Disponibilité et exploitation des données cliniques et biologiques en cancérologie : Etat des lieux et perspectives 5 décembre 2014

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1 2 1 Temps d animation scientifique sur des compétences et des outils locaux dans le but de transmettre un savoir-faire sur le site bordelais Disponibilité et exploitation des données cliniques et biologiques en cancérologie : Etat des lieux et perspectives 5 décembre 2014

2 Problématique des BCB en Cancérologie Définition BCB (INCa 2012) Outil de recueil et de gestion de données de patients Comportant des informations administratives, cliniques, biologiques et épidémiologiques À l échelon national 2

3 Bases Clinico-Biologiques en Cancérologie Missions Optimiser à l échelle nationale le recueil, l intégration et l exploitation des données par différentes disciplines de recherche (épidémiologie, fondamentale, transversale, clinique) Etudier pour un grand nombre de cas les relations entre données cliniques, biologiques, thérapeutiques, sociales, démographiques, environnementales Gérer les ressources biologiques 3

4 Appels d offre INCa Réseau CRB Foie (tumeurs du foie) Uro CCR (tumeurs du rein) Melbase (Mélanomes) Mesobank (Mésothéliomes) FR3 LyS (Sd de Lynch, colon rectum) FREGAT (carcinomes oesogastriques) BCB Sarcomes (sarcomes et T. conjonctives) BACAP (Tumeurs du pancréas) BCB Glioblastomes (Glioblastomes) 4

5 Appels d offre INCa Réseau CRB Foie (tumeurs du foie) Bordeaux Uro CCR (tumeurs du rein) Bordeaux Melbase (Mélanomes) Mesobank (Mésothéliomes) FR3 LyS (Sd de Lynch, colon rectum) FREGAT (carcinomes oesogastriques) BCB Sarcomes (sarcomes et T. conjonctives) Bordeaux BACAP (Tumeurs du pancréas) BCB Glioblastomes (Glioblastomes) 5

6 Hétérogénéité des BCB Cancers CRB Foie : biobanque virtuelle annotée pour recherche biologique Melbase : cohorte de patients en phase avancée avec suivi des nouveaux traitements BCB Sarcomes : cohorte de patients traités dans les centres, biobanque annotée, réseaux tumeurs rares, données «omiques» Différences d objectifs, de taille et de couverture 6

7 BCB Cancers : les enjeux (1) Collecte des données et qualité Techniques Dictionnaire de données / modèle de données Codifications internationales Système de base de données Partage via Internet ou non Ethiques et réglementaires CNIL Consentement Anonymisation 7

8 BCB Cancers : les enjeux (2) Gouvernance, partage et exploitation Charte Comité exécutif et comité scientifique Accès et utilisation des données Règles de publications Enjeux financiers et pérennité de la BCB Coût important Sources de financement Liens avec les industriels 8

9 BCB Cancers : les enjeux (3) Intégration de données hétérogènes Caractère multidimensionnel et multisource des données clinico-biologiques problème des données «omiques» Données de prise en charge des patients Partage inter BCB 9

10 Projet BCB Inter SIRIC BCB Cancers : les enjeux (4) Initié par qqs centres et l INCa Objectif : intégrer les nouvelles données moléculaires générées au cours des nouveaux essais thérapeutiques 4 groupes de travail - Ontologie et référentiels - Aspects réglementaires - Solutions informatiques - Orientations stratégiques et questions médico-scientifiques 2 types de cancer retenu - Sarcomes - Sein 10

11 BCB et contexte international Initiatives internationales I2B2 / TransMART Foundation Global Alliance etriks. Le futur : le Big Data Super-ordinateur Watson ASCO CancerLinQ (Consore en France) 11

12 Programme du workshop Besoins cliniques et biologiques actuels Les nouveaux essais cliniques : Antoine Italiano Recherche sur les tumeurs hépatiques : apport de la BCB foie : Paulette Bioulac Structuration des données à la source Données cliniques : Binh Bui Données «omiques» : Macha Nicholski Intégration des données hétérogènes cliniques et biologiques Aspects théoriques : Gayo Diallo Cas d usage : SarcomaBCB : Vianney Jouhet 12