Spécialiste en biologie moléculaire, votre partenaire de l extraction à l amplification

Dimension: px
Commencer à balayer dès la page:

Download "Spécialiste en biologie moléculaire, votre partenaire de l extraction à l amplification"

Transcription

1 Spécialiste en biologie moléculaire, votre partenaire de l extraction à l amplification CATALOGUE HOSPITALIER

2 Sommaire Extraction p 6 Maxwell 16 IVD instrument, extraction petits volumes p 7 Extraction manuelle p 13 HSM 2.0 Instrument, extraction grands volumes p 14 Quantification p 16 Analyse STR p 20 Focus épigénétique p 26 Amplification (Coffrets - Mix) p 28 Identification (Spectrométrie de Masse) p 36 Recherche Translationnelle p 38 Démarche Promega p 40 Services p 40 Centre de formation PETAL p 41 Site Feynman Center cgmp p 42 Développement durable p 43 Les produits sont identifiés CE IVD s ils bénéficient du marquage CE IVD (Conformité Européenne pour le Diagnostic In Vitro) ou RUO (Research Use Only) s'ils sont utilisés en recherche uniquement.

3 Promega, des solutions automatisées et ciblées pour répondre aux besoins des laboratoires hospitaliers Les progrès en biologie moléculaire ces dernières années ont permis l émergence de découvertes médicales extraordinaires dans des domaines tels que les maladies rares, la cancérologie, les maladies infectieuses... En plus des nouvelles armes thérapeutiques en cours de développement (biomédicaments), les techniques de biologie molécu laire permettent également d étudier les pathologies au niveau moléculaire d un point de vue génétique humaine, comme la détection de mutations. Le facteur pronostic, basé sur une caractérisation moléculaire des maladies, devient un élément fondamental dans la prise en charge du patient. L émergence d une méde cine personnalisée est désormais possible. Des techniques universelles, telles que la PCR largement utilisée en recherche, sont désormais routinières dans de nombreux laboratoires hospitaliers. Les tests de biologie moléculaire ouvrent ainsi la voie à une biologie nouvelle et trouvent leur place dans le paysage de la biologie hospitalière. 3

4 Avec plus de 30 ans d existence, Promega est présent dans le monde avec 14 filiales et 50 distributeurs. Il se positionne comme un acteur incontournable en biologie moléculaire. Détenteur de plus de 500 brevets pour la conception de réactifs, notamment dans les domaines de la génomique, de la protéomique, de l identification génétique humaine, Promega contribue aux travaux de la communauté scientifique internationale. 4

5 Promega, une solide expertise en biologie moléculaire Plus qu un spécialiste, un partenaire Promega a développé une expertise et un savoir-faire dans des domaines variés tels que la recherche fondamentale, la biologie clinique, le screening de molécules à visée thérapeutique ou la médecine légale. Ses produits sont cités au travers de milliers de publications scientifiques et médicales parmi lesquelles Oncology, Science, Nature. Promega développe des solutions automatisées et ciblées à destination des laboratoires hospitaliers : services de génétique (oncogénétique, cytogénétique ), HLA, immunologie, hématologie, oncologie, anatomopathologie, infectiologie. Promega vous accompagne ainsi depuis l extraction (automatisée ou manuelle) jusqu à l amplification. Un service de qualité optimale Un marquage CE IVD ou RUO selon les produits Des normes ISO 9001 et ISO Un SAV de qualité et de proximité Une plateforme technique à votre écoute (Hotline - Messenger) Des délais et des conditions de livraison optimaux (respect de la chaîne du froid) Un laboratoire d application disponible pour suivre, tester des produits, réaliser des formations (Lyon) Un site industriel classé cgmp pour la production de produits réglementés pour l'industrie pharmaceutique ou l'industrie du diagnostic 5

6 Extraction Promega offre des solutions automatisées dans le but de répondre aux besoins de standardisation des méthodes et d'optimisation des flux de laboratoires. De la microbiopsie au grand volume de sang (10 ml), Maxwell 16 IVD System et HSM 2.0 Instrument permettent d extraire ADN ou ARN en toute confiance.

7 Maxwell 16 IVD System (CE IVD) Extraction automatisée de petits volumes Rapidité Extraction automatisée de 1 à 16 échantillons en minutes. Facilité d utilisation Des cartouches pré-remplies adaptées à un large panel d échantillons Moins de traitements en amont Traçabilité Un lecteur de code barres pour le suivi des échantillons et des runs Fiabilité Absence de contamination croisée Lampe UV pour la décontamination Procédé unique de déplacement de billes magnétiques, sans pipetage de liquides Extraction à partir d'un large panel d échantillons ADN génomique Sang total / Buffy coat Tissus frais/congelés FFPE Cellule Salive Ecouvillons Fluides corporels Protocoles pré-enregistrés et faciles d'utilisation Un écran tactile Exportation des données vers un PC A reproductibilité assurée : aucune variation d'un run à l'autre Service de maintenance préventive pour garantir le fonctionnement optimal du système ARN total Sang total / Buffy coat Cellules Tissus ADN/ARN de virus Plasma Sérum Ecouvillons AS3050 Gagnez 6 fois plus de temps dans vos extractions! Temps utilisateur 90 min. 15 min. Optimisation des coûts : réduisez de 50% vos dépenses en extractions * Coût des extractions 22,5 E 11,5 E -50% Colonnes (manuel) Cartouches (automate) Colonnes Cartouches (manuel) (automate) * Coût global = prix du réactif + temps technicien 7

8 Hématologie / Oncologie / Génétique Extraction d'arn à partir de prélèvements de sang, cellules et tissus La qualité de l ARN extrait d un prélèvement est primordiale pour la recherche de mutations génétiques impliquées dans les cancers ou les maladies héréditaires. Trois kits Maxwel 16 dédiés à l extraction d ARN à partir de sang (EDTA et Paxgene), cellules ou tissus sont désormais disponibles et offrent une solution rapide et efficace. Grâce au traitement à la DNase inclus dans la cartouche, l ARN obtenu est quasi exempt d ADN (<0,017%). Des concentrations élevées en ARN Moins de contamination par l'adn RNA RNA (ng/ul (ng/ul per per ml blood ml blood input) input) by Absorbance by Absorbance Donneur 1 simply RNA Donneur Blood 2 Donneur 3 simply Concentration Donneur RNA Blood 1 normalisée Marque Donneur Q RNA Blood par 2 ml Mini de sang Donneur (ng/µl) 3 onneur 2 Donneur Concentration 3 Marque Q RNA Blood Mini normalisée par ml de sang (ng/µl) isée par ml de sang (ng/µl) Donneur 3 ng (ng/µl) Average Cq (n=3) Maxwell 16/simply RNA Q TRIzol-Manual simply RNA Blood 15 Marque simply Q RNA RNA Blood Blood Mini 10 Marque Q RNA Blood Mini 17 18,1 18, ,7 20, Faible contamination par l ADN génomique 24, HEK 293 Cells 27,8 27,8 25, ,6 24,6 27, No RT 6,5 à 9 Ct de moins sur ces réactions correspondent à une contamination en ADN génomique 90 à 500 fois plus élevée 10027MA Rendement d extraction d ARN sur 10 millions de cellules N échantillon Rendement extraction en ng Ratio A260/A280 concentration en ng.µl-1 volume d'élution en µl , , , , , , , , , , , , , , , , L'automate Maxwell nous permet d'extraire simultanément jusqu'à 16 ARN en 1 heure environ. Ceci représente un gain de temps considérable en comparaison de notre ancienne technique manuelle. Ainsi à partir de culots secs de 10M de cellules nous obtenons des ARN de quantité et de qualité adéquates pour nos techniques de qpcr. Dr O. K. Laboratoire d'hématologie Moléculaire, APHP 8

9 Anatomopathologie Extraction d'adn à partir de tissus inclus en paraffine Promega propose une solution automatisée d extraction d ADN à partir de tissus inclus en paraffine. L association du Maxwel 16 et du kit Maxwel LEV FFPE offre une solution complète aux laboratoires d Anatomopathologie et d Oncologie, permettant une extraction en 30 minutes sans étape de déparaffinage au préalable. Cette solution permet de s affranchir des contraintes liées à l extraction manuelle, technique longue et fastidieuse nécessitant souvent l utilisation de solvants toxiques. Les laboratoires augmentent ainsi en rapidité et en efficacité pour le rendu d analyses. 200bp 100bp pur 1/5 1/10 Trois dilutions (pur, 1/5, 1/10) de l ADN extrait à partir d une coupe d adénocarcinome colique macrodisséquée qui est amplifiée par PCR multiplexe ciblant les exons 11 et 13 du gène KIT (respectivement 150 et 116bp) et l exon 15 du gène BRAF (173bp). AS3050 Kit Maxwell 16 FFPE Plus LEV DNA Purification Nous utilisons l extracteur Maxwell pour extraire l ADN à partir de coupes de tissus inclus en paraffine. L augmentation du nombre d échantillons traités nécessitait d automatiser l étape d extraction pour réduire les risques d erreurs liés à la manipulation des échantillons et pour gagner du temps. La qualité des éluats issus du Maxwell a réduit le nombre d échec d amplification surtout pour les petites biopsies. Dr C. L.M. Laboratoire de Génétique Moléculaire Plateforme de Génétique Moléculaire des Cancers (INCa) de Brest 9

