Rapport du comité d'experts

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1 Section des Unités de recherche Rapport du comité d'experts Unité de recherche : Epidémiologie, Stratégies Thérapeutiques et Virologie Clinique dans l'infection à VIH UMR_S 720 de l'université Pierre et Marie Curie Mai

2 Section des Unités de recherche Rapport du comité d'experts Unité de recherche : Epidémiologie, Stratégies Thérapeutiques et Virologie Clinique dans l'infection à VIH UMR_S 720 Université Pierre et Marie Curie mai 2008

3 Rapport du comité d'experts L'Unité de recherche : Nom de l'unité : Epidémiologie, Stratégies Thérapeutiques et Virologie Clinique dans l'infection à VIH Label demandé : UMR_S N si renouvellement : 720 Nom du directeur : Mme Dominique COSTAGLIOLA Université ou école principale : Université Pierre et Marie Curie Paris 6 Autres établissements et organismes de rattachement : INSERM Date(s) de la visite : 20 mars

4 Membres du comité d'évaluation Président : M. Denis HEMON, Villejuif Experts : M. Asier SAEZ-CIRION, Paris Mme Josiane WARSZAWSKI, Villejuif Expert(s) représentant des comités d évaluation des personnels (CNU, CoNRS, CSS INSERM, représentant INRA, INRIA, IRD ) : M. Christian PRADIER, Nice, représentant du CNU Mme Hélène JACQMIN-GADDA, Bordeaux, représentant des CSS de l INSERM Observateurs Délégué scientifique de l'aeres : Mme Archana SINGH-MANOUX Représentant de l'université ou école, établissement principal : M. Jean CHAMBAZ, Université Paris 6 Représentant(s) des organismes tutelles de l'unité : Mme Josiane POGGIOLI, INSERM 4

5 Rapport du comité d'experts 1 Présentation succincte de l'unité Le projet de l unité " Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l infection à VIH " est centré sur la problématique de vivre au long cours avec le VIH. Il s articule autour des questions que pose la recherche clinique sur le VIH depuis l avènement des multi- thérapies qui ont changé le cours de cette infection en 1996, et dans le contexte de l arrivée des 2 nouvelles familles d anti-rétroviraux, qui bloquent l'entrée du virus dans la cellule ou son intégration. Il est fondé sur l interaction entre des cliniciens, virologues, épidémiologistes et biostatisticiens qui collaborent étroitement depuis 10 ans. Les recherches seront organisées autour de 3 équipes travaillant en étroite collaboration sur des projets complémentaires : Epidémiologie clinique de l infection à VIH, de ses complications et de ses traitements Stratégies thérapeutiques dans l infection à VIH Résistance aux anti- rétroviraux Ces recherches s appuieront sur les cohortes et les essais cliniques coordonnés par l'unité (qui est l un des centres de méthodologie et de gestion des essais ANRS sur le VIH) et notamment sur la Base de données hospitalière française sur l infection à VIH. Cette base comprend les données relatives à plus de personnes dans 68 hôpitaux répartis sur tout le territoire français. Elles s intégreront au sein de projets européens financés (Cascade, Gisheal, réseau d excellence NEAT) ou soumis (Chain dans le cadre du FP7, Cohere dans le cadre du MRC) et de coopérations internationales (HIV-Causal Collaboration, NIH R01 AI A2 ; ART Cohort collaboration dans le cadre du MRC). L hôpital de la Pitié-Salpêtrière regroupe aussi des immunologistes au sein de l IFR "Immunité et infection", auquel participe l'unité et bénéficie d un fort recrutement clinique (environ 3000 patients suivis dans le service des maladies infectieuses, plus de au sein du Corevih Paris-Est), il est donc un site particulièrement bien adapté pour développer ce projet. L unité est constituée de 57 membres dont : 3 chercheurs statutaires 15 enseignants-chercheurs 28 ingénieurs et techniciens dont 7 statutaires 7 doctorants, tous financés Depuis Janvier 2004, 6 étudiants ont soutenu leur thèse, la durée moyenne d une thèse étant de 3 ans et demi. 4 membres de l unité sont titulaires d une HDR dont 3 supervisent des étudiants. 2 Déroulement de l'évaluation Tous les exposés (présentations générales et par équipe, par les coordonnateurs des équipes et par des doctorants) ont eut lieu en présence de l'ensemble des personnels et ont donné lieu à des échanges scientifiques multiples avec tous les membres du groupe d'expertise. Les documents écrits et exposés ont présenté de façon parfaitemment claire les problématiques abordées, questions posées, démarches adoptées, instruments d'observations développés, résultats obtenues à ce jour et nouvelles questions ouvertes. Une rencontre a eut lieu avec les personnels ingénieurs, techniciens et administratifs (titulaires et contractuels) en présence des seuls experts et observateurs, puis avec les doctorants dans la même configuration. A l'occasion de ces échanges le groupe de visite a très positivement apprécié la dynamique d'ensemble de l'unité et l'implication de la totalité des personnels de l'unité (directeur, coordonnateurs des équipes, chercheurs, inténgieurs techniciens et administratifs) dans toutes les dimensions de la vie scientifique de l'unité. Les délibérations du groupe d'expertises ont eu lieu à huis clos, en présence des membres observateurs mais sans 5

