Journée de restitution Labex MILYON 13 janvier 2015

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1 Journée de restitution Labex MILYON 13 janvier 2015 Trimestre Mathematical Biology 2013! SBIP 2013 & Modélisation de la réponse immunitaire

2 SBIP 2013! Systems Biology hpp://mathbio2013.sciencesconf.org/( hpp://sbip2013.sciencesconf.org/( Approach to Infectious Processes mai 2013 Campus de la Doua (INSA) Co-organisation : MiLyon/BioSyL/Ecofect Budget : ( ), dont 65% en missions 100+ participants (+ CO), - région lyonnaise - pays limitrophes - secteur privé BIOMATH SPRING LYON CONFERENCE SBIP 2013 Systems Biology Approach to Infectious Processes May 13-15, 2013 LA ROTONDE, 16 RUE DES ARTS, INSA de LYON Plenary(Speakers(( ( Alain(Barrat((Centre(de(Phys.(Theor.,(Marseille,(France)( Chistophe(Fraser((Imperial(College,(London,(UK)( Ronald(Germain((NIH,(Maryland,(USA)( Michael(Lässig((Univ.(of(Cologne,(Germany)( Yoram(Louzoun((BarMIlan(Univ.,(Ramat(Gan,(Israel)( Jason(McDermoP((Pacific(North.(Nat.(Lab.,(Richland,(USA)( Alan(Perelson((Los(Alamos(NaSonal(Lab.,(USA)( Paul(Sharp((Univ.(of(Edinburgh,(UK)( Adrien(Six((Univ.(Pierre(et(Marie(Curie,(Paris,(France)( Jacky(Snoep((Univ.(of((Stellenbosch,(South(Africa)(( Organizing(CommiPee( (( Hubert( Charles( (BioSyL),( François( Loïc( Cosset( (Ecofect),( Fabien( Crauste( (Milyon), ( Eric( Fleury( (BioSyL),( Olivier( Gandrillon((BioSyL),( Daniel( Kahn((BioSyL),( Jacqueline( Marvel((BioSyL),( Dominique( PonSer((Ecofect),(Sylvie(RicardMBlum((BioSyL)(

3 Provenance des exposants. 9 plenary speakers Thèmes de recherche des! plenary speakers :!! Mathématiques /! Physique /! Epidémiologie /! Biophysique /! Computational Biology /! Biochimie /! Génétique / 14 contributions orales : France (1/2) / Pays-Bas / Suisse / Allemagne / USA / Chili

4 Objectifs :! - Compréhension des mécanismes (moléculaires & cellulaires) de la réponse immunitaire! - Développement de vaccins (enjeux économiques et sociétaux) Contexte :! - Lyon, place forte de la recherche pharmaceutique! - Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI, tutelles : Inserm/CNRS/ENSL/UCBL)! - Sanofi-Pasteur, siège mondial! - Nombreuses PME (Cosmo, AltraBio, Nova Discovery, )! - Forte activité interdisciplinaire (maths-info/bio) : IXXI, BioSyL, Inria

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12 Identifiabilité et Estimation de Paramètres 1e+09 1e+08 1e+07 CD8 T cell count 1e Time (days)

13 Identifiabilité et Estimation de Paramètres 1e+09 1e+08 Dynamique des cellules mémoires # of simulations x Percentage of Memory CD8 T cells 38 days # of simulations 8 x Percentage of Memory CD8 T cells 360 days CD8 T cell count 1e+07 1e Percentage (%) Percentage (%) Time (days)

14 Modèles multi-échelle! de la réponse

15 Modèles multi-échelle! de la réponse CD8

16 Modèles multi-échelle! de la réponse CD8

17 Modèles multi-échelle! de la réponse CD8

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