10 HLA / Transplantation / Immunologie Des extractions sécurisées pour des résultats reproductibles Pourquoi le Maxwell est la solution des laboratoires HLA? Une solution automatisée qui remplace les méthodes d extraction d ADN sur colonne, consommatrices de temps et sujettes aux erreurs de manipulation. Le nombre de transplantations d organes et de moelle osseuse augmente. Les laboratoires HLA sont amenés à travailler plus vite. Le Maxwell apporte un gain de temps considérable dans le typage HLA pour la recherche de donneurs compatibles. Il donne des résultats reproductibles et des rendements élevés. Le risque d erreur est également réduit du fait d'une simplification des manipulations rendant l automate facilement accessible. Nous cherchions justement un véritable automate d extraction des acides nucléiques. Une partie des manipulations nécessitait l intervention d une technicienne, et seuls six échantillons pouvaient être traités à la fois. Désormais en 40 min. environ, ce sont jusqu à 16 échantillons qui sont préparés. Le Maxwell 16 nous a donc permis de libérer du temps technicien, il se révèle particulièrement utile pour les grandes séries. Laboratoires HLA EFS Rhône-Alpes Rendement (µg) Sang Buffy Coat (2,5 ml) Echantillon 6691MC Publications 1. Effects of infectious mononucleosis and HLA-DRB1*15 in multiple sclerosis. TR. Nielsen, K. Rostgaard, J. Askling, R. Steffensen, A. Oturai, C. Jersild, N. Koch-Henriksen, PS. Sørensen, and H. Hjalgrim. Multiple Sclerosis, Apr 2009; 15: IL-17 Is Necessary for Host Protection against Acute-Phase Trypanosoma cruzi Infection. Yoshiyuki Miyazaki, Shinjiro Hamano, Seng Wang, Yohei Shimanoe, Yoichiro Iwakura, and Hiroki Yoshida. J. Immunol., Jul 2010; 185:

11 Virologie Pourquoi le Maxwell est la solution des laboratoires de virologie? L automate Maxwell 16 permet de répondre à des besoins urgents, tout en garantissant la qualité optimale des acides nucléiques extraits. Ce système d'une grande fiabilité donne des résultats reproductibles d un run à l autre. Sa lampe UV et son procédé unique de déplacements de billes magnétiques, sans avoir recours à l'aspiration de liquide, assurent l absence de contamination croisée et préserve la sécurité des utilisateurs. Le risque d erreur est réduit du fait de la simplification des manipulations. Virus Acides Nucléiques Type d'échantillons Applications Influenza (Flu) ARN Sécrétions Nasales (M4 media) RT PCR classique (CDC 5 primer set) Respiratory virus panel ARN Sécrétions Nasales / NP / BAI Luminex RV Hepatis C Virus (HCV) ARN Plasma Genotypage HCV (Siemens) Adenovirus ADN Sécrétions QuantiTect Virus (Qiagen) Human Immunodeficiency Virus (HIV) ARN Plasma PCR classique Cyto megalovirus (CMV) ADN Plasma PCR en temps réel (Roche Hvb-probe), Artus (Qiagen) Herpes Simplex Virus (SHV) ADN Sécrétions PCR classique HPV ADN Sécrétions Third Wave Invader Extraction personnalisée selon les virus. Validation de l extraction d une large gamme de virus avec le Maxwell 16 Viral Total nucleic acid purification kit. Cette solution a été adoptée par de nombreux biologistes qui souhaitent détecter des infections grippales, des infections du système nerveux (ex. CMV, VIH), des infections respiratoires (adénovirus), des infections du tractus génital (ex. HPV), des infections systémiques (ex. HCV) Le Maxwell 16 nous a permis d extraire des acides nucléiques viraux à partir de sécrétions respiratoires. Nous avons pu faire, en 36 min., des extractions sur 16 prélèvements différents à partir de volumes de 200 μl et ainsi mettre en évidence la présence de virus à partir d ADN génomique ou d ARN. La limite dans la détection des virus ne dépend pas de la méthode d extraction utilisée mais de la sensibilité de l amplification utilisée. Les rendements obtenus sont comparables à ceux du QIACube, qui utilise des colonnes de silice. Mais en plus nous avons particulièrement apprécié le gain de temps grâce au Maxwell 16 et sa simplicité d utilisation. F. P., Pilar Pérez-Breña Inmaculada Casas - Centro Nacional de Microbiología. Instituto de Salud Carlos III - Madrid Publications 1. Association of polymorphism in FcGR3A gene and progression of low-grade precursor lesions of cervical carcinoma - P. Conesa-Zamora, V. Santaclara, E. Gadea-Niñoles, S. Ortiz-Reina and M. Perez-Guillermo. 2. Genotype distribution of human papillomavirus (HPV) and co-infections in cervical cytologic specimens from two outpatient gynecological clinics in a region of southeast Spain - Pablo Conesa-Zamora, Sebastián Ortiz-Reina, Joaquín Moya-Biosca, Asunción Doménech-Peris, Francisco Javier Orantes-Casado, Miguel Pérez-Guillermo and Marcos Egea-Cortines. 11

12 Kit d'extraction automatisée avec le Maxwell 16 Volume d élution Type d'acide nucléique Type d'échantillon Prise d essai Kit Maxwell 16 Référence catalogue Elution dans 300 à 600 µl Cartouches SEV ADN Sang Buffy coat 400 µl de sang frais 500 µl de buffy coat Maxwell 16 Blood DNA Purification Kit AS1015 (CE-IVD) AS1010 Tissus 20 à 50 mg Maxwell 16 Tissue DNA Purification Kit Cellules 5 millions cell. Maxwell 16 Cell DNA Purification Kit AS1030 AS1020 Traces DNA IQ Reference Sample Kit for Maxwell 16 AS1040 Elution dans 50 à 100 µl Cartouches LEV ADN Sang total Fluides biologiques 400 µl Maxwell 16 LEV Blood DNA Kit AS1290 Ecouvillons buccaux 1 ou 2 Maxwell 16 Buccal Swab LEV DNA Purification Kit Tissus paraffinés 10 x 5 µ Maxwell 16 FFPE Plus LEV DNA Purification Kit Cellules <10000 cell. Maxwell 16 Cell LEV DNA Purification Kit AS1295 AS1135 AS1140 Traces DNA IQ Casework Pro Kit AS1240 ARN Sang total (EDTA et Paxgene) 2,5 ml de sang frais Maxwell 16 LEV simplyrna Blood Kit AS1310 Tissus 20 mg Maxwell 16 LEV simplyrna Tissue Kit Cellules 5 millions cell. Maxwell 16 LEV simplyrna Cells Kit AS1280 AS1270 ADN + ARN viral Plasma Sérum Fluides biologiques 300 µl Maxwell 16 Viral Total Nucleic Acid Purification kit AS1155 (CE-IVD) AS1150 Maintenance Préventive Maintenance Préventive Annuelle Vérification de l appareil et réalisation des tests standards SA1310 Contactez votre délégué commercial pour en savoir plus sur les autres contrats et services après-vente disponibles 12

13 Extraction manuelle Type d'acide nucléique Type d'échantillon Solution Promega Rendements (µg) Méthode d'extraction Conditionnement Cat.# ADN Sang, tissu, cellules, bactéries, levures, champignons Wizard Genomic DNA Purification Variable selon les échantillons Solution saline 100 extractions / 300 µl de sang A extractions / 300 µl de sang A extractions / 10 ml de sang A1620 Tissu Cellules Wizard SV Genomic DNA Purification System 30 Membrane 50 preps 250 preps A2360 A2361 Tissu Cellules Wizard SV 96 Genomic DNA Purification System 30 Membrane 1 x 96 preps 4 x 96 preps A2370 A2371 Tissu FFPE MagneSil Genomic, Fixed Tissue System 400 ng Billes magnétiques 100 preps MD1490 Sang Reliaprep Blood gdna Miniprep System 4-10 µg Membrane 10 preps 100 preps 250 preps A5080 A5081 A5082 Tissu ReliaPrep gdna Tissue Miniprep System 4-10 µg Membrane 100 preps 250 preps A2051 A2052 Tissu paraffinés FFPE ReliaPrep FFPE gdna Miniprep System 4-10 µg 10 réactions 100 réactions A2351 A2352 ARN Sang, tissus animal ou végétal, bactéries SV Total RNA Isolation System Variable selon les échantillons Membrane 10 preps 50 preps 250 preps Z3101 Z3100 Z3105 Cellules ReliaPrep RNA Cell Miniprep System Variable selon les échantillons Membrane 10 preps 50 preps 250 preps Z6010 Z6011 Z6012 NOUVEAU Tissu paraffinés FFPE ReliaPrep FFPE Total RNA Miniprep System Variable selon les échantillons Membrane 10 réactions 100 réactions Z1001 Z1002 Tissu ReliaPrep RNA Tissue Miniprep System Variable selon les échantillons Membrane 10 preps 50 preps 250 preps Z6110 Z6111 Z6112 NOUVEAU 13

