Viroses du voyageur et viroses émergentes. Plusieurs exemples sont illustrés dans les pages qui suivent.

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2 Viroses du voyageur et viroses émergentes Plusieurs exemples sont illustrés dans les pages qui suivent. Pour chaque exemple d infection virale sont indiquées une carte d identité brève de l agent pathogène (encadré bleu) et les adresses des liens vers des documents de référence (encadré rouge). Je vous conseille la lecture de ces documents car ils sont régulièrement mis à jour : - «factsheets» de l Organisation Mondiale de la Santé, - dossiers thématiques de l Institut National de Veille Sanitaire, - fiches des Centers for Disease Control and Prevention (CDC d Atlanta, USA) - fiches du European Centers for Disease Control. Viroses du voyageur : «fièvre du retour» Selon les symptômes et l origine géographique, penser à dengue, chikungunya, MERS Coronavirus, Zika, West Nile, Ebola, grippes aviaires mais ne jamais oublier les viroses ubiquitaires, présentes dans toutes les populations humaines : grippes épidémiques, virus respiratoire syncytial, rougeole, hépatites virales A, B, C, Delta, E 2

3 Dengue arbovirus (arthropode borne virus) Vecteur : moustique (genre Aedes) Infection humaine : incubation 4-10 jours fièvre élevée (40 C), céphalées, douleurs rétro-orbitaires musculaires articulaires, exanthème, nausées-vomissements, adénopathies Surinfections successives par les 4 sérotypes possibles (gravité supérieure à chaque épisode) Forme sévère, hémorragique, 3-7 jours après début des symptômes, potentiellement mortelle Diagnostic : PCR (précoce) et sérologie Estimation du nombre de cas : 50 à 100 millions par an Mortalité : 10% Prévention efficace : réduction du nombre des récipients naturels et artificiels contenant de l'eau, qui favorisent la reproduction des moustiques. Dengue virus Flaviviridae (prototype : fièvre jaune) ARN (+), capside hélicoïdale, enveloppe 4 sérotypes Zones de prévalence de la dengue (OMS) France INVS 3

4 Virus West Nile arbovirus Réservoir : oiseaux (corvidés) Vecteur : moustique (genre Culex) Hôte intermédiaire : cheval Infection humaine : incubation 3-14 jours Asymptomatique dans 80% des cas / fièvre / formes neurologiques potentiellement mortelles (méningites, encéphalites, syndromes de Guillain Barré ) Diagnostic : PCR (précoce) et sérologie vaccin chez le cheval Forme grave chez environ 1 personne infectée sur 150. Marqueurs diagnostiques West Nile Virus Flaviviridae (prototype : fièvre jaune) ARN (+), capside hélicoïdale, enveloppe Cycle de transmission Zones d endémie du WNV 4

5 Chikungunya arbovirus Première description : 1952 Tanzanie Vecteur : moustique (genre Aedes) Infection humaine : incubation 4-8 jours Symptômes : fièvre - arthralgies douleurs musculaires et céphalées - exanthème Diagnostic : PCR (précoce) et sérologie Séquelles : arthralgies chroniques invalidantes +++ («maladie de l homme courbé») Virus Chikungunya Bunyaviridae ARN (+), capside hélicoïdale, enveloppe Source : CDC Zika virus Première description en 1947 Vecteur : moustiques Infection humaine : incubation 3-12 jours - Contamination : par piqûre de moustique, transmission mèreenfant, voie sexuelle - Symptômes : asymptomatique 4/5 / fièvre-conjonctivite-exanthèmearthralgie (type Dengue) / formes neurologiques graves : méningite, encéphalite, Sd de Guillain Barré / 1 er trimestre grossesse risque microcéphalie / Mortalité : non rapportée Diagnostic : PCR (précoce) et sérologie Zika virus Flaviviridae (prototype : fièvre jaune) ARN (+), capside hélicoïdale, enveloppe Zones de transmission du virus Zika 5

6 Fièvre jaune Virus Amaril arbovirus Flaviviridae ARN (+), capside hélicoïdale, Vecteur : moustiques (genres Aedes et Haemogogus) enveloppe Cycles Huraux et al, Traité de virologie Médicale, ESTEM, Paris, 2003 Infection humaine : incubation 3-6 jours - Contamination : par piqûre de moustique - Symptômes : Syndrome pseudogrippal, signes digestifs, pendant 3-4 jours Forme grave chez 15% des patients : phase «toxique» : ictère fébrile et syndrome hémorragique Mortalité : 20-50% dans les formes graves. Environ cas dont morts par an Diagnostic : PCR (précoce) et sérologie Source CDC Prévention : vaccin vivant atténué, 1 dose +++ 6

