Rapport de l AERES sur l unité :

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1 Section des Unités de recherche Rapport de l AERES sur l unité : Mycotoxines et Toxicologie Comparée des Xénobiotiques Sous tutelle des établissements et organismes : Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENV) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) Mai 2010

2 Section des Unités de recherche Rapport de l AERES sur l unité : Mycotoxines et Toxicologie Comparée des Xénobiotiques Sous tutelle des établissements et organismes Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENV) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) Mai 2010

3 Unité Nom de l'unité : Mycotoxines et Toxicologie Comparée des Xénobiotiques Label demandé : UMR N si renouvellement : 1233 Nom du directeur : M. Benoît ETIENNE Membres du comité d'experts Président : M. Jacques MAGDALOU, Vandoeuvre-lès-Nancy Experts : M. Elie DASSA, Institut Pasteur, Paris M. Joachim FREY, Université de Berne, Suisse Mme Chantal LE BOUGUENEC, Institut Pasteur, Paris ; Mme Anne LESPINE, INRA, Toulouse Mme Marie-Anne LORIOT, Assistance Publique, Hôpitaux de Paris ( absence excusée) ; Mme Isabelle PODGLAJEN, Hôpital Georges Pompidou, Paris Expert(s) proposés par des comités d évaluation des personnels (CNU, CoNRS, CSS INSERM, représentant INRA, INRIA, IRD..) : Représentants présents lors de la visite Délégué scientifique représentant de l'aeres : Mme Claire POYART Représentant(s) des établissements et organismes tutelles de l'unité : M. Thierry PINEAU, INRA M. Gilles BRUNSCHWIG, VetAgro Sup 3

4 Rapport 1 Introduction Date et déroulement de la visite : La visite s est déroulée le jeudi 6 Mai 2010 de 9h00 à 12h30 dans les locaux de l Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon à Marcy l Etoile. Après une présentation générale par le Directeur de l Unité, les responsables des deux équipes constitutives ont présenté leurs travaux antérieurs ainsi que le projet proposé. La visite a continué par une réunion avec les chercheurs, enseignants-chercheurs, les IATOS et les Doctorants, en l absence de leurs responsables, et par une réunion avec les représentants des deux tutelles INRA et VetAgro Sup. Historique et localisation géographique de l unité et description synthétique de son domaine et de ses activités : L UMR 1233 a été créée en 2004, puis évaluée en Elle est localisée dans les locaux de l Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon à Marcy l Etoile. L Ecole s est regroupée le 1er janvier 2010 avec l Enita de Clermont-Ferrand et l Ecole Nationale des Services Vétérinaires pour fonder VetAgro Sup (Institut d Enseignement Supérieur et de Recherche en Alimentation, Santé Animale, Sciences Agronomiques et de l Environnement). Domaine et activités scientifiques : autour de 2 équipes dirigées par Etienne Benoît : - Equipe Transport Membranaire Mycotoxines (S. Locoeur) : mécanismes de transport par les transporteurs ABC et toxicité des mycotoxines ; - Equipe Résistances aux rodonticides (P. Berny) : développement d AVKs de 2ème génération, mécanismes de résistances, écotoxicité des AVKs. Equipe de Direction : A sa création en 2004, l UMR1233 avait 3 axes majeurs (mycotoxines, transport membranaire des pesticides, résistance aux rodonticides). En 2006, S. Lecoeur fédère les 2 premiers groupes. Le 3ème groupe alors élargit son champ d investigation à la résistance des populations de rats en relation avec l écotoxocité. L équipe de Direction de la nouvelle Unité n est pas clairement identifiée. Les 2 équipes coexistent de façon indépendante mais sont sous la direction d Etienne Benoît. L Unité comprend un secrétariat, un plateau technique et service de documentation communs aux deux équipes. 4

