Table des matières 0 - Remarques préliminaires

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1 Mémo MIDAS Projet expérimentaux du M2 AAIS Observatoire de Paris Spectroscopie à Haute Résolution Table Equatoriale/T60 Catherine Boisson & Miguel Montargès - 29/09/2013 Table des matières 0 - Remarques préliminaires...1 a) Pour lancer MIDAS...2 b) Pour vérifier que MIDAS fonctionne correctement...2 c) Pour obtenir l'aide en ligne...2 d) Commandes UNIX...2 e) Répertoire de travail...2 I Manipulation d'images...3 a) Caractéristiques...3 b) Ouverture d'une image...3 c) Inspection d'une image...3 d) Opérations sur des images...3 e) Lecture d'une table...4 f) Sauvegarde d'un fichier FITS...4 g) Sauvegarde de l'affichage...4 II - Graphiques...4 a) Création...4 b) Options...5 c) Affichage...5 d) Ajustement de raies...5 e) Exporter un graphique...5 III Catalogues...5 IV Procédures...5 V Commandes en vrac pouvant être utiles Remarques préliminaires - Pour télécharger MIDAS : - Pour installer MIDAS : 1/6

2 Dans la suite du document, les lignes commençant par un $ indiqueront des commandes à exécuter dans le terminal (bash ou tcsh) de votre système. Si elles sont suivies par un # la suite du texte est un commentaire. Les lignes commençant par un > doivent être exécutées dans MIDAS. Si elles sont suivies par un! la suite du du texte est un commentaire a) Pour lancer MIDAS $ inmidas # Lance une nouvelle session de MIDAS, l'historique est perdu $ gomidas # Redémarre MIDAS en conservant l'historique des commandes précédentes > bye! Quitte MIDAS b) Pour vérifier que MIDAS fonctionne correctement Se placer dans un nouveau dossier vierge (la procédure ci-dessous va le remplir d'une multitude de fichiers) $ inmidas vericopy veriall Laisser mouliner... Si MIDAS est bien installé, plein de graphes vont apparaître et être modifiés. Vérifier à la fin qu'il n'y a pas de message d'erreur dans le terminal. Notez que vous voyez ici une démonstration des possibilités de MIDAS, les procédures utilisées sont dans le dossier que vous avez créé et se nomment verify*.prg c) Pour obtenir l'aide en ligne > crea/gui help Pour naviguer dans l'interface, faire des double-clics sur les mots-clés. Attention : pour quitter cette interface, passer impérativement par le menu File>Exit. d) Commandes UNIX Depuis MIDAS, pour exécuter des commandes UNIX, il suffit de les précéder par un $. > $ ls *.fits! Par exemple cette commande va lister tous les fichiers FITS du répertoire courant e) Répertoire de travail > change/dir /home/toto/bureau/monbeaudossier! Permet de changer le répertoire de travail de MIDAS (ici on va dans /home/toto/bureau/monbeaudossier) 2/6

3 I Manipulation d'images a) Caractéristiques > read/descr fichier.fits! Cette commande lit l'en-tête du fichier FITS (ou descripteur) > stat/ima fichier.fits! Cette commande renvoie des statistiques sur l'image > stat/ima fichier.fits Pareil en se limitant à une portion de l'image Remarque sur les coordonnées de l'image : b) Ouverture d'une image > load/ima fichier.fits! Charge et affiche le fichier (et ouvre automatiquement une fenêtre) > load/ima fichier.fits, cuts=d! Charge et affiche le fichier avec les cuts par défaut (3 sigma) > load/ima fichier.fits, cuts=f, method! Charge et affiche le fichier avec les cuts donnés par la méthode choisie (cf l'aide) > load/lut heat! Permet d'utiliser une palette de couleur chaleureuse > crea/disp! Permet de créer une fenêtre vite et d'y afficher ensuite une image via les fonctions ci-dessus. > reset/disp! Permet de ré-initialiser à la fois le système d'affichage d'image et la fenêtre graphique (utile en cas de mauvaise manipulation) c) Inspection d'une image > get/curs! La souris devient un curseur. Cliquer dans l'image pour afficher les informations. Pour reprendre la main dans le terminal, faire un clic droit quelque part dans l'image d) Opérations sur des images Pour faire des opérations courantes sur des images : > compute/ima out = fichier1 + fichier2! Stocke la somme de 2 fichiers dans out.bdf. Fonctionne aussi avec et * et / Opération également très utile : > average/ima out = nom1,nom2,nom3? + median! Médiane sur plusieurs fichiers > rename/ima old new! Renomme une image Sous-ensemble : > extract/ima out = fichier[@xstart,@ystart:@xend,@yend]! Extrait une portion d'image Niveaux : > cut/ima fichier.bdf min,max! Permet de redéfinir les niveaux d'affichage (on ne regarde plus que les valeurs entre min et max) 3/6

