Bilan du programme STOC-EPS en région PACA : tendances, statuts des espèces et les indicateurs de biodiversité pour la période

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1 CEEP Conservatoire - Etudes des Ecosystèmes de Provence - Alpes du Sud Association agréée de protection de la nature dans un cadre régional Bilan du programme STOC-EPS en région PACA : tendances, statuts des espèces et les indicateurs de biodiversité pour la période Année 2009 Nicolas VINCENT-MARTIN Conservatoire - Etudes des Ecosystèmes de Provence / Alpes du sud Ecomusée de la Crau Boulevard de Provence Saint Martin de Crau

2 SOMMAIRE Remerciements Participation Méthode d analyse des données Variation d abondance Tendance Carte d abondance relative Résultats Variation et tendance depuis Cartes d abondance relative et cartes de variations d abondance Cartes d abondance relative Cartes de variations d abondances Les indicateurs de biodiversité Tendance des indicateurs de biodiversité Cartes d abondances relatives et variations d abondances des indicateurs de biodiversité Conclusion et perspectives Bibliographie Comment participer Plus d infos et plus de résultats Illustration 1 ère page : photo du haut Marc Thibault, photo du bas Georges Olioso. CEEP - 1 -

3 Remerciements Ce suivi ne pourrait exister sans la participation de nombreux bénévoles des associations naturalistes de la région et la coordination locale réalisée par certains d entre eux comme Cédric Denis, Matthieu Lascève, Olivier Hameau et Amine Flitti de la LPO-PACA. Nous remercions aussi le CRBPO qui fait vivre ce programme en assurant la coordination nationale et son aide apporté pour l analyse des données. Enfin, nous remercions Guillaume Paulus pour la mise a jour de la page Internet sur le STOC- EPS sur le site du CEEP et Etienne Becker pour la relecture de ce rapport. La coordination régionale de se programme est rendu possible grâce au soutien du Conseil Régional PACA et de la DREAL PACA. CEEP - 2 -

4 1. Introduction Le programme de Suivi Temporel des Oiseaux Communs (STOC) permet d'estimer les variations d'effectifs d'une année à l'autre mais aussi d'estimer les tendances d'évolution des espèces sur le long terme. Chaque année des centaines d'observateurs assurent le suivi de points d'écoute et de station de baguage dans le cadre de ce programme, dont la coordination est assurée par le Centre de Recherches par le Baguage des Populations d'oiseaux (CRBPO), au sein du Muséum National d'histoire Naturelle. Le STOC rentre dans le cadre du programme Vigie nature qui à pour objectif de surveiller l évolution de la biodiversité. Le programme STOC se décompose en deux volets. Le premier est basé sur le baguage des oiseaux sur un site donné pendant plusieurs années de suite (STOC-capture). Le baguage permet d'individualiser les oiseaux et d'obtenir des indices sur le succès de reproduction de chaque espèce, d'estimer la survie des oiseaux et le recrutement au sein d'une station. Le second volet du programme STOC est basé sur des points d'écoute ou échantillonnage ponctuel simple (STOC-EPS). Il permet d'obtenir une évaluation des tendances d'évolution des effectifs pour 175 espèces communes nicheuses en France. Si le programme STOC-capture permet d'obtenir des informations sur la structure des populations d'oiseaux, le STOC-EPS permet d'effectuer des échantillonnages sur un plus grand nombre d'espèces et de sites. Ce dernier est ouvert au plus grand nombre d'observateurs grâce à un protocole simple. Le CEEP a en charge la coordination du programme STOC-EPS pour la région PACA et vous propose ici les résultats régionaux. 2. Participation Depuis 2001, des relevés ont été réalisés au moins une fois sur 102 carrés sur les 6 départements de la région (Figure 1). Le nombre moyen de carrés réalisés en PACA est de 45 avec un minimum de 13 carrés pour 2001 et un maximum de 57 pour 2007 (Figure 2). En 2009, on observe un léger mieux dans la participation des bénévoles par rapport à l an dernier. A cela nous pouvons ajouter les sites suivis avec le même protocole mais adapté à des espaces particuliers (STOC-Site). Ils sont au nombre de 20, dont 17 ont été réalisés cette année (Réserves Naturelles, Parcs Naturels Régionaux et certains sites du CEEP). CEEP - 3 -

