Tela Botanica. Le réseau de la botanique francophone

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Florine Bonnet
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1 Tela Botanica Le réseau de la botanique francophone

2 Le réseau de la botanique francophone ONG créée en décembre 1999, début d activité en 2000 Dix salariés (niveau bac+5 à bac+8) situés à Montpellier membres dans 85 pays, dont 700 en Afrique 5 nouveaux adhérents par jour en moyenne Communication uniquement par Internet ( visites/jour) Une lettre d actualité (Web) diffusée à exemplaires chaque semaine Missions : Φ Φ Φ Φ Φ Mettre en relation les botanistes francophones sur un mode coopératif Développer des outils adaptés aux besoins d échange du réseau (logiciels libres) Accompagner le montage de projets collaboratifs entre les membres du réseau Participer à des programmes de «science citoyenne» avec les organismes de recherche Organiser et diffuser les données issues des projets

Missions : Φ Φ Φ Φ Φ Mettre en relation les botanistes francophones sur un mode coopératif Développer des outils adaptés aux besoins d échange du réseau (logiciels libres) Accompagner le

3 The Project Citizen science CNRS, INRA, CNES, MNHN Collaborative work All publics and organisations News letters Forums Workplaces Source forge And also: PHENOCLIM, Vigie Plants Taxonomic indexes & e-floras African Plants Initiative (Mellon Foundation) Herbaria UM 2, MNHN, Rabat Data bases MNHN, ONF, Rabat, Geneva All publics and organisations Iconography Bibliography Maps descriptive sheets of taxa

indexes & e-floras African Plants Initiative (Mellon Foundation) Herbaria UM 2, MNHN, Rabat Data bases

4 Les référentiels taxonomiques Objectif : disposer de référentiels par groupes taxonomiques, uniques et validés Référentiels taxonomiques de la flore de France Diffusion unique sur le site de l'inpn SINP Comité de coordination scientifique Commission de la flore de France Animé par le MNHN Valide le Référentiel Plantes vasculaires Bryophytes Lichens champignons Algues DOM Tela Botanica coordonne et anime les groupes de travail des spécialistes de chaque groupe taxonomique

scientifique Commission de la flore de France Animé par le MNHN Valide le Référentiel Plantes vasculaires Bryophytes

5 Les référentiels taxonomiques Actions en Préparation du protocole de mise à jour et d'évolution des référentiels Réalisé par Tela Botanica avec l IFN, l ONF et le MNHN Objectif : Φ définir un modèle générique de référentiel taxonomique, Φ caratériser les types de modifications entre chaque version Φ Mettre au point le protocole d évolution d une version à l autre et de transmission à la commission de la flore de France pour validation. 2 - Rédaction de la procédure de validation des référentiels Réalisée par le MNHN et soumise à Tela Botanica, aux CBN, à l'onf, au MEEDDAT et au SINP pour discussion et approbation 3 - Livraison de version 5 de la BDNFF d'ici la fin de l'année au MNHN Cette version servira de base commune pour les évolutions ultérieures du référentiel de la Flore de France.

la commission de la flore de France pour validation.

6 Les référentiels taxonomiques Actions en 2009 et au delà 1 - Organisation du travail des groupes taxonomiques Mise au point de la méthode d animation générale de tous les groupes Mise en place des espaces de travail collaboratifs Adaptation de la base eflore à tous les groupes taxonomiques Développement des outils et des interfaces de mise à jour des référentiels 2 - Création des groupes Constitution des groupes de travail en appui aux sociétés savantes qui en auront le pilotage (ex : Société Française de Ficologie pour les algues ) Désignation et formatin des animateurs aux outils collaboratifs 3 - Fourniture des référentiels et suivi des mises à jour Bryophytes et champignons, puis lichens, algues et DOM Mise à jour des versions successives de chaque référentiel

groupes Constitution des groupes de travail en appui aux sociétés savantes qui en auront le pilotage (ex : Société Française de Ficologie pour les algues ) Désignation et formatin des

7 Interopérabilité entre les bases de données Objectif : mettre à disposition des outils qui permettent l'échange des données naturalistes entre différentes bases de données Export des données grâce à l application web «Tapir Link» du TDWG Base de données X Champ 1 X Champ 2 X Champ 3 X... Tapir Link : basé sur les standards internationaux Standard : Champ 1 Champ 2 Champ 3... Base de données Y Champ 1 Y Champ 2 Y Champ 3 Y... Travail de correspondance entre BD X et le standard Travail de correspondance entre BD Y et le standard URL BD X Export des données Interrogation des données URL BD Y Test de l'application avec eflore et SILENE et avec eflore et la base de données du CEN

.. Tapir Link : basé sur les standards internationaux Standard : Champ 1 Champ 2 Champ 3... Base de données Y Champ 1 Y Champ 2 Y Champ 3 Y.

8 Mutualisation des outils naturalistes Objectif : Mettre à disposition de l'ensemble des acteurs des outils de gestion des données naturalistes développés sous licence libre ADULLACT Source forge Mise à disposition des codes sources des outils naturalistes STERNE, BDN (ONF), Outil de la Tour du Valat, OGREVA (DIREN Corse, Outils Tela Botanica, etc. Site Internet collaboratif «outils-naturalistes» Échanges entre développeurs Échanges entre les utilisateurs Listes de discussions Lettre d'actualité Animation par Tela Botanica dans le cadre du SINP, en lien avec la maison de la télédétection et l'aten,

du Valat, OGREVA (DIREN Corse, Outils Tela Botanica, etc.

9 Mutualisation des outils naturalistes Actions en 2008, et poursuite au delà 1 - Ouverture d'un espace spécifique dans la source forge de l'adullact création d'une nouvelle catégorie : outils naturalistes dédié aux membres de l'aten (qui adhére en leur nom) adhesion des auutres partenaires directement auprès de l ADULLACT 2 - Création d'un site internet collaboratif outils-naturalites Objectif : permettre les échanges entre développeurs et utilisateurs : Φ listes de discussions sur différents thèmes Φ grille d'analyse des logiciels : «comment bien choisir un outil qui correspond à nos besoins» Φ démonstrations en ligne des outils naturalistes Φ FAQ : qu'est ce qu'un logiciel libre, qu'est ce qu'un standard, un cahier des charges type avec spécificité pour les logiciels libres

Objectif : permettre les échanges entre développeurs et utilisateurs : Φ listes de discussions sur différents thèmes Φ grille d'analyse des logiciels : «comment bien choisir un outil qui

10 Speakers and Leader Teams The Project Daniel Barthélémy (INRA) Nozha Boujemaa (Imedia Project) Jean François Molino (IRD) many thanks for many others Daniel Mathieu : Plant Computational Identification and Collaborative Information System»

(IRD) many thanks for many others Daniel Mathieu Pl@ntNet :

Building a scientific platform The Pl@ntNet Project Social perception of ITC Interactive visual content indexing & browsing Web Portal Modular Identikit Modelling plant distribution Local Data

11 Building a scientific platform The Pl@ntNet Project Social perception of ITC Interactive visual content indexing & browsing Web Portal Modular Identikit Modelling plant distribution Local Data Pl@ntNote Management Plant Pl@ntID Identification Pl@ntWeeds Software interoperability Man Machine Interface Web Global Data Pl@ntDB Integration Demonstrative project on Carapa Pl@ntInv Pl@ntInvF + Pl@ntInvK Pl@ntTree Pl@ntWood Pl@ntMedit Pl@ntUse

Plant Pl@ntID Identification Pl@ntWeeds Software interoperability Man Machine Interface Web Global Data

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