6 intervention de leur part. La durée de ces délibérations, environ 1h30 a assuré une analyse approfondie des différents aspects du projet d'unité. 3 Analyse globale de l unité, de son évolution et de son positionnement local, régional et européen Cette unité, créée en janvier 2005, demande sa reconnaissance pour un nouveau mandat quadriennal ( ). Son projet de recherche est parfaitement structuré à partir des éléments suivants sur lesquels s'articulent de façon systématique et particulièrement cohérente les problématiques, questions, approches, projets et méthodes. Dix ans après l introduction en 1996 des toutes premières trithérapies, le nombre de patients dont la réplication virale est contrôlée a progressivement augmenté jusqu à atteindre près de 85% des patients sous traitements, conduisant à une augmentation de la survie que l on peut estimer maintenant de plusieurs décennies. Cependant : Ces succès ne sont obtenus qu au prix d un maintien constant du traitement antirétroviral (ARV) sous peine de reprise de réplication immédiatement après interruption du traitement ; L absence de restauration immunitaire anti VIH sous traitement ARV, ou même celle modeste que l on peut obtenir après immunothérapie, ne permet pas de s affranchir même transitoirement du traitement ARV ; Les causes de morbidité et de mortalité deviennent plus diverses (pathologies vasculaires, rénales, osseuses, cancers classant ou non SIDA), en grande partie en raison du vieillissement de la population infectée par le VIH, de la fréquence importante des facteurs de risque pour les maladies cardiovasculaires et le cancer, des effets de l infection elle-même et de l effet des traitements antirétroviraux. Il existe un risque permanent de développement de résistance virale en cas de réplication virale même minime, variable selon les différentes classes thérapeutiques, obligeant au maintien quasi absolu d une charge virale plasmatique sous le seuil minimal de détection. 4 Analyse équipe par équipe et par projet Equipe 1 : Epidémiologie clinique de l'infection à VIH, de ses complications et de ses traitements L équipe 1 a travaillé sur les thèmes suivants depuis 2003 : Pronostic clinique et réponse immuno- virologique au traitement ; Échec thérapeutique, résistance au anti- rétroviraux ; Restauration immune et pathologies opportunistes ; Complications associées à la maladie ou aux traitements ; Surveillance épidémiologique. Les objectifs scientifiques généraux de son projet sont les suivants : Etudier l histoire clinique de la maladie et mettre en relation les résultats biologiques et cliniques des combinaisons antirétrovirales (cart) ; Etudier la morbi-mortalité chez les patients naïfs et les patients traités et en particulier étudier la survenue de pathologies rares susceptibles d être liées à l exposition aux traitements et/ou à l infection à VIH, notamment les cancers classants et non classants SIDA et les pathologies métaboliques et vasculaires ; Contribuer à la surveillance épidémiologique de l infection à VIH en France, via la modélisation. 6