5 Figure 1 : Distribution des 102 carrés EPS (en bleu) et 20 STOC-site (en rouge) réalisés au moins une fois de 2001 à Figure 2 : Evolution du nombre de carrés suivis en PACA depuis Méthode d analyse des données 3.1. Variation d abondance Les variations d abondances sont calculées en utilisant les carrés réalisés avec la même pression d observation les deux années consécutives, soit 45 carrés (EPS et Site). Pour chaque carré, nous prenons en compte le nombre maximal d individus contactés par point lors de l un ou l autre des passages. Puis c est la somme des individus par carré qui est utilisée. Le choix des espèces est déterminé arbitrairement par un nombre moyen minimum de 25 individus recensés annuellement et sur au moins cinq carrés par an. CEEP - 4 -

6 3.2. Tendance Tous les carrés réalisés au moins deux années avec la même pression d observation sont utilisés pour le calcul des tendances. Nous avons pris en compte indifféremment les STOC- EPS et les STOC-Site, ainsi nous utilisons 90 sites échantillons pour ces analyses. Comme pour les variations d abondance (cf. 3.1), nous prenons en compte le nombre maximal d individus contactés par point lors de l un ou l autre des passages. Puis c est la somme des individus par carré qui est utilisée. Le choix des espèces est déterminé arbitrairement par un nombre moyen minimum de 25 individus recensés annuellement et sur au moins cinq carrés par an. Au final, il nous est possible d estimer les tendances de 77 espèces pour la région PACA. Pour certaines d entres-elles les tendances sont calculées à partir de 2002 au lieu de Les raisons sont, soit qu elles n étaient pas échantillonnées par absence de carré dans leur aire de distribution au début du suivi, soit que le nombre d individus ou de carrés avec présence de l espèce n étaient pas assez important en Les analyses de tendance ont été réalisées avec le logiciel TRIM 3.53 (Pannekoek & van Strine 2001) Carte d abondance relative La couverture relativement homogène de la région PACA par des carrés STOC-EPS permet d interpoler l abondance des espèces communes à tout le territoire de la région. La mesure de l abondance des espèces est très simple car il s agit de la somme du nombre d individus par carré, comme précédemment (cf. 3.1 et 3.2). Pour optimiser la couverture de la région, nous prenons en compte tous les carrés réalisés au moins une fois depuis Dans le cas où des relevés ont été fait plusieurs années sur un même carré, nous prenons en considération la moyenne annuelle du nombre d individus. A partir de ces valeurs d abondances relatives géoréférencées, nous utilisons des outils de statistiques spatiales pour calculer l abondance relative sur tout le territoire de la région. Nous obtenons ainsi des cartes d abondances relatives par espèce qui permettent de mettre en évidence les bastions des espèces communes. Pour plus de lisibilité des cartes, nous avons choisi seulement cinq classes déterminées par seuils naturels (Jenks). Plus la couleur est foncée plus l espèce est abondante. Mais l espèce n est pas forcément absente des zones les plus claires. Elle peut être présente en faible densité ou non détectée par absence de relevés. 4. Résultats 4.1. Variation et tendance depuis 2001 Le tableau 1 présente les variations d abondance pour 74 espèces et les tendances depuis 2001 pour 77 espèces communes de notre région. La définition des statuts des espèces d après les tendances et la même qu utilisée en Elle correspond à ceux données au niveau national (voir attribution des statuts à la fin du tableau). CEEP - 5 -

