Transport, manipulation et conservation des échantillons (à rédiger) Aliquotage des échantillons biologiques Recommandations préana Axsym

Transcription

1 C3 IN PA 02 Version A Laboratoire Conservation des échantillons biologiques Rédigé en juillet 2012 par B.LUREAU diffusé : juillet 2012 Conservation POTanalytique 1. Objet et domaine d application Cette fiche d instruction se focalise sur les échantillons déjà réceptionnés au laboratoire. Elle décrit les principes de conservation des échantillons au laboratoire en pré et post-analytique. Elle a essentiellement pour objectif de servir de support afin d accepter ou non un ajout d examen à posteriori sur un échantillon déjà présent au laboratoire. Elle n a pas pour but de reprendre les critères d acceptation des prélèvements par le laboratoire décrits dans les instructions B4 IN 01 et Documents associés C3 PR 02 C3 IN PA 05 C3 IN VID 01 C3 IN Ax 01 C3 IN Bac 01 C3 IN Personnes concernées Transport, manipulation et conservation des échantillons (à rédiger) Aliquotage des échantillons biologiques Recommandations préana Vidas Recommandations préana Axsym Tri des prélèvements bactériologiques avant ensemencement Gestion de la sérothèque (à rédiger) L ensemble du personnel du laboratoire est concerné par cette instruction pour la partie pré-analytique. Le versant post-analytique incombe aux techniciens sous la responsabilité des biologistes. 4. Déroulement de l activité 4.1 Conservation pré/ post-analytique Ce tableau correspond à notre mode de fonctionnement en situation de routine et en l absence de panne et/ou rupture de réactifs. Tous les échantillons primaires, quelque soit leur nature, qu ils aient été qualifiés conformes ou non conformes, sont conservés, - à la fois, dans un but analytique o sous réserve du respect des conditions (délais, température ) mentionnées dans le tableau ci-dessous, o et sous réserve de l absence de mention de NC sur le tube, - mais également dans un but d identitovigilance, si nécessaire. en règle générale, 7 jours après la date de réalisation de l examen ultime en les classant au jour de réalisation. par le technicien de nuit vers minuit (il élimine alors les échantillons du jour correspondant de la semaine précédente) C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 1 sur 15

2 Les échantillons sont conservés bouchés, à +4 C en chambre froide F0 : - les échantillons 1aires, à l exception de la bactériologie, sont stockés en position verticale dans des containers jaunes identifiés/ jour sur des portoirs correspondants aux différentes paillasses. - les échantillons 1aires de bactériologie sont stockés dans un semainier. Les échantillons sanguins prélevés sur tube à gel ayant été centrifugés selon les préconisations ne doivent pas être recentrifugés. i une nouvelle centrifugation s avère nécessaire, réaliser cette 2 nde centrifugation après décantation du sérum/plasma Les échantillons sanguins congelés, en dehors de ceux destinés aux examens d hémostase, doivent être décongelés à température ambiante (sauf mention particulière) puis homogénéisés avant analyse. Les échantillons sanguins congelés destinés aux examens d hémostase, doivent être décongelés à 37 C puis homogénéisés avant analyse. : concernant les examens sous-traités, se référer aux préconisations de conservations préanalytiques du laboratoire spécialisé. Légende des tableaux ci-après : = centrifugation + 20 C ** «elon préana ANM» = correspond à des recommandations préanalytiques / spécialités diffusées en 2009 (H:\DrLUREAU\PRELEVEMENT ET PREANALYTIQUE\PREANALYTIQUE) = volume non compatible avec analyse / tube 1 aire ou tube unique pour plusieurs techniques (ex : Axsym et Vidas, yphilis et Axsym ) non réalisées le même jour = sérothèque 1 an sauf si quantité insuffisante QI = tube sans gel séparateur et analyse au-delà de J0 * : mention «échantillon séparé» clairement noté par le fournisseur sur la notice. C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 2 sur 15