14 HSM 2.0 Instrument (Kit associé : ReliaPrep Large Volume HT gdna System) Extraction automatisée d ADN à partir de grands Intégré dans la plateforme de pipetage Freedom EVO 100 pour une extraction ADN entièrement automatisée A Research Use Only - 14

15 volumes de sang (2 à 10 ml) Concentration (ng/ul) 250 Moyenne A260/A280 = 1, ,5 3 3,5 4 4,5 5 5,5 6 6,5 Volume de sang (ml) INPUT Tubes primaires de sang PROCESS Extraction ADNg (de 2 à 10 ml) OUTPUT Obtention d ADN pur Jusqu à 32 échantillons (2 à 10 ml) Sang total (frais ou congelé), buffy coat, salive Identification des tubes primaires par lecture de code-barre (système PosID) HSM 2.0 (agitation, chauffage et aimantation) couplé au robot pipeteur Tecan Technologie d extraction en billes magnétiques (ReliaPrep LV HT purification system) Pas de déplacement d échantillons pendant l extraction Coûts en réactifs et consommables maitrisés Prêt pour des applications type PCR, long PCR, séquençage, CGH Array, HRM Prêt pour être archivé dans une biobanque Rendement # 300 µg pour 10 ml Traçabilité totale des échantillons (du tube primaire à l ADN extrait) 32 échantillons extraits en # 3,5h Kits d'extraction automatisés Type d'acide nucléique Type d'échantillon Solution Promega Rendements (µg) Temps moyen (minutes) Conditionnement Cat.# ADN Sang total, buffy coat, salive ReliaPrep Large Volume HT gdna Isolation System # 300 μg pour 10 ml 32 échantillons extraits en # 3,5h ml preps A

16 Quantification fine et précise d'adn et d'arn Promega offre une solution complète (réactif et lecteur) de dosage de l ADN ou de l ARN en fluorescence. Les nouveaux systèmes Quantifluor permettent ainsi de mesurer de façon simple et rapide de petites quantités avec une linéarité et une sensibilité optimale.

17 10 fois PLus Sensible que le Qubit 2.0 fluorometer Aucun accessoire marqueurs fluorescents QuantiFluor optimisé pour les simple & intuitif Calibration unique fourni avec le Quantus Software pour le traitement des données Produit (Instrument & réactifs) Conditionnement Réf. Quantus Fluorometer Instrument E6150 QuantiFluor dsdna System 1 ml E2670 QuantiFluor ssdna System 1 ml E3190 QuantiFluor RNA System 1 ml E3310 En savoir plus - Research Use Only - 17

18 Instrument Quantus Fluorometer Quantification d acides nucléiques Haute sensibilité Combinés au Quantus, les marqueurs fluorescents Quantifluor permettent d obtenir une sensibilité supérieure à l absorbance pour les échantillons : précieux ou difficiles Limites de détection pauvres en acides nucléiques très dilués 50 pg/ml Quantus Fluorometer Haute spécificité La quantification par fluorescence permet : de mesurer précisément vos acides nucléiques de garantir le succès de vos applications telles que la qpcr ou le séquençage haut débit de distinguer les molécules d intérêt (ADN simple ou double brin, ARN) au sein d échantillons complexes Compatible avec tous types de fluorophores FOIS PLUS Sensible 200 pg/ml 500 pg/ml FOIS PLUS Sensible dsdna (ng/ml) QuantiFluor ST Fluorometer Qubit 2.0 Fluorometer 2 µg/ml NanoDrop 2000 Fluorometer 11574MC Spécifications Taille Poids Gamme dynamique linéaire Détecteur Filtres d excitation Filtres d émission Type de calibration Format des tubes Arrêt automatique Compatibilité électrique Configuration nécessaire (pour le Quantus Software en option) Garantie 22,7 x 11,5 x 4,5 cm 400 grammes 5 logs (dépend du type de mesure) Capteur de silicium solide Rouge : 640 nm (shortpass) Bleu : 495 nm (shortpass) Rouge : nm Bleu : nm Point unique (blanc et standard) Tubes PCR de 0,5 ml (Axygen - Référence PCR-05-C) Après une heure d inactivité 5V - 0,2A maximum Windows XP, Windows 7 (32 ou 64 bit).net Framework 4.0 ou supérieur 1 port USB libre 1 an - Research Use Only - 18

19 Réactifs QuantiFluor dsdna System Haute spécificité : se lie spécifiquement à l'adn double brin RFU Comparing QuantiFluor dsdna against PicoGreen PicoGreen Sensibilité augmentée : beaucoup plus sensible 100 QuantiFluor DNA que la mesure de l absorbance à 260 nm pour les 10 échantillons faiblement concentrés. Une détection 1 supérieure ou équivalente au PicoGreen avec une limite à 50 pg/ml Calf Thymus DNA [ng/ml] 9587MA QuantiFluor RNA Competitor P } RNA Detection Range QuantiFluor RNA Competitor P Low Concentration Range } UV abs (NanoDorp) High Concentration Range Competitor Q RNA Concentration (ng/µ) 10556MA QuantiFluor RNA System Sensibilité augmentée : une sensibilité qui augmente significativement par rapport au Nanodrop sur de faibles concentrations d'échantillons Plus économique : moins de template d'arn requis comparé à la spectrophotométrie Facile à mettre en place : un système qui inclus tous les réactifs nécessaires à la préparation et la quantification d'arn Bon ratio coût/efficacité : des prix compétitifs pour tenir compte des contraintes budgétaires des utilisateurs - Research Use Only - 19

20 Analyse moléculaire Promega a développé une expertise de pointe dans le domaine de l analyse moléculaire et plus spécifiquement dans les techniques d analyses de fragments STRs par électrophorèse capillaire, permettant d identifier des mutations à l origine de certaines pathologies. Leader du marché en identité génétique, Promega développe de nouveaux kits d analyse STR, ouvrant de nouvelles perspectives pour les laboratoires hospitaliers de génétique, de cytogénétique et d immunologie (transplantation de moelle).

21 Y Chromosome Analysis System La prévalence des troubles de la fertilité masculine est estimée à 10% de la population générale. Ces troubles sont définis par un déficit quantitatif et/ou fonctionnel des spermatozoïdes et peuvent être liés à des anomalies chromosomiques comme des micro délétions du chromosome Y. L'identification de ces troubles majeurs de la fertilité liés à ces microdélétions est possible grâce au kit de détection Promega Y Chromosome Analysis System suivant les recommandations de la EAA / European Molecular Genetic Quality Network. Bénéfices Facile à utiliser : un Master Mix multiplex avec 20 paires de primers, dont un contrôle interne garantissant un panel standardisé de résultats Analyse "State-of-the-Art" : le kit est marqué CE IVD et les paires de primers sont en accord avec les recommandations EMQN et incluent l'amplification SRY Robuste : utilisation de la GoTaq DNA Polymérase qui minimise les pics Flexible : amplifie l'adn génomique purifié en utilisant des méthodes variées et avec un thermocycleur PE480 (oil overlay) ou PE9600/9700 (non-oil overlay) Applications Infertilité masculine Procréation médicalement assistée (FIV, ICSI) Détection de régions spécifiques du chromosome Y humain A B C D E M 1 2 M 3 4 M 5 6 M 7 8 M 9 10 M bp Analyse en multiplex d'adn génomique mâle. Puits : 1, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex A avec l'adn mâle ; 2, réaction contrôle sans ADN ; 3, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex B avec l'adn mâle ; 4, réaction contrôle sans ADN ; 5, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex C avec l'adn mâle ; 6, réaction contrôle sans ADN ; 7, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex D avec l'adn mâle ; 8, réaction contrôle sans ADN ; 9, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex E avec l'adn mâle ; Puit M : 50bp DNA. Step Ladder (Cat.# G4521). Les réactions ont été réalisées sur thermocycleur et séparées sur gel 4% NuSieve 3:1 Plus TBE Buffer Reliant gel TA09_3A Nous avons choisi le kit Promega pour sa facilité d'utilisation, le fait qu il soit prêt à l'emploi permettant une validation simple de notre méthode avec un Kit CE IVD puisque nous sommes actuellement en démarche d'accréditation selon la norme EN NF ISO 15189, et enfin la réponse qu il apporte à une demande expresse de nos correspondants qui souhaitent faire bénéficier à leurs clients du test le plus complet du marché avec une cartographie détaillée de la région AZF Laboratoire Alpigene - Lyon Produit Conditionnement Réf. - Research Use Only - Y Chromosome Deletion Detection System, Version réactions MD1531 Y Chromosome AZF Analysis System (CE IVD) 25 réactions MD Research Use Only - 21