4 Rotation : > rebin/rotate input output [angle,rotx,roty,scalx,scaly]! Effectue une rotation de l'image autour du point (rotx,roty) d'un angle exprimé en degrés (+ = sens horaire). scalx scaly permettent de changer l échantillonnage (mettre 1 pour conserver le précédent). Suppression d'un cosmique : > modify/gcurs fichier! Cliquer avant et après le cosmique, une interpolation linéaire est faite entre les 2 points (les données originales sont écrasées) Nettoyage : > filter/median image_in image_out 3,3,0.05 NQ! Nettoie une image en utilisant un filtre median e) Lecture d'une table > read/tab table.tbl! Lit le contenu d'une table (fichier table.tbl) f) Sauvegarde d'un fichier FITS Remarque : Après manipulation d'une image, MIDAS crée un fichier.bdf (bulk data file) qui est le format de travail de MIDAS. Il est impératif de convertir à nouveau le.bdf en FITS quand on a fini de travailler dessus car un fichier BDF est lié au système sur lequel il a été écrit (32/64 bits, Linux, Mac OS, Windows). > outdisk/fits fichier.bdf fichier.fits! Conversion en FITS g) Sauvegarde de l'affichage Soyons clairs tout de suite : une capture d'écran, c'est moche (car ça a la résolution de l'écran qui est en général inférieure à la résolution de l'image qu'on affiche). Pour exporter un affichage > copy/disp! Exporte l'affichage courant dans screen99.ps > $ cp screen99.ps mon_affichage.ps! On fait une copie du fichier.ps pour éviter qu'il ne soit écrasé lors de la prochaine exportation > $ gv mon_affichage.ps! Affiche rapidement le fichier.ps dans Linux II - Graphiques Par graphique on entend des affichages y = f(x) et non plus des images z = f(x,y). a) Création > crea/grap 17! Créé la fenêtre graphique n 17 avec les dimensions par défaut > crea/grap 0 xsize,ysize,xoffset,yoffset! Créé la fenêtre graphique n 0 avec les dimensions spécifiées (attention à ne pas dépasser la résolution de l'écran : ça peut donner des choses difficiles à gérer) 4/6

5 b) Options > set/grap pmode=1! Supprime la pub de MIDAS > set/grap binmode=on! Pour faire des histogrammes > set/grap coulour=2! Défini la couleur du tracé (cf : aide) > set/graph yaxis ystart,yend! Fixe l'échelle verticale c) Affichage > Affiche la ligne N du fichier entre les colonnes xstart et xend > over Affiche également la ligne M du fichier 2 d) Ajustement de raies > center/gauss gcurs[,color]! Permet d'ajuster une raie par une gaussienne en émission (cliquer de chaque côté de la raie, si color (red, blue, green,...) est précisé, les curseur seront colorés) > center/gauss gcurs[,red]? a! Permet d'ajuster une raie par une gaussienne en absorption, les curseurs apparaîtront rouges Remarque : faire un clic droit dans le fenêtre graphique pour récupérer la main dans le terminal e) Exporter un graphique > copy/grap laser! Cette commande sauvegarde le graphique courant dans ps2usr0.ps > $ cp ps2usr0.ps mon_graphique.ps! Permet de s'assurer que le graphique ne sera pas écrasé par le prochain export > $ gv mon_graphique.ps! Permet de visualiser rapidement le graphique sauvegardé III Catalogues Les catalogues permettent de regrouper des images et de les manipuler ensemble dans avoir à taper à chaque fois leur nom individuel > crea/icat mon_catalogue nom1,nom2,nom3! Créé le catalogue «mon_catalogue» contenant les images «nom1», «nom2» et «nom3» > read/icat mon_catalogue.cat! Lit le catalogue (affiche le nom des images et leurs dimensions) > aver/ima out = mon_catalogue.cat! Exécute la moyenne de tous les fichiers du catalogue IV Procédures Les procédures sont des ensembles de commandes Midas qui sont regroupées dans un fichier pour être exécutées à la suite les unes des autres (utile si on doit faire plusieurs fois les mêmes manipulations). Elle se terminent par l'extension.prg 5/6

6 arg1! Permet de lancer la procédure toto.prg située dans le dossier courant prenant l'argument arg1 V Commandes en vrac pouvant être utiles Utiliser l'aide pour plus de précisions. clear/channel write/descr plot/row plot/col over/row over/col grow/ima aver/row aver/col rebin/lin integrate/line (flux d'une raie) 6/6