3 HEMATOLOGIE : cytologie- immunohématologie- parasitologie sanguine < 6h ** NF/réticulocytes homogénéisation Paillasse hématologie - V homogénéisation Paillasse hématologie - Groupage sanguin c Paillasse immunohématologie 3500 rpm 15min ou rpm 5min RAI Coombs direct c 3500 rpm 15min ou 2000 rpm 5min c 3500 rpm 15min ou 2000 rpm 5min Paillasse immunohématologie - Paillasse immunohématologie - Test de Kleihauer homogénéisation dilution 1/3 Paillasse hématologie - Recherche de palu homogénéisation Paillasse hématologie - <2h ur sang total ou centrifugé 7j +2-8 C ** ur sang total ou centrifugé 3j +2-8 C ** ur sang total ou centrifugé ** 48h (non prétraité) ou 2-8 C 3j +2-8 C (Palutop) Frottis sanguin : aucune mention biblio mais «le plasmodium survit pendant des heures dans des GR à» selon préana ANM Frottis à faire systématiquement en double le soir, nuit et WE dont 1 non coloré -conservé à la paillasse Faire au minimum 2 frottis FIN dont 1 non coloré. Faire au minimum 3 frottis dont 1 non coloré C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 3 sur 15

4 Hémostase c 3500 rpm 15min ( double centrifugation, c'est-àdire 2 ème après décantation, si congélation du plasma : ACC, RPCa ) - si nécessité de congélation du plasma (examen différé) - HEMOTAE Paillasse hémostase- sur tube centrifugé et conservé à : a-xa : 2h TCA/TCK : 4h DDI, fib, TP/INR : 8h C : 2h FV : 4h (8h +2-8 C) après congélation en position verticale, complète avant transport («Biomnis et vous» n 37 aout2011). décongélation à 37 C si nécessité d analyser un échantillon de plasma décanté et congelé) DCA 2000 : suivi diabétologie HbA1c homogénéisation Paillasse hématologie - µalbuminurie homogénéisation Paillasse chimie 7j 14j +2-8 C 14j +2-8 C C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 4 sur 15

5 TH FT4 IMMUNOENZYMOLOGIE : AXYM 3j 2-8 C* B c i analyse à J0 : 10j 2-8 C 3500 rpm 15min paillasse Axsym ou Vidas ou Folates Δ il n est pas chimie - (<1 mois) recommandé de AgHbs 14j 2-8 C recentrifuger un tube avec gel séparateur Ac anti Hbs => passer nécessairement par Ac anti Hbc une étape de double 14j 2-8 C (c'est-à-dire 2 HCV ème après décantation) si analyse au-delà de J0 : 14j 2-8 C se référer à C3 IN Ax 01 Acide valproïque (recommandations préanalytiques Axsym) 24h 2-8 C 24h 2-8 C Carbamazépine Paracétamol - portoir dédié : réfrigérateur n F6 24h 2-8 C - portoir dédié congélateur n C2 Phénobarbital 24h 2-8 C *Données établies sur notre vérification de méthode (voir C3 IN Ax 01) C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 5 sur 15

6 IMMUNOENZYMOLOGIE (1): VIDA mini VIDA ACE CA125 CA153 CA199 i analyse à J0 : c paillasse Vidas ou Axsym ou PA T 3500 rpm 15min chimie- 24 h 2-8 C HCG quantitative Δ il n est pas recommandé de HCG qualitative sang recentrifuger un tube avec gel séparateur HCG urines => passer nécessairement par Cortisol une étape de double si analyse au-delà de J0 : 3j 2-8 C (c'est-à-dire 2 ème après se référer à C3 IN Vid 01 CMV G et M décantation) (recommandations préanalytiques VIDA) 5j 2-8 C - portoir dédié : réfrigérateur n F6 HAV M - portoir dédié congélateur n C2 i PA libre => à congeler <4h pour envoi Biomnis C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 6 sur 15

