OntoNeuroLOG : une ontologie modulaire et multi-niveaux pour gérer l hétérogénéité sémantique des métadonnées
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- Stéphane Ménard
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1 OntoNeuroLOG : une ontologie modulaire et multi-niveaux pour gérer l hétérogénéité sémantique des métadonnées Lynda TEMAL a, Pascal LANDO b, Michel DOJAT c, Frédéric Fürst b, Bernard GIBAUD a, Gilles KASSEL b, and Anne LAPUJADE b a Unité/Projet VisAGeS U746, INSERM/INRIA/CNRS/Université de Rennes 1, Rennes b LaRIA, CNRS (FRE 2733), Université de Jules Verne, Picardie, Amiens c INSERM U836, Grenoble 03 juillet 2007 L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
2 Contexte Le Domaine de la Neuroimagerie Contexte L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
3 Contexte Le Domaine de la Neuroimagerie Exemples de données en Neuroimagerie Imagerie Morphologique IRM L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
4 Contexte Le Domaine de la Neuroimagerie Exemples de données en Neuroimagerie Imagerie Morphologique Segmentation de l hippocampe dans une image IRM L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
5 Contexte Le Domaine de la Neuroimagerie Exemples de données en Neuroimagerie Imagerie Morphologique La Matière Grise La Matière Blanche L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
6 Contexte Le Domaine de la Neuroimagerie Exemples de données en Neuroimagerie Imagerie Fonctionnelle MEG Image Reconstruite Données Non-Reconstruites L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
7 Contexte Le Domaine de la Neuroimagerie Exemples de données en Neuroimagerie Imagerie Fonctionelle Image TEMP fusion IRM et TEMP L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
8 Contexte Le Projet NeuroLOG Motivations Générales Optimiser le travail collaboratif en neuroimagerie, via le partage de données et des outils de traitement d images Intégrer des applications cibles : AVC, SEP, Épilepsie, Maladie d Alzheimer, suivi évolutif de tumeur dans le but de : Disposer de cohortes à grande échelle Réutiliser les outils de traitement d images Valider les nouveaux outils de traitement Accéder à des données de validation Comparer des outils de traitement existants L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
9 Contexte Le Projet NeuroLOG Référentiel Sémantique Commun Application Application Application Approche Ontologique Modèle Sémantique commun adaptateur adaptateur adaptateur Site #1 Site #2 Site #n Données Données Données Outils Traitement Outils Traitement Outils Traitement L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
10 Objectifs Contexte Le Projet NeuroLOG Intégration de données hétérogènes, brutes ou traitées contexte d acquisition (équipement, protocole d acquisition,... ) format d encodage des données (DICOM, Analyze, GIS,...) dimensionalité des images (3D, 2D) contenu selon l entité explorée (anatomique, fonctionnelle,...) contenu selon le traitement utilisé (segmentation, reconstruction... ) régions d intérêt et leur annotations Interopérabilité des outils de traitement statut : isolé ou en pipeline sémantique du type de traitement (e.g. segmentation, recalage) données acceptées en entrée (e.g. reconstruites, segmentées) données fournies en résultat (e.g. masque du cerveau, champ de déformation) conditions d utilisation (paramétrage, ressources logicielles ) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
11 Objectifs Contexte Le Projet NeuroLOG Intégration de données hétérogènes, brutes ou traitées contexte d acquisition (équipement, protocole d acquisition,... ) format d encodage des données (DICOM, Analyze, GIS,...) dimensionalité des images (3D, 2D) contenu selon l entité explorée (anatomique, fonctionnelle,...) contenu selon le traitement utilisé (segmentation, reconstruction... ) régions d intérêt et leur annotations Interopérabilité des outils de traitement statut : isolé ou en pipeline sémantique du type de traitement (e.g. segmentation, recalage) données acceptées en entrée (e.g. reconstruites, segmentées) données fournies en résultat (e.g. masque du cerveau, champ de déformation) conditions d utilisation (paramétrage, ressources logicielles ) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
12 Méthodes Contexte Le Projet NeuroLOG Principes de base Modularité Réutilisation des composants existants Ontologie Fondationnelle Ontologies Noyaux Méthodologie ONTOSPEC Approche semi-informelle Facile à traduire en OWL L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
13 Méthodes Contexte Le Projet NeuroLOG Principes de base Modularité Réutilisation des composants existants Ontologie Fondationnelle Ontologies Noyaux Méthodologie ONTOSPEC Approche semi-informelle Facile à traduire en OWL L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
14 Cadre de travail OntoNeuroLOG Architecture modulaire multi-niveaux L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
15 Cadre de travail OntoNeuroLOG Cadre de Référence Ontologique L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
16 Cadre de travail DOLCE Ontologie des Particuliers (DOLCE) Particular L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