7 Tableau 1 : Variation d abondance , tendance d évolution de 2001 à 2009 et statut de 77 espèces communes recensées dans le cadre du programme STOC-EPS en région PACA. Espèces Variation Tendance moyen terme Rousserolle effarvatte Augmentation Mésange à longue queue Stable Statut (*) Alouette des champs Non significatif Perdrix rouge 8-63 Diminution Canard colvert Diminution Pipit rousseline Stable Pipit des arbres Stable Martinet noir Stable Héron cendré Non significatif Héron garde-bœufs Non significatif Linotte mélodieuse Non significatif, Stable Chardonneret élégant Diminution Verdier d'europe 3-29 Stable Grimpereau des jardins -3 1 Stable Bouscarle de Cetti 1-20 Stable Cisticole des joncs Non significatif Pigeon bizet (féral) Non significatif Pigeon ramier Stable Corneille noire -6 7 Stable Choucas des tours 11-9 Non significatif Grand Corbeau Stable Caille des blés Non significatif Coucou gris Stable Hirondelle de fenêtre Diminution Pic épeiche 3-15 Stable Aigrette garzette Non significatif Bruant fou Stable Bruant zizi Non significatif Bruant jaune Stable Bruant ortolan -4-6 Stable Rougegorge famillier Stable Faucon crécerelle Non significatif Pinson des arbres Diminution Foulque macroule Non significatif Cochevis huppé Stable Geai des chênes Stable Hypolaïs polyglotte Stable Hirondelle rustique Non significatif Goéland leucophée Non significatif Bec-croisé des sapins 265 Non évalué Alouette lulu 6 43 Stable Rossignol philomèle 5-13 Stable Guêpier d'europe Augmentation Bruant proyer Non significatif Milan noir Stable Bergeronnette grise 4 41 Stable CEEP - 6 -

8 Suite Tableau 1 : Variation d abondance , tendance d évolution de 2001 à 2009 et statut de 79 espèces communes recensées dans le cadre du programme STOC-EPS en région PACA. Espèces Variation Tendance moyen terme Bergeronnette printanière 0-10 Stable Loriot d'europe Stable Mésange noire Diminution Mésange bleue 6-17 Stable Mésange huppée 0 2 Stable Mésange charbonnière Stable Mésange boréale Non évalué 31 Stable Statut (*) Moineau domestique Non significatif Moineau friquet Non significatif Faisan de Colchide Diminution Rougequeue noir Stable Rougequeue à front blanc Stable Pouillot de Bonelli Stable Pouillot véloce Non significatif Pie bavarde -4 9 Stable Pic vert 3-16 Stable Hirondelle de rocher Non évalué -20 Stable Roitelet à triple bandeau Non évalué 2 Stable Tarier pâtre Diminution Serin cini 2-12 Stable Sitelle torchepots Stable Tourterelle turque Augmentation Tourterelle des bois 4-4 Stable Etourneau sansonnet Non significatif Fauvette à tête noire Diminution Fauvette passerinette Stable Fauvette mélanocéphale Non significatif Fauvette pitchou 8-33 Stable Troglodyte mignon Diminution Merle noir Stable Grive musicienne Non évalué -17 Stable Huppe fasciée Stable (*) Détail de l'attribution des statuts (d après Jiguet 2008) : Déclin : tendance linéaire négative significative (P<0.05) sur le long terme (plus de 10 ans de suivi nécessaire) Diminution : tendance linéaire négative significative (P<0.05) sur le moyen terme ( ) Augmentation : tendance linéaire positive significative (P<0.05) sur le long ou le moyen terme Non significatif : tendance linéaire non significative (P>0.05) Stable : tendance linéaire non significative et pas de variations inter-annuelles significatives. Sur les 77 espèces pour lesquelles nous pouvons donner un statut, 44 apparaissent stables, 20 présentent des tendances non significatives et donc de fortes variations inter-annuelles. Enfin, 3 espèces sont en augmentation et 10 en diminution significatives (Figure 3 et 4). Par rapport aux résultats , la Mésange charbonnière, le Coucou gris, l Alouette lulu, le Pigeon ramier et la Grive draine n apparaissent plus en augmentation significative, mais une autre espèce est ajoutée à cette catégorie : la Rousserolle effarvatte. Part contre, quatre nouvelles espèces rejoignent le groupe d espèces en diminution significative : le Chardonneret élégant, le Pinson des arbres, la Mésange noire et le Faisan. CEEP - 7 -

