Haplotype ancestral AH8.1 dans la mucoviscidose

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1 Haplotype ancestral AH8.1 dans la mucoviscidose Julie Beucher Directeur de thèse H. Corvol Unité INSERM U938, Hôpital St Antoine

2 Mucoviscidose et gènes modificateurs Variabilité de la sévérité de l atteinte respiratoire dans la mucoviscidose, même chez des individus Porteurs des mêmes mutations de CFTR Partageant le même environnement Vanscoy et al 2007

3 Contexte Quels variants génétiques peuvent être responsables de la variabilité de l atteinte respiratoire? Variants rares mais connus? Résultats répliqués pour TGFB1 et MBL2 par exemple De nombreuses études non répliquées Expliqueraient seulement un faible pourcentage de la variabilité phenotypique Facteurs de haute prévalence mais inconnus? Hypothèse: un ensemble de gènes très fréquents (= haplotype) pourrait participer à la variabilité de la fonction pulmonaire Certains haplotypes ont une grande prévalence en Europe telle que l haplotype ancestral AH8.1 Cet haplotype pourrait-il contribuer à la variabilité de la sévérité de l atteinte respiratoire des patients atteints de mucoviscidose?

4 Haplotype ancestral AH8.1 Compris dans la région du Major Histocompatibility Complex (MHC) 6p21.3 LTA +252A/G TNF -308G/A LTA Lymphotoxin A TNF Membres clés de la famille du TNF HSPA1L +1267A/G Heat shock protein A1 like Protège des protéines contre l aggrégation et aide au repliement de protéines nouvellement traduites Chromosome 6 RAGE -429T/C Présent chez près d 1/4 des caucasiens Receptor for Avanced Glycation Endproducts Membre de la famille des immunoglobulines Médiateur proinflammatoire hautement exprimé dans le poumon

5 Population européenne Total France Grande-Bretagne Allemagne Population d étude, n Age: médiane[min-max] 18,6 11 [6-18] 26,5 [23-54] 16 [6-18] Sexe, femme/ homme 183/ /122 36/43 39/56 Génotype CFTR, % F508del homozygote 58% 52% 61% 62% F508del heterozygote Autres mutations 32% 10% 37% 11% 24% 15% 35% 3% Présence de 8.1 AH 26% 22% 28% 29% Similaire (p=0.3) Corvol, Beucher et al., J Cyst Fibros 2012

6 Variation du VEMS selon AH8.1 France Germany UK Overall Au total, le VEMS est plus bas chez les porteurs de l haplotype 8AH.1 (p<0,04; ajusté sur l'âge et le pays) Soit une diminution >6% du VEMS en % prédit Corvol, Beucher et al., J Cyst Fibros 2012

7 RAGE Receptor for Advanced Glycation Endproducts Récepteur proinflammatoire exprimé à la surface des pneumocytes I Variant AGER -429T/C Recherche d une association avec la sévérité de l atteinte respiratoire dans la cohorte française Etude in vitro de ce variant situé dans le promoteur : Mutagénèse dirigée Lignées de cellules alvéolaires A549 et bronchiques Beas-2b Mesure de l activité du promoteur par mesure de l expression de la luciférase

8 Association avec la sévérité de l atteinte respiratoire Patients homozygotes F508del Population d étude, n 1039 Age : médiane [min-max] 19,9 [6-57,6] Sexe, femme / homme 499/540 IMC z-score, médiane [min-max] -0,76 [-4, ]

9 Association avec la sévérité de l atteinte respiratoire AGER -429T/C associé à la sévérité de l atteinte respiratoire (p=0.03)

10 Augmentation de l expression du promoteur en présence du variant AGER -429C A. 2 P=0,016 Relative luciferase activity Relative luciferase activity 1,8 1,6 1,4 1,2 1 0,8 0,6 0,4 0,2 0 AGER -429T AGER-429C

11 Conclusion L haplotype ancestral AH8.1 est associé à la sévérité de l atteinte respiratoire dans une cohorte de 404 patients européens de génotypes CFTR variables AGER-429C est associé à une plus grande sévérité de l atteinte respiratoire chez 1039 patients homozygotes F508del à une activité accrue du promoteur in vitro RAGE pourrait être un marqueur d inflammation pulmonaire, augmenté dans la mucoviscidose, en particulier en présence du variant AGER-429C

12 Les patients et les CRCM participants au projet national de recherche des gènes modificateurs dans la mucoviscidose Equipe française : Annick Clement, Pierre-Yves Boelle, Loic Guillot, Olivier Tabary, Philippe Le Rouzic Equipe anglaise Judith Laki, Colin Palmer, Stuart Elborn & Anil Mehta Equipe allemande Felix Ratjen & Hartmut Grasemann