunologiques IFR IBCT / par Femto-ST: fluorescence favoriser à deux photons" les interfaces "Modulation Microtechniques de l'activité / Santé transcriptionnelle des récepteurs aux estrogènes par des ligands des naturels synergies et synthétiques: entre les compétences approche in dans vitro le à l'aide domaine d'une des biopuce SPI et ADNrécepteur et validation ex vivo par transfection cellulaire«svs "Lab on l émergence chip pour le de transport nouvelles et thématiques le conditionnement de recherche de la cornée" communes "Microsystème une mise pour en œuvre la caractérisation de plates-formes du derme technologiques équivalent" communes.

24 Un Centre d Investigation Clinique intégré en Innovation Technologie «Microtech-Santé» Exemples: Projet Medicalip: microsystème embarqué pour le diagnostic des infections à CMV au lit du patient Projet Contrultime: système automatisé de contrôle ultime prétransfusionnel

25 Institut FEMTO-ST (UFC, CNRS, UTBM, ENSMM) INGENIERIE BIOMEDICALE MICRO-NANO SYSTEMES POLE de COMPETITIVITE microtechniques Immunomodulatio, immunothérapie cellulaire allogénique et autologue Cellules souches, tissus et médecine régénérative Signalisation et régulation cellulaire et tissulaire CANCEROPÔLE GRAND EST COLLABORATION DIJON IFR 100 COLLABORATIONS TRANSFRONTALIERES

26 Plateforme Protéomique Interrégionale Université de Franche Comté Institut FEMTO-ST Axe Santé: Biomarqueurs Axe Ingénieries: nieries: Cartographie 2D Biochromatographie Biopuces Biocapteurs IFR STIC-Santé IFR IBCT Institut Carnot Université de Bourgogne W Boireau / P Ducoroy 04/09/2007

27 Institut de Bio-Ingénierie de Franche-Comté EFS BFC, CHUB, IFR133, Canceropôle Grand-Est, Sociétés de Biotechnologie Bâtiment de 3000 m2 au cœur du pole santé Activités d Ingénierie et biologie cellulaire et tissulaire Ingénierie cellulaire et tissulaire Activité de «routine» Innovation Formation Oncologie moléculaire Radioprotection et Pratiques diagnostiques et thérapeutiques Partenariats industriels Production d anticorps monoclonaux / Diaclone Création d un laboratoire de transfert Production de cellules Cellules immuno-compétentes (EFS BFC Txcell) Production de tissus Ingénierie cutané Micro-nanotechnologies Pole de compétitivité microtechnique / Femto-ST Soutenu par le CPER

28 Dépenses IFR Dotation: 200 K 28,5 9,40 3,5 Achats divers Animation Vacations ,5 Maintenances diverses Maintenance animalerie Equipements 14,5 Fonctionnement : 105,40 ( ,4 recettes / mutualisation) Equipements : 115

29 Ressources extérieures IFR Total: 1003,5 K ,5 24 Conseil Régional CHU Université Inserm EFS Ligue contre le Cancer Recettes séquenceur Mutualisation des équipes

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