Parcours : Médecine Personnalisée en Transplantation Humaine

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1 Mention Sciences du Vivant Spécialité de Master : Physiopathologie : de la Molécule à l'homme Parcours : Médecine Personnalisée en Transplantation Humaine Responsables: Pr. Seiamak BAHRAM Dr. Raphael CARAPITO INSERM UMR_S 1109 et LabEx Transplantex Fédération de Médecine Translationnelle Faculté de Médecine Université de Strasbourg Institut d'immunologie et d'hématologie 1 Place de l'hôpital Strasbourg Tel: Fax: Contact : master-tsx@unistra.fr 1

2 Descriptif du parcours Les étudiants attirés par la formation Physiopathologie : de la Molécule à l Homme, mais souhaitant se spécialiser dès le Master 1 au domaine de la Transplantation peuvent s inscrire au parcours Médecine Personnalisée en Transplantation Humaine. Ce parcours s appuie largement sur les cours du Master Physiopathologie : de la Molécule à l'homme en intégrant à chaque semestre une vingtaine d heures de cours spécifiques à la transplantation et à la médecine personnalisée. Ces enseignements spécifiques couvrent trois axes théoriques : Le système d histocompatibilité humain. Les bases moléculaires, cellulaires et physiologiques des transplantations de cellules, de tissus et d'organes. La pratique clinique de la transplantation et la médecine personnalisée. Les prérequis pour les inscriptions, les modalités d inscriptions, les spécificités du contrôle des connaissances et des stages sont identiques à ceux du Master Physiopathologie : de la Molécule à l Homme : voir Les débouchés : Ce parcours vise à former des étudiants qui pourront s inscrire en doctorat en France ou à l étranger. Il existe de nombreuses possibilités de financement via des contrats doctoraux institutionnels (Présidence, concours des écoles doctorales, excellence, Inserm, Région), des fondations ou associations. Suite à l obtention d un doctorat, les étudiants pourront intégrer la recherche publique ou privée. A la sortie de ce parcours, les étudiants auront également la possibilité de postuler directement à des postes d ingénieur d études ou d ingénieur assistant dans la recherche biomédicale académique ou industrielle. Les nouvelles technologies qui se développent depuis peu pour l analyse et le suivi des greffés créent actuellement un réel besoin de spécialistes dans les laboratoires d analyses médicales. Enfin, des postes d assistant de recherche clinique (ARC) ou d ingénieur en biologie au sein de CHU pourront être visés. 2