9 Figure 3 : Evolution de l indice d abondance des 3 espèces en augmentation présentant une tendance significative. Figure 4 et 5 : Evolution de l indice d abondance des 10 espèces en diminution présentant une tendance significative. CEEP - 8 -

10 4.2. Cartes d abondance relative et cartes de variations d abondance Cartes d abondance relative L échantillonnage avec un protocole standardisé sur l ensemble de la région permet d interpoler les abondances relevées à l ensemble du territoire (Figures 6). Il faut cependant être prudent dans la lecture des cartes car la distance entre chaque relevé va influencer la taille des zones de forte ou faible abondance (Figure 1). Ainsi, si la basse Provence est relativement bien couverte par un fort réseau de carrés STOC, les Alpes le sont beaucoup moins. Nous perdons donc de la précision sur la répartition et l abondance réelle des espèces dans cette zone. Nous obtenons tout de même des cartes très intéressantes qui peuvent être mises en relation avec la biologie des espèces et les grands types d habitat de notre région Cartes de variations d abondances Le même type de cartes peut être produit avec le taux de croissance observé par espèce et par carré (taux de croissance = exposant (pente de la régression linéaire)). Ces cartes permettent de localiser les secteurs où une espèce donnée et en augmentation, stable ou en régression (Figure 6). Elles ne sont en aucun cas une mesure de l abondance mais seulement de la tendance locale. Les données prises en compte ici concernent tous les carrés réalisés au moins trois années sur la période Il peut donc y avoir un certain biais entre la tendance sur neuf ans et les observations sur des carrés échantillonnés seulement trois années. Cependant, ces cartes semblent assez révélatrices de ce que l on observe globalement. Un taux de croissance de 1 correspond à la stabilité. Si le taux de croissance est en dessous de 1 l espèce est en diminution. Inversement, s il est au dessus de 1 l espèce est en augmentation. Sur les carte (Figure 6 : b, d, f et h), le rouge foncé signifie que l espèce à un taux de croissance locale compris entre 0 et 0,4 soit en forte diminution. En rouge claire, le taux de croissance est compris entre 0,4 et 0,8 donc en diminution. En jaune le taux de croissance est compris entre 0,8 et 1,2, donc plutôt stable. En bleu claire le taux de croissant est en augmentation de 1,2 à 1,6 et en forte augmentation pour le bleu foncé supérieur à au taux de croissance de 1,6. Dans le cas où l espèce est absente d un carré, la valeur 1 (donc stable) lui est attribué. Légende des cartes de variations d abondances (Taux de croissance) : de 0 à 0,4 : En forte diminution de 0,4 à 0,8 : En diminution de 0,8 à 1,2 : Stable (ou absent) de 1,2 à 1,6 : en augmentation > à 1,6 : en forte augmentation CEEP - 9 -

11 a Pinson des Arbres : Espèce forestière en déclin de 20% depuis 2001, très abondante dans les Alpes (carte a) et principalement en déclin dans les Alpes-Maritimes et les Bouches-du-Rhône (carte b). Elle est par contre en augmentation dans le Var, les Alpes-de-Haute-Provence et le nord du Vaucluse. b c Tourterelle turque : La carte de gauche (c) montre les différents niveaux de densités avec notamment les bastions de l espèce localisés aux côtes urbanisées. La carte de droite (d) montre en bleu les zones où elle est en progression. d e Tarier pâtre : l espèce est en diminution (f) sur son principale bastion (e), l est des Bouches-du-Rhône et du Var, ainsi que sur d autres plus petites zones où il apparaît abondant. f g Hirondelle de fenêtre : Bien quelle apparaît plus abondante dans certaines zones notamment dans les Alpes-Maritimes (g) le déclin est sensible sur une grande proportion de la région (h). Figure 6 : exemples de cartes d abondances relatives et de cartes de variations d abondances (taux de croissance) issues du programme STOC-EPS en PACA. CEEP h

