Banque de semences : un outil de conservation à suivre et évaluer, un socle pour étudier l évolution

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1 C o n s e r v a t o i r e b o t a n i q u e n a t i o n a l a l p i n Banque de semences : un outil de conservation à suivre et évaluer, un socle pour étudier l évolution Rencontres des Jardins s de France, 9 juillet 2013, Villar d Arène, Station alpine Joseph Fourier/Jardin du Lautaret Ensemble par-delà les frontières

2 Crise de la biodiversité -> conservation ex situ de plus en plus reconnue Les banques de semences = bon outil de conservation de la biodiversité Peu de données existent sur la viabilité des graines conservées dans les banques de semences Peu d exploitation à des fins de recherche Des enjeux importants à développer!

3 La conservation ex situ au CBNA La banque de semences: 3142 lots soit 1114 espèces (dont 60% récoltés en PACA) Sans statut 8,14 Livre rouge tome 1 et 2 3,92 4,85 27,28 Livre rouge PACA Livre rouge Rhone-Alpes 8,71 Directive habitat Partie V Conclusion 4,94 9,29 11,25 Protection nationale Annexes 1 et 2 Protection PACA 21,62 Protection Rhone-Alpes Arrétés préfectoraux de ceuillette

4 La conservation ex situ au CBNA Les tests de germination: 5974 tests de germination entre 1996 et 2011 Programmes expérimentaux de germination > suivi viabilité site de culture : 1500m2 de culture : chassis, bassins, ombrières, serre 344 espèces cultivées Partie V Conclusion

5 C o n s e r v a t o i r e b o t a n i q u e n a t i o n a l a l p i n Banque de semences et germination de la flore méditerranéo-alpine de la Région PACA : Application à la conservation de la biodiversité végétale

6 Présentation du projet Banque de semences et germination de la flore méditerranéo-alpine de PACA Objectifs Partenariat CBNA/CBNMed -> vision régionale Partie I Projet 1. S assurer de la viabilité des stocks de semences conservées Partie II Actions réalisées Partie III Actions restantes Partie IV Conclusion 2. Définir une stratégie régionale pour la conservation de la biodiversité 3. Synthétiser et présenter les résultats de cette étude 4. Diffuser et valoriser les résultats du projet par la mise en ligne d une base de données

7 Présentation du projet Banque de semences et germination de la flore méditerranéo-alpine de PACA Mise à jour des bases de données conservation Récolte - Banque de semences - Tests de germination - Culture - Semis soit fiches papiers Partie I Projet Partie II Actions réalisées Partie III Actions restantes Partie IV Conclusion données vérifiées, validées, mises à jour et donc exploitables Création de nouvelles bases de données Base de données photos Actuellement 870 scans soit 401 espèces Base de données description des semences Actuellement 708 descriptions soit 403 espèces

8 Présentation du projet Banque de semences et germination de la flore méditerranéo-alpine de PACA Evaluation de la banque de semences Mise en place de tests de germination pour connaitre la viabilité des lots au cours de leurs conservation Partie I Projet Partie II Actions réalisées Partie III Actions restantes Partie IV Conclusion Méthodologie: 1. Priorisation des lots à tester 2. Détermination d un protocole et d une durée de tests standardisés 3. Mise en place de tests de germination

9 Présentation du projet Banque de semences et germination de la flore méditerranéo-alpine de PACA Analyse des données (à partir de septembre 2013) Evaluer l état des lots présents en banque des semences Partie I Projet Partie II Actions réalisées Partie III Actions restantes Partie IV Conclusion Connaitre l état de conservation des lots en banque de semences (ou du moins une partie) Mettre en place une stratégie de récolte pour les 10 prochaines années Mettre en place une stratégie de suivi de l état de la banque de semences

10 Présentation du projet Banque de semences et germination de la flore méditerranéo-alpine de PACA Comment poursuivre ce travail sur toute la banque de semences? Partie I Projet Créer un projet semblable pour la Région Rhône-Alpes Partie II Actions réalisées Partie III Actions restantes Partie IV Conclusion Projet Interreg Régénération séminale des Alpes sud-occidentales Continuer à évaluer l état de conservation des lots récoltés en PACA Acquérir de nouvelles connaissances sur la germination

11 C o n s e r v a t o i r e b o t a n i q u e n a t i o n a l a l p i n Etude de l écologie de la régénération de la flore patrimoniale des Alpes Sud occidentales Problématiques et perspectives

12 Introduction Méthodologie Quelle est la part des processus évolutifs contemporains dans la dynamique actuelle de la diversité? Vers la prise en compte de ces processus dans les mesures de protection

13 Expérience de résurrection Introduction Méthodologie BioOne, 2008

14 Régénération et phénologie de la germination Germination précoce Introduction Méthodologie Germination tardive Part importante de la fitness des individus Sensibilité aux conditions environnementales (températures, précipitation) Définition de l environnement de sélection de l ensemble des traits (Syndromes de traits de germination) Donohue et al 2010 Ann Rev Ecol Evol Syst La germination: un trait important de la régénération susceptible de répondre face aux changements climatiques

15 La flore patrimoniale des Alpes Sud occidentales En Europe, les changements climatiques (température et précipitation) devraient avoir un impact particulièrement important sur la flore des zones de montagne (Thuiller 2005 PNAS) Introduction Le Conservatoire Méthodologie Banque de semences (3000 accessions) Base de données Description de la dynamique de germination 385 accessions, 215 espèces, 55 familles + Données CBN Med + Données Parc Naturel du Marguareis (Italie) Dans le cadre du projet SEMINALP Détection de patrons d évolution des traits en liens avec la germination Quels liens entre ces patrons d évolution et les changements climatiques?

16 Approche exploratoire parents Introduction Méthodologie Temps n générations descendants 16 espèces, 1 population par espèces, 2 générations (de 5 à 29 ans d écart), 30 individus par génération graines graines Mesure de traits en jardin commun - germination, - croissance (SLA, taux de croissance), - reproduction (date de floraison, nombre de graine, ratio pollen/ovule) Détection de patrons d évolution généraux sur les traits principaux de la régénération en lien avec la phénologie de la germination

17 Evolution de la germination F1 (design familiaux) Adaptation locale Introduction Méthodologie Tendance évolutive graines 3 espèces du genre androsace d écologie différente Estimation de la germination en laboratoire Délai germinatif Messicoles Pourcentage de germination Androsace maxima L. Pelouse sèche Date de germination

18 Evolution de la germination Introduction Méthodologie Germination Evolution Température Humidité Tendance évolutive Adaptation locale Adaptation locale Germination Température Humidité Patrons d adaptation locale en lien avec l écologie de l espèce Evolution de la germination en lien avec les changements climatiques

19 Analyse des bases de données Relation entre niche écologique et répartition des espèces Introduction Méthodologie Trait 2 Performance (Abondance, fitness) Hétérogénéité environnementale Quels sont les traits majeurs de la répartition des espèces?

20 Analyse des bases de données Introduction Méthodologie Niche de germination estimée en laboratoire Répartition des espèces Performance (Germination)? Température

21 Observatoire de la régénération Introduction Méthodologie Récolte (estimation de la niche de germination) Récolte (estimation de la niche de germination) Réponse évolutive aux changements environnementaux Performance (Germination) Hétérogénéité environnementale (Température)