5 Effectifs de l unité : N1 : Nombre d enseignants-chercheurs (cf. Formulaire 2.1 du dossier de l unité) N2 : Nombre de chercheurs des EPST ou EPIC (cf. Formulaire 2.3 du dossier de l unité) N3 : Nombre d autres enseignants-chercheurs et chercheurs (cf. Formulaire 2.2 et 2.4 du dossier de l unité) N4 : Nombre d ingénieurs, techniciens et de personnels administratifs titulaires (cf. Formulaire 2.5 du dossier de l unité) N5 : Nombre d ingénieurs, techniciens et de personnels administratifs non titulaires (cf. Formulaire 2.6 du dossier de l unité) N6 : Nombre de doctorants (cf. Formulaire 2.7 du dossier de l unité) N7 : Nombre de personnes habilitées à diriger des recherches ou assimilées Dans le bilan Dans le projet 2 Appréciation sur l unité Avis global : L Unité mène une recherche finalisée avec un volet cognitif important sur la toxicité des mycotoxines et la résistances aux rodonticides. Les problématiques abordées sont des enjeux majeurs en santé animale et humaine. L Unité a acquis une reconnaissance internationale, notamment dans le domaine de la résistance aux AVKs, en mettant en œuvre une approche pluridisciplinaire et un partenariat important avec des laboratoires des EPST et des Industriels. L Unité constitue un interlocuteur privilégié avec les organisations agricoles et les professionnels de la dératisation. Le nouveau projet repose sur les bases solides expérimentales développées ces dernières années. Il prend en compte de nouvelles avancées scientifiques dans la littérature comme l élucidation de la structure cristallographique de la VKOR bactérienne qui peut conduire à la conception d AVK de 2ème génération, ou l apparition de nouveaux risques toxiques liés aux perturbateurs endocriniens. L Unité est bien sensibilisée à l impact de ces molécules sur l environnement en développant en particulier un projet ambitieux sur la surveillance de l écotoxicité des AVKs. Les 2 représentants des tutelles ont apporté tout leur soutien à l Unité et exprimé leur souhait de faire évoluer le statut d UMR à celui d une UsC (Unité sous contrat). Points forts et opportunités : La compétence et l expérience du personnel des deux équipes dans les domaines des AVKs et des mycotoxines sont importants et constituent un atoût pour la réussite du projet. Les recherches entreprises à l interface chimiebiologie sont réalisées au sein d un réseau européen non labellisé ou en collaboration avec plusieurs laboratoires INRA, CNRS ou INSERM. Elles combinent des approches à la fois structurales, mécanistiques et fonctionnelles pour l étude de cibles protéiques sélectionnées (transporteurs ABC, VKOR), débouchant sur la conception et le développement de nouvelles molécules ou une meilleure caractérisation et prévention des risques toxiques. Le partenariat industriel est fort (contrats, bourses CIFRE). Points à améliorer et risques : Pour l équipe Transport Membranaire-Mycotoxines, il est suggéré d approfondir les données acquises sur les transporteurs ABC, notamment les bases moléculaires de l implication de ces transporteurs avant de se lancer sur de 5

6 nouvelles pistes ou tissus cibles (placenta, glande mammaire). Le projet abordé est trop vaste par rapport à la taille de l équipe. Les perspectives du projet doivent être mieux définies. Pour la seconde équipe, le projet Ecotoxicité des AVKs doit être clarifié et mieux positionné dans le projet global de l Unité. Le projet Maîtrise des risques liés aux rongeurs, comme réservoirs de zoonoses doit mieux s intégrer dans le projet global. Le manque de connaissance en dynamique génétique des populations doit être rapidement comblé. L ensemble de ces recommandations devraient conduire à améliorer la qualité des publications.d une façon générale, on note un manque de communication sur l ensemble de l Unité entre les équipes et avec les tutelles. Dans ce contexte, l animation scientifique doit être améliorée. L interaction et la synergie entre les 2 équipes doit être mieux gérée. Les bonnes pratiques de laboratoire doivent être établies au sein de l Unité. Recommandations au directeur de l unité : -Améliorer la gestion et les potentialités scientifiques de l Unité en tirant partie des forces et des compétences des 2 équipes. -Améliorer la qualité des publications. -Accroître l animation scientifique au sein des 2 équipes -Accroître l attractivité de l Unité, surtout pour les chercheurs post-doctoraux au moyen de contrats (ANR, EU) -Avoir une politique d obtention de contrats et de dépôt de brevet plus ambitieuse -La prospective du projet Mycotoxines doit être mieux affinée -Veiller à l application des règles d hygiène et sécurité. Données de production : (cf. A1 : Nombre de produisants parmi les chercheurs et enseignants 8 chercheurs référencés en N1 et N2 dans la colonne projet A2 : Nombre de produisants parmi les autres personnels référencés en N3, N4 et N5 dans la colonne projet A3 : Taux de produisants de l unité [A1/(N1+N2)] 1 Nombre d HDR soutenues 0 Nombre de thèses soutenues 5 Autre donnée pertinente pour le domaine (à préciser ) 3 Appréciations détaillées : Appréciation sur la qualité scientifique et la production : -Recherche pluridisciplinaire avec des stratégies expérimentales justifiées visant à mieux comprendre et à prévenir la toxicité des mycotoxines, et développer de nouveaux AVKs. En particulier l Equipe Résistance aux Rodonticides est pionnière dans ce domaine et fait autorité à l échelon national et international. L expertise et les compétences des deux équipes sont un gage de faisabilité du projet. 6

