Retour d expérience d outils autour d EML. Marie-Claude Quidoz (CEFE) Atelier FRB : 02/04/2014

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1 Retour d expérience d outils autour d EML Marie-Claude Quidoz (CEFE) Atelier FRB : 02/04/2014

2 Contexte de l expérience 2 visions des métadonnées : Le fournisseur informe les potentiels utilisateurs des caractéristiques de ses données L utilisateur découvre des ressources et évalue leur pertinence pour ses besoins Description des attributs indispensables Fournir les métadonnées selon plusieurs standards ISO 19115/INSPIRE, EML, Darwin Core

3 Outils recensés Critères retenus Fournissent des métadonnées au format EML Interface de saisie & de consultation Open source «Soutenu» par des références dans le domaine de l environnement Outils étudiés (chronologiquement) Metacat (avec Morpho) (NCEAS) DEIMS (LTER) BDD ODS - phénologie d Isabelle Chuine Appartient au réseau thématique Citoscope (FRB)

4 Metacat (1) Outil de catalogage Fonctionnalités Catalogue de métadonnées Dépôt de données (fichier csv) Interface conviviale pour la saisie et la recherche Interface de programmation d'application (API ) Caractéristiques Informations stockées en XML Standard : EML, ISO19139, FGDC Biological Data Profile Deux mécanismes intéressants Réplication (sécurité) Moissonnage (centralisation de l information)

5 Metacat (2) Popularité Largement utilisé dans le monde entier pour gérer les données environnementales. Elément clé de l'infrastructure pour les catalogues de données (NCEAS, KNB, LTER,..) et pour le système DataOne. Pratique Application web en Java (Windows, Linux, Mac OS) PostgreSQL Version (February, 2014) Documentation Metacat Administrator s Guide (https://knb.ecoinformatics.org/knb/docs/) 2 outils de saisie (Morpho, formulaire intégré)

6 Test de la saisie avec Morpho Points forts Client lourd / multiplateforme / interface graphique Créer et organiser des métadonnées comme des données localement ou sur un serveur metacat Présence de thésaurus et de tables d unité Prend en compte «eml-datatable module» Module de recherche (pas testé) Outil intéressant mais qui a pris un sacré coup de vieux!

7 Test de la saisie avec le formulaire Formulaire assez complet ( manque «eml-datatable») Aide en ligne Permet la saisie mais pas la correction (bug?) Outil pas adapté aux attentes du CEFE Remarque : pas étudiée les possibilités d adaptation

8 Bilan provisoire / Metacat Avantages Logiciel maintenu (à nuancer) Installation du produit facile Visualisation des attributs (eml-datatable) Clients (saisie) disponibles Recherche ciblée (assez fine) Inconvénients : Visualisation pas très jolie Paramétrage et configuration difficile Pas de clients idéals Liste de diffusion pas très réactive Conclusion : Des tentatives d amélioration de visualisation faites en collaboration avec l OSU OREME mais non concluant Investissement trop important pour le CEFE

9 Quelques liens de serveurs Metacat LTER Data Portal (http://metacat.lternet.edu/das/lter/index.jsp) LTER Europe (http://data.lter-europe.net/knb/) JALTER (http://db.cger.nies.go.jp/jalter/) BiK-F (http://dataportal-senckenberg.de/database/metacat) TERN (http://www.ternsupersites.net.au/knb/metacat/lloyd.191/asn) NCEAS (http://knb.ecoinformatics.org/knb/metacat) KNB (http://knb.ecoinformatics.org/ ) GBIF Finlandais (http://meta.gbif.fi/meta/) Metacat OSU OREME (http:// /metacatui/)

10 DEIMS (1) Drupal Ecological Information Management System Module Drupal pour stocker, éditer, et partager des données et des informations dans le domaine de la biologie et de l écologie Projet initié en 2008 Développé en partenariat entre le Réseau US Long Term Ecological Research, 3 Universités (Nouveau-Mexique, Porto Rico, Wisconsin) et depuis Mars 2013 avec Palantir.net (version actuelle 7.x-1-dev)

11 DEIMS (2) Editeur de métadonnées conviviale associée à des fonctionnalités pour construire facilement des outils de découverte de données, d affichage voir de téléchargement. Des fonctionnalités intéressantes Web services (ISO, EML, BDP) Grande souplesse de personnalisation Grand nombre de modules (description des attributs, des personnes, des organismes, des publications, ) Un «site de test» sur le site de LTER Europe

12 Bilan provisoire / DEIMS Avantages Applicatif maintenu et basé sur un CMS connu Installation du produit facile (sur MySQL) Module pour la gestion des attributs (datasource) Liste de diffusion réactive Inconvénients «Légo» à monter Utilisateurs peu nombreux mais proche de nous Conclusion Produit intéressant pour le CEFE

13 Pré-projet CEFE Définir le profil des métadonnées Utiliser les potentialité de DEIMS pour construire le catalogage des BDD du CEFE saisie, recherche et affichage Ajouter une fonctionnalité pour faire des «datapaper» Etudier le partage des données avec d autres catalogues Metacat (EML) & Geosource (ISO19115) Une voie à suivre : Poster-ENVEurope.pdf?

14 Geosource Projet français porté par la DGME (MEDDE) Basé sur Geonetwork Projet initié en 2008 Développé par le BRGM (version actuelle 2.9-1)

15 Geosource Catalogue de métadonnées conforme aux standards ISO & OGC Les plus Moissonnage Ergonomie de l interface actuelle Aide à la saisie Gestion d annuaires et de thésaurus Une communauté d utilisateurs large

16 Bilan provisoire / Geosource Avantages Outil «officiel» français Aide à la saisie très détaillée Outil moissonnable Implémentation du profil Inspire Liste de diffusion (de plus en plus) active Inconvénients Installation et maintenance pas toujours aisées Personnalisation peu aisée ISO donc peu de champs «spécifiques» biodiversité

17 Références Poster : EnvEurope DEIMS Making European Long-Term Ecological Data Available Via The Internet IH2013_Demos/D5-EnvEurope.pdf Tests faits au CEFE Metacat OSU DEIMS CEFE (accès privé)

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