MICROBIOLOGIE ET PHYSICO-CHIMIE DES BIOFILMS

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1 École Thématique CNRS MICROBIOLOGIE ET PHYSICO-CHIMIE DES BIOFILMS Une école financée et gérée par la délégation Centre-Est du CNRS avec le soutien de Nancy-Université (université Henri Poincaré et institut national polytechnique de Lorraine) et de l'école doctorale BioSE. Parrainée par la société française de microbiologie. Comité d'organisation : Fabien Gaboriaud, Frédéric Jorand Comité scientifique : Jérôme Duval, Grégory Francius, Fabien Gaboriaud, Frédéric Jorand, Bruno Lartiges, Christophe Merlin. Du lundi 19 octobre au soir au vendredi 23 Octobre 2009 au matin. Au Club Med Vittel le parc (Vittel, 88), 4 jours en résidentiel. Frais d'inscription de 500 à 750 HT selon statuts (gratuit pour les personnels CNRS) Inscriptions Caroline François Bureau formation permanente - Délégation Centre-Est 17 rue Notre-Dame des Pauvres, B.P Vandœuvre-lès-Nancy cedex Tél. : / Télécopie : rh.fp@dr6.cnrs.fr Renseignements : Frédéric Jorand, LCPME UMR , rue de Vandœuvre Villers-les-Nancy Tél : / Télécopie : jorand@lcpme.cnrs-nancy.fr 1

2 Modules du programme Module I. Notions de base en microbiologie et en physicochimie Structure et fonctions de la cellule bactérienne, les enveloppes bactériennes, bases de génétique bactérienne Physico-chimie des surfaces et des interfaces Module II. Bioadhésion Conditionnement des surfaces : interactions protéines surfaces Physico-chimie des interphases biologiques Méthodes biophysiques d étude de l adhésion bactérienne Nanomicrobiologie Module III. Travaux dirigés / Tables rondes : aspects méthodologiques Les propriétés de surface des cellules microbiennes Suivi et conception de biofilms au laboratoire Module IV. Régulations et activités microbiennes dans les biofilms Perception des surfaces et expression de gènes spécifiques à la croissance en biofilm Les transferts génétiques au sein des biofilms Virus et biofilms Module V. Les biofilms du milieu naturel et anthropisé Les biofilms de rivière Analyses in situ par approche moléculaire Biofilms "multi-espèces" Module VI. Usage des biofilms et lutte contre les biofilms Les biofilms du milieu agro-alimentaire Installation d un biofilm dans un réseau d eau potable Surfaces anti-adhésives Biofilms et production d énergie Biofilms et biodétérioration. 2

3 Du lundi 19 (soir) au vendredi 23 (matin) octobre 2009 Effectif attendu (tous compris) : 60 personnes PROGRAMME lundi 19 octobre Accueil en soirée sur le site 18h 19h30 Présentation de l école et accueil par les organisateurs Apéritif d accueil 20h00 Dîner Mardi 20 octobre Module I. Notions de base en microbiologie et en physicochimie. 8h30 10h15 Structure et fonctions de la cellule bactérienne, bases de génétique Bactérienne - F. Jorand & C. Merlin (UHP - Nancy-Université) cours 1h30 10h15 10h45 : Pause café (devant les posters) 10h45 12h30 : Physico-chimie des surfaces et des interfaces - P. Rouxhet (UCL - Louvain, B.) cours1h30 Pause déjeuner Module II. Bioadhésion 14h00 15h00 : Physico-chimie des interphases biologiques - J. Duval (CNRS - Nancy) cours 45 mn 15h00-16h00 : Conditionnement des surfaces : interactions protéines matériaux P. Rouxhet (UCL - Louvain, B.) conférence 45 mn 16h00-16h30 : Pause café & posters 16h30 17h15 : L adhésion bactérienne en cytométrie en flux N. Henri (Institut Curie - Paris) conférence 30 mn 17h15 18h00 : Nanomicrobiologie - Y. Dufrêne (UCL - Louvain, B.) conférence 30 mn 19h00 : Dîner 3

4 Mercredi 21 octobre Module III. Travaux dirigés / Table ronde traitant des aspects méthodologiques 08h30 10h00 : Groupe A (25 pers max) :- Propriétés de surface des cellules microbiennes- animé par Jérôme Duval & Grégory Francius, Groupe B (25 pers max) :- Suivi et conception de biofilms au laboratoire animé par Christophe Merlin & Bruno Lartiges, 10h00 10h30 : pause café 10h30 12h00 : Groupe B & A, mêmes séances en alternance. 12h 14h : pause déjeuner 14h00 18h00 18h00 19 h00 Activités détentes en groupe pour favoriser la communication entre personnes et mieux se connaître. Présentation flash des posters (1, 2 diapo par poster, 5 mn max discussion comprise, max posters). 19h : dîner 21h00 22h00 : Formation des biofilms chez E. coli: "Les dessous de la vie sur les surfaces" C. Beloin (Institut Pasteur - Paris) En introduction du module IV. Conférence - débat 1h00 Jeudi 22 octobre Module IV : Régulations et activités microbiennes dans les biofilms 08h30 09h15 : 09h15 09h45 : Perception des surfaces par la cellule bactérienne et expression de gènes spécifiques à la croissance en biofilms - C. Dorel (INSA - Lyon) cours 30 mn Les transferts génétiques au sein des biofilms - Eva Top (Moscow, Idaho University, USA) (sous réserve) 09h45 10h15 : Virus et biofilms - C. Gantzer (UHP - Nancy-Université) 10h15 10h45 : Pause café Module V : Les biofilms du milieu naturel et anthropisé 10h45 11h30 : 11h30 12h00 : Des biofilms témoins et acteurs du fonctionnement de la rivière F. Garabetian (Université Bordeaux 1) cours 30 mn Compétition et socialisation dans des biofilms dégradants des polluants - effets de changements environnementaux - Dirk Springael (UCL - Louvain, B.) 12h00 12h30 : Analyses in situ (FISH, nanosims) de biofilms complexes Th. Bouchez (CEMAGREF - Antony) 4

5 12h30 : Pause déjeuner Module VI. Usage des biofilms et lutte contre les biofilms 14 h 15 h : Les biofilms de la chaîne alimentaire : dynamiques d'installation et moyens de maîtrise R. Briandet (INRA - Jouy) cours 45 mn 15h- 15h30 : Biofilms en réseaux d'eaux potables : structures, propriétés et contrôle JC Block (UHP - Nancy-Université 15h30 16h00 : Surfaces anti-adhésives et/ou antibactériennes Th. Jouenne (CNRS - Rouen) 16h00 16h30 : Pause café 16h30 17h00 : 17h00 17h30 : 17h30 18h00 : Biofilms électro-actifs et production d énergie A. Bergel (CNRS - Toulouse) Développement de biofilms aux interfaces eaux - composés organiques hydrophobes R. Grimaud (Université de Pau et des pays de l'adour) Biofilms et biodétérioration des matériaux cimentaires F. Feugeas (INSA Strasbourg) 19h : dîner Soirée conviviale - pot de départ vendredi 23 octobre 9h00-10h00. 10h00 : Conclusion - discussion Bilan des acquis sur les biofilms, orientation de la recherche sur les biofilms dans les années à venir les enjeux scientifiques Place des biofilms dans l'industrie, café - clôture de l'école 5