17 Cadre de travail DOLCE Ontologie des Particuliers (DOLCE) Particular Endurant L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
18 Cadre de travail DOLCE Ontologie des Particuliers (DOLCE) Particular Endurant Perdurant L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
19 Cadre de travail DOLCE Ontologie des Particuliers (DOLCE) Particular Endurant Perdurant participates in L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
20 Cadre de travail DOLCE Ontologie des Particuliers (DOLCE) Particular Endurant Perdurant Quality L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
21 Cadre de travail DOLCE Ontologie des Particuliers (DOLCE) Particular Endurant Perdurant Quality inherent in inherent in L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
22 Cadre de travail DOLCE Ontologie des Particuliers (DOLCE) Particular Endurant Perdurant Quality Abstract has for quale L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
23 Cadre de travail DOLCE Ontologie des Particuliers (DOLCE) Particular Endurant Perdurant Quality Abstract Physical Object Non-Physical Object L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
24 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Non-Physical Object L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
25 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Non-Physical Object Inscription L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
26 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Non-Physical Object Written text Inscription Image L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
27 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Inscription Expression Non-Physical Object Written text Image L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
28 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Inscription Expression Non-Physical Object Written text Image Linguistic Expression Formal Expression L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
29 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Non-Physical Object Inscription Expression Conceptualization Written text Image Linguistic Expression Formal Expression L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
30 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Non-Physical Object Inscription Expression Conceptualization Written text Image Linguistic Expression Formal Expression Proposition L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
31 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Non-Physical Object Inscription Expression Conceptualization Written text Image Linguistic Concept Expression Formal Proposition Expression L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
32 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Non-Physical Object Inscription Expression Conceptualization expressed by L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
33 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Non-Physical Object Inscription Expression Conceptualization realized by expressed by L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
34 Cadre de travail I&DA Ontologie des Documents (I&DA) Endurant Physical Object Non-Physical Object Inscription Expression Conceptualization realized by expressed by physically realized by L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
35 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Proposition L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
36 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Proposition Meta-Data Set Values L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
37 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Proposition Meta-Data Set Values part of part of L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
38 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Proposition Acquired CT MRI MEEG PET Datas et SPECT L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
39 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Expression Proposition Expression Acquired CT MRI MEEG PET Datas et SPECT L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
40 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Expression Proposition Expression Acquired GIS Expression DICOM Expression Analyze Expression CT MRI MEEG PET Datas et SPECT L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
41 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Inscription Expression Proposition Image Expression Acquired GIS Expression DICOM Expression Analyze Expression CT MRI MEEG PET Datas et SPECT L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
42 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Inscription Expression Proposition Image Expression 2D Image Black&White Image 3D Image GIS Expression Color Image DICOM Expression Analyze Expression CT MRI Acquired MEEG PET Datas et SPECT L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
43 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Inscription Expression Proposition File Image Expression 2D Image Black&White Image 3D Image GIS Expression Color Image DICOM Expression Analyze Expression CT MRI Acquired MEEG PET Datas et SPECT L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