3 Détail des enseignements du parcours Médecine Personnalisée en Transplantation Humaine Intitulé de l UE Description Spécialité : physiopathologie : de la Molécule à l Homme / Parcours «Médecine Personnalisée en Transplantation Humaine» SEMESTRE S1 BioInformatique Techniques de la biologie moléculaire & cellulaire en Physiopathologie Initiation à la démarche scientifique en Transplantation I (stage) Anglais Génétique Humaine Cancérologie TRANSPLANTATION I (Histocompatibilité : rôle du HLA, son utilisation en transplantation et les nouvelles technologies) Acquisition, mise en forme et présentation de données scientifiques. Utilisation de divers logiciels d'analyse bioinformatiques (analyse et comparaison de séquences, analyse génétique d'allèles, prévisions de mutations,...) Connaissance des principes et de l'apport des nouvelles technologies en biologie moléculaire ou cellulaire. Connaître et comprendre les méthodes pouvant être appliquées dans les laboratoires pour répondre aux questions de recherche ou aux analyses de routine en transplantation. Maitrise de l anglais scientifique Connaître les approches cliniques, cytogénétiques et moléculaires concernant l étude physio pathogénique des principaux groupes de pathologies étudiées en génétique humaine. Avoir les bases théoriques et conceptuelles pour s intégrer dans une équipe de recherche et y développer des études à l échelon moléculaire, cellulaire et/ou tumoral dans le domaine de la cancérologie. Système d'histocompatibilité humain: connaissances de base et applications en transplantation. Connaître les techniques moléculaires et sérologiques actuelles. Connaissances des recherches actuelles en ce qui concerne les nouveaux marqueurs de tolérances, rejets, Sensibilisation aux nouvelles technologies (NGS) du domaine. SEMESTRE S2 Compte-rendu bibliographique en groupe (tuteuré) Histologie Appliquée Initiation à la démarche scientifique en Transplantation II (stage) Anglais Microbiologie Médicale Immunologie Médicale TRANSPLANTATION II (Bases moléculaires, cellulaires et physiologiques des transplantations de cellules, de tissus et d'organes) Capacité à comprendre, analyser et présenter des articles scientifiques Savoir observer des photos de microscopie électronique et des lames au microscope optique. Savoir reconnaître la normalité d un tissu. Savoir établir un protocole en Histologie selon la question scientifique posée. Etre capable de s intégrer à une équipe de recherche Etre capable de reconnaître les équipements d un laboratoire et leur usage Savoir interagir avec les membres d une équipe scientifique et accéder aux éléments bibliographiques Savoir réaliser et intégrer une à quelques expériences Savoir produire un document scientifique équilibré dans ses différentes parties. Maitrise de l anglais scientifique Epidémiologie des maladies microbiennes, Interactions cellulaires hôte pathogènes, Physiopathologie des maladies infectieuses. Connaître les bases moléculaires et cellulaires du système immunitaire afin de savoir disséquer la réponse immune normale et pathologique chez l homme. Connaissances approfondies au niveau moléculaire, cellulaire et physiologique des greffes d organes solides, de tissus et de cellules souches hématopoïétiques. 3

4 SEMESTRE S3 Intitulé de l UE Ouverture professionnelle Recherche bibliographique en Physiopathologie Préparation au stage S4 Histologie fonctionnelle et applications Questions d'actualité en Physiopathologie Génomique comparative et intégrative TRANSPLANTATION III (Pratiques cliniques et médecine personnalisée) SEMESTRE S4 Stage S4 Ecole d été internationale du LabEx TRANSPLANTEX Description Finance, Optimisation en gestion de production, L'essentiel du marketing, Gestion industrielle Maîtriser les tenants et les aboutissants d un projet de recherche en étant capable de l étayer par une recherche bibliographique pertinente actualisée. Comprendre l environnement scientifique et technique d un laboratoire. Travailler en équipe. Etre capable de programmer et d anticiper un projet de recherche ciblé. Savoir évaluer la faisabilité et la pertinence de ce projet de recherche et pouvoir imaginer des alternatives, le cas échéant. Evaluer la place des techniques morphologiques par rapport aux autres méthodes, de savoir les choisir et les hiérarchiser selon leurs avantages et leurs limites d élaborer un protocole pour les mettre en œuvre. Il devra également être capable d une évaluation critique de la méthode mise en œuvre et des résultats obtenus. Sensibilisation des étudiants à l'ouverture et à l'excellence scientifiques. Maîtrise des ressources utilisées en génomique comparative et intégrative. Capacité à manipuler et analyser une liste de gènes en exploitant des données génomiques, fonctionnelles et évolutives. Utilisation critique de données de haut débit. Connaissances des pratiques cliniques de transplantation (immunosuppression, choix des donneurs, transplantation, suivi des patients greffés, ). Sensibilisation aux nouvelles technologies et à leur rôle dans l avènement de la pratique de la médecine personnalisée Intégrer un laboratoire de recherche pendant un semestre et mener à bien un projet de recherche sous la tutelle d un responsable de stage interne au laboratoire. Ouverture à l excellence scientifique internationale dans le cadre de cours donnés par des spécialistes mondiaux du domaine de la transplantation. 4