22 Microsatellite Instability (MSI) Analysis System Permet de mesurer l instabilité des microsatellites (MSI) qui se caractérise par la variation anormale du nombre de séquences répétées dans l'adn tumoral comparé à l'adn du même patient provenant de tissus sains. Bénéfices Obtention du phénotype complet MSI : une simple multiplex PCR amplifie 5 marqueurs mono nucléotidiques pour le génotypage du statut MSI-H Traçabilité de l échantillon : la co-amplification de séquences répétées pentanucléotidiques hautement polymorphiques permet un suivi des échantillons Suit les recommandations : 2003 NCI Workshop, Bethesda Applications Dans le cadre de la recherche de prédispositions héréditaires au cancer colorectal (HNPCC, Syndrome de Lynch), les instances internationales recommandent la recherche d'instabilité de microsatellites (MSI) dans l'adn tumoral du patient. Ce précriblage somatique permet d'orienter le clinicien vers l'étude constitutionnelle des gènes MMR, facilitant le diagnostic précoce et la prise en charge du patient Purification ADN Dosage ADN Amplification ADN Electrophorese Capillaire Analyse des profils Maxwell 16 FFPE Plus ReliaPrep FFPE gdna Quantifluor dsdna Dye MSI Analysis system v1.2 Spectrale dédiée (ABI 3100/3130/3500) Panel et bins téléchargeables pour GeneMapper Research Use Only - 22

23 NR-21 BAT-26 BAT-25 NR-24 MONO-27 Penta D Penta C 4639TA Instabilité des Microsatellites mise en avant grâce au kit MSI Analysis System. Lecture sur électrophorégramme. Une comparaison entre des échantillons témoins (en haut) et des échantillons avec une tumeur du colon MSI positive (en bas) en utilisant le kit MSI Analysis System. Deux nanogrames d'adn génomique ont été amplifiés et analysés avec l'analyseur ABI PRISM 3100, et les modèles alléliques des différents échantillons représentés graphiquement. La présence de nouveaux allèles au niveau des échantillons tumoraux (cf. les flèches) absents dans l'échantillon témoin indique une instabilité des microsatellites. Ce kit est dérivé de marqueurs déterminés par notre groupe, l UMRS INSERM 938, et amplifiant dans une réaction de PCR pentaplex (Suraweera et al., Gastroenterology, 123(2002)1804). Il permet de déterminer le statut MSI des tumeurs héréditaires et sporadiques quels que soient leur défaut moléculaire et leur localisation tumorale. Dans la majorité des cas, il n est pas indispensable d analyser de manière comparative les ADN normaux des patients (Buhard et al., J. Clin. Oncol., 24(2006)241). Cette comparaison est cependant conseillée pour les tumeurs présentant un défaut du gène MSH6 et/ou provenant de l endomètre (Wong et al., Carcinogenesis, 27(2006)951). R. H., DR1 INSERM - Equipe Microsatellites et Cancers Mononucleolides BAT-25 BAT-26 MONO-27 NR-21 NR-24 Pentanucleolides Penta C Penta D Produit Conditionnement Réf. MSI Analysis System, Version réactions (50 paires réactions) MD Research Use Only - 23

24 Kits d analyse STRs Un outil puissant pour l identification de cellules humaines et la caractérisation de mélanges d ADN. Promega STR kit Avantages - Research Use Only - Pouvoir discriminant PowerPlex 16 HS System Multiplex, validé sur de nombreux cycleurs et analyseurs PowerPlex Fusion System Analyse multiplex sur 24 locis discriminants, 5 dye fluorencents Amplification directe sur papiers FTA, non FTA et écouvillons Très sensible. Obtention d'un profil ADN à partir de 100 pg de template d'adn 6.58 * PowerPlex 18D System Multiplex, optimisé pour l amplification directe sur carte FTA PowerPlex 21 System Multiplex, excellent pouvoir discriminant, résistance accrue aux inhibiteurs et compatible avec l amplification directe (FTA) PowerPlex CS7 System Multiplex sur 7 loci discriminants, économique NC PowerPlex Y23 System Nombre de loci supérieur aux autres kits sur le marché - Le plus sensible Amplification rapide (90min) - Compatible avec amplification directe - MonoPlex System Analyse locus par locus - PowerPlex 16 HS Systems Bénéfices Sensible : obtention de résultats reproductibles à partir de 0,1ng d'adn Discriminant : système avec 16 loci (D18S51, D21S11, TH01, D3S1358, Penta E, FGA, TPOX, D8S1179, vwa, Amelogenine, CSF1PO, D16S539, D7S820, D13S317, D5S818 et Penta D). Indice de paternité de 1,520,000 Flexible : convient à l'utilisation d'une large variété d'analyseurs génétiques d Applied Biosystems Complet : le kit contient un standard de poids moléculaire et une échelle allélique Applications Analyse ADN médecine légale Test de paternité Test d identité humaine Identification sur des cultures de cellules souches Contamination cellulaire maternelle Etude de zygotie des jumeaux Détermination du sexe fœtal à un stade précoce D3 THO1 D21 D18 Penta E D5 D13 D7 D16 CSF1PO Penta D A vwa D8 TPOX FGA TMR Fluorescein JOE - Research Use Only - 24

Guide d utilisation des kits Perfect Master Mix SYBR Green

Guide d utilisation des kits Perfect Master Mix SYBR Green Guide d utilisation des kits Perfect Master Mix SYBR Green Pour les produits AnyGenes : Cat # PMSX-F2S Cat # PMSX-F4S Cat # PMSX-F8S Cat # PMSX-F12S Cat # PMSX-F24S (* Cat # pour toutes les références

Plus en détail

La PCR en temps réel frederic.gevaudant@bordeaux.inra.fr

La PCR en temps réel frederic.gevaudant@bordeaux.inra.fr La PCR en temps réel frederic.gevaudant@bordeaux.inra.fr INRA Centre de recherche de Bordeaux UMR Biologie du Fruit et Pathologie Historique 1985 : Invention par Kary Mullis de la technique de (PCR). 1991

Plus en détail

TP de Biochimie Groupe 4 Forestier Michèle 25.05.2010 Fournier Coralie Freyre Christophe Manipulation d ADN

TP de Biochimie Groupe 4 Forestier Michèle 25.05.2010 Fournier Coralie Freyre Christophe Manipulation d ADN MANIPULATION D ADN Clonage du gène «venus» dans des plasmides et expression de celui-ci chez les bactéries E.Coli. Assistants: U. Loizides M. Umebayashi C. Gehin - 1 - 1. Résumé Lors de notre expérience,

Plus en détail

Université Bordeaux Segalen - PACES 2012-2013 ED UE9s Avril 2013

Université Bordeaux Segalen - PACES 2012-2013 ED UE9s Avril 2013 Sélectionner les propositions exactes Université Bordeaux Segalen - PACES 2012-2013 ED UE9s Avril 2013 QCM 1 La plupart des techniques de biologie moléculaire repose sur le principe de complémentarité

Plus en détail

Kit d extraction PicoPure DNA

Kit d extraction PicoPure DNA Directement à la PCR Le kit PicoPure DNA permet une extraction simple et rapide de l ADN génomique prêt à l utilisation en PCR. Extraire et amplifier l ADN dans le même tube, sans phase d extraction organique

Plus en détail

La PCR en temps réel

La PCR en temps réel La PCR en temps réel Hôpital La Rabta Tunis 6 juin 2013 Dr Sabine Favre-Bonté Maître de Conférences, Université Claude Bernard Lyon 1 UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne Equipe Multi-résistance environnementale

Plus en détail

LA PCR QUANTITATIVE EN TEMPS REEL OU LA "TAQMAN"

LA PCR QUANTITATIVE EN TEMPS REEL OU LA TAQMAN LA PCR QUANTITATIVE EN TEMPS REEL OU LA "TAQMAN" I- Terminologie Le terme TaqMan est souvent utilisé par abus de langage pour désigner : - la technique de PCR quantitative par détection en temps réel de

Plus en détail

TEST MMR POUR TUMEURS COLIQUES EN PRATIQUE COURANTE? Karen LEROY Hôpital Henri Mondor, Créteil

TEST MMR POUR TUMEURS COLIQUES EN PRATIQUE COURANTE? Karen LEROY Hôpital Henri Mondor, Créteil TEST MMR POUR TUMEURS COLIQUES EN PRATIQUE COURANTE? Karen LEROY Hôpital Henri Mondor, Créteil 47 Définition du phénotype MSI (MicroSatellite Instability) Environ 15% des cancers colo-rectaux présentent

Plus en détail

Principales techniques utilisées en génie génétique Ces différentes techniques peuvent également se combiner entre elles. Séquençage de l ADN

Principales techniques utilisées en génie génétique Ces différentes techniques peuvent également se combiner entre elles. Séquençage de l ADN Principales techniques utilisées en génie génétique Ces différentes techniques peuvent également se combiner entre elles Séquençage de l ADN 1- Un brin complémentaire de l ADN à séquencer est fabriqué

Plus en détail

Infections aiguës respiratoires

Infections aiguës respiratoires Infections aiguës respiratoires Apport de la biologie moléculaire Marie-Claude Bernard D I symposium infections aiguës respiratoires 29/03/05 - p.1 Le diagnostic Culture EIA ICT (immunochromato) Immuno

Plus en détail

Importance du développement des biomarqueurs par un industriel

Importance du développement des biomarqueurs par un industriel Importance du développement des biomarqueurs par un industriel Dr Frédéric Eberlé, responsable médical Roche Diagnostics France Marseille, 27 mars 2015 Terminologie Biomarqueurs, Tests de diagnostic, Tests-compagnons

Plus en détail

Chapitre 10 L isolement et la manipulation de gènes. Injection d ADN étranger dans une cellule animale

Chapitre 10 L isolement et la manipulation de gènes. Injection d ADN étranger dans une cellule animale Chapitre 10 L isolement et la manipulation de gènes Injection d ADN étranger dans une cellule animale Comment amplifier un gène d intérêt? Amplification in vivo à l aide du clonage d ADN L ensemble formé

Plus en détail

10b : La PCR (locus PV92)

10b : La PCR (locus PV92) 10b : La PCR (locus PV92) Cette expérience a été mise en place afin de remplacer le protocole intitulé "PCR (locus D1S80)". L amplification est en effet meilleure et les résultats plus simples à interpréter.

