I. TOUITOU (Mise ligne 20/10/08 LIPCOM-RM) Faculté de Médecine Montpellier-Nîmes

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1 Incidence des lois de Mendel au conseil génétique: Calcul de risque à priori Risque pour la descendance: Suit la loi binomiale Soit une famille de 3 enfants: 1. Le père est atteint d une maladie AD Calculer la probabilité à priori que : - les 3 enfants soient atteints - 2 soit atteints et un sain - 1 soit atteint et 2 sains - les 3 enfants soient sains 2. Faire le même calcul pour un couple hétérozygote pour une maladie AR DERIVE GENETIQUE (Modèle de l île) Proportion attendue pour chaque couple de germains (frères-sœurs) P frère-sœur avec ce génotype Nb îles MM MM 1/4x1/4 = 1/16 10 MM MN MN MM MM NN NN MM MN NN NN MN MN MN NN NN 1/4x1/4 = 1/16 10 Conséquences Fixation M, Extinction N Fixation N, Extinction M HASARD Nomenclature: numérotation de l ADNc Exemple du codon d initiation dans l exon 1 5 Flanking Ex 1 In1 Ex 2 initiation donnor acceptor..taccagaagc GCACCATGGCTAA TCAGGgtaag....tgcagTTAAT CTGACTGAATGCC AATCTggtca.. c.- c. c.277 c c.* Ex X termination Exemple du codon d initiation dans l exon 2 5 Flanking Ex 1 In 1 Ex 2 initiation In2 Ex 3 donnor acceptor Ex X termination 3 UT 3 UT 3 Flanking 3 Flanking gaggggcggc GAGCCATGTTGTC GCAAGgtaca cgcagggctg GCCTCTGAGAGGA ACAGTagaga c.- c. c.78 c c.* Nomenclature de l ADN Où est localisée la mutation suivante: 240A-->G, choisir une proposition - Substitution d une Adénine en Guanine à la position 240 de l ADN ladn - Mutation du codon Alanine 240 en codon Glycine - Cette écriture est fausse, on ne peut pas répondre à cette question Comment doit-on écrire les mutations suivantes selon la nomenclature - Substitution d une Adénine en Guanine à la position 240 de l ADNc - Mutation du codon Alanine 240 en codon Glycine - Délétion d un phénylalanine au codon 508 de la protéine CFTR (on rappelle: abréviation phénylalanine =F ou Phe) - A quoi correspond cette mutation

2 DIAGNOSTIC DIRECT Classer ces mutations par catégorie croissante de gravité à priori c.89-1g>t p.trp26x p.trp26trp p.val726ala p.phe508del c.6_13dup p.glu5fs Quelle approche diagnostique utiliseriez-vous en première intention pour les maladies suivantes: - Mucoviscidose - Drépanocytose - Hypercholestérolémie familiale - Maladie de Crohn DIAGNOSTIC INDIRECT - Exemples L informativité est-elle complète ou incomplète dans les cas suivants RFLP et maladie RA RFLP et maladie DA Microsatellite FEVRIER 2008 A) Dans un couple, la femme est atteinte d hypercholestérolémie familiale et le mari est sain. L analyse moléculaire du gène codant le récepteur des LDL montre une mutation hétérozygote chez cette femme, et aucune anomalie dans le gène porté par le mari. Calculer le risque à priori pour ce couple d avoir un enfant atteint sur quatre. Arbre généalogique de la reine Victoria: Mode de transmission le plus probable B) Enumérer sans les détailler les conditions dans lesquelles s applique la loi de Hardy-Weinberg C) Dessinez les symboles représentant les informations suivantes dans un arbre généalogique: Un père porteur sain d une maladie récessive autosomique Une mère porteuse saine d une maladie récessive liée à l X Leur 3 enfants sains dont on ne connaît pas le sexe Surdité Transmission probable Anomalie dans cet arbre Pourquoi D) Ecrire les mutations correspondant aux anomalies suivantes selon la nomenclature: Une délétion d une adénine 3 bases après le codon de terminaison au niveau de l ADNc Une mutation non sens au niveau du 13ème acide aminé (Valine) de la protéine

3 FEVRIER 2007 I. Vers un diagnostic génétique : Dans cet arbre généalogique, quel est le mode de transmission le plus probable de la maladie II. Culture générale en génétique : répondre brièvement aux questions suivantes : - Date de la découverte du génome humain - Registre Internet des maladies orphelines héréditaires - Mutation la plus fréquente de la mucoviscidose SEPTEMBRE 2006 Entourer la ou les lettre(s) correspondant à la ou aux bonne(s) définition(s) a. Une union entre un frère et une sœur est une union consanguine b. Un individu consanguin est né d un homme et d une femme apparentés c. Une union entre apparentés implique l existence d au moins une boucle de consanguinité chez les ascendants d. Des germains sont des individus apparentés au 2ème degré FEVRIER 2005 a. Dans quel type d hérédité les garçons sont plus atteints que les filles III. Conseil génétique : Un père est porteur d une mutation dominante sur un de ses chromosomes 7. La pénétrance de cette mutation est de 50%. - Définition de la pénétrance - Calculer le risque à priori pour son enfant à naître de présenter des signes de la maladie si la mère porte deux chromosomes 7 normaux b. On analyse la ségrégation familiale de 2 marqueurs de type microsatellite dans 10 familles de 5 enfants chacune. On met en évidence 2 recombinaisons entre ces 2 marqueurs. A quelle distance génétique en cm sont-ils l un de l autre FEVRIER 2005 suite c. Dessiner l arbre généalogique d une famille ainsi composée : La mère a eu 3 enfants de 2 pères différents. Elle a eu avec son oncle maternel maintenant décédé, un garçon atteint de drépanocytose. Quelques années plus tard elle a eu des jumelles monozygotes non malades avec son mari actuel non apparenté. JUIN 2004 a. Quel est le mode de transmission le plus probable du trait héréditaire dans cette famille b. Quelle est la probabilité à priori d avoir un enfant malade II pour chacun de ces 3 individus : I.1, II.1, II.4 Comparez avec ce que vous observez à la génération III III I JUIN Citer un exemple de maladie dominante liée à l'x Sans faire de calcul, expliquer en une phrase pourquoi le risque d être atteint de drépanocytose était plus grand pour le fils que pour les filles. 2. Numérotez cet arbre. - Quel est le mode de transmission le plus probable dans cette famille - Symbolisez dans le schéma les porteurs obligatoires.

4 SEPTEMBRE Dans une même famille, on trouve des patients atteints de la maladie d'angelman et des patient atteints de la maladie de Prader Willy. Le type de maladie héritée dépend du sexe du parent transmetteur. Des études cytogénétiques montrent que tous ces malades portent une petite délétion du chr De quel type d'hérédité sagit s'agit il - Citer une autre aberration chromosomique pouvant donner ce type d'hérédité JUIN Qu'est ce qu'un corpuscule de Barr - Combien y en a-t-il dans une cellule 2. Calculer le coefficient de consanguinité pour un couple demi-frère/demi-sœur (même père, mères différentes) SEPTEMBRE 2001 II. Quelles sont les trois étapes permettant de mettre en évidence la composante héréditaire d'une maladie Pour chacune de ces étapes, citer une méthode de mesure 3. Daltonisme: Comment se transmet le daltonisme Citer le principal mécanisme moléculaire à l'origine de cette anomalie de la vision JUIN 2001 Dans une famille, certains garçons sont frappés de retard mental, de troubles du langage, d'un certain degré d'autisme, d'un faciès avec de grandes oreilles, et d'hypertrophie des testicules. On constate que la maladie commence de plus en plus tôt au cours des générations, et que la pénétrance est de plus en plus forte. 1. Comment appelle t-on ce phénomène 2. Quel est le mécanisme moléculaire qui rend compte de ce phénomène SEPTEMBRE Dessinez l'arbre généalogique correspondant aux conditions suivantes: Sont malades: Le grand père maternel, la mère et ses deux enfants: un garçon et une fille. Deux enfants de sexe inconnu issus du remariage du père sont non malades. - Quel est le mode de transmission le plus probable de la maladie - Que dites vous à la 2ème épouse qui s'inquiète ièt pour l'avenir de ses enfants 3. Définition de la pénétrance 4. Quel est le diagnostic le plus probable de cette maladie 5. Citer sans les décrire, les deux principales p méthodes permettant de confirmer le diagnostic

5 JUIN 2000 Une maladie n'est transmise que par les filles. De quel type d'hérédité s'agit-il Quelle type d'hérédité non mendelienne peut être due à une disomie uniparentale Dans le cas du rachitisme vitamino-résistant, un père malade dont l'épouse est en bonne santé, transmet la maladie à toutes ses filles et à aucun de ses fils. Quel est le mode de transmission de cette maladie Un couple a un enfant qui est atteint d'une maladie autosomique récessive très rare. Quelle(s) question(s) devez vous poser Quel est le nom du phénomène moléculaire qui entraîne l'augmentation de la gravité et de la précocité d'une maladie dans les générations successives décrit par Sherman La prévalence d'une maladie est de 5% chez les apparentés d'un sujet malade et de 1/1000 dans la population générale. Calculer le risque relatif. Le taux de concordance pour la schizophrénie chez les jumeaux monozygotes est de 65%. Pourquoi n'est il pas de 100% Le programme génome humain. Quel est son but en une phrase Le syndrome néphrotique congénital est une maladie récessive rare dans le monde mais assez fréquente en Finlande. Donnez une explication en une phrase. Comment appelle t-on un gène qui influence le phénotype d'une maladie mais qui est insuffisant pour provoquer son apparition Un individu est heterozygote au niveau de 2 locus différents. Comment est défini ce type d'hétérozygotie Soit un locus à 2 allèles A et a. Sachant que pour un couple donné, la probabilité d'avoir des enfants dont le génotype est Aa est de 100%, Quelle est le génotype des parents à ce locus SEPTEMBRE 99 Pour une maladie autosomique récessive, des études démographiques ont montré qu il naît un malade sur 400 chez les Mormons et un malade sur dans les autres populations. - Quel phénomène pourrait expliquer cette différence - Quelle est la fréquence de l allèle morbide dans chaque cas - Quelle est la probabilité pour un couple malade d avoir un enfant malade dans chaque cas JUIN 98 Soit une maladie autosomique récessive. La fréquence des patients souffrant de cette maladie dans la population générale est de 1/ Quelle est la fréquence de l allèle morbide (q) Quelle est la fréquence de l allèle normal (p) Quelle est la fréquence des hétérozygotes

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