Prélèvement et envoi d échantillons Centre national de référence pour les maladies transmises par les tiques NRZK

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1 Janvier 2016 Prélèvement et envoi d échantillons Centre national de référence pour les maladies transmises par les tiques NRZK Ce document est une compilation basée sur les listes d analyse des instituts partenaires du NRZK. Les instructions des instituts sont toujours obligeantes (ADMED Microbiologie, Institut de Microbiologie du CHUV, LABORATOIRE SPIEZ). Veuillez contacter le laboratoire correspondant avant l envoi des échantillons. 1. Responsabilités de la phase préanalytique Il incombe à l'expéditeur de prélever correctement les échantillons, de désigner clairement les récipients qui les contiennent, de remplir dûment le formulaire de demande d'analyse, d'entreposer adéquatement les échantillons avant leur transport et de coordonner leur envoi. Il est de sa responsabilité de prévenir par téléphone les laboratoires qui seront chargés d'effectuer les analyses. Les laboratoires du NRZK sont tenus de se mettre en contact avec l'expéditeur en cas de doutes quant au mandat d'analyse ou d'échantillons ne satisfaisant pas les exigences de qualité qu'impose le NRZK. 1/7

2 2. Matériaux Agent Recherche Matériel Récipient Volume Conservation/Envoi Borrelia burgdorferi s.l. IgG, IgM, dépistage et confirmation IgG, IgM, production intrathécale Sérum Monovette sérum (blanc), sérum-gel (brun) 5 ml Conservation: frigo 4 C, Plasma Monovette EDTA (rouge) 5 ml Conservation: frigo 4 C, LCR et Sérum/plasma Tube stérile 1 ml chaque Conservation: frigo 4 C, Amplification génique Liquide synovial Tube stérile 1 ml Conservation: frigo 4 C, Biopsie synoviale Tube stérile ou milieu BSK II - Conservation: frigo 4 C, Biopsie de peau Tube stérile ou milieu BSK II - Conservation: frigo 4 C, LCR Tube stérile 1 ml Conservation: frigo 4 C, Envoi: temp. Ambiante Culture Biopsie milieu BSK II; sur demande - Envoi: temp. Ambiante, Chemokine CXCL13 LCR et sérum Tube stérile 1 ml chaque Conservation: frigo 4 C, Envoi: temp. Ambiante Coxiella burnetii IgG, IgM (Phase I, II) Sérum Monovette sérum (blanc) Plasma Monovette EDTA (rouge) Amplification génique Sérum Monovette sérum (blanc) Echantillons respiratoires Tube stérile - Conservation: frigo 4 C, Biopsies Tube stérile - Conservation: frigo 4 C, FSME IgG, IgM Sérum Monovette sérum (blanc), sérum-gel (brun) Vacutainer Tube à sérum sans (rouge) ou avec (jaune) granules Plasma Monovette EDTA (rouge), héparine (orange), citrate (violet/vert) Vacutainer EDTA (violet), héparine (vert), citrate (bleu/noir) LCR Tube stérile 0.5 ml Conservation: frigo 4 C, Amplification génique Sérum Monovette sérum (blanc), sérum-gel (brun) Vacutainer Tube à sérum sans (rouge) ou avec (jaune) granules Plasma Monovette EDTA (rouge), citrate (violet/vert) Vacutainer EDTA (violet), citrate (bleu/noir) LCR Tube stérile 0.5 ml Conservation: frigo 4 C, 2/7

3 3. Prélèvement d'échantillons Matériel biopsique: Opération d'échantillonnage. Pour éviter que l'échantillon ne sèche, placer les petites biopsies sur des tampons de gaze stériles humectés de solution de chlorure de sodium physiologique. Introduire les échantillons de plus grand taille dans des récipients stériles sans solution saline. NE PAS utiliser de formaline! A noter: pour la détection en culture/par PCR de Borrelia spp., il faut (éventuellement) utiliser un milieu BSK II disponible sur demande auprès du laboratoire compétent (ADMED MICROBIOLOGIE). Veuillez donc contacter le laboratoire responsable (ADMED). une température de 2 à 8 C. Dans la mesure du possible, il convient de procéder à la prise d'échantillon AVANT le début d'une thérapie antimicrobienne. Echantillons sangiuns (sang, sérum, plasma): Prélèvement d'échantillons selon la méthode classique de la prise de sang veineux. Utilisation des tubes spécifiés dans le tableau. Conservation de l'échantillon à une température de 2 à 8 C. Liquide céphalo-rachidien: Prélèvement selon la méthode classique de la ponction lombaire. Introduire l'échantillon dans un récipient stérile et bien le fermer. une température de 2 à 8 C. Liquides de ponction: Prélèvement selon la méthode classique de la ponction. Introduire les ponctions dans un récipient stérile et bien le fermer. NE PAS utiliser de formaline! une température de 2 à 8 C. 3/7

