FICHE PROJET BAC TRAC Bactérie fécales, traceurs des sources de contaminations fécales dans les eaux

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1 FICHE PROJET BAC TRAC Bactérie fécales, traceurs des sources de contaminations fécales dans les eaux Contexte besoins identifiés Les Laboratoires des Pyrénées et des Landes, chef de file du projet, en partenariat avec l Ifremer Brest et le laboratoire EPOC de l Université de Bordeaux, et avec le soutien des collectivités locales de la côte basque et du bassin d Arcachon, ont construit le projet BAC TRAC qui a pour objectif la quantification et l identification des sources des contaminations fécales dans les eaux de surface. Ce projet innovant fédère des acteurs publics et scientifiques aux compétences complémentaires à l échelle de la côte Aquitaine. Ce partenariat vise à développer une nouvelle méthode analytique unique en France permettant de déterminer à la fois les concentrations et les origines des pollutions fécales (entérocoques et Escherichia Coli) en réalisant un suivi dans l espace et dans le temps grâce à la définition de traceurs de contaminations associés à un hôte (humains, bovins, ovins, aviaires ). Les résultats attendus, qui seront diffusés dans la sphère publique, ainsi que les méthodologies développées, permettront d apporter de nouveaux moyens de contrôles performants et des possibilités de réduction de la dépense publique. Ce projet suscite au sein des collectivités du littoral Aquitain un intérêt significatif car il leur permettra de définir des priorités d investissements au sein de leurs programmes de gestion de la qualité des eaux : travaux, études, aménagements, modélisations des flux bactériologiques... 1

2 Ce projet est en effet essentiel pour la hiérarchisation des actions de la puissance publique car malgré la poursuite d importants travaux réalisés au niveau des réseaux d assainissement, des pollutions fécales sont toujours observées le long de la côte basque et au niveau du bassin d Arcachon par temps de forte pluie. Ces phénomènes démontrent que les flux bactériologues ont un lien avec d autres sources situées plus en amont et qu il est aujourd hui nécessaire d agir à l échelle globale des bassins versants afin d endiguer efficacement ces épisodes de pollutions. Les acteurs du monde socio-professionnel agricole ont également montré une forte attente vis-à-vis du projet BAC TRAC car il leur apporterait des éléments fiables susceptibles de les accompagner dans leurs actions de réductions de rejets dans le milieu récepteur. Le projet BAC TRAC a reçu le soutien du Groupement d Intérêt Scientifique (GIS) Littoral Basque dont sont membres les agglomérations Côte Basque Adour et Sud Pays Basque. Le GIS Littoral Basque, qui est une instance vouée à faire émerger des projets de recherche en corrélation avec les besoins des collectivités basques et les savoir-faire des scientifiques de ce territoire depuis 2013, a permis d assurer un important travail de coordination entre les partenaires institutionnels et scientifiques. Le GIS Littoral Basque a pu assurer l organisation de réunion techniques en présence des acteurs de l eau de la côte Aquitaine (AEAG, ASPB, ACBA, Département 64, SIBA) afin de stabiliser un budget prévisionnel politiquement soutenable et des cofinancements envisageables prenant en compte les règles communautaires et les principes de transférabilité des résultats dans la sphère publique. Objectifs L objectif du projet «Bac Trac» est de développer une méthode complète de détermination des origines de contaminations fécales dans les eaux de surface (Escherichia coli et les entérocoques) en couplant deux méthodes analytiques de type «Microbial Source Tracking» : - l approche «MST culture» (méthode culture et librairie dépendante), élaborée par le laboratoire EPOC de l Université de Bordeaux, qui permet la corrélation directe entre le degré de contamination et la détermination de la source de contamination puisque basée sur l analyse de E. coli; - la «MST PCR» (méthode culture et librairie indépendante), élaborée par l Ifremer de Brest, qui repose sur la technique de PCR en temps réel (PCRQ) et utilisant les marqueurs Bacteroidales, bactéries anaérobies spécifiques du tractus digestif et présentant une spécificité d hôte. À terme, il s agira de disposer «en routine» d une technique complète d identification des sources de contaminations fécales dans eaux de surface : humain, ovins, bovins, porcins, aviaires La réussite de Bac Trac repose notamment sur une collaboration étroite entre deux structures EPIC, l une à vocation industrielle (les Laboratoires Landes Pyrénées) et l autre à vocation de recherche (IFREMER Brest), et une structure académique (EPOC, Université de Bordeaux I), ces deux dernières étant les développeurs de méthodes de Microbial Source Tracking en France donc possédant une forte expertise dans ce domaine. Dans le cadre de la mise en œuvre de BAC TRAC, le Laboratoire EPOC a prévu de léguer aux Laboratoires des Pyrénées et des Landes les souches et les résultats obtenus au travers du programme IDEFEC qui avait pour objet d étude les pollutions fécales, auquel le SIBA et l Agence de l Eau Adour-Garonne ont été associés. Cette 2