7 Emergence virale : apparition spontanée de cas d infection dus à un virus apparemment «nouveau», avec une forte capacité invasive et/ou mortalité Ex : pandémie de grippe AH1N1pdm09 Ré-émergence virale : réapparition d une maladie virale identifiée Ex : infection à virus Ebola Viroses émergentes Chez l homme, les émergences virales sont presque toutes d origine zoonotique et rendues possibles par les activités humaines. La réussite émergentielle passe par deux étapes : - Changement d hôte : le virus franchit une «barrière d espèce» - Extension épidémique : le virus réussit une transmission inter-humaine ou vectorielle Réservoir (porteur sain) = chauve souris Exemple : épidémie de SARS coronavirus en 2003 Hôte accidentel (malade) = la civette vendue vivante sur les marchés chinois Hôte accidentel (malade) = homme ayant touché ou consommé de la civette Transmission inter-humaine dans un grand hôtel de Hong Kong dont les clients se dispersent dans le monde entier (Chine, Viet Nam, Canada, France ) La réussite émergentielle est le plus souvent dûe à des modifications des activités humaines : 7 - déforestation, plantations dans des zones forestières - migrations humaines, exode rural - conflits armés et problèmes politiques, camps de réfugiés (cf carte ci-jointe) D après Emerg Infect Dis 2007; 13: Exemple : infections à Hantavirus à partir d un réservoir rongeur sauvage dans les villes pendant la guerre en ex-yougoslavie

8 Emergence réussie : Grippe pandémique A H1N : oiseaux / porcs Premières observations : publication 24 avril 2009 Influenza AH1N1pdm09 Othomyxoviridae ARN (-), en 8 segments, capsides hélicoïdales, enveloppe Peu après ces premiers cas, un grand nombre de formes graves sont observées, au Mexique et aux USA, chez de jeunes adultes : l OMS déclare l état de pandémie dès la fin avril Séquençage complet du nouveau virus A(H1N1)pdm09 : 22 mai 2009 Les différents segments d ARN génomique sont issus de 4 virus différents, tous d origine aviaire, qui ont contaminé soit l homme, soit le porc, soit les deux, aux dates indiquées audessus des flèches. Le virus pandémique est donc issu d un quadruple réassortiment. D après R Garten et al. Science 2009 ; 325 : Réussite de l émergence : la souche circule toujours, au cours des épidémies saisonnières hivernales (ici, 2011, en turquoise clair). 8

9 Emergence à fort potentiel de réussite : le MERS Coronavirus MERS-CoV Coronaviridae ARN (+), capside hélicoïdale, enveloppe Première détection en 2012 en Arabie Saoudite depuis, >1300 cas confirmés. Réservoir ancien : chauve-souris actuel : camélidés Infection humaine respiratoire fébrile avec risque de syndrome de détresse respiratoire Transmission inter-humaine possible par contacts rapprochés. Mortalité : 36% A noter : une épidémie en Corée (été 2015) à partir d un cas index venant des pays du Golfe Situation MersCoV en D après LA Reperant et al One Health 2 (2016) 1 7 9

10 Ré-émergence réussie : Ebola Ebolavirus Filoviridae ARN (-), capside hélicoïdale, enveloppe MSF Première détection en 1976 au Soudan et République Démocratique du Congo Réservoir : chauve-souris Hôte intermédiaire (malade) : singe Infection humaine : fièvre hémorragique Transmission inter-humaine par contact avec tous les fluides biologiques. essais vaccinaux en cours Mortalité : 50% en (25 à 90% selon les épidémies plus anciennes) Situation Ebola en D après LA Reperant et al One Health 2 (2016) 1 7 L épidémie de en Guinée, Sierra Léone et Libéria est la plus complexe et étendue jamais survenue. 10

11 Divers exemples de virus ou agents qui pourraient émerger Grippe aviaire AH7N9 D après Wang, Y.B. et al. Sci. Rep. 3, 2318; DOI: /srep02318 (2013). Virus influenza issu de la recombinaison de 3 différents virus aviaires. Plus de 350 cas prouvés. Transmission de l oiseau à l homme ; très peu ou pas de transmission inter-humaine (c est encore une grippe aviaire). Situation A H7N9 en D après LA Reperant et al One Health 2 (2016) 1 7 Grippe aviaire AH5N1 Hong Kong, 1997 Contamination humaine : contact direct avec des volailles vivantes ou consommation de viande non cuite. Plus de 650 cas prouvés. Mortalité 60%. 11