12 5. Les indicateurs de biodiversité 5.1. Tendance des indicateurs de biodiversité Le CRBPO produit 4 indicateurs, regroupant les espèces selon leur spécialisation par rapport à trois grands types d habitat. Ces indicateurs sont ceux des espèces spécialistes des milieux agricoles, espèces spécialistes des milieux forestiers, espèces spécialistes des milieux bâtis et des espèces généralistes. Le degré de spécialisation est calculé à partir de la répartition des effectifs de l espèce dans les trois grands types d habitats, en proportion de leurs disponibilités. Ainsi pour la France 66 espèces sont prises en compte contre 39 pour la région PACA. Le nombre d espèces dans notre région est plus faible, d une part, car notre échantillon est réduit et d autre part, parce que le degré de spécialisation des espèces est différent au niveau régional par rapport au niveau national. En PACA, elles se répartissent de la manière suivante : - Espèces généralistes (9) : Bruant zizi, Pic épeiche, Rossignol philomèle, Mésange charbonnière, Fauvette à tête noire, Huppe fasciée, Pigeon ramier, Serin cini et Merle noir. - Espèces spécialistes des milieux agricoles (14) : Alouette des champs, Perdrix rouge, Linotte mélodieuse, Corneille noire, Choucas des tours, Faucon crécerelle, Cochevis huppé, Guêpier d Europe, Milan noir, Pie bavarde, Etourneau sansonnet, Alouette lulu, Bruant proyer et Tourterelle des bois. - Espèces spécialistes des milieux forestiers (12) : Grimpereau des jardins, Rougegorge familier, Geai des chênes, Faisan de Colchide, Pouillot de Bonelli, Pouillot véloce, Roitelet à triple bandeau, Fauvette passerinette, Troglodyte mignon, Grive musicienne, Pinson des arbres et Fauvette mélanocéphale. - Espèces spécialistes des milieux bâtis (8) : Verdier d Europe, Pigeon biset (féral), Hirondelle de fenêtre, Bergeronnette grise, Moineau domestique, Rougequeue noir, Tourterelle turque et Martinet noir. L'année de référence (indice d'abondance de 1) a été fixée à l'année 2002, car en 2001, année de redémarrage du programme, certaines espèces de ces indicateurs n'ont pas été détectées par manque de relevés. Les analyses statistiques sont réalisées par le CEEP pour PACA. Figure 7 : Evolution de 2001 à 2009 des indicateurs régionaux de biodiversité issus du programme STOC en PACA. CEEP

13 Ainsi, la diminution globale continue encore avec 18% cette année contre 12% en 2008 pour les 82 espèces suivies et prises en compte pour les indicateurs (Figure 7). Tous les indicateurs affichent une baisse depuis Il faut cependant noter que l indicateur des milieux agricoles affiche une nette amélioration depuis 2 ans, passant de 10% en 2007, -6% en 2008 et 2% en L indicateur des milieux bâtis garde la même tendance que l an dernier avec une baisse de 19% en La situation des deux autres indicateurs, espèces généralistes et des milieux forestiers, s aggrave, passant respectivement de 0,2% à 8% et de 1% à 9% cette année. Comme chaque année, nous calculons ces mêmes indicateurs pour la région mais avec les espèces identifiées comme spécialistes au niveau national (Jiguet & Julliard 2006). Ainsi la baisse de l indicateur des espèces spécialistes des milieux agricoles affiche toujours une baisse inquiétante de 46% en seulement 9 ans. La tendance des autres indicateurs est aussi à la baisse. Celui des milieux bâtis se creuse cette année en passant à 24% contre 15% en L indicateur des milieux forestiers reste dans les valeur observées en Enfin, les espèces généralistes sont aussi à la baisse, bien que moins préoccupante (Figure 8). Figure 8 : Evolution de 2001 à 2009 des indicateurs nationaux de biodiversité issus du programme STOC pour PACA Cartes d abondances relatives et variations d abondances des indicateurs de biodiversité Comme pour les espèces, nous pouvons produire des cartes permettant de visualiser les bastions des différents indicateurs de biodiversité par interpolation (Figure 8 : a, d, e et g). Ici, nous prenons en compte le nombre d espèces de chaque indicateur contacté par carré STOC sur le nombre maximum d espèces de l indicateur en question pondéré par le nombre maximum d espèces observées sur le site. Les valeurs retenues pour produire des cartes de variation d abondances des indicateurs sont les moyennes géométriques des taux de croissances des espèces des indicateurs par carré STOC. Nous pouvons ainsi visualiser les zones où ces indicateurs sont en augmentation ou régression (Figure 8 : b, d, f et h) et les comparer à leur «répartition» régionale (Figure 8 : a, d, e et g). CEEP

