LA TAXINOMIE. Gilles Bourbonnais Cégep de Sainte-Foy

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1 LA TAXINOMIE Gilles Bourbonnais Cégep de Sainte-Foy

2 La TAXINOMIE : science de la classification 619 Classification = système regroupant les organismes vivants en groupes logiques.

3 Carl von Linné ( ) Naturaliste suédois qui a établi le système de classification encore utilisé aujourd'hui. Dans le système de Linné, les organismes vivants sont regroupés en catégories de plus en plus vastes imbriquées les unes dans les autres. Ces catégories = taxons

4 Règne Les taxons définis par Linné Embranchement Classe Ordre On peut aussi ajouter des sous-catégories. Ex. Super-classe, sous-classe, sous-embranchement, etc. Famille Genre Espèce

5 Règne Animal Embranchement des Cordés Chaque espèce est nommée en utilisant le nom de son genre et le nom de l espèce proprement dite = nomenclature binomiale Classe des Mammifères Ordre des Carnivores Léopard Famille des Félidés Genre Panthera Espèce : pardus Notez que le nom d un taxon commence toujours par une majuscule (sauf le taxon «espèce»). Panthera pardus

6 Règne Végétal Embranchement des Trachéophytes Classe des Angiospermes Ont des vaisseaux conducteurs Plantes à fleurs Ordre des Térébinthales Fleurs aux pétales séparés Famille des Acéracés Fruit de type disamare (hélicoptère) Genre Acer Espèce : saccharum Érable à sucre Acer saccharum

7

8 De 2 règnes à trois domaines 636 Linné divisait le monde vivant en 2 règnes : Animaux Animaux unicellulaires Animaux Bactéries Végétaux Champignons Algues unicellulaires Plantes

9 Dans les années 60, on est passé à 5 règnes 1. Monères 2. Protistes 3. Mycètes 4. Végétaux 5. Animaux Procaryotes (bactéries) Unicellulaires eucaryotes Champignons, moisissures, levures Pluricellulaires autotrophes Pluricellulaires hétérotrophes

10 Par la suite, on a constaté qu il y avait deux grands types de bactéries. Ces deux types sont aussi différents l un de l autre que les bactéries en général sont différentes des organismes eucaryotes. On a alors divisé le monde vivant en trois domaines : Bactéries Archées Eucaryotes Protistes Eumycètes Végétaux Animaux Le règne des protistes est un groupe un peu artificiel (fourretout). La tendance actuelle est de l éliminer et de répartir ses membres dans les autres règnes des Eucaryotes ou d en faire plusieurs règnes différents. Le règne des Mycètes a été mieux défini et rebaptisé «Eumycètes»

11 Les lignes en rouges correspondes aux pluricellulaires

12 621

13 La nomenclature binomiale 620 = Règles pour former le «nom scientifique» d une espèce» Chaque espèce est désignée par les deux derniers taxons de sa classification : Genre et espèce Les deux mots s'écrivent en italique Le genre prend une Majuscule L espèce prend une minuscule Ex. Ursus americanus Strigiphilus garylarsoni Homo sapiens Escherichia coli Notez l usage du latin (et de ses déclinaisons) encore en vigueur aujourd hui. Le nom fait généralement référence à une caractéristique de l organisme ou à une personne.

14 Avantages de la nomenclature binomiale : Elle est universellement reconnue donc valide dans toutes les langues de tous les pays. Il n y a qu un seul nom qui soit valide pour une espèce donnée. C est ce nom qui doit obligatoirement être utilisé dans tout article scientifique. Elle permet de reconnaître les espèces les plus proches les unes des autres puisqu elles portent alors le même nom de genre. Ex. Ursus americanus (ours noir) Ursus arctos (ours brun) Ursus maritimus (ours blanc) Ursus thibetanus (ours noir d Asie) Normalement, c est au découvreur d une nouvelle espèce que revient l honneur de «baptiser» sa trouvaille.

15 Le système de Linné présente plusieurs difficultés : Les critères pour définir les taxons sont souvent arbitraires et sujets à controverses. Les taxons ne reflètent pas nécessairement l évolution.

16 Les taxons ne reflètent pas l histoire évolutive Ex. Embranchement des Cordés Sous-embranchement des Vertébrés Classes des Agnathes (poissons sans mâchoires) Classe des Ostéichtyens (poissons cartilagineux) Classe des Chondrichtyens (poissons osseux) Classe des Amphibiens Classe des Reptiles Classe des Oiseaux Classe des Mammifères Ex. Les reptiles, les oiseaux et les mammifères dans la classification linnéenne. Cette classification n indique pas du tout les liens évolutifs entre chacune de ces classes. On peut seulement conclure que ces classes dérivent d un ancêtre vertébré commun.

17 Actuellement, la classification par taxon tend à laisser sa place aux arbres phylogénétiques. On regroupe les organisme en différentes branches d un arbre phylogénétique. = représentation graphique en forme de branches ramifiées montrant les liens évolutifs entre les groupes. On n utilise pas les taxons (embranchements, classes, ordres, etc.) reconnus dans le système de Linné même si on en retrouve souvent les noms.

18 Les arbres phylogéniques Représentation, par un arbre phylogénique, des reptiles, des oiseaux et des mammifères. On n utilise, dans un arbre phylogénique, que des critères basés sur l évolution. On attribue un nom à chacune des branches (noms qui ne correspondent pas nécessairement à ceux de la classification linnéenne).

19 Un nœud indique un ancêtre commun Chaque nœud correspond à une divergence en deux branches Les arbres phylogéniques sont très souvent modifiés en fonction de nouvelles découvertes sur les liens évolutifs. Un arbre phylogénique est toujours basé sur un ensemble d hypothèses.

20 On peut aussi ajouter une échelle du temps. La longueur de chaque branche indique alors une durée.

21 La diversité du monde vivant

22 FIN

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