Plus en détail

ED Biologie moléculaire. E. Turpin J. Lehmann-Che 5-6 novembre 2007

ED Biologie moléculaire. E. Turpin J. Lehmann-Che 5-6 novembre 2007 ED Biologie moléculaire E. Turpin J. Lehmann-Che 5-6 novembre 2007 PCR 1983: Kary Mullis Amplification in vitro par une méthode enzymatique d'un fragmentd'adn en présence de deux oligonucléotides spécifiques

Plus en détail

POPULATION D ADN COMPLEXE - ADN génomique ou - copie d ARNm = CDNA

POPULATION D ADN COMPLEXE - ADN génomique ou - copie d ARNm = CDNA POPULATION D ADN COMPLEXE - ADN génomique ou - copie d ARNm = CDNA Amplification spécifique Détection spécifique Clonage dans des vecteurs Amplification in vitro PCR Hybridation moléculaire - hôte cellulaire

Plus en détail

Protocole de laboratoire pour la purification manuelle de l ADN d un échantillon de 0,5 ml

Protocole de laboratoire pour la purification manuelle de l ADN d un échantillon de 0,5 ml Protocole de laboratoire pour la purification manuelle de l ADN d un échantillon de 0,5 ml Pour la purification de l ADN génomique des kits de prélèvements Oragene et ORAcollect. Pour tout protocole et

Plus en détail

GINGIVO-STOMATITES HERPETIQUES: Quels prélèvements et quelles techniques?

GINGIVO-STOMATITES HERPETIQUES: Quels prélèvements et quelles techniques? GINGIVO-STOMATITES HERPETIQUES: Quels prélèvements et quelles techniques? Dr C. ZANDOTTI Laboratoire de Virologie du Pr D. Raoult CHU Timone, Marseille. Virus herpes simplex (HSV) Virus strictement humain,

Plus en détail

Interprétation des résultats et troubleshooting

Interprétation des résultats et troubleshooting Interprétation des résultats et troubleshooting Le Service de séquençage du Centre d innovation Génome Québec et Université McGill utilise des appareils 3730xl DNA Analyzer d Applied Biosystems. Cette

Plus en détail

3. Biotechnologie de l ADN

3. Biotechnologie de l ADN 3. Biotechnologie de l ADN 3.1. Technologie de l ADN recombinant 3.1.1. Isolation d ADN et d ARN 3.1.2. Fragmentation de l ADN (les Endonucléases) 3.1.3. Analyse d ADN sur d agarose et d acrylamide 3.1.4.

Plus en détail

Principe des études moléculaires en génétique médicale Méthodes d analyse des microlésions du génome

Principe des études moléculaires en génétique médicale Méthodes d analyse des microlésions du génome Mercredi 23 Octobre LECLERCQ Barbara L2 GM Pr Krahn 10 pages Principe des études moléculaires en génétique médicale Méthodes d analyse des microlésions du génome Plan A. Introduction B. Techniques courantes

Plus en détail

Clonage de Vénus et transformation de E.Coli.

Clonage de Vénus et transformation de E.Coli. Clonage de Vénus et transformation de E.Coli. Samueal Joseph, Romain Laverrière, Elias Laudato, Noé Mage Assisstants : Gisele Dewhurst, Charlotte Gehin, Miwa Umebayashi Résumé [1] L expérience consiste

Plus en détail

Apport de la PCR en temps réel en maladies infectieuses

Apport de la PCR en temps réel en maladies infectieuses Apport de la PCR en temps réel en maladies infectieuses Biologie moléculaire Amplification PCR I. Dénaturation ADN 95 C II. Hybridation t = Tm III. Extension t dépend de la polymérase employée PCR «classique»

Plus en détail

Introduction au PCR en. Par Philipe Lampron, M.Sc.

Introduction au PCR en. Par Philipe Lampron, M.Sc. Introduction au PCR en temps réel Par Philipe Lampron, M.Sc. Résumé Fondements du PCR en temps réel (qpcr) Théorie du PCR en temps réel Types de chimies Méthode de quantification Acquisition de résultats

Plus en détail

Guide sur le PCR en temps réel (qpcr)

Guide sur le PCR en temps réel (qpcr) Guide sur le PCR en temps réel (qpcr) Un service complet est offert par la plateforme de génomique de l IRIC pour le qpcr incluant l analyse de votre ARN, la préparation de vos cdna, le design des essais,

Plus en détail

Biologie Moléculaire 6 GT SG FWB Leçon n 5

Biologie Moléculaire 6 GT SG FWB Leçon n 5 Biologie Moléculaire 6 GT SG FWB Leçon n 5 Tests de paternité (fin labo électrophorèse) Un test de paternité consiste à analyser l'adn de deux personnes dans le but d'établir un lien de parenté génétique.

Plus en détail

TD Révision BIO57. Connaissance et Technique du gène

TD Révision BIO57. Connaissance et Technique du gène TD Révision BIO57 Connaissance et Technique du gène Novembre 2007 Cécile BAUDOT cecile.baudot@medecine.univ-mrs.fr INSERM 910 «Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle» Maladies Neuromusculaires Le

Plus en détail

PRINCIPES THEORIQUES DE LA PCRq

PRINCIPES THEORIQUES DE LA PCRq PRINCIPES THEORIQUES DE LA PCRq Ce chapitre aborde les notions présentées rapidement dans l introduction (Ct, droite standard, principes de la quantification). Il détaille les différents formats de fluorescence

Plus en détail

Taq'Ozyme Purple Mix MANUEL D UTILISATION

Taq'Ozyme Purple Mix MANUEL D UTILISATION Taq'Ozyme Purple Mix OZYA003-40 - 40 réactions OZYA003-200 - 200 réactions (avec supplément de MgCl 2 ) OZYA003-200XL - 200 réactions (avec supplément de MgCl 2 ) OZYA003-1000 - 1000 réactions (avec supplément

Plus en détail

8.3.3 Réactifs. La polymérase catalyse la synthèse de brins complémentaires d ADN.

8.3.3 Réactifs. La polymérase catalyse la synthèse de brins complémentaires d ADN. 8.3.3 Réactifs 1. AD polymérase: La polymérase catalyse la synthèse de brins complémentaires d AD. Des polymérases qui sont résistantes à la chaleur sont utilisées, telles que la Taq polymérase (Thermus

Plus en détail

P.C.R. POLYMERASE CHAIN REACTION ou AMPLIFICATION PAR POLYMERISATION EN CHAÎNE

P.C.R. POLYMERASE CHAIN REACTION ou AMPLIFICATION PAR POLYMERISATION EN CHAÎNE P.C.R. POLYMERASE CHAIN REACTION ou AMPLIFICATION PAR POLYMERISATION EN CHAÎNE P.C.R.: Méthode rapide d'amplification d'une séquence déterminée d'a.d.n. à partir d'une matrice. Elle permet d'obtenir plusieurs

Plus en détail

TUTORAT UE spécifiques 2010-2011

TUTORAT UE spécifiques 2010-2011 FACULTE de PHARMACIE TUTORAT UE spécifiques 2010-2011 Méthodes d étude et d analyse du génome Eric Badia, Bernard Carcy Séance préparée par Alexandre Leboucher (ATM²), Astrid Robert (ATP) QCM n 1: Synthèse

Plus en détail

Biologie cellulaire. Perfectionnement à la culture cellulaire. Programme. ParTIe PraTIQUe. ParTIe THÉorIQUe. durée : 4 jours

Biologie cellulaire. Perfectionnement à la culture cellulaire. Programme. ParTIe PraTIQUe. ParTIe THÉorIQUe. durée : 4 jours Biologie cellulaire Perfectionnement à la culture cellulaire durée : 4 jours ingénieurs, chercheurs et chefs de projet connaissances de base en culture cellulaire ou validation du module «initiation à