44 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Inscription Expression Proposition File Image Expression GIS File Analyze File DICOM File 2D Image Black&White Image 3D Image Color Image GIS Expression DICOM Expression Analyze Expression CT MRI Acquired MEEG PET Datas et SPECT L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
45 OntoNeuroLOG l Ontologie des s Inscription Expression Proposition File Image Expression GIS File Analyze File DICOM File 2D Image Black&White Image 3D Image Color Image GIS Expression DICOM Expression Analyze Expression CT MRI Acquired MEEG PET Datas et SPECT L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
46 OntoNeuroLOG Catégories de s Premier axe Sémantique Les s sont spécialisés selon les équipements utilisés pour leur acquisition (isacquiredwith) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
47 OntoNeuroLOG Catégories de s Premier axe Sémantique Les s sont spécialisés selon les équipements utilisés pour leur acquisition (isacquiredwith) Second axe Sémantique Les s sont spécialisés selon les traitements dont ils sont le résultat (isresultof) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
48 OntoNeuroLOG Catégories de s Premier axe Sémantique Les s sont spécialisés selon les équipements utilisés pour leur acquisition (isacquiredwith) Second axe Sémantique Les s sont spécialisés selon les traitements dont ils sont le résultat (isresultof) Troisième axe Sémantique Les s sont spécialisés selon la structure ou la fonction du cerveau explorée (explores) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
49 OntoNeuroLOG Catégories de s L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
50 OntoNeuroLOG Catégories de s Acquired CT MRI MEEG PET SPECT L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
51 OntoNeuroLOG Catégories de s Acquired Non-Reconstructed Reconstructed L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
52 OntoNeuroLOG Catégories de s Acquired Registration Non-Reconstructed Reconstructed Template Segmentation Statistical Parametric L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
53 OntoNeuroLOG Catégories de s Anatomical Functional Vascular Metabolic Acquired Registration Non-Reconstructed Reconstructed Template Segmentation Statistical Parametric L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
54 Traitements et outils de traitements d images Notions de traitement et outil Traitement/outils De nombreux traitements (actions) peuvent être appliqués aux images concernées. Exemples : segmentation recalage etc. L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
55 Traitements et outils de traitements d images Notions de traitement et outil Traitement/outils De nombreux traitements (actions) peuvent être appliqués aux images concernées. Exemples : segmentation recalage etc. L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
56 Traitements et outils de traitements d images Notions de traitement et outil Traitement/outils De nombreux traitements (actions) peuvent être appliqués aux images concernées. Exemples : segmentation recalage etc. L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
57 Traitements et outils de traitements d images Notions de traitement et outil Traitement/outils De nombreux traitements (actions) peuvent être appliqués aux images concernées. Exemples : segmentation recalage etc. Outils et traitements associés À chaque traitement correspond un certain nombre d outils, dont la fonction est de permettre de réaliser le traitement. L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
58 Traitements et outils de traitements d images Notions de traitement et outil Des ressources de nature hétérogène Les outils de traitement d images médicales constituent des ressources très hétérogènes : programmes logiciels pipelines L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
59 Traitements et outils de traitements d images Notions de traitement et outil Des ressources de nature hétérogène Les outils de traitement d images médicales constituent des ressources très hétérogènes : programmes logiciels pipelines L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
60 Traitements et outils de traitements d images Notions de traitement et outil Des ressources de nature hétérogène Les outils de traitement d images médicales constituent des ressources très hétérogènes : programmes logiciels pipelines L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
61 Traitements et outils de traitements d images Notions de traitement et outil Des ressources de nature hétérogène Les outils de traitement d images médicales constituent des ressources très hétérogènes : programmes logiciels pipelines Un besoin... Pouvoir modéliser tous ces outils (même si leur type n est pas connu a priori) ainsi que leurs entrées/sorties. L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
62 Traitements et outils de traitements d images COPS COPS : une ontologie noyau des programmes et logiciels COPS : Core Ontology of Programs and Software L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