7 Cette équipe est constituée de 2 chercheurs statutaires, 2 enseignants-chercheurs et de 2 praticiens hospitaliers représentant un total de 2 ETP. 2 des membres de cette équipe sont titulaires d une HDR. L équipe bénéficie également de 8 ingénieurs, techniciens et personnels administratifs dont 3 sont titulaires. De Janvier 2002 à Septembre 2007, les membres de cette équipe ont publié 128 publications originales dont 17 en premier auteur et 34 en dernier auteur. 95 articles scientifiques originaux ont été publiés dans des revues du meilleur niveau du domaine : revues spécialisées et généralistes : notamment : Antiv Ther / AIDS / J Infec Dis / Br J Haematol / J Acquir immune Defic Syndr / Clin Infec Dis / J Clin Oncol / Stat Med / Infection / J Clin Microbiol / Arch Int Med / The Lancet). Au total l'équipe 1 présente une excellente production scientifique , un excellent projet scientifique , centré sur des problématiques parfaitement pertinentes. Equipe 2 : Stratégies thérapeutiques dans l'infection à VIH Cette équipe est constitué de 3 chercheurs statutaires, 1 enseignant-chercheur et de 6 praticiens hospitaliers représentant un total de 2,7 ETP. Un membre de cette équipe est titulaire d une HDR. L équipe bénéficie également de 15 ingénieurs, techniciens et personnels administratifs dont 1 est titulaire. L équipe 2 a travaillé sur les thèmes suivants depuis 2003 : Echec thérapeutique et nouvelles molécules antirétrovirales ; Complications des traitements anti- rétroviraux et de l infection VIH ; Nouvelles stratégies thérapeutiques ; Restauration immunitaire et stratégies d immuno-intervention ; Coinfection par les virus des hépatites C et B ; Traitements antirétroviraux dans les Pays en développement. Les objectifs scientifiques généraux de son projet sont les suivants : Complications des traitements antirétroviraux et de l infection VIH ; Nouvelles stratégies antirétrovirales ; Co-infection par les virus des hépatites C et B ; Prise en charge de l infection à VIH dans les pays en développement. De Janvier 2002 à Septembre 2007, les membres de cette équipe ont publié 182 publications originales dont 15 en premier auteur et 18 en dernier auteur. 142 articles ont été publiés dans des revues du meilleur niveau du domaine, notamment : Antiv Ther, AIDS, Hepatology, Clin Infec Dis, Nat Rev Immunol, HIV Clin Trials, Vaccine, J Med Virol. Au total l'équipe 2 présente une excellente production scientifique , un excellent projet scientifique , centré sur des problématiques parfaitement pertinentes. Cette équipe a centré son activité et son projet scientifiques sur les essais cliniques. Elle est encouragée à accroître ses activités d'encadrement de doctorants (ce qui implique, comme elle l'indique, que les établissements considèrent comme pertinent de proposer des positions permanentes aux cliniciens ayant une formation doctorale dans ce domaine de recherche). Equipe 3 : Résistance aux anti- rétroviraux Cette équipe est constitué de 2 chercheurs statutaires, 4 enseignants-chercheurs et de 1 praticien hospitalier représentant un total de 3 ETP. Un membre de cette équipe est titulaire d une HDR. L équipe bénéficie également de 8 ingénieurs, techniciens et personnels administratifs dont aucun n est titulaire. 7

