De la recherche bibliographique à la lecture critique d articles

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1 De la recherche bibliographique à la lecture critique d articles Staff de santé publique 19 janvier 2010 Dr Marion ALBOUY-LLATY Staff SP 19/01/2011 1

2 Évolution des connaissances Sackett DL. EBM 1996 ; Haynes RB. ACP J Club 1993 ; Shaneyfelt et al. JAMA % des prescriptions concernent des médicaments non vus en formation initiale 50% des connaissances se périment en 7 ans Pour un médecin interniste (20 journaux, 6000 articles/ an) Souhaitable : lecture de 19 articles / jour Observé : durée moyenne de lecture 2 h / sem 90% de la littérature publiée n atteint pas les standards minimum de qualité 50% des recommandations conformes aux standards d élaboration et de présentation Recommandations non connues des professionnelles Staff SP 19/01/2011 2

3 Évolution des connaissances Sackett DL. EBM 1996 ; Haynes RB. ACP J Club 1993 ; Shaneyfelt et al. JAMA % des prescriptions concernent des médicaments non vus en formation initiale 50% des connaissances se périment en 7 ans Recherche Pour un médecin interniste (20 journaux, 6000 articles/ an) Souhaitable : lecture de 19 articles / jour bibliographique Observé : durée moyenne de lecture et 2 h LCA / sem 90% de la littérature publiée n atteint pas les standards minimum de qualité de qualité obligatoires!!!! 50% des recommandations conformes aux standards d élaboration et de présentation Recommandations non connues des professionnelles Staff SP 19/01/2011 3

4 Recherche biblio = savoir ce que l on cherche des livres ou des thèses? Catalogue de bibliothèque des informations? Sites web des sites? Moteurs de recherche des articles? Bases de données (gratuites ou payantes) Staff SP 19/01/2011 4

5 2 types de littérature Littérature «blanche» = publiée ou éditée Articles de périodiques Livres Littérature «grise» = non commercialisée Thèses, mémoires Rapports Plaquettes, brochures, brevets, normes Staff SP 19/01/2011 5

6 Catalogues de bibliothèque Staff SP 19/01/2011 6

7 Catalogues de bibliothèque Staff SP 19/01/2011 7

8 Sites Web Staff SP 19/01/2011 8

9 Sites Web ex-urcam Staff SP 19/01/2011 9

10 Bases de données MEDLINE : articles de revues biomédicales Sciencedirect: articles de revues biomédicales BDSP (Banque de Données Santé Publique) : BIBLIOINSERM (INSERM) : sciences BIBLIOVIE (CNRS) : sciences PASCAL : sciences et techniques FRANCIS : Fichier de Recherches Bibliographiques Automatisées sur les Nouveautés, la Communication et l'information en Sciences humaines et sociales PSYDOC : psychiatrie TOXLINE: Toxicologie Staff SP 19/01/

11 MEDLINE Comment accéder à MEDLINE? Comment se faire aider? Comment faire une recherche libre? Comment faire une recherche par mot-clé? Comment faire le tri? Comment sauvegarder sa recherche? Comment accéder aux textes complets? Staff SP 19/01/

12 PubMed Interface d interrogation permettant de consulter la base MEDLINE les pré-citations de MEDLINE les bases spécialisées du NCBI Produit développé conjointement par le National Center for Biotechnology Information (NCBI) la National Library of Medicine (NLM, Bethesda, USA) : The literature Selection technical review commitee sélectionne >4800 revues à indexer les éditeurs de revues biomédicales Staff SP 19/01/

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14 Recherche libre [ Text word ] Ecriture Opérateur booléen AND (par défaut), OR, NOT Ponctuation importante (Expression précise = ) Troncature (*) 4 listes [MeSh Translation Table] [ Journals Translation Table ] [ Phrase List ] [ Author Index ] Avantage : repère les références pas encore indexées Inconvénient : nombreux résultats Staff SP 19/01/

15 Premier auteur Titre en lien Revue, année, volume Staff SP 19/01/

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18 Display settings : MEDLINE Staff SP 19/01/

19 Différentes bases de données MEDLINE Staff SP 19/01/

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22 Comment faire une recherche par mot-clé? Staff SP 19/01/

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25 Comment sélectionner quelques articles? Presse papier qui regroupe les documents sélectionnés par l utilisateur Mémorise temporairement (8h) 500 références Staff SP 19/01/

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27 Comment sauvegarder sa recherche? Staff SP 19/01/

28 S inscrire sur NCBI +++ Staff SP 19/01/

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30 Comment faire le tri? Staff SP 19/01/

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33 Comment accéder aux textes complets? Staff SP 19/01/

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35 Sélection des articles Comment récupérer les articles? Lien vers éditeur dans Pubmed Parfois gratuit Parfois disponible à partir de la fac ou en format papier Éditeurs accessibles par le SCD de l université de Poitiers (depuis la fac et de chez vous avec votre compte fac): Sciencedirect (+ depuis le CHU) Springerlink PsycArticles Staff SP 19/01/