7 - 33 publications entre , soit 6,6 articles/an. Le facteur d impact moyen est faible (2,11) communications (conférences, posters) et dix revues de vulgarisation et diffusion des informations dans le domaine de la santé animale et de la résistance aux rodonticides -L Unité a été l organisateur du 7 ème Colloque Européen sur les nuisibles des vertébrés, ainsi que d une journée d animation scientifique du département de Santé Animale de l INRA. Cette initiative doit être encouragée pour promouvoir les échanges entre principaux scientifiques du domaine. - L Unité a un partenariat industriel fort avec les principaux industriels impliqués dans la résistance aux AVKs. Elle a noué en particulier un contrat privilégié avec un Industriel autour d une convention cadre permettant l obtention de plusieurs bourses Cifre. Elle a également un réseau de collaborations par les contrats ANR en particulier avec un ensemble de laboratoires CNRS, INSERM ou INRA couvrant toutes les disciplines du projet. - L Unité a accueilli en 2009 un nouveau professeur, ainsi qu un CR1 CNRS qui a demandé une mise à disposition au CNRS. Ce chercheur est expérimenté dans la production et purification de protéines recombinantes et participera activement à la caractérisation de la VKOR. Le nombre de doctorants n a pas évolué et reste limité. L accueil de chercheurs post-doctoraux est fortement recommandé pour conforter l activité des deux équipes. L Unité a une bonne expérience dans l obtention de contrats académiques et industriels (ANR, AFSSET). L Unité participe à deux contrats ANR et s intègre dans un réseau international. Cette dynamique de collaborations contribue significativement à l avancée et à la qualité du projet. L Unité émarge par le rôle d un des membres de l Unité à un programme européen. Cette politique doit être amplifiée afin d accroître la lisibilité de l Unité. L Unité est un interlocuteur privilégié du monde économique agricole et des professionnels des rodonticides. Une politique plus ambitieuse doit être menée autour du dépôt de brevets, concernant notamment les nouveaux AVKs développés. Appréciation sur la stratégie, la gouvernance et la vie de l unité: L Unité comprend deux équipes qui coexistent indépendamment l une de l autre sous la direction du Directeur de l Unité. Elles ont chacune leur propre personnel et source de financement. Elles publient de façon séparée. Elles partagent néanmoins un service commun analytique, ainsi qu un secrétariat. Plus d interactions scientifiques entre les deux équipes seraient souhaitables pour la qualité de l ensemble du projet, par exemple autour des transporteurs ABC. L Unité est consciente de la quasi absence d animation scientifique. Cette animation est voulue au demeurant par les Doctorants. L accroissement de la taille de l Unité impose de mettre en place une animation plus régulière source de fédération de l Unité. Les enseignants-chercheurs de l Unité participent à de nombreux enseignements sur le site de Marcy l Etoile, Lyon intra-muros et de Clermont-Ferrand, en tant que responsables de Masters ou d Equipes d Accueil. L intervention sur ces différents sites distants est pénalisante. Appréciation sur le projet : La faisabilité du projet est très raisonnable étant donné l expertise et les compétences des 2 équipes dans les domaines du transport des mycotoxines et de la résistance aux rodonticides. Les collaborations sont en place. Pour l instant, les 2 équipes fonctionnent en autarcie avec des financements et un personnel qui leur sont propres, sur 2 sujets scientifiques distincts. Seuls le secrétariat ainsi que les équipements scientifiques sont mutualisés. Recherche innovante et réaliste dans le domaine du transport et de la toxicité des mycotoxines, ainsi que dans le développement d AVKs de seconde génération. Le groupe a une lisibilité internationale dans le domaine des rodonticides. La prise de risque concerne la conception, la synthèse et le développement de nouvelles molécules rodonticides toxicologiquement actives chez le rat tout en préservant une certaine innocuité chez l homme. Une 7

8 meilleure intégration du projet écotoxicologie et une meilleure connaissance de la génétique des populations constituent également un atout pour la réussite du projet. Note de l unité Qualité scientifique et production Rayonnement et attractivité, intégration dans l environnement Stratégie, gouvernance et vie du laboratoire Appréciation du projet A B A C A 8