5 Détails des Unités d Enseignements spécifiques à la Transplantation Unité d enseignement : TRANSPLANTATION I Histocompatibilité : rôle du HLA, son utilisation en transplantation et les nouvelles technologies Objectifs en termes de connaissances -Système d'histocompatibilité humain: connaissances de base et applications en transplantation. -Connaissance de la structure biochimique des molécules et gènes HLA, ainsi que leur expression tissulaire. -Connaissance des techniques moléculaires et sérologiques actuelles en histocompatibilité. -Connaissances des recherches actuelles en ce qui concerne les nouveaux marqueurs de tolérances, rejets, -Sensibilisation aux nouvelles technologies (NGS, tests sérologiques multiparamétriques) dans le domaine. Objectifs en termes de compétences -Connaître l ensemble des tests diagnostic en transplantation -Savoir analyser de manière critique des résultats de compatibilité cellulaire, sérologique ou moléculaire. -Savoir appliquer les règles d assignement d organes et de choix du donneur. -Savoir évaluer les risques post-transplantation en fonction des résultats des analyses de laboratoire -Analyser les paramètres de suivi des patients greffés -Maîtriser les nouvelles technologies utilisées dans le domaine (notamment le séquençage haut-débit) Prérequis Connaissances de bases en biologie moléculaire et cellulaire Responsable : Dr. Raphael Carapito, IR ImmunoRhumatologie Moléculaire, INSERM UMR_S 1109, LabEx Transplantex, Université de Strasbourg, Faculté de Médecine, Institut d Immunologie et d Hématologie, 4, rue Kirschleger, F Strasbourg cedex. Tél +33 (0) / Fax +33 (0) / carapito@unistra.fr 5

6 Unité d Enseignement : TRANSPLANTATION II Bases moléculaires, cellulaires et physiologiques des transplantations de cellules, de tissus et d'organes Objectifs en termes de connaissances -Connaissances approfondies au niveau moléculaire, cellulaire et physiologique des greffes d organes solides, de tissus et de cellules souches hématopoïétiques. -Connaissance des principes de base des différents types de greffes -Connaissance des mécanismes immunologiques liés à la transplantation -Connaissance des mécanismes de l allo-réactivité, des rejets de greffes et de la réaction du greffon contre l hôte -Connaissance des bases de l immunosuppression Objectifs en termes de compétences -Reconnaître les différents types de rejets en transplantation d organe -Evaluer les conséquences physiologiques des complications post-greffes -Connaissance des signes cliniques et des marqueurs biologiques permettant de diagnostiquer l évolution des greffes. Responsable : Prof. Seiamak Bahram, PU-PH ImmunoRhumatologie Moléculaire, INSERM UMR_S 1109, LabEx Transplantex, Université de Strasbourg, Faculté de Médecine, Institut d Immunologie et d Hématologie, 4, rue Kirschleger, F Strasbourg cedex. Tél +33 (0) / Fax +33 (0) / siamak@unistra.fr 6

7 Unité d enseignement : TRANSPLANTATION III Pratiques cliniques et médecine personnalisée Objectifs en termes de connaissances -Connaissance des pratiques cliniques de transplantation (immunosuppression, choix des donneurs, transplantation, suivi des patients greffés, ) -Connaître le parcours d une greffe (du prélèvement du donneur au suivi post-greffe du patient) -Pathologies traitées par transplantation -Sensibilisation aux nouvelles technologies et à leurs rôles dans l avènement de la pratique de la médecine personnalisée. Objectifs en termes de compétences -Connaître les indications cliniques pour une greffe -Connaître la pratique quotidienne et les différentes options cliniques en transplantation. -Savoir évaluer différents facteurs de risques post-greffes -Connaître les points clés de l adaptation des traitements aux patients en fonction des signes cliniques et marqueurs biologiques actuels. Responsable : Dr. Mirjana RADOSAVLJEVIC, MCU-PH ImmunoRhumatologie Moléculaire, INSERM UMR_S 1109, Université de Strasbourg, Faculté de Médecine, Institut d Immunologie et d Hématologie, 4, rue Kirschleger, F Strasbourg cedex. Tél +33 (0) / Fax +33 (0) / mirjana@unistra.fr Contact: master-tsx@unistra.fr Site web du Master Physiopathologie : de la Molécule à l'homme 7