Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats de la France en 2015

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1 Surveillance européenne de la résistance aux antibiotiques chez les animaux de rente : résultats de la France en 2015 LNR résistance antimicrobienne Agnès Perrin-Guyomard, Anses Laboratoire de Fougères

2 Base réglementaire Directive zoonose 2003/99/CE Surveillance programmée, continue, harmonisée EFSA Texte d exécution Décision 2013/652/UE 2 Evaluer les niveaux de résistance aux antibiotiques chez les animaux producteurs d aliments Texte d application Notes de service DGAl Pilotage Evaluer les niveaux de résistance aux antibiotiques des Echantillonnage Appui épidémiologique Laboratoires d analyses agréés Bilans PSPC bactéries d origine alimentaire Services (diffusion Prélèvements dans la chaîne déconcentrés alimentaire et exposition du consommateur ) Isolements Suivre les tendances et les émergences LNR Résistance Antimicrobienne CMI/traitements des données 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 2

3 Services déconcentrés Prélèvements Filière : animaux de boucherie Abattoir : carcasses et caeca de porcs et de veaux Distribution : viandes fraîches de porcs et de bœufs 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 3

4 non ciblé, aléatoire au moins 300 prélèvements de caeca et 300 prélèvements de viandes Echantillonnage uniforme sur tous les mois de l année 170 isolats pour chaque combinaison espèce bactérienne/espèce animale représentatif de la production française proportionnel à la population humaine 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 4

5 Laboratoires d analyses agréés Isolements - Salmonella spp. (carcasses) - Escherichia coli commensales indicatrices (flore dominante/caeca) - Escherichia coli BLSE/AmpC/Carba (flore sous-dominante/ caeca et viandes, recherche sélective) 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 5

6 LNR Résistance Antimicrobienne CMI/traitements des données - Test de sensibilité = CMI en milieu liquide - Microplaques harmonisées au niveau européen Panel 1 : 14 antibiotiques (9 familles) Panel 2 : 10 antibiotiques (famille des β-lactamines) - Interprétation selon les seuils épidémiologiques de l EUCAST 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 6

7 Isolements Salmonella spp. Nombre de prélèvements sur carcasses Nombre de salmonelles isolées Prévalence PORC % VEAU ,7 % E. coli BLSE/AmpC/Carba isolés des caeca à l abattoir Nombre de prélèvements de caeca analysés Nombre de E. coli BLSE/AmpC isolés Prévalence PORC ,8 % VEAU ,7 % 29,4% en E. coli BLSE/AmpC/Carba isolés des viandes à la distribution Nombre de prélèvements de viandes analysés Nombre de E. coli BLSE/AmpC isolés Prévalence PORC ,4 % BOEUF ,3 % 1 Haenni, M., Châtre, P., Métayer, V., Bour, M., Signol, E., Madec, J. Y., & Gay, E. (2014). Comparative prevalence and characterization of ESBL-producing Enterobacteriaceae in dominant versus subdominant enteric flora in veal calves at slaughterhouse, France. Veterinary microbiology, 171(3), /11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 7

8 Sensibilité aux antibiotiques/salmonelles - Sensibles aux antibiotiques d importance critique pour la Santé Publique (céphalosporines de 3ème génération, carbapénèmes, colistine, fluoroquinolones, azithromycine) 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 8

9 Sensibilité aux antibiotiques/e. coli indicatrices/caeca Multirésistance (R) chez le porc (N=200) et chez le veau (N=202) 1% 4% 1% 15% 11% 11% 6% 12% en % TET 23% S 1 R 2 R 3 R 4 R 5 R 6 R 5% 10% AMP-TET-SMX-TMP 24% 12% 8,5% en % 9% 11% S 1 R 2 R 3 R 4 R 5 R 6 R 7 R 9 R 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 9

10 Sensibilité aux antibiotiques/e. coli indicatrices/caeca Evolution des pourcentages de résistance entre 2009 et 2015 chez le porc Pourcentages de résistance > 10 % Pourcentages de résistance < 10 % % de résistance (seuil épidémiologique) Ampicilline Tétracycline Chloramphénicol Sulfaméthoxazole Triméthoprime Céfotaxime Ceftazidime Colistine Gentamicine Méropénème Ciprofloxacine Acide Nalidixique Diminution significative sur les 6 années d observation, testé par une régression linéaire simple Augmentation significative sur les 6 années d observation, testé par une régression linéaire simple 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 10

11 Sensibilité aux antibiotiques/e. coli indicatrices/caeca Comparaison des pourcentages de résistance en 2007 et 2015 chez le veau 100 Pourcenatges (N=118) 2015 (N=202) /11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 11

12 E. coli BLSE-AmpC-Carba/caeca prévalence flore dominante/sous dominante Flore dominante Flore sous-dominante pas de carbapénèmase 0,5% (N=200) 35,8% (N=302) 2% (N=202) 50,7% (N=306) phénotype BLSE >>>AmpC co-résistances 12,1 3,7 4,7 13,1 1 R 2 R 5,3 2,6 15,8 1,3 5,9 19,1 1 R 2 R 3 R 4 R 5 R 3 R 6 R 36,4 β-lactamines-tet-smx-tmp 29,9 4 R 5 R 6 R 12,5 17,1 7 R 8 R 20,4 9 R β-lactamines-tet-smx-tmp 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 12

13 E. coli BLSE-AmpC/caeca pourcentages de résistance / E. coli indicatrice Triméthoprime Tigécycline Tétracycline Sulphaméthoxazole Acid nalidixique Gentamicine Colistine Ciprofloxacine E. coli BLSE/AmpC E. coli indicatrice Chloramphénicol Azithromycin N E. coli 200 ; N E. coli BLSE/AmpC 108 N E. coli 202 ; N E. coli BLSE/AmpC /11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 13

14 Conclusions Aucune résistance acquise chez la majorité des salmonelles isolées à l abattoir Prévalence très faible du nombre de E. coli résistantes aux C3G (flore sous dominante) dans les prélèvements de viandes à la distribution Chez le porc à l abattoir, augmentation du nombre de E. coli indicatrices sensibles à tous les antibiotiques testés diminution significative du pourcentage de résistance à la tétracycline chez les E. coli avec en revanche une augmentation significative de la résistance aux quinolones Chez le veau à l abattoir, 1 ère année de surveillance obligatoire augmentation du nombre de E. coli indicatrices sensibles à tous les antibiotiques testés augmentation du nombre de prélèvements contenant des E. coli résistantes aux C3G (flore sous-dominante) 16/11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 14

15 Conclusions - Surveillance sanitaire des denrées animales et végétales en France : bilan 2015 des plans de surveillance et de contrôle - Coût du plan 2015 : /11/16 Rencontres scientifiques de l Anses 15

16 Remerciements Les Services Déconcentrés Les Laboratoires agréés Anses Fougères Anses Maisons Alfort Anses Lyon Anses Ploufragan