14 a b Agricole : Les espèces spécialisées des milieux agricoles sont principalement localisées à la vallée du Rhône et dans une moindre mesure au plateau de Valensole (a). Elles sont en régression sur cette première zone mais aussi sur la côte varoise et des Alpes-Maritime (b). c d Bâtis : Il n est pas étonnant de constater que les bastions des espèces des milieux bâtis sont localisés à la côte (c). Par contre, que signifie leur augmentation dans le secteur des Maures et la région de Digne (d)? e f Forestier : Pas de surprise non plus sur le bastion des espèces forestières (e) principalement cantonné aux Alpes. Leur diminution est principalement marquée dans les Bouches-du-Rhône (f), là où elles sont le moins abondantes (e). g h Généraliste : Les généralistes occupent une grande partie du centre de la région (g) et sont en diminution principalement sur l est du Var et du Vaucluse (h). Figure 8 : Cartes d abondance et de variations d abondance (taux de croissance) des quatre indicateurs de biodiversité de PACA. CEEP

15 6. Conclusion et perspectives Grâce à l investissement de nombreux bénévoles un nombre relativement important de carrés est suivi chaque année et permet l estimation de tendances de nombreuses espèces communes de notre région. Bien qu inscrit dans le réseau national, le programme STOC est décliné ici en un véritable observatoire de l avifaune régionale avec des tendances pour plus de 70 espèces. Cependant, il apparaît important de compléter la couverture régionale afin d améliorer le suivi et d avoir une vue d ensemble de notre avifaune. D autre part, l implication dans ce programme de plus en plus de gestionnaires d espaces protégés montre l intérêt de ce suivi. Certains d entre eux bénéficient déjà d un nombre d années de suivi intéressant permettant de comparer leur données à l ensemble du réseau ou de produire des indicateurs propres à leur site. Bibliographie Jiguet F. et Julliard R. (2006). Suivi temporel des oiseaux communs. Bilan du programme STOC pour la France en Ornithos Jiguet F (2008). Les résultats nationaux du programme STOC de 1989 à www2.mnhn.fr/vigie-nature Pannekoek J. and van Strine A. (2001) TRIM 3 Manual (Trends & Indices for Monitoring data). Research paper no Statisitcs Netherlands, Voorburg. Vincent-Martin N. (2006) Suivi temporel des oiseaux communs en PACA, Bilan Rapport CEEP. Vincent-Martin N. (2008) Bilan du programme STOC-EPS en région PACA : tendances, statuts des espèces et les indicateurs de biodiversité pour la période Faune de Provence, Vol Vincent-Martin N. (2009) Bilan du programme STOC-EPS en région PACA : tendance, statuts des espèce et les indicateurs de biodiversité pour la période Rapport CEEP. CEEP

16 Comment participer Pour participer, il suffit de bien connaître les oiseaux de sa région et de contacter le coordinateur régional. L'échantillonnage est réalisé sur un carré de 2 x 2 km où l'observateur réparti 10 points d'observation. Les carrés sont tirés au sort dans un rayon de 10 km autour d'un point fourni par l'observateur (nom de commune). Le tirage aléatoire des sites prospectés est obligatoire pour obtenir une bonne représentativité des différents habitats disponibles. Depuis la relance en 2001 du programme STOC-EPS par le CRBPO ( ), le CEEP ( a pris en main la coordination de ce programme pour la région PACA. Nicolas Vincent-Martin (tél. : ou par mail : ) assure la centralisation des demandes de nouveaux carrés et des données avant leur envoi au CRBPO, ainsi que la synthèse annuelle pour PACA. Télécharger le protocole sur : Ou sur : Télécharger gratuitement le logiciel de saisi sur : Plus d infos et plus de résultats Sur le programme STOC au niveau national : Au niveau régional : CEEP

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