63 Traitements et outils de traitements d images COPS COPS : une ontologie noyau des programmes et logiciels COPS : Core Ontology of Programs and Software Ontologie noyau des programmes et logiciels informatiques L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
64 Traitements et outils de traitements d images COPS COPS : une ontologie noyau des programmes et logiciels COPS : Core Ontology of Programs and Software Ontologie noyau des programmes et logiciels informatiques Étend l ontologie I&DA développée au LaRIA L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
65 Traitements et outils de traitements d images COPS COPS : une ontologie noyau des programmes et logiciels COPS : Core Ontology of Programs and Software Ontologie noyau des programmes et logiciels informatiques Étend l ontologie I&DA développée au LaRIA Plusieurs manifestations de l ontologie : semi-informelle (OntoSpec) et formelle (OWL) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
66 Traitements et outils de traitements d images Haut niveau de COPS COPS L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
67 Traitements et outils de traitements d images COPS Intérêt de l utilisation de COPS COPS permet : la description des traitements et outils de traitement d images à l aide d un vocabulaire défini sur la base de primitives de haut niveau (DOLCE, I&DA) : création d une sous-ontologie des traitements d images et outils de traitement d images L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
68 Traitements et outils de traitements d images COPS Intérêt de l utilisation de COPS COPS permet : la description des traitements et outils de traitement d images à l aide d un vocabulaire défini sur la base de primitives de haut niveau (DOLCE, I&DA) : création d une sous-ontologie des traitements d images et outils de traitement d images la description des outils selon leur aspect fonctionnel syntaxique L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
69 Traitements et outils de traitements d images COPS Intérêt de l utilisation de COPS COPS permet : la description des traitements et outils de traitement d images à l aide d un vocabulaire défini sur la base de primitives de haut niveau (DOLCE, I&DA) : création d une sous-ontologie des traitements d images et outils de traitement d images la description des outils selon leur aspect fonctionnel syntaxique L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
70 Traitements et outils de traitements d images COPS Intérêt de l utilisation de COPS COPS permet : la description des traitements et outils de traitement d images à l aide d un vocabulaire défini sur la base de primitives de haut niveau (DOLCE, I&DA) : création d une sous-ontologie des traitements d images et outils de traitement d images la description des outils selon leur aspect fonctionnel syntaxique Démarche de réutilisation d ontologies... OntoNeuroLOG spécialise COPS L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
71 Traitements et outils de traitements d images COPS Sous-ontologie des programmes (1) Taxinomie déterminée par l aspect fonctionnel des programmes L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
72 Traitements et outils de traitements d images COPS Sous-ontologie des programmes (1) Taxinomie déterminée par l aspect fonctionnel des programmes On parle de programme uniquement pour les expressions de langages Turing-complets L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
73 Traitements et outils de traitements d images COPS Sous-ontologie des programmes (1) Taxinomie déterminée par l aspect fonctionnel des programmes On parle de programme uniquement pour les expressions de langages Turing-complets Programme Un programme est une expression en langage Turing-complet susceptible d être exécutée par une machine physique ou virtuelle, éventuellement après traduction. L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
74 Traitements et outils de traitements d images COPS Sous-ontologie des programmes (2) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
75 Traitements et outils de traitements d images COPS Sous-ontologie des logiciels et plate-formes (1) Introduction de la notion de Library of Programs (collection) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
76 Traitements et outils de traitements d images COPS Sous-ontologie des logiciels et plate-formes (1) Introduction de la notion de Library of Programs (collection) Logiciel Un logiciel est un artefact de computation et une librairie de programmes, comportant au moins un programme exécutable ou interprétable. L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
77 Traitements et outils de traitements d images COPS Sous-ontologie des logiciels et plate-formes (2) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
78 Architecture logicielle pour la recherche sémantique Identification des besoins Besoins fonctionnels de l application Recherche sémantique d images et d outils de traitement d images, notamment à l aide de métadonnées sur les images et outils L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
79 Architecture logicielle pour la recherche sémantique Identification des besoins Besoins fonctionnels de l application Recherche sémantique d images et d outils de traitement d images, notamment à l aide de métadonnées sur les images et outils Interface de travail intuitive, avec guidage ontologique L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