36 Sélection des articles Ma stratégie: 1. Cliquez sur le lien vers l éditeur Si gratuit OK Si payant 2 2. Qui est l éditeur? = sciencedirect / springerlink OK (direct depuis la fac / identification depuis chez vous) 3 3. Catalogue SCD Université Soit électronique suivre instructions Soit papier BU (médecine ou sciences) Si rien prêt entre bibliothèque (payant): ou Peb.Med.Phar@univ-poitiers.fr Staff SP 19/01/

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39 BIBLIOINSERM (codes) Staff SP 19/01/

40 BIBLIOVIE (codes) Staff SP 19/01/

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42 TOXLINE effets sur la santé des produits chimiques et des médicaments depuis 1965 périodiques et littérature grise+++ Staff SP 19/01/ une adresse et >10 bases de données de toxicologie

43 NOSOBASE Staff SP 19/01/

44 BDSP Staff SP 19/01/

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46 ENDNOTE Staff SP 19/01/

47 Début de la LCA Comment faire pour sélectionner les articles à lire? Lire le titre Lire le résumé Les auteurs La langue de la revue L Impact Factor de la revue Si intéressant, conservez la référence ou récupérer l article pour une lecture plus approfondie Staff SP 19/01/

48 Titre Court (15 mots) Informatif Thème Intervention évaluée Plan expérimental Population concernée Staff SP 19/01/

49 Résumé 150 (Vancouver)-300 mots Utilisable sorti du contexte de l étude IMRAD pourquoi? Comment? Résultat principal? Conclusion? 1-2 phrases par partie. Chiffres et test stats dans résultats. Plus structurés si essais cliniques: but de l étude protocole et méthodes de l étude lieu et condition de réalisation de l étude description de la population et des critères de sélection traitements ou méthodes d intervention critères de jugement méthodes d analyse et principaux résultats conclusions principales et applications pratiques Staff SP 19/01/

50 Auteurs 1 er auteur : celui qui a réalisé ou dirigé le travail et rédigé le manuscrit Dernier auteur: chef de service ou directeur de recherche (caution) Lieu d exercice : insertion hospitalière et/ou universitaire On ne cite tous les auteurs que si moins de 7 sinon les 6 premiers + et al Staff SP 19/01/

51 Exemples de revues Staff SP 19/01/

52 Cas clinique et Article original Observation commentée d un patient Exposé d un travail de recherche fondamentale, clinique ou épidémiologique Staff SP 19/01/

53 Lettre à la rédaction et Éditorial Résultats préliminaires ou critique de travaux publiés Opinion sur un sujet d un expert, commandité par comité rédaction Staff SP 19/01/

54 Revue et Méta-analyse Analyse critique de l ensemble des travaux sur un thème précis Combinaison des résultats d études antérieures sur un même sujet (puissance) Staff SP 19/01/

55 Analyse commentée et Article didactique Résumé d un article paru récemment + critique de la validité des résultats Article pédagogique pour des lecteurs naïfs du sujets Staff SP 19/01/

56 Article original 2) Revue 3) Mots-clés 4) Titre 5) Auteurs 6) Résumé 1) Année Staff SP 19/01/

57 IMRAD Structure de l article Introduction Matériel et méthodes Résultats And Discussion ± conclusion Staff SP 19/01/

58 Introduction 1. Position du problème Mise au point sur les connaissances actuelles concernant le problème étudié Fait appel à des références bibliographiques 2. Aspect particulier du problème hypothèse Justification de l étude mise en œuvre (pour combler les lacunes dans le domaine) 3. Objectif du travail Dernière phrase de l introduction Verbe à infinitif Temps des verbes : présent pour les données communément admises Passé pour rapporter des faits passés Staff SP 19/01/

59 Matériel et méthodes 1. Environnement de la recherche (Structures, Périodes) 2. Population 3. Type d étude 4. Schéma expérimental 5. Données recueillies 6. Analyse statistique Temps des verbes : passé Staff SP 19/01/

60 Matériel et méthodes Population Population cible = à laquelle on veut extrapoler les résultats Population source = d où on tire l échantillon Échantillon = sur laquelle on fait l étude Définir Critères d éligibilité Critères d inclusion Critères d exclusion (définitions référentiels ) Méthodes de recrutement Choix des témoins Staff SP 19/01/

61 Matériel et méthodes Type d étude = dépend de l objectif Estimer un paramètre ou décrire un phénomène (étude descriptive) Évaluer si certaines caractéristiques des individus ou de leur environnement sont associés à un risque plus élevé de maladie (étude de causalité) Évaluer l effet d une action de santé (prévention, dépistage, traitement médicamenteux ou non ) Évaluer la performance d un test diagnostique (étude diagnostique) Évaluer si certaines caractéristiques des individus ou de leur environnement sont associés à un risque plus élevé de complications ou de séquelles (étude pronostique) Staff SP 19/01/