3 démarche permettra de valoriser les conclusions du projet IDEFEC et d assurer une continuité opérationnelle des résultats obtenus. À l issue de réunions techniques organisées dans le cadre du GIS Littoral Basque avec les partenaires scientifiques et publics, il a été convenu de mettre en œuvre et de tester cette nouvelle méthode sur les bassins versants de l Untxin, de l Uhabia et de la Nive, ainsi qu au niveau de l estuaire de l Adour et du bassin d Arcachon. Ces sites pilotes se caractérisent par la présence d enjeux socio-économiques et environnementaux communs : activités touristiques et balnéaires, usages des plages, nautisme, protection des espaces naturels, Résultats BAC TRAC est projet de recherche innovant, issu des partenariats du GIS Littoral Basque et dont les LPL sont chef de file, faisant appel à différences compétences scientifiques de pointe avec une application directe pour les pouvoirs publics de la côte basque et Aquitaine. Le partenariat cherche à développer une nouvelle méthode d analyse visant à différencier les sources de pollutions bactériologiques échelle cohérente d analyse, allant du bassin versant au littoral, analysant les pollutions fécales : - D origines humaines : réseaux assainissement défaillants, pollution sauvage, propriété privée qui n est pas aux normes. - De celles d origines animales : développement de marqueurs permettant de définir si la pollution est d'origine ovine, bovine, porcine, aviaire, équidée, canine Le choix de ces sites pilotes permettra d apporter des solutions opérationnelles et complémentaires permettant d identifier les sources de pollutions à l échelle du bassin versant et du littoral. Cette démarche apportera des éléments d aide à la décision nouveaux et nécessaires pour hiérarchiser les investissement à réaliser en termes de travaux sur le réseau d assainissement, mais également d inventer de nouveaux modes de gestion en collaboration avec le secteur agricole et les acteurs de l eau afin d endiguer les épisodes de poltron en mont du bassin versant. Ces synergies permettront de faire rayonner les travaux du GIS Littoral Basque et les activités de recherche menés par les partenariats de la côte basque, et apporteront des informations nouvelles à destination des collectivités du littoral Aquitain devant assurer la surveillance des eaux de baignade et la protection des populations dans le cadre de la réglementation Européenne. 3

4 27 points de prélèvements répartis sur 5 bassins versants Bassin d Arcachon Adour/Aturri Uhabia Nive/Errobi Untxin Organisme Points de prélèvement ASPB 8 (dont 4 Uhabia) ACBA 17 (dont 4 Uhabia) SIBA 2 TOTAL 27 4

5 Partenariat budget Le projet se déroulera sur 3 ans entre 2016 et 2019 pour un coût total estimé à Budget LPL EPOC LSEM Ifremer SIBA ASPB ACBA Agence de l'eau TOTAL Contact Caroline LUMMERT Coordonnatrice scientifique du GIS Littoral Basque c.lummert@agglo-cotebasque.fr Groupement d Intérêt Scientifique Littoral Basque 15 avenue Maréchal Foch Bayonne 5

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