Manuel Qualité Plateforme Transcriptomique

Transcription

1 Manuel Qualité Plateforme Transcriptomique Selonla normeiso 9001 version décembre 2011 Contact : Equipe Génomique Fonctionnelle d Arabidopsis Plateforme Analyse Du Transcriptome Sandrine Balzergue Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) 2 rue Gaston Crémieux CP Evry cedex FRANCE Tel: balzerg@evry.inra.fr

2 La plateforme Transcriptomique, créée en 2003, réalise des projets d étude du transcriptome en collaboration avec des équipes de recherche. Notre mission est de mettre à la disposition de la communauté scientifique le savoir-faire et l expertise d une équipe pluridisciplinaire pour réaliser les expériences et analyser les résultats produits. Des milliers de données sont accessibles via la base de données publique CATdb. Le transfert de données est facilité vers la base de données internationale GEO. Notre Equipe Sandrine Balzergue / Etienne Delannoy CATMA v5 & v6 Ludivine Soubigou-Taconnat Stéphanie Pateyron (mi-temps) Affymetrix Stéphanie Huguet José Caïus (mi-temps) + 2 CDD en moyenne / an RNA seq Nous développons actuellement notre expertise dans l analyse transcriptomique par séquençage à haut débit sur séquenceurs Illumina Roche-NimbleGen - Tiling array Arabidopsis - Puces à façon plantes cultivées En moyenne (CATMA et Affymetrix) 800 hybridations / an 50 projets / an 11 publications / an, IF moyen de 5. La caractérisation et la quantification des différents transcrits d un organisme ou d un tissu donné, dans des conditions déterminées, permettent d'identifier les gènes actifs, de caractériser les mécanismes de régulation d'expression des gènes, de définir ces réseaux ou de découvrir de nouveaux gènes. Selon votre question biologique, nous vous conseillerons au mieux sur la solution technologique la plus pertinente pour y répondre.

3 Accès à la plateforme Mise à disposition d équipement : accès environné ou non Projets en collaboration (à financement propre au laboratoire) Projets en partenariat (ANR, Région, Européen, etc.) Formations des étudiants (écoles doctorales, master Pro et Recherche, écoles d ingénieurs, universités) Nos Technologies CATMA (Complete Arabidopsis Transcriptome MicroArray) Affymetrix (plantes cultivées) NimbleGen (plantes cultivées (puces à façon) et Arabidopsis) RNA seq (en développement) Le déroulement de votre projet Expertise de votre projet transcriptome Conceptiond oligos pour les puces NimbleGen à façon Contrôle qualité et quantification des ARN Marquage des ARN Hybridation, acquisition des résultats bruts Analyses statistiques des résultats Soumission dans 2 bases de données Formation des utilisateurs sur demande Afin de garantir le niveau de qualité des analyses transcriptomes, la plateforme a mis en place un Système de Management de la Qualité selon l'intégralité des exigences de la norme ISO9001:2008.

4 Domaine d application Le système de management de la qualité s applique à toutes les activités de la plateforme transcriptome. Il concerne les 4 technologies proposées sur la plateforme. Nos atouts Aide à l élaboration des projets Analyses statistiques des résultats Aide à l interprétation des données Aide à la rédaction d articles (M&M, figures ) Prise en charge des soumissions dans les bases de données Support Statistique Support bioinformatique Veille technologique Possibilité d accueil des collaborateurs La qualité technique de nos prestations Nos engagements L amélioration de la communication avec nos clients La capacité d offrir une solution complète de l élaboration des projets aux résultats analysés statistiquement

5 Mesure de la satisfaction clients Réalisée grâce à des études de satisfaction ciblées et périodiques. L écoute client s appuie également sur les échanges, les discussions et les rencontres notamment dans le cadre du suivi des projets et également lors des journées utilisateurs. Revue de direction Réagir Planifier Maîtrise de la documentation Le système management qualité s'appuie sur la traçabilité documentaire. Tous les documents du SMQ suivent les règles de création, d'approbation, de mise à jour et de diffusion définies dans la procédure PRO-01 de Gestion documentaire nous permettant de garantir la disponibilité des bons documents au bon endroit. Planification générale Réunions Journées des utilisateurs Métrologie Audits Revues de direction L évaluation périodique du système de management de la qualité par l équipe de direction Vérifier Faire Envoie des enquêtes permet de s assurer qu il demeure pertinent, adéquat et efficace. Les 6 procédures exigées par la norme ISO Audits internes Le suivi et l amélioration du système de management de la qualité de la plateforme sont assurés par la réalisation régulière d audits qualité internes selon la procédure PRO-03 de gestion d audit interne. Non Conformités La détection d un dysfonctionnement ou d un incident (avéré ou potentiel) est gérée selon la procédure PRO-02 de gestion des anomalies et des actions préventives et correctives. Maîtrise des enregistrements Le tableau Inventaire des Enregistrements définit les modes d identification, d utilisation, de classement et d archivage des enregistrements de la plateforme. Hygiène et Sécurité Gestion des compétences Le tableau de Suivi des compétences permet de connaître et d'optimiser les compétences disponibles sur la plateforme. Tout nouvel arrivant reçoit une formation en matière d hygiène et de sécurité dispensé par notre Agent Chargé de la Prévention. La plateforme et ses infrastructures dépendent du bâtiment d'accueil et de ses tutelles : le règlement intérieur et les procédures y sont donc appliqués. L évaluation des risques est retranscrite dans le document de l Outils de Pilotage de la Prévention à l INRA.

6 Notre équipe De gauche à droite et de bas en haut: Claire Lurin Responsable équipe, Directrice de recherche Delphine Gey * CDD Ingénieur Etienne Delannoy Chercheur, Responsable Scientifique Stephanie Huguet Technicienne Eddy Blondet * CDD Ingénieur Sandrine Arribat * CDD Ingénieur Stephanie Pateyron Technicienne (mi-temps) Ludivine Soubigou Assistant ingénieur - RMQ Sandrine Balzergue Responsible technique et projets, Ingénieur José Caius Adjoint technique (mi-temps) * membres ayant quittés la plateforme en 2011