62 Matériel et méthodes Schéma expérimental L investigateur impose-t-il l exposition à un facteur? Oui Etude expérimentale Non Etude observationnelle Randomisation? Groupe comparateur? Oui Non Oui Non Etude analytique ou étiologique Etude descriptive Essai contrôlé randomisé Etude non randomisée Etude transversale comparative Cohorte exposés non exposés (prospective Cohorte: étude ou rétrospective) longitudinale (prospective Staff SP 19/01/2011 ou historique), d incidence 62 Cas-témoins (rétrospective) Etude transversale non comparative (prévalence)

63 NIVEAU DE PREUVE SCIENTIFIQUE FOURNI PAR LA LITTERATURE Niveau 1 - Essais comparatifs randomisées de forte puissance - Méta-analyses d essais comparatifs randomisés - Analyse de décision basée sur des études bien menées Niveau 2 - Essais comparatifs randomisés de faible puissance - Etudes comparatives non randomisées bien menées - Etudes de cohorte Niveau 3 - Etudes cas-témoins Niveau 4 - Etudes comparatives comportant des biais importants - Etudes rétrospectives - Séries de cas - Etudes épidémiologiques descriptives (transversale, longitudinale) Staff SP 19/01/

64 Matériel et méthodes Données recueillies Critère de jugement principal = variable qui va permettre de tester l hypothèse avancée Définition? Classifications Variables à expliquer Variables explicatives(facteurs d exposition ) Variables d ajustement Mesure recueil des données? Comment? Prise de sang - questionnaire Quand? A jeun Qui? Automate de laboratoire attaché de recherche clinique Qui saisit les données? Staff SP 19/01/

65 Matériel et méthodes Analyse statistique Analyse uni(bi)variée Comparaison de moyennes (Student) ou % (chi2) ou courbes de survie (logrank) au seuil α=5% Analyse multivariée régression logistiques, linéaire, analyse de (co)variance, modèle de Cox au seuil α=20% Facteur de confusion à neutraliser = ajustement NSN Logiciel Staff SP 19/01/

66 Résultats Aucun résultat dans parties méthode et discussion Résultats sans discussion dans partie résultats Pas de redondance entre texte, tableaux et figures Lecture des tableaux ou figures indépendamment du texte Cohérence des chiffres (totaux) Temps: passé Étapes 1. Participants (Diagramme de flux,raisons de non participation) 2. Description des données sociodémographiques 3. Description du critère de jugement 4. Présentation analyse univariée 5. Recherche de confusions ou d interactions 6. Résultats de l analyse multivariée Staff SP 19/01/

67 Résultats : Tableaux et Figures Forme le type de représentation est-il adéquat? (tableau ou histogramme, courbe de survie.) Fond quelle est l information présentée? Interprétation que montre le tableau ou la figure, est-ce pertinent et cohérent avec le texte? Staff SP 19/01/

68 Discussion Objectif de l étude atteint ou non =bref résumé des découvertes clé Critique de la qualité et validité des résultats: Estimation : précision (NSN) biais Comparaison: Non significatif Réalité? Biais? Puissance? Significatif Réalité? Biais de confusion? Comparaison avec la littérature Généralisation: discuter la validité externe et les implications du travail pour la clinique et pour la recherche Staff SP 19/01/

69 Références bibliographiques Article = Références de Vancouver Dépend des recommandations aux auteurs des revues On ne cite tous les auteurs que si moins de 7 sinon les 6 premiers + et al Staff SP 19/01/

70 Staff SP 19/01/

71 Grilles de lecture CONSORT Français : Grilles établies par des méthodologiques pour homogénéiser le contenu des articles Scientifiques STARD= diagnostique REMARK = Staff SP 19/01/2011 pronostique71

72 STROBE Staff SP 19/01/

73 Références bibliographiques D. JOLLY. Lecture critique d articles médicaux. 2005; Editions Masson. L.R. SALMI. Lecture critique et communication médicale scientifique, Comment lire, présenter, rédiger et publier une étude clinique ou épidémiologique: 2002; Editions scientifiques et médicales Elsevier. Altman DG, Schulz KF, Moher D, Egger M, Davidoff F, Elbourne D, Gotzsche PC, Lang T; CONSORT GROUP (Consolidated Standards of Reporting Trials). The revised CONSORT statement for reporting randomized trials: explanation and elaboration. Ann Intern Med Apr 17;134(8): Von Elm E, Altman DG, Egger M, Pocock SJ, Gøtzsche PC, Vandenbroucke JP; STROBE Initiative. The Strengthening the Reporting of Observational Studies in epidemiology (STROBE) statement: guidelines for reporting observational studies. PLoS Med Oct 16;4(10) Bossuyt PM, Reitsma JB, Bruns DE, et al. Towards complete and accurate reporting of studies of diagnostic accuracy: The STARD Initiative. Ann Intern Med 2003;138: McShane LM, Altman DG, Sauerbrei W, et al. Reporting recommendations for tumor marker prognostic studies (REMARK). J Natl Cancer Inst 2005;97: Staff SP 19/01/

74 Comment s en sortir avec l anglais? Staff SP 19/01/

75 Staff SP 19/01/