7 Rubéole G Toxoplasmose G et M Digoxine Nt pro BNP PCT Troponine c 3500 rpm 15min Δ il n est pas recommandé de recentrifuger un tube avec gel séparateur => passer nécessairement par une étape de double (c'est-àdire 2 ème après décantation) IMMUNOENZYMOLOGIE (2) : VIDA mini VIDA Paillasse Vidas ou chimie 5j 2-8 C 24 h 2-8 C (48h si décanté) 3j 2-8 C ionogramme et glycémie/héparine => voir chimie Gaz du sang/ HCO3 Homogénéisation + sang total ou plasma/ éliminer 1 ère goutte Ca++sang total lactates possible sur plasma et sang total héparinés Ca++plasma immédiatement c 3500 rpm 15m GAZOMETRIE : GEM 3500 et Gem OPL -Paillasse gazométrie pochette isotherme si analyse extemporanée -Frigo n F4 si différée (<1h) Paillasse gazométrie <15 mn (30 mn = délai limite) <1 h 2-8 C (2h =délai limite) <20 mn 2-8 C (1h =délai limite) <4h Carboxy Hb homogénéisation 1h30 au-delà conserver à 2-8 C Δ seulement si rapidement et tube non ouvert C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 7 sur 15

8 CHIMIE (1) : RXL Ac urique (sang) 24h * 3-5 j 2-8 C* Ac urique (urine) Urines alcalinisées 3-4j albumine 8h Paillasse chimie 2 j 2-8 C Alat /asat c 8h 3500 rpm 15min 2 j 2-8 C alcoolémie 2j Δ il n est pas 2 semaines 2-8 C recommandé de Δ tube fermé+++ ammoniémie recentrifuger un tube Δ analyse dans les 20 min <20 mn 4-8 C avec gel séparateur après le prélèvement (30 mn =délai limite) => passer bilirubines 8h * nécessairement par 7 j 2-8 C* mais Δ à l abri de une étape de double Paillasse chimie lumière++ (c'est-à-dire 2 Calcium sang après décantation 8h * 2 j 2-8 C* Calcium urines Pas de mention Rq : recueil sur des récipients contenant du NaOh pour éviter urates Δ tube fermé+++ Δ dès réception du tube Δ à l abri de lumière++ (thermosensible) (recueil dans un récipient avec 10 à 30 ml de 6M HCL ou acidifier à ph<3 avant analyse) C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 8 sur 15

9 CHIMIE (2) : RXL Cholestérol T 8h 2 j 2-8 C Cholestérol HDL 8h 7 j 2-8 C (rq : au delà de 8h, diminution possible du HDL jusqu à 10%) CPK c 7 j 2-8 C* Créatinine (sang) 3500 rpm 15min 8h * 2 j 2-8 C* Créatinine (urines) 4 j 2-8 C CRP 8h Δ il n est pas Paillasse chimie - < 72 h 2-8 C Glucose (sang) recommandé de - ur héparine Δ après recentrifuger un tube centrifugation++++ : avec gel séparateur 8h * => passer 3 j 2-8 C* sans hémolyse nécessairement par - ur fluorure : une étape de double 3j (c'est-à-dire 2 Glucose (urines et après décantation Pas de mention autres) Fer 4j * 7 j 2-8 C* Ferritine 8h * 7 j 2-8 C* dans l heure après le prélèvement C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 9 sur 15

10 ecteur (type d analyse) Centrifugation CHIMIE (3) : RXL GGT 8h * 2 j 2-8 C* haptoglobine 2 j 2-8 C Ionogramme (sang) 7j ou 2-8 C dans l heure après le prélèvement Ionogramme (urines) c 2-8 C pour une «analyse tardive» Ig A, G et M 3500 rpm 15min 3j LDH 3j dans l heure après Δ il n est pas ne pas réfrigérer, ni congeler le prélèvement Lipase recommandé de Paillasse chimie - 24h recentrifuger un tube avec gel séparateur Magnésium (sang) 3j => passer 3j 2-8 C nécessairement par Magnésium (urines) Urines acidifiées une étape de double (c est-à-dire 2 PAL après décantation 8h Phosphