Agathe Guilloux LSTA - Université Pierre et Marie Curie (UPMC) Boîte courrier place Jussieu, Paris cedex 05

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1 Agathe Guilloux LSTA - Université Pierre et Marie Curie (UPMC) Boîte courrier place Jussieu, Paris cedex 05 agathe.guilloux@upmc.fr www : Née à Paris le 28 août 1978 Mariée, deux enfants Nationalité française Tel : Cursus universitaire et professionnel Professeur chargé de cours. (depuis septembre 2014) à l Ecole Polytechnique, membre associé du Centre de Mathématiques Appliquées de l Ecole Polytechnique (CMAP) Enseignant. (depuis septembre 2012) à l Ecole Supérieure de Commerce de Paris Habilitation à diriger les recherches. Soutenue le 9/12/2010 à l UPMC. Contributions to nonparametric statistics for survival analysis Jury : N. Keiding, V. Patilea, K. Tribouley, Z. Ying (Rapporteurs), L. Birgé (Président), G. Biau, F. Comte, J.Y. Dauxois (Examinateurs). Qualification en 26-ième section. Maître de conférences. (depuis septembre 2005) à l UPMC ATER. ( ) à l IUT de Sceaux, Université Paris-Sud Thèse de doctorat. Soutenue le 11/10/2004 à l Université de Rennes 1, Mention très honorable Inférence non-paramétrique en Statistique des Durées de Vie sous biais de sélection Jury : M. Hoffman, I. Van Keilegom (Rapporteurs), P. Deheuvels (Président), J.Y. Dauxois, M. Delecroix (Directeurs), J. Deshayes, S.N.U.A. Kirmani (Examinateurs) Thèse financée par le CREST (Ministère de l Economie et des Finances). DEA de Mathématiques. ( ), spécialité Statistique à l Université de Rennes 1. ENSAI. ( ), spécialité Biostatistiques et Epidémiologie. Projets, distinctions Projet INCA-DGOS. Programme de recherche translationnelle en cancérologie, avec Alex Duval (CdR Saint Antoine), Jean-Francois Fléjou et Tabassome Simon (APHP). Janvier 2015-Décembre Budget 636keuros. Porteur de l ANR Prognostic. Point processes : non-parametric inference, learning and applications. ANR-09-JCJC-010 (Octobre Juillet 2013). Budget : euros. Titulaire de la PES. Prime d excellence scientifique (depuis 2007) Délégation CNRS. (Août 2010 à Février 2011) au MAP5 - UMR CNRS Paris Descartes Partenariats, contrats Caisse Nationale d assurance maladie/ecole Polytechnique. Big data et santé publique. Ubisoft/UPMC/CNAM. Approches big data pour la modélisation de la rétention et de la monétisation des joueurs. MutRé/UPMC. Apports du machine learning et de l open-data pour la modélisation du risque en assurance santé. 1

2 Responsabilités administratives Liées à la recherche. Membre du Conseil d Administration de l Institut Henri Poincarré Membre du Comité de Pilotage Big data de Sorbonne Universités Membre de la commission des thèses et habilitations de l ED 386 (depuis 2012) Membre élu du Conseil d UFR (depuis 2009) Membre nommé de la Commission des Personnels (depuis 2009) Membre nommé de la Commission pour l attribution de la Prime d Investissement Recherche (PIR) ( ) Membre nommé de la Commission d Avancement des Maîtres de Conférences (depuis 2009) Coordinateur (rang B) du Groupe d Experts de la 26-ième section ( ), Vice-président de la Commission des Spécialistes 26-ième section ( , Membre ) Recrutement. Membre des Comités de Sélection de l UPMC (postes fléchés Statistique et Probabilités) (2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2014, 2015). Membre extérieur de Comités de Sélection : Lyon-1 et Ecole Centrale de Lyon (2012), Paris-Descartes (2010), Paris-Ouest (2009 et 2010) Liées à l enseignement. Membre élu du Conseil de Direction de l ISUP (depuis 2006) Membre du Jury d admission sur titre de l ISUP (depuis 2009) Membre du Jury de l ISUP - UPMC (depuis 2006) Co-responsable des stages du M2 de Statistique ( ) Animation scientifique Institut des actuaires. Coordinateur du groupe de travail Big data Société Française de Statistique. Membre élu du bureau du Groupe Statistique Mathématique de la SFDS European research consortium for Informatics and Mathematics. Membre du Groupe Statistical Analysis of Event Time de l ERCIM Workshop SAM. Membre du comité d organisation de SAM ( The statistical analysis of multi-outcome data ) organisé à l UPMC les 9 et 10 juillet Rapport sur articles. Annals of Statistics, Journal of Multivariate Analysis, Bernoulli, Electronic Journal of Statistics, Journal of Statistical Planning and Inference, Scandinavian Journal of Statistics, Life Time Data Analysis, Comptes Rendus de l Académie des Sciences. Encadrement scientifique Thèses. Co-encadrement de la thèse de Thibault Allart avec Stéphane Natkin, Guillaume Levieux (CNAM) et Michel Pierrefite (Ubisoft) depuis décembre 2014 Co-encadrement de la thèse de Mokhar Alaya avec Stéphane Gaïffas (CMAP, X) depuis septembre 2012 Sujet : Segmentation pour l intensité de processus ponctuels Co-encadrement de la thèse de Sarah Lemler avec Marie-Luce Taupin (UEVE) - depuis septembre 2011 Sujet : Réduction de dimension en analyse de survie. Application en statistique génétique et génomique. Co-encadrement de la thèse de Ségolen Geffray (dirigée par Paul Deheuvels, LSTA -UPMC), soutenue le 3 novembre Sujet : Estimation non-paramétrique de données censurées dans un cadre multiétats.

3 Mémoires et stages. Encadrement ( ) du stage M2 (Master Math-SV) d Alain Virouleau Détection de valeurs aberrantes dans des modèles linéaires généralisés en grande dimension, application à des données exomiques. Encadrement ( ) du stage de stage de fin d étude de l ISUP de Sami Lagnaoui : Apports du machine learning et de l open-data pour la modélisation du risque en assurance santé. Encadrement ( ) du stage de S3 de l Ecole des Mines de Paris de Soufiane Mourragui : Statistique pour la diffusion dans les réseaux sociaux Encadrement ( ) du stage de S3 de l Ecole des Mines de Paris de Christine Cutting : Etude par simulation du lasso en présence de corrélation Co-encadrement (2012) du mémoire de M2 de Mokhar Alaya avec Stéphane Gaïffas : Segmentation pour les processus ponctuels Co-encadrement (2012) du mémoire de M2 de Weidong Hua avec Etienne Roquain (LPMA-UPMC) : Quelles méthodes pour la sélection de variables en grande dimension dans le modèle linéaire? Co-encadrement (2011) du mémoire de M2 de Sarah Lemler avec Marie-Luce Taupin (UEVE) : Modèle de Cox en grande dimension. Encadrement (2012) du TER de Damien Fontanes (M1 Maths UPMC) : Modèles paramétriques pour les données de comptages, application aux données count RNA-Seq. Encadrement (2010) du TER de Siegfried Fotso (M1 Maths UPMC) : Bootstrap pour la régression linéaire. Encadrement (2009) du TER de Noury Sin (M1 Maths UPMC) : Statistique dans le diagramme de Lexis. Jurys de thèse. Membre du jury de la thèse de Sarah Lemler - Univ. Evry (2014) Membre du jury de la thèse de Cécile Chauvel - Univ. Paris 6 (2014) Membre du jury de la thèse de Svetlana Gribkova - Univ. Paris 6 (2014) Rapporteur de la thèse de Paul Blanche - Univ. Bordeaux (2013) Membre du jury de la thèse de Margarita Moreno- Univ. Paris-Sud (2013) Membre du jury de la thèse d Abdullah Oueslati- Univ. Paris 6 (2013) Rapporteur de la thèse de Damien Bousquet - Univ. Montpellier 2 (2012) Membre du jury de la thèse de Juliette Penichoux - Univ. Paris-Sud (2012) Membre du jury de la thèse d Alexis Flesch - Univ. de Franche Comté (2012) Membre du jury de la thèse de Ségolen Geffray - UPMC (2006)