80 Architecture logicielle pour la recherche sémantique Identification des besoins Besoins fonctionnels de l application Recherche sémantique d images et d outils de traitement d images, notamment à l aide de métadonnées sur les images et outils Interface de travail intuitive, avec guidage ontologique Présentation des résultats et lien avec d autres composants logiciels L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
81 Architecture logicielle pour la recherche sémantique Architecture proposée Technologies utilisées Data Federator, pour l intégration des sources de données METAmorphose, outil de conversion DB RDF Moteur de recherche sémantique Corese (Acacia) Librairie SeWeSe (interface, présentation des résultats... ) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
82 Architecture logicielle pour la recherche sémantique Architecture proposée Technologies utilisées Data Federator, pour l intégration des sources de données METAmorphose, outil de conversion DB RDF Moteur de recherche sémantique Corese (Acacia) Librairie SeWeSe (interface, présentation des résultats... ) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
83 Architecture logicielle pour la recherche sémantique Architecture proposée Technologies utilisées Data Federator, pour l intégration des sources de données METAmorphose, outil de conversion DB RDF Moteur de recherche sémantique Corese (Acacia) Librairie SeWeSe (interface, présentation des résultats... ) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
84 Architecture logicielle pour la recherche sémantique Architecture proposée Technologies utilisées Data Federator, pour l intégration des sources de données METAmorphose, outil de conversion DB RDF Moteur de recherche sémantique Corese (Acacia) Librairie SeWeSe (interface, présentation des résultats... ) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
85 Architecture logicielle pour la recherche sémantique Architecture proposée Présentation générale de l architecture L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
86 Conclusion et perspectives Conclusion Proposition d une modélisation permettant de modéliser des objets complexes et hétérogènes (images, traitements d images, outils... ) à différents niveaux d abstraction Ontologie modulaire multi-niveaux Ontologie structurée à l aide d une ontologie de haut niveau (DOLCE) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
87 Conclusion et perspectives Conclusion Proposition d une modélisation permettant de modéliser des objets complexes et hétérogènes (images, traitements d images, outils... ) à différents niveaux d abstraction Ontologie modulaire multi-niveaux Ontologie structurée à l aide d une ontologie de haut niveau (DOLCE) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
88 Conclusion et perspectives Conclusion Proposition d une modélisation permettant de modéliser des objets complexes et hétérogènes (images, traitements d images, outils... ) à différents niveaux d abstraction Ontologie modulaire multi-niveaux Ontologie structurée à l aide d une ontologie de haut niveau (DOLCE) L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
89 Conclusion et perspectives Perspectives Compléter et étendre les ontologies du projet Ajouter des fonctionnalités au prototype logiciel et l évaluer en situation Adresser les problèmes de passage à l échelle L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
90 Conclusion et perspectives Perspectives Compléter et étendre les ontologies du projet Ajouter des fonctionnalités au prototype logiciel et l évaluer en situation Adresser les problèmes de passage à l échelle L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
91 Conclusion et perspectives Perspectives Compléter et étendre les ontologies du projet Ajouter des fonctionnalités au prototype logiciel et l évaluer en situation Adresser les problèmes de passage à l échelle L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
92 Conclusion et perspectives Références bibliographiques Lando P., Lapujade A., Kassel G., Fürst F. Towards a General Ontology of Computer Programs. À paraître dans les actes de la conférence ICSOFT 2007 : Second International Conference on Software and Data Technologies, Barcelone, Espagne, juillet Lando P., Fürst F., Kassel K., Lapujade A.. Premiers pas vers une ontologie générale des programmes informatiques. À paraître dans les actes de la conférence IC 2007 : Ingénierie des connaissances, Grenoble, 2-6 juillet Témal L., Lando P., Gibaud B., Dojat M., Kassel G., Lapujade A. OntoNeuroBase : a Multi-Layered Application Ontology in Neuroimaging. Second Workshop FOMI : Formal Ontologies Meet Industry, Trento, Italy, L.TEMAL, P.LANDO et al. (VisAGeS) OntoNeuroLOG 03/07/ / 30
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Alban Gaignard Docteur Ingénieur Données numériques et connaissances 1 rue Fontana 06200 Nice - France H (+33)6 89 44 49 91 B alban.gaignard@cnrs.fr Né le 8 juillet 1980 à Rennes, en couple, 2 enfants.
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