Patrick Cormier/ Robert Bellé Adrien Richard

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1 Ouverture BioTempo TÂCHE 5 : Applications 2. Initiation dans le modèle oursin a: courte présentation de l Unité b: traduction & oursin c: vers un réseau traductionnel Patrick Cormier/ Robert Bellé Adrien Richard

2 -Etudes des principes fondamentaux qui président à la vie de la cellule et au développement de modèles marins (deutérostomiens) : -Origine et scénario évolutif des mécanismes impliqués Evo Devo & Biologie systémique -Recherche translationnelle Retinoic acid Development Evolution M. Schubert Translation Cell cycle Development P. Cormier Erythrocyte Cellular Physiology S. Egée Direction Patrick Cormier Vertebrates Development Evolution S.Mazan Dir. Patrick Cormier Mer & Santé UMR 7150

3 Mer & Santé Activité traductionnelle en Condition physiologique Mol Rep. Dev., 2010 Mol Rep. Dev., 2010 Nuc Aci Res., 2010 Structures Traduction cap-dépendante Biologie systémique (collab. Siegel A, PEPS & ANR ) Régulation traductionelle Transfert Brevet déposé Scénario évolutif PloS One 2009, Dev Biol, 2011 Science, 2006 Équipe TCCD

4 A mrna is not systematically translated stimulation a: courte présentation de l Unité b: traduction & oursin c: vers un réseau traductionnel mrna mrna mrna translational regulation Global synthesis

5 A mrna is not systematically translated stimulation mrna translational regulation mrna mrna Global synthesis Specific synthesis

6 Old players, new concepts Temporal precision and substrate specificity Gene Regulatory Network Cap binding partner trans-acting factor Cis Non coding RNA microrna for macro function cis-acting factor

7 Sphaerechinus granularis sea urchin early development as a model for translation and cell cycle analysis G1 S M 2 cells Global synthesis increases

8 CDK1 G1 S metaphase 2 cells MPF activity first mitotic division in sea urchin Nobel price 2001 (Hartwell, Nurse and Hunt)

9 Sphaerechinus granularis sea urchin early development as a model for translation and cell cycle analysis G1 S M 2 cells Global synthesis increases Protein synthesis inhibitor Post-transcriptional processes Translational and post-translational processes But what about the translational machinery involved?

10 Translation can be regulated at different levels

11 From Sonenberg and Hinnebush, Cell 2009 Translation initiation

12 Sea urchin unfertilized egg fertilization Global synthesis off FRAP/mTOR 4G 4E BP A summary from Cormier et al., 2001, Dev Biol Salaün et al., 2003, Dev Biol Salaün et al., 2004,Exp. Cell Res. Salaün et al., 2005, J. cell Science Oulhen et al., 2007, J. cell Science

13 fertilization Global synthesis on 15 minutes post-fertilization 4G 4E 4G A summary from Cormier et al., 2001, Dev Biol Salaün et al., 2003, Dev Biol Salaün et al., 2004,Exp. Cell Res. Salaün et al., 2005, J. cell Science Oulhen et al., 2007, J. cell Science

14 fertilization mrna translational regulation Cyclin B mrna Cyclin B mrna minutes Post-fertilization Global synthesis A summary from Cormier et al., 2001, Dev Biol Salaün et al., 2003, Dev Biol Salaün et al., 2004,Exp. Cell Res. Salaün et al., 2005, J. cell Science Oulhen et al., 2007, J. cell Science

15 Mer & Santé Translation factors genes in S. purpuratus genome Name other name SPU # function tiling expression data Initiation eif AUG recognition + eif1a eif2alpha eif2beta eif2gamma binds GTP, Met-tRNA; GTPase eif2balpha eif2bbeta eif2bgamma eif2bdelta eif2bepsilon GTP exchange activity on eif eif3a eif3b eif3c eif3d eif3e eif3f eif3g eif3h eif3i eif3j eif3k Int6 TRIP multisubunit complex, binds to 40S ribosome, eif4g, eif1, eif5 eif4a DEAD-box RNA helicase eif4b stimulates helicase eif4h WBSCR stimulates helicase + eif4e1 eif4e2 eif4e3 4E-HP binds to 7mGTP cap, eif4g + eif4g binds to eif4e, eif4a, eif3, PABP eif stimulates eif2 GTPase + eif5b ribosome junction, GTPase + Elongation eef1a delivery of aa-trna, GTPase + eef1balpha eef1bdelta eef1bgamma Translation factors genes in sea urchin GTP exchange activity on eef1a + eef peptidyl-trna translocation, GTPase Terminaison erf recognizes STOP codon erf stimulates erf1, GTPase + a: courte présentation de l Unité b: traduction & oursin c: vers un réseau traductionnel Une machinerie De traduction Complexe Mais identifiée Adapted from Morales et al., Dev Biol. 2006

16 Ouverture BioTempo TÂCHE 5 : Applications 2. Initiation dans le modèle oursin a: courte présentation de l Unité b: traduction & oursin c: vers un réseau traductionnel Adrien Richard

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