Plus en détail

METHODES DE SEPARATION DE PROTEINES : PURIFICATION DE LA GST PAR AFFINITE AU GLUTATHION

METHODES DE SEPARATION DE PROTEINES : PURIFICATION DE LA GST PAR AFFINITE AU GLUTATHION Laboratoire de Physiologie Végétale Université de Neuchâtel (2005) Travaux pratiques METHODES DE SEPARATION DE PROTEINES : PURIFICATION DE LA PAR AFFINITE AU GLUTATHION INTRODUCTION: Les protéines tiennent

Plus en détail

Technologie de l ADN recombinant. Complément de cours sur: «Les Méthodes d Etude de la Cellule»

Technologie de l ADN recombinant. Complément de cours sur: «Les Méthodes d Etude de la Cellule» Technologie de l ADN recombinant Complément de cours sur: «Les Méthodes d Etude de la Cellule» 1 Les techniques de l ADN Recombinant But: isoler des fragments d ADN de génomes complexes et les recombiner

Plus en détail

Méthodes et techniques de la biologie du développement

Méthodes et techniques de la biologie du développement Méthodes et techniques de la biologie du développement 1. Etude de l expression des gènes : Détecter les transcrits et les protéines au cours de l ontogenèse l outil anticorps 1.1. La RT-PCR La réaction

Plus en détail

Lettres: A, T, G, C. Mots: à 3 lettres (codons) Phrase: gène (information pour synthétiser une protéine). Ponctuation

Lettres: A, T, G, C. Mots: à 3 lettres (codons) Phrase: gène (information pour synthétiser une protéine). Ponctuation 2- Les molécules d ADN constituent le génome 2-1 La séquence d ADN représente l information génétique Lettres: A, T, G, C Mots: à 3 lettres (codons) Phrase: gène (information pour synthétiser une protéine).

Plus en détail

Etude du transcriptome et du protéome en Neurooncologie

Etude du transcriptome et du protéome en Neurooncologie Etude du transcriptome et du protéome en Neurooncologie Principes, aspects pratiques, applications cliniques François Ducray Neurologie Mazarin, Unité Inserm U711 Groupe hospitalier Pitié-Salpêtrière Etude

Plus en détail

ATELIER EPIGENETIQUE

ATELIER EPIGENETIQUE Juin 2012 ATELIER EPIGENETIQUE Utilisation de la Q-PCR pour analyser des données de ChIP ou de MeDIP Emmanuèle Mouchel-Vielh I. La PCR quantitative: principe et généralités II. Interprétation des résultats

Plus en détail

L AMPLIFICATION GÉNIQUE PAR PCR. (Polymérase Chain Reaction)

L AMPLIFICATION GÉNIQUE PAR PCR. (Polymérase Chain Reaction) L AMPLIFICATION GÉNIQUE PAR PCR (Polymérase Chain Reaction) ATELIER DE FORMATION SUR LE DIAGNOSTIC DE LA FIEVRE APHTEUSE 21 mai 2012 Corinne SAILLEAU Corinne.sailleau@anses.fr Agence Nationale de Sécurité

Plus en détail

2: Les enzymes de restriction

2: Les enzymes de restriction 2: Les enzymes de restriction Les enzymes de restriction sont des protéines synthétisées par des bactéries pour se protéger des infections de virus (bactériophages). Ces enzymes coupent l ADN viral à des

Plus en détail

TD de Biochimie 4 : Coloration.

TD de Biochimie 4 : Coloration. TD de Biochimie 4 : Coloration. Synthèse de l expérience 2 Les questions posées durant l expérience 2 Exposé sur les méthodes de coloration des molécules : Générique Spécifique Autres Questions Pourquoi

Plus en détail

Kit d extraction PicoPure RNA

Kit d extraction PicoPure RNA Isoler des ARN même à partir d une cellule Le kit d extraction PicoPure RNA a été développé pour obtenir une haute qualité des ARNs totaux à partir d un minimum de dix cellules. Le haut rendement obtenu

Plus en détail

Isolement automatisé d ADN génomique à partir de culots de cellules sanguines à l aide de l appareil Tecan Freedom EVO -HSM Workstation

Isolement automatisé d ADN génomique à partir de culots de cellules sanguines à l aide de l appareil Tecan Freedom EVO -HSM Workstation PROTOCOLE AUTOMATISÉ Isolement automatisé d ADN génomique à partir de culots de cellules sanguines à l aide de l appareil Tecan Freedom EVO -HSM Workstation Mode d emploi des produits A1751 et A2751 Réservé

Plus en détail

SEMIOLOGIE- Applications de la biologie moléculaire à la médecine. Applications de la biologie moléculaire à la médecine.

SEMIOLOGIE- Applications de la biologie moléculaire à la médecine. Applications de la biologie moléculaire à la médecine. 30/04/12 Camille Garbarino Sémiologie Pr Barlier 6 pages SEMIOLOGIE- Applications de la biologie moléculaire à la médecine. Applications de la biologie moléculaire à la médecine. Plan : A) Principales

Plus en détail

Sommaire. Première partie Les concepts de base

Sommaire. Première partie Les concepts de base Sommaire Préface à la troisième édition... Préface à la deuxième édition... Avant-propos à la troisième édition... Avant-propos à la deuxième édition... Avant-propos à la première édition... XV XVII XIX

Plus en détail

Q PCR sur LC480 Roche

Q PCR sur LC480 Roche Q PCR sur LC480 Roche!! NE JAMAIS LAISSER DE PLAQUE DANS L APPAREIL!! Généralités : lampe xénon à arc : s éteint 30 min après chaque run durée d un run : plq 96p = 1h10 environ plq 384p = 40 50 min environ

Plus en détail

Les virus dans les aliments : un nouveau défi pour les laboratoires de microbiologie

Les virus dans les aliments : un nouveau défi pour les laboratoires de microbiologie : un nouveau défi pour les laboratoires de microbiologie Véronique ZULIANI, Institut de la Filière Porcine Jean Christophe Augustin, ENVA, ASA Qu est ce qu un virus? Microorganisme de 15 à 40 nm Environ

Plus en détail

MLVA Streptococcus pneumoniae

MLVA Streptococcus pneumoniae H.I.A. Robert Picqué Bordeaux Laboratoire de Biologie moléculaire Version Internet 2 MLVA Streptococcus pneumoniae 1. DESCRIPTION DES OPERATIONS 1.1 Culture et extraction des ADN NB : prévoir dans la série

Plus en détail

Les microarrays: technologie pour interroger le génome

Les microarrays: technologie pour interroger le génome Les microarrays: technologie pour interroger le génome Patrick DESCOMBES patrick.descombes@frontiers-in-genetics.org Plate forme génomique NCCR Frontiers in Genetics Université de Genève http://genomics.frontiers-in-genetics.org

Plus en détail

Les outils du génie génétique.

Les outils du génie génétique. Les outils du génie génétique. I\ Les enzymes. On va se servir des enzymes pour couper, coller et synthétiser des acides nucléiques. A\ Les polymérases. Toutes les polymérases agissent de 5 vers 3. En

Plus en détail

www.gbo.com/bioscience 1 Culture Cellulaire Microplaques 2 HTS- 3 Immunologie/ HLA 4 Microbiologie/ Bactériologie Containers 5 Tubes/ 6 Pipetage

www.gbo.com/bioscience 1 Culture Cellulaire Microplaques 2 HTS- 3 Immunologie/ HLA 4 Microbiologie/ Bactériologie Containers 5 Tubes/ 6 Pipetage 2 HTS 3 Immunologie / Immunologie Informations Techniques 3 I 2 ELISA 96 Puits 3 I 4 ELISA 96 Puits en Barrettes 3 I 6 en Barrettes de 8 Puits 3 I 7 en Barrettes de 12 Puits 3 I 8 en Barrettes de 16 Puits

Plus en détail

TYPAGE HLA CROSSMATCH ANTICORPS ANTI-HLA

TYPAGE HLA CROSSMATCH ANTICORPS ANTI-HLA 16/11/12 TYPAGE HLA CROSSMATCH ANTICORPS ANTI-HLA Chantal GAUTREAU LABORATOIRE HLA S E R V I C E D I M M U N O L O G I E E T D H I S T O C O M PAT I B I L I T É, A P - H P, HÔPITAL SAINT LOUIS, PARIS,

Plus en détail

altona altona RealStar CMV PCR Kit 1.0 always a drop ahead. 04/2015 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany

altona altona RealStar CMV PCR Kit 1.0 always a drop ahead. 04/2015 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany altona DIAGNOSTICS altona DIAGNOSTICS RealStar CMV PCR Kit 1.0 04/2015 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany phone +49 40 548 06 76-0 fax +49 40 548 06 76-10 e-mail info@altona-diagnostics.com

Plus en détail

L'ADN mitochondrial a été découvert en 1962 par Margit MK Nass et Sylvan Nass par microscopie électronique.