4 Dans la mesure du possible, il convient de procéder à la prise d'échantillon AVANT le début d'une thérapie antimicrobienne. Echantillons respiratoires: Lavage broncho-alvéolaire (LBA): prélèvement des échantillons selon la méthode classique. Sécrétion trachéo-bronchique: obtention par aspiration. Crachat: rinçage buccal à l'eau du robinet; obtention du crachat après plusieurs inspirations profondes par expectoration du mucus des voies respiratoires profondes. Après prélèvement, introduire les échantillons dans un récipient stérile et bien le fermer. une température de 2 à 8 C. 4. Désignation des échantillons à examiner Chaque matière envoyée doit être identifiable de manière univoque. Mentions obligatoires: nom, prénom, date de naissance et sexe du patient ainsi qu'éventuellement le numéro interne de l'échantillon, spécifié par le laboratoire. 5. Formulaires de demande d'analyse Chaque demande d'examen adressée au NRZK doit être accompagnée d'un formulaire du laboratoire compétent dûment rempli. Les formulaires renseigneront sur: L'expéditeur: nom, adresse exacte, n de téléphone ou de fax (pour demandes de renseignements et envoi des résultats). Le patient: nom, date de naissance, adresse exacte et, éventuellement, le numéro interne de l'échantillon, spécifié par le laboratoire. L'échantillon: désignation de la matière, date et heure du prélèvement. Le cas: contexte clinique, si possible avec des éléments de l'anamnèse. L'examen demandé: sélection de l'analyse souhaitée. 6. Emballage et envoi L'envoi d'échantillons cliniques aux laboratoires du NRZK est soumis aux dispositions concernant le transport de matériel biologique (instructions d'emballage de l'oms, ONU 3373, P 650). Les échantillons cliniques appartiennent à la catégorie B. 4/7

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6 Catégorie B: l'empaquetage est triple: Un récipient primaire incassable (ni en verre, ni en polycarbonate) doté d'une fermeture hermétique; l'extérieur du récipient doit être désinfecté après le prélèvement de l'échantillon. Un récipient secondaire rigide renfermant suffisamment de matériel absorbant pour retenir tout le contenu d'un échantillon liquide (il est autorisé de placer plusieurs récipients primaires dans le même récipient secondaire). Un emballage extérieur faisant mention des noms et adresses de l'expéditeur et du destinataire et portant l'indication "Matière biologique de catégorie B" et le numéro ONU Les agents cultivés seront envoyés conformément aux prescriptions sur les marchandises dangereuses (p. ex. SDR/ADR). Les agents cultivés peuvent appartenir soit à la catégorie A soit à la catégorie B (ONU 2814 et ONU 3373). 6/7

7 7. Contacts Veuillez adresser vos questions d'ordre général à l'administration du NRZK dont le siège est au LABORATOIRE SPIEZ. Les laboratoires concernés renseignent sur les procédures liées aux tests de diagnostic. Les échantillons pour diagnostic doivent être envoyés, selon le point "6. Emballage et envoi", aux adresses postales indiquées. Labor LABORATOIRE SPIEZ Austrasse 3700 Spiez Tél Fax Mail ADMED MICROBIOLOGIE Boucle de Cydalise La Chaux-de-Fonds Tél Fax Mail Institut de Microbiologie du CHUV Prof. Dr. med. G. Greub Rue du Bugnon Lausanne Tél Fax Mail Question/recherche Questions administratives Diagnostic de référence et questions techniques concernant la MEVE Diagnostic de référence et questions techniques concernant Borrelia burgdorferi s.l. Diagnostic de référence et questions techniques concernant Coxiella burnetii 7/7