8 L équipe 3 a travaillé sur les thèmes suivants depuis 2003 : Identification des mutations de résistance aux antirétroviraux et lien avec la pharmacologie ; Méthodologie de la construction des règles d interprétation des tests génotypiques ; Epidémiologie de la résistance aux antirétroviraux. Les objectifs scientifiques généraux de son projet sont les suivants : Identification des mutations de résistance ; Méthodologie de la construction d algorithmes génotypiques ; Résistance aux antirétroviraux et pays du sud. De Janvier 2002 à Septembre 2007, les membres de cette équipe ont publié 111 publications originales dont 41 en premier auteur et 14 en dernier auteur. 109 articles ont été publiés dans des revues du meilleur niveau du domaine, notamment : Antiv Ther, AIDS, J Acquir immune Defic Syndr, J Med Virol, HIV Med, Blood, Antimicrob Agents Chemother, J Clin Microbio, J Inf Dis, N Engl J Med, Stat Med. Au total l'équipe 3 présente une excellente production scientifique , un excellent projet scientifique , centré sur des problématiques parfaitement pertinentes. 5 Analyse de la vie de l'unité En termes de management : L'Unité est apparue comme bénéficiant d'un directeur et de coordonnateurs d'équipes : particulièrement compétents sur le plan scientifique et ayant une excellente visibilité internationale, ayant mis en place des outils d'observation ou d'expérimentation d'envergure sur leur problématique, capables de mobiliser les importantes ressources humaines et financière nécessaires au développement de leurs travaux, sachant parfaitement animer sur le plan humain leurs Unité et Equipes. En termes de ressources humaines : L'Unité est apparue comme disposant des ressources lui permettant de réaliser son projet de recherche, aussi bien du fait de la qualification de l'ensemble de ses membres (chercheurs, ingénieurs techniciens doctorants et post-doctorants), que du fait de leur nombre et de l'efficacité de l'organisation de leurs travaux. En termes de communication : L'Unité joue un rôle central au niveau national et international dans l'acquisition des connaissances nouvelles sur la population des personnes infectées par le VIH et aussi sur leur transfert aux autorités de santé et partenaires des problématiques liées à l'infection au VIH. 8

9 6 Conclusions Points forts : Importance de la problématique générale abordée et des contributions scientifiques antérieures sur celle-ci ; Importance des outils d'observation épidémioloiques et cliniques d'envergure mis en place ; Qualité de l'équipe de direction de l'unité et des Equipes et de l'ensemble des personnels impliqués dans le projet ; Excellente visibilité internationale de l'équipe de ses projets et contributions scientifiques ; Importance qualitative et quantitative des contributions scientifques antérieures qui place cette unité au meilleur niveau de son domaine de recherche sur le plan international ; Rôle leader de l'unité au sein de plusieurs projets scientifiques d'envergure nationale et européenne dans le domaine et qualité des partenaires scientifiques extérieurs de l'unité. Points à améliorer : Cette unité a un fort potentiel d'encadrement de thèses et pourrait renforcer encore son activité dans ce domaine, notamment, comme elle le projette, en accroissant son nombre d'hdr et de doctorants. Recommandations : Le comité recommende de renforcer le potentiel d encadrement de doctorants en incitant les membres des 3 équipes à soutenir une HDR. En conclusion, les membres du comité de visite ont un avis très positif sur cette unité. 9

10 Epidémiologie clinique et traitement de lʼinfection à VIH Directeur : D. Costagliola1 Réf : AER_P06_057-UMRS720-ASM-V1 Paris, le 13 mai 2008 J ai bien reçu le rapport d évaluation de l AERES concernant notre unité de recherche UMR- S 720 Epidémiologie, Stratégies Thérapeutiques et Virologie Clinique dans l'infection à VIH et je vous signale que ce dernier n appelle aucune observation de ma part ou de celle des autres responsables d équipe. Dominique COSTAGLIOLA Directeur de l UMR-S 720 Correspondance : INSERM U Boulevard Vincent Auriol BP PARIS Cedex 13 - FRANCE Tel : (33-1) Fax : (33-1) Dominique.costagliola@ccde.chups.jussieu.fr