12 Hantavirus Hantavirus Bunyaviridae ARN (+), 3 segments, capside hélicoïdale, enveloppe Réservoir : différentes espèces de rongeurs Infection humaine : incubation 1 semaine à 2 mois - Contamination par contact direct et aérosols à partir de l urine, des selles, de la salive des rongeurs - Physiopathologie : altération de l endothélium vasculaire et augmentation de la perméabilité vasculaire - Symptômes : selon les virus, insuffisance rénale aiguë ou détresse respiratoire (hypotension, choc, insuffisance rénale, œdème pulmonaire non cardiogénique) Mortalité : 15 50% Diagnostic : sérologie et PCR Nouvelle variante de la Maladie de Creutzfeldt Jakob encéphalopathie spongiforme transmissible Agent transmissible non conventionnel : prion Première description : 1996 Contamination : consommation de viande bovine atteinte d encéphalopathie spongiforme bovine Particularités cliniques : patients jeunes (âge moyen 29 ans), évolution longue (médiane 14 mois) Mortalité : 100% ( 230 personnes dans le monde) (cf le cours sur les infections virales du système nerveux central ) 12

13 Nipah virus Nipah virus Paramyxoviridae ARN (-), capside hélicoïdale, enveloppe Première description en 1998, en Malaisie Réservoir : chauves-souris frugivores Hôte intermédiaire possible : porc Infection humaine : incubation 5-14 jours - Contamination par contact direct et indirect avec l urine et les selles des chauves-souris mais transmission inter-humaine possible - Symptômes : encéphalite/ infection respiratoire aiguë / formes asymptomatiques Mortalité : jusqu à 50% Diagnostic : sérologie et PCR Hendra virus Hendra virus Paramyxoviridae ARN (-), capside hélicoïdale, enveloppe Première description en 1994, en Australie Réservoir : chauves-souris frugivores Hôte intermédiaire possible : cheval Infection humaine : 7 cas humains décrits ; incubation 9-16 jours - Contamination par contact direct et indirect avec l urine et les selles des chauves-souris, et les sécrétions (respiratoires en particulier) des chevaux - Symptômes : infection respiratoire basse pseudo-grippale, éventuellement encéphalite Mortalité : 4 personnes sur les 7 cas humains Diagnostic : sérologie et PCR 13

14 Virus de la Fièvre hémorragique Crimée-Congo CCHFV Bunyaviridae ARN (+), 3 segments, capside hélicoïdale, enveloppe Première description en 1944 : Crimée, Congo, Afrique, Balkans, Moyen Orient, Asie du Sud Réservoir : tiques Hôte intermédiaire : ruminants Infection humaine : incubation 3 à 13 jours - Contamination : par piqûre de tique ou contact avec le sang des animaux infectés lors de l abattage - Symptômes : fièvre hémorragique Mortalité : 10-40% Diagnostic : sérologie et PCR Virus de la fièvre de Lassa Réservoir : rongeurs Infection humaine : incubation 1 3 semaines - Contamination : ingestion ou inhalation des déjections du rat - Symptômes : 80% discrets (fièvre, céphalées) / fièvre hémorragique / séquelle : surdité Mortalité : 15-20% Diagnostic : sérologie et PCR Traitement : ribavirine Lassa fever virus Arenaviridae ARN (+), capside hélicoïdale, enveloppe Dernières épidémies (CDC) 14

15 Virus de l Encéphalite à tiques Vecteur : Tiques (famille Ixodidae) En France, présence en Alsace Infection humaine : incubation 7-14 jours - Contamination : piqûre de tique - Symptômes : fièvre-douleurs musculaires et céphalées-anorexie nausées vomissements - Formes graves : 30-30% des patients, après 8 jours de rémission, méningite et/ou encéphalite Mortalité : 1-2% Vaccin tué disponible (Europe centrale) Tick Borne Encephalitis Virus (TBEV) Flaviviridae ARN (+), capside hélicoïdale, enveloppe f/tbe/ en/healthtopics/emerg ing_and_vectorborne_diseases/tick_ borne_diseases/tick_ borne_encephalitis/ba sic_facts/pages/facts heet-healthprofessionals.aspx Poliovirus : vers l éradication? Source : ECDC Poliovirus (picornaviridae) ARN +, capside icosaédrique sans enveloppe Vaccin anti-polio oral Virus de la Variole Virus de la variole (smallpox virus) Poxviridae ADN (300kpb) capside biconcave avec 2 corps latéraux, deux enveloppes - Variole éradiquée grâce à la vaccination par le virus de la vaccine - Le Poxvirus simien (Monkeypox) circule et peut contaminer l homme accidentellement (Afrique centrale et de l ouest). Réservoir : écureuils arboricoles, singes. La vaccination anti-variolique est efficace. 15

16 Accés gratuit