Outils méthodologiques et astuces pour la thèse de médecine Les sources de données

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1 Outils méthodologiques et astuces pour la thèse de médecine Les sources de données Dr Emmanuel Chirpaz, DIM, CHU-FG

2 Multiples et diverses >> finalité >> structure >> nature >>.

3 Dans ce cadre, se présentent 2 situations (et surtout beaucoup plus.) la moins favorable : rien. la plus favorable : tout

4 Si y a tout, c est à dire rien à faire en fait, reste encore beaucoup à faire: > adéquation des données / objectifs > qualité des données On ne peut de toutes façons pas traiter des données sans les connaitre!!!

5 En fait, en pratique.. Si l on met à part les recueils ad-hoc, 3 grandes caractéristiques des bases de données «à disposition» dont il faut tenir compte: >> Bases de données «institutionnalisées», avec recueil standardisé/obligatoires ou non >> Bases de données donnant l accès à des données nominatives.ou non >> Bases de données à objectif épidémiologique.ou non

6 Bases de données «institutionnelles» Multiples et variées: maladies à déclaration obligatoire causes de décès réseaux sentinelles registres de population réseaux régionaux soins Données de la CNAMTS PMSI

7 Bases de données issues de la recherche épidémiologique Etudes de cohorte Données nationales ou internationales provenant d études cliniques. Et puis les autres

8 à l hôpital Le dossier patient Les «fichiers excels de service» Le PMSI

9 Le dossier patient Source de recueil de données ++ Mais avec son informatisation, c est aussi une source de «recensement de patients» Dossiers de spécialité Services Examens de laboratoire

10 Les «fichiers excels de service» Recueils «organisés» sur une problématique par un/des praticiens Théoriquement la situation la plus confortable (recueil et saisie réalisés sur un/des objectifs précis) Mais attention à la qualité, l exhaustivité des données, leur adéquation à l objectif de l étude +++

11 Le PMSI = Programme de Médicalisation des Systèmes d Information = Source de données majeure pour «l épidémiologie hospitalière»

12 Le PMSI Avantages: Exhaustivité: concerne toutes les hospitalisation dans tous les établissements Recueil de données standardisé (pathologies, actes, IGS2, PDN, SA, ), national Informatisé, avec données depuis début des années 1990 (1991 au CHFG)

13 Le PMSI Limites: Outil à objectif «médico-économique» et non épidémiologique Investissement des médecins (qualité du codage) Ne concerne pas l activité externe

14 PMSI: informations accessibles > Données administratives: DMS, Code postal de résidence,. > Données démographiques: Age, sexe > Motifs de prise en charge: - Codés en CIM X (pas forcément précision voulue) - Règles de hiérarchisation de l information (DP, DS..) - Pathologies ou motifs de recours, conditions socioéconomiques, causes externes de morbidité.

15 PMSI: informations accessibles > Données des prestations réalisées: - Actes médico-techniques (diagnostiques ou thérapeutiques) réalisés pendant le séjour - Codés en CCAM > Données complémentaires: -IGS2 en réanimation et soins Continus -Poids à l entrée en néonatologie -SA à la maternité

16 La pratique épidémiologique du PMSI En tenant compte des limites précitées: Utilisable en épidémiologie descriptive pour l activité d hospitalisation: > RUN: on l utilise pour décrire l activité en cancérologie pour la région (part hospitalière) > Au niveau National: va être utilisé pour déterminer les taux de mortinatalité et de mortalité périnatale (plus calculables par l état civile depuis 2008 et obligatoire pour les état de la communauté Européenne) Utilisable pour la surveillance épidémiologique ciblée Moyen de «recensement» de dossiers a aller décortiquer ensuite (+++)

17 La pratique épidémiologique du PMSI En tenant compte des limites précitées: Utilisable pour la surveillance épidémiologique ciblée: > RUN: utilisé en 2006 pour la surveillance de l épidémie du Chik > PMSI urgences utilisé dans le cadre du réseau OSCOUR (leptospirose,..)

18 La pratique épidémiologique du PMSI En tenant compte des limites précitées: Moyen de «recensement» de dossiers a aller décortiquer ensuite (+++): > Demande de liste de patients ayant été hospitalisés dans le service X pendant la période Y pour la prise en charge de la pathologie Z

19 La pratique épidémiologique du PMSI En tenant compte des limites précitées: Utilisable pour la surveillance épidémiologique ciblée