Journée Workflow - 21 Décembre Franck Le Petit Laboratoire Univers & Théories.
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- Théodore Doucet
- il y a 7 ans
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1 Journée Worklow - 21 Décembre 2006 Frnck Le Pei Lboroire Univers & Théories hp://vo.obspm.r/simulion
2 Objecis Observions dns des milieux moléculires nuges moléculires : dius & sombres disques circumplnéires sysèmes Lymn lph dmpés Ri A
3 Objecis A Code de MHD résou l évoluion dynmique Proil de densié Condiions iniiles Code MHD Proil de densié ne résou ps les processus microscopiques ne clcule ps les bondnces des espèces Chuge Reroidissemen Code PDR clcule l srucure microscopique Proil d bondnce des espèces Proil de empérure Proil de densié Code PDR Proils : - bondnces - empérure ne résou ps l dynmique : proil de densié d-hoc ne clcule ps l émission de oues les espèces Code de rnser de ryonnemen résou l équion de rnser émissiviés ou specres Proils - bondnce - empérure Code de rnser de ryonnemen inensié / specre ne résou ps l chimie / biln hermique
4 Objecis A Objeci : Uiliser des worklows pour relier les diérens élémens Fire simplemen des opérions ujourd hui complexes Aller plus loin dns l nlyse scieniique Condiions iniiles Aom. Bse Physique Molé. Code MHD Code PDR Code de rnser de ryonnemen Chuge Reroidissemen nensié / Specre
5 Rélision A Première épe : inscrire des codes de simulions dns le VO pouvoir lncer des codes vi le VO sur des serveurs disns pouvoir exrire des résuls du binire créé > oncionnel mis mnuel PDR dns Asrogrid Regisry Asrogrid VO-Pris Ressources de Clcul PDR) muli-uiliseurs nerce de lncemen MySpce Espce uiliseur
6 Rélision A nroducion du code PDR dns les OV Lncemen vi Asrogrid à prir de l inerce de lncemen Développemen de l inerce d nlyse Bses de données de résuls Bse de données de physique omique e moléculire Développemen en collborion vec : Ressources de Clcul PDR) MySpce Espce uiliseur Bse de données PDR VO-Pris LUTh Asrogrid Asrogrid nerce de lncemen nerce d'nlyse Ouils compibles OV
7 Rélision A Première épe : Codes dns le VO inscrire des codes de simulions dns le VO pouvoir lncer des codes vi le VO sur des serveurs disns pouvoir exrire des résuls du binire créé > oncionnel mis mnuel Seconde épe : élémen d un worklow récupérion de résuls de çon uomique créion d un ichier lu pr le progrmme d nlyse processus nlyse ourne sur le serveur Foncionnemen cuel Fichier prmères enrees pour l'nlyse Progrmme / inerce d'nlyse MySpce Binire Résul d un clcul Bse de données héoriques
8 Rélision A Première épe : Codes dns le VO inscrire des codes de simulions dns le VO pouvoir lncer des codes vi le VO sur des serveurs disns pouvoir exrire des résuls du binire créé > oncionnel mis mnuel Seconde épe : élémen d un worklow récupérion de résuls de çon uomique créion d un ichier lu pr le progrmme d nlyse processus nlyse ourne sur le serveur Elémen worklow Sysème Fichier prmères enrees pour l'nlyse Serveur Progrmme d'nlyse Aure élémen worklow MySpce Binire
9 Rélision A Code de simulion : prmères d enrée code ichier de résuls binire code d nlyse sorie humn redble Uiliseur ou Sysème Prmères d'enrée Répriion des prmères Prmères d'enrée Prmères d'enrée Prmères d'enrée Prmères d'enrée Code MHD Binire MHD Anlyse MHD Code PDR Binire PDR Anlyse PDR
10 Rélision A Première épe : Codes dns le VO inscrire des codes de simulions dns le VO pouvoir lncer des codes vi le VO sur des serveurs disns pouvoir exrire des résuls du binire créé > oncionnel mis mnuel Seconde épe : élémen d un worklow récupérion de résuls de çon uomique créion d un ichier lu pr le progrmme d nlyse processus nlyse ourne sur le serveur Troisième épe : relier des codes Worklow enre PDR + rnser : es vec Aïd diiculé : lngge sndrd enre les diérens membres d une communué
11 Diiculés A Problèmes scieniiques Cohérence physique du couplge enre codes Exemple : Couplge enre un code MHD e un code PDR pour l résoluion du biln hermique Déiniion des quniés physiques peu êre diérenes enre les codes Exemple : densié n nh) + 2 nh2) ou n nh) + nh2) + nhe)? Problèmes echniques UCD / Uypes pour ire communiquer les élémens Code de rnser u code PDR : Envoie moi le proil de empérure e d bondnce de HCO + Srucurion des données en sories : dmodel Proocoles d inerrogion Trvux en cours pour les codes de simulion sur grille cosmologie, MHD,...) : SNAP Pour les codes de rnser le problème es diéren mis on doi pouvoir s inspirer de l philosophie Problèmes des ichiers binires Les résuls des codes de simulion son écris dns un gros ichier binire En oncion du sysème sur lequel le binire éé créé on peu voir des problèmes pour le relire sur un ure sysème : Exemple ypique : lile endin / big endin Soluions : Lire le binire là où il éé créé : ps oujours possible Trnser des données sur une mchine de sockge) Soluion des imges.i : code un nombre connu en débu de ichier : lourd mere en oeuvre
12 Worklow A Couplge enre codes, bses de données héoriques Clcul synchrone Chngemens de ypes de codes pour éudier ee sur résuls physiques Comprison ux observions
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