4 Publications Articles publiés ou acceptés. [P1] Lambert R., Guilloux A, Oshima A, Pompe-Kirn V, Bray F, Parkin D.M., Ajiki W, Tsukuma H. (2002). Incidence and mortality from stomach cancer in Japan, Slovenia and USA. International Journal of Cancer 97 no.6, [P2] Bray F., Guilloux A., Sankila R., Parkin D.M. (2002). Practical implications of imposing a new world standard population. Cancer Causes Control 13. no.2, [P3] Dauxois J.-Y., Guilloux A. and Kirmani S.N.U.A. (2003) Estimation de la fonction de survie sous biais de longueur pour des risques concurrents et proportionnels. C. R. Math. Acad. Sci no. 11, [P4] Dauxois J.-Y., Guilloux A. and Kirmani S.N.U.A. (2005). Nonparametric estimation from proportional hazards competing risks data under selection bias. Journal of Nonparametric Statistics 17, no. 6, [P5] Geffray S. et Guilloux A. (2005). Estimation in a generalized Koziol-Green model. C. R. Math. Acad. Sci. 341 no. 1, [P6] Guilloux A. (2006). Estimation sous biais de sélection et avec fonction de poids inconnue. C. R. Math. Acad. Sci. 342 no. 4, [P7] Guilloux A. (2007). Non-parametric estimation for censored lifetimes suffering from an unknown selection bias. Mathematical Methods in Statistics 16, no. 3, [P8] Dauxois J.-Y. et Guilloux A. (2008). Nonparametric inference under competing risks and selection bias sampling. Journal of Multivariate Analysis 99, no. 4, [P9] Guilloux A. (2008). Estimation with unknown selection bias and censoring. Statistical models and methods for biomedical and technical systems, Chap. 23, , edited by F.Vonta, M. Nikulin, N. Limnios and C. Huber, Birkhauser. [P10] Guilloux A. et Saint-Pierre P. (2008). Estimateur de la fonction de répartition bivariée avec censure à droite et à gauche. Pub. Inst. Stat. Univ. Paris 1-2, [P11] Brunel E., Comte F., Guilloux A. (2008). Adaptive nonparametric strategies for censored lifetimes with unknown sampling bias. Scandinavian Journal of Statistics 35, 3, [P12] El-Bchiri J., Guilloux A., Dartigues P., Loire E., Mercier D., Buhard O., Sobhani I., de la Grange P., Auboeuf D., Praz F., Fléjou J.F., Duval A. (2008). Nonsense-mediated mrna decay impacts MSIdriven carcinogenesis and anti-tumor immunity in colorectal cancers. PLoS ONE. 9 no.3(7) :e2583. [P13] Brunel E., Comte F., Guilloux A. (2010). Nonparametric density estimation in presence of bias and censoring. Test. 18, no.1, [P14] Zaanan A., Cuilliere-Dartigues P., Parc Y., Louvet C., de Gramont A., Tiret E., Dumont S., Gayet B., Validire P., Fléjou J.-F., Guilloux A., Duval A., Praz. F. (2010). Impact of microsatellite instability and p53 expression on stage III colon cancer disease-free survival in patients treated by fluorouracil and leucovorin with or without oxaliplatin. Annals of Oncology 21, [P15] Comte F., Gaïffas S. et Guilloux A. (2011). Adaptive estimation of the conditional intensity of marker-dependent counting processes. Annales de l IHP, Probability and Statistics 47, [P16] Geffray S. et Guilloux A. (2011) Maximum likelihood estimator for cumulative incidence functions under proportionality constraint. Sankhya Serie A 73, [P17] Gaïffas S. et Guilloux A. (2012). High-dimensional additive hazard models and the lasso. Electronic Journal of Statistics, 6, [P18] Bouaziz O., Comte F., et Guilloux A. (2013). Nonparametric estimation of the intensity function of a recurrent event process. Statistica Sinica, 23, [P19] Brunel E., Comte F., Guilloux A. (2013). Nonparametric estimation for survival data with censoring indicators missing at random. Journal of statistical planning and inference, 143, [P20] Dauxois J.-Y., Guilloux A., Kirmani, S.N.U.A. (2014). Estimation in a competing risks proportional hazards model under length-biased sampling with censoring. Lifetime data analysis. 20, [P21] Collura A. et al. (2014). Microsatellite-unstable colorectal cancer patients with large HSP110 deletions in tumor dna display improved response to 5-FU based chemotherapy. Gastroenterology, 146, [P22] Bouaziz O. et Guilloux A. (2015). A lasso algorithm for event-specific rate estimation from recurrent events. Biostatistics,16,

5 [P23] Alaya M., Gaïffas, S. et Guilloux A. (2015). Learning the intensity of time events with change points. Accepté à IEEE Transactions on Information Theory. [P24] Bodo S. et al. (2015) Diagnosis of constitutional mismatch repair-deficiency syndrome by functional screening of blood lymphocytes. Accepté à Gastroenterology. Articles en révision et soumis, prépublications. [P25] Gaïffas S. et Guilloux A. (2010). Learning for marker-dependent counting processes. Préprint. [P26] Buhard O. et al (2014). HSP110 T17, a next generation marker for the detection of micro satellite instability in colorectal cancer. Soumis. [P27] Guilloux A., Lemler S. et Taupin M.-L. Rates of convergence of a kernel estimator of the baseline function in a high-dimensional Cox model. Preprint [P28] Guilloux A., Lemler S. et Taupin M.-L. (2015) Adaptive estimation of the baseline function in a high-dimensional Cox model via model selection. Soumis. [P29] Achab M., Bacry E., Gaïffas S. and Guilloux A. (2015). Doubly Stochastic Gradient Descent using Predictive Variance Reduction. Soumis. [P30] Alaya M., Guilloux A. and Lemler S. High-Dimensional Cox and Aalen Models with Change-Points. Preprint [P31] Alaya M.,Gaiffas, S. et Guilloux A. Binarsity : features binarization and cuts selection using convex optimization. Preprint.