L'ADN mitochondrial a été découvert en 1962 par Margit MK Nass et Sylvan Nass par microscopie électronique. L L'ADN mitochondrial a été découvert en 1962 par Margit MK Nass et Sylvan Nass par microscopie électronique. Figure 1 Mitochondries observées au microscope électronique à transmission Plus tard, cet ADN

Plus en détail

Marc DELPECH. CORATA La Rochelle le 21 mai 2008

Marc DELPECH. CORATA La Rochelle le 21 mai 2008 Marc DELPECH CORATA La Rochelle le 21 mai 2008 En 24 ans les progrès ont été considérables Premières utilisation des techniques de génétique moléculaire en diagnostic : 1984 Une palette de techniques très

Plus en détail

Cônes PureSpeed. Pureté et concentration optimisées Cônes pour purification de Protéines

Cônes PureSpeed. Pureté et concentration optimisées Cônes pour purification de Protéines Cônes PureSpeed Cônes pour protéine PureSpeed Pureté et concentration optimales Rapide moins de 15 minutes Traitement simultané de plusieurs échantillons Pureté et concentration optimisées Cônes pour purification

Plus en détail

Licence d Informatique Année 2001-2002 Option: Introduction à la biologie moléculaire. LA P.C.R. Polymerase Chain Reaction

Licence d Informatique Année 2001-2002 Option: Introduction à la biologie moléculaire. LA P.C.R. Polymerase Chain Reaction Licence d Informatique Année 2001-2002 Option: Introduction à la biologie moléculaire LA P.C.R. Polymerase Chain Reaction "chercher une aiguille dans une meule de foin"? Chercher à repérer un gène particulier

Plus en détail

Les différentes stratégies de quantification :

Les différentes stratégies de quantification : Les différentes stratégies de quantification : Ce chapitre présente les 2 principales stratégies de quantification relative utilisée classiquement : la méthode des droites standards et celle des Ct. Les

Plus en détail

10a: La PCR (locus D1S80)

10a: La PCR (locus D1S80) 10a: La PCR (locus D1S80) Pour des raisons techniques, ce protocole n'est plus utilisé. Il a été remplacé par le protocole "PCR locus PV92" ainsi que le nouveau protocole "PCR sensibilité au PTC". Il reste

Plus en détail

Single Molecule Real Time (SMRT) Sequencing : PacBio RS II

Single Molecule Real Time (SMRT) Sequencing : PacBio RS II Single Molecule Real Time (SMRT) Sequencing : PacBio RS II Input sample Genome DNA, Amplicons, cdna Input sample amounts according to the protocols (10ng-10µg) High Input sample quality (integrity and

Plus en détail

Explications théoriques

Explications théoriques Explications théoriques L'ADN: Définitions L'ADN (Acide Désoxyribo Nucléique) est la molécule qui est utilisée dans la nature comme support matériel de l'information génétique des êtres vivants, un peu

Plus en détail

altona altona RealStar EBV PCR Kit 1.0 always a drop ahead. 11/2012 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany

altona altona RealStar EBV PCR Kit 1.0 always a drop ahead. 11/2012 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany altona DIAGNOSTICS altona DIAGNOSTICS RealStar EBV PCR Kit 1.0 11/2012 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany phone +49 40 548 06 76-0 fax +49 40 548 06 76-10 e-mail info@altona-diagnostics.com

Plus en détail

Les méthodes de diagnostic en virologie

Les méthodes de diagnostic en virologie Les méthodes de diagnostic en virologie Pourquoi faire du diagnostic en virologie? Dons de sang, d organes et de tissus (dépistage obligatoire) Suivi biologique des infections (VIH, VHB, VHC) Mesures prophylactiques

Plus en détail

Génie génétique. Définition : Outils nécessaires : Techniques utilisées : Application du génie génétique : - Production de protéines

Génie génétique. Définition : Outils nécessaires : Techniques utilisées : Application du génie génétique : - Production de protéines Génie génétique Définition : Ensemble de méthodes d investigation et d expérimentation sur les gènes. Outils nécessaires : ADN recombinant, enzyme de restriction, vecteur, banque ADNc, sonde nucléique...

Plus en détail

Kit Maxwell CSC DNA FFPE

Kit Maxwell CSC DNA FFPE MANUEL TECHNIQUE Kit Maxwell CSC DNA FFPE Mode d'emploi du produit AS1350 Ce produit est des né à être vendu uniquement aux États-Unis et au Canada. A en on: manier les cartouches avec précau on les bords

Plus en détail

Méthodes diagnostiques en génétique moléculaire

Méthodes diagnostiques en génétique moléculaire Méthodes diagnostiques en génétique moléculaire P. Latour Praticien Hospitalier Responsable UF 3427 Neurogénétique Moléculaire Laboratoire de Neurochimie Pr Renaud HCL Centre de Biologie Est DES Neurologie

Plus en détail

altona altona RealStar HSV PCR Kit 1.0 always a drop ahead. 11/2012 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany

altona altona RealStar HSV PCR Kit 1.0 always a drop ahead. 11/2012 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany altona DIAGNOSTICS altona DIAGNOSTICS RealStar HSV PCR Kit 1.0 11/2012 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany phone +49 40 548 06 76-0 fax +49 40 548 06 76-10 e-mail info@altona-diagnostics.com

Plus en détail

Isolement des cellules mononucléées du sang périphérique

Isolement des cellules mononucléées du sang périphérique Isolement des cellules mononucléées du sang périphérique 1. Equipements utilisés L isolement des cellules mononucléées du sang périphérique est effectué à partir d échantillons sanguins par une technique

Plus en détail

Enjeux de la biologie haut débit en oncologie

Enjeux de la biologie haut débit en oncologie Enjeux de la biologie haut débit en oncologie Pascal BARBRY, CNRS, Sophia Antipolis o Les technologies haut-débit ont enrichi considérablement nos approches quantitatives en biologie. o Des applications

Plus en détail

IDENTIFICATION DES PERSONNES PAR TESTS GENETIQUES

IDENTIFICATION DES PERSONNES PAR TESTS GENETIQUES IDENTIFICATION DES PERSONNES PAR TESTS GENETIQUES DIFFERENTES SITUATIONS - Pénal: affaires criminelles FNAEG (950000 individus actuellement) individus associés aux affaires - Civil: tests de paternité

Plus en détail

Les Biomarqueurs moléculaires en Oncologie

Les Biomarqueurs moléculaires en Oncologie Les Biomarqueurs moléculaires en Oncologie Institut de Cancérologie de Lorraine Service de Biopathologie CNRS UMR7039 CRAN Université de Lorraine Pr Jean-Louis Merlin Définition Un biomarqueur est une

Plus en détail

A : Vrai : La biotechnologie est l'ensemble des techniques qui utilisent des microorganismes,

A : Vrai : La biotechnologie est l'ensemble des techniques qui utilisent des microorganismes, Ecurie du 1/02/12 1: AE A : Vrai : La biotechnologie est l'ensemble des techniques qui utilisent des microorganismes, des cellules animales, végétales ou leurs constituants à des fins industrielles (agro

Plus en détail

ANALYSE DE PROTEINE DANS LES

ANALYSE DE PROTEINE DANS LES ANALYSE DE PROTEINE DANS LES CELLULES Assistants: K. Umebayashi G. Dewhurst A. Santos L. Pineau 1. Introduction Lors de cette expérience, nous avons réalisé l extraction de protéines à partir de deux souches

Plus en détail

PRINCIPES DE BASES DE L ANALYSE DES CHROMOSOMES HUMAINS

PRINCIPES DE BASES DE L ANALYSE DES CHROMOSOMES HUMAINS PRINCIPES DE BASES DE L ANALYSE DES CHROMOSOMES HUMAINS II. Outils CONTEXTE CLINIQUE Jonction entre chromosomique et moléculaire Dr G. Lefort II. TECHNIQUE 1) Le caryotype conventionnel en bandes Nécessite

Plus en détail

Séquençage Haut-Débit : HiSeq 2000 et HiSeq 2500 (Illumina)

Séquençage Haut-Débit : HiSeq 2000 et HiSeq 2500 (Illumina) Séquençage Haut-Débit : HiSeq 2000 et HiSeq 2500 (Illumina) avec automatisation sur robot Tecan EVO200 Préparation des librairies High Output - HiSeq 2000 ou 2500 Run : 11 jours -2 Flowcells, 8 lanes /

Plus en détail

CHAPITRE III: Le Clonage

CHAPITRE III: Le Clonage BIOLOGIE MOLECULAIRE CHAPITRE III: Le Clonage I) Définition: Cloner un fragment d'adn consiste à: isoler physiquement ce fragment. en augmenter le nombre de copie (cf: amplification) II) Principe: Le clonage

Plus en détail

Procédure normalisée de fonctionnement du RCBT Dérivés de tissus Extraction d ARN

Procédure normalisée de fonctionnement du RCBT Dérivés de tissus Extraction d ARN Procédure normalisée de fonctionnement du RCBT Dérivés de tissus Extraction d ARN Numéro de PNF: 08.03.009 Version: f2.0 Remplace: 8.3.009 f1.0 Catégorie: Manipulation et documentation du matériel Tissu

Plus en détail

Les principes du sequençage haut-débit

Les principes du sequençage haut-débit Les principes du sequençage haut-débit Mardi 23 avril 2013 Dr H. EL HOUSNI Organisation Génomique Podhala'et'al.'Trends'in'genetics'2012' Costa V et al. J BioMed BioTech 2010 32 ans Costa V et al. J BioMed

Plus en détail

Techniques de biologie moléculaire utilisées dans un cadre diagnostique. A. CALENDER 7.11 couvrant l ensemble des techniques

Techniques de biologie moléculaire utilisées dans un cadre diagnostique. A. CALENDER 7.11 couvrant l ensemble des techniques Techniques de biologie moléculaire utilisées dans un cadre diagnostique A. CALENDER 7.11 couvrant l ensemble des techniques Introduction Diagnostic clinique Confirmation par l analyse génétique Traitement

Plus en détail

Organisation et gestion des prescriptions en oncogénétique

Organisation et gestion des prescriptions en oncogénétique PR-0408.02 Page 1 / 5 OBJET : Ce document a pour objectif de définir tous les éléments concernant la partie préanalytique et post analytique nécessaires pour : - réaliser un criblage dans les gènes BRCA1

Plus en détail

BACCALAURÉAT TECHNOLOGIQUE

BACCALAURÉAT TECHNOLOGIQUE BACCALAURÉAT TECHNOLOGIQUE Série : Sciences et Technologies de Laboratoire Spécialité : Biotechnologies SESSION 2013 Sous-épreuve écrite de Biotechnologies Coefficient de la sous-épreuve : 4 Ce sujet est

Plus en détail

Quelques notions de génomique fonctionnelle: l exemple des puces à ADN

Quelques notions de génomique fonctionnelle: l exemple des puces à ADN Quelques notions de génomique fonctionnelle: l exemple des puces à ADN Frédéric Devaux Laboratoire de génétique moléculaire Ecole Normale Supérieure Le «dogme central» de la biologie moléculaire Transcription

Plus en détail

Diagnostic moléculaire des tumeurs solides,! l'expérience Rennaise!

Diagnostic moléculaire des tumeurs solides,! l'expérience Rennaise! Diagnostic moléculaire des tumeurs solides, l'expérience Rennaise Bioinformaticien, Biologiste moléculaire, Biostatisticien, Biologiste B. Ndiaye, M. de Tayrac, J. & A. Mosser Le#séquençage#à#haut#débit#NGS#dans#le#cadre#du#diagnos9c##

Plus en détail

GENETIQUE MEDICALE - Principe des études moléculaires en Génétique Médicale, Méthodes d analyse des microlésions du Génome

GENETIQUE MEDICALE - Principe des études moléculaires en Génétique Médicale, Méthodes d analyse des microlésions du Génome 29/10/2014 Crévits Léna L2 Génétique médicale Dr Martin Krahn 14 pages Principe des études moléculaires en Génétique Médicale - Méthodes d analyse des microlésions du Génome Plan A. Rappels et généralités

Plus en détail

Détection de mutations somatiques par NGS sur GAIIx

Détection de mutations somatiques par NGS sur GAIIx Détection de mutations somatiques par NGS sur GAIIx Aude Lamy Laboratoire de Génétique Somatique des Tumeurs CHU de Rouen Inserm U1079 Faculté de Médecine et Pharmacie de Rouen La médecine personalisée

Plus en détail

Licence-Master Bioinformatique Contrôle continu 06/03/06. Correction

Licence-Master Bioinformatique Contrôle continu 06/03/06. Correction Licence-Master Bioinformatique Contrôle continu 06/03/06 Correction -«Vraies» questions de cours -«fausses» questions de cours: questions pour voir si pouviez imaginer une réponse crédible qui n était

Plus en détail

altona altona RealStar WNV RT-PCR Kit 1.0 always a drop ahead. 07/2015 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany

altona altona RealStar WNV RT-PCR Kit 1.0 always a drop ahead. 07/2015 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany altona DIAGNOSTICS altona DIAGNOSTICS RealStar WNV RT-PCR Kit 1.0 07/2015 altona Diagnostics GmbH Mörkenstr. 12 22767 Hamburg Germany phone +49 40 548 06 76-0 fax +49 40 548 06 76-10 e-mail info@altona-diagnostics.com

Plus en détail

Techniques de base de la biologie moléculaire

Techniques de base de la biologie moléculaire Techniques de base de la biologie moléculaire Présenté par : Addoun Hadjer Ait Saadi Taous Plan: Introduction Purification des acides nucléiques 1-extraction à partir de matériels biologiques 2-estimation

Plus en détail

Institut de Génomique. olaso@cng.fr

Institut de Génomique. olaso@cng.fr Institut de Génomique PCR quantitative : état des lieux... (de la théorie à la pratique, MIQE, CQ et stratégie de normalisation) olaso@cng.fr Microarray data qpcr data? Règles générales pour la présentation

Plus en détail

Spectrophotomètre double faisceau modèle 6800

Spectrophotomètre double faisceau modèle 6800 Spectrophotomètre double faisceau modèle 6800 Spectrophotomètre double faisceau modèle 6800 Double faisceau avec optiques parfaitement stables. Bande passante 1,5 nm. Logiciel de navigation Jenway Flight

Plus en détail

Tumeurs du sein triple négatif: Biologie moléculaire et projets de recherche

Tumeurs du sein triple négatif: Biologie moléculaire et projets de recherche 64 ème réunion du GERM Tumeurs du sein triple négatif: Biologie moléculaire et projets de recherche Tumeurs du sein triple négatif (TN) 12-17% des cancers du sein Contexte familial porteuses des mutations

Plus en détail

2: Les enzymes de restriction

2: Les enzymes de restriction 2: Les enzymes de restriction Les enzymes de restriction sont des protéines synthétisées par des bactéries pour se protéger des infections de virus (bactériophages). Ces enzymes coupent l ADN viral à des

Plus en détail

Maxwell 16 Blood DNA Purification System

Maxwell 16 Blood DNA Purification System Manuel Technique Maxwell 16 Blood DNA Purification System Attention, cartouches à manipuler avec précaution, les bords scellés peuvent être tranchants. 2800 Woods Hollow Rd. Madison, WI USA Dispositif

Plus en détail

N PSO : 04_00_00_08_002.doc. Version : 12 Date : 01/06/2015 Page 1 sur 9 Manuel de prélèvement des échantillons primaires

N PSO : 04_00_00_08_002.doc. Version : 12 Date : 01/06/2015 Page 1 sur 9 Manuel de prélèvement des échantillons primaires Version : 12 Date : 01/06/2015 Page 1 sur 9 Vérificateurs : Pascale COCHAUX, Barbara DESSARS, Anne DE LEENER, Nadine CLAIS, Eric STIEVENART, Emmanuel USABYIMFURA CONTENU 1. Objet... 1 2. Domaine d application...

Plus en détail

SERVICES DE SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION

SERVICES DE SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION 2015-09-29 SERVICES DE SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION Centre d innovation Génome Québec et Université McGill Guide de l utilisateur: Technologies de séquençage Illumina Version 5.6 Copyright 2015 Centre

Plus en détail

ECUE 2 (L 1 -S 2 ) : Microbiologie générale Microbiologie générale

ECUE 2 (L 1 -S 2 ) : Microbiologie générale Microbiologie générale Unité d enseignement UE 8 : Biologie Moléculaire - Microbiologie ECUE 2 (L 1 -S 2 ) : Microbiologie générale Microbiologie générale 1h30 de cours et 1h15 de Travaux pratiques Un examen écrit ; un examen

Plus en détail

Approche pratique de la transgénèse :

Approche pratique de la transgénèse : Approche pratique de la transgénèse : Recherche et analyse fine d une modification génétique dans le génome murin octobre 2006 1) 2) 3) 7) 8) 9) 10) 11) 12) 13) 14) Plan / Introduction Extraction et Préparation

Plus en détail

Atelier : Détection de la mort cellulaire par apoptose en réponse à un agent anti-tumoral.

Atelier : Détection de la mort cellulaire par apoptose en réponse à un agent anti-tumoral. - La cytométrie en flux est une méthode d analyse de cellules en suspension, véhiculées à grande vitesse jusqu à une chambre d analyse traversée par des faisceaux lasers. L interaction des cellules avec

Plus en détail

Biomarqueurs en Cancérologie

Biomarqueurs en Cancérologie Biomarqueurs en Cancérologie Définition, détermination, usage Biomarqueurs et Cancer: définition Anomalie(s) quantitative(s) ou qualitative(s) Indicative(s) ou caractéristique(s) d un cancer ou de certaines

Plus en détail

I. TOUITOU (Mise ligne 15/10/08 LIPCOM-RM) Faculté de Médecine Montpellier-Nîmes

I. TOUITOU (Mise ligne 15/10/08 LIPCOM-RM) Faculté de Médecine Montpellier-Nîmes er cycle PCEM MI5 Génétique moléculaire et clinique Année Universitaire 008-009 Comment apprécier la composante héréditaire des maladies?. Excès de cas familiaux - Les études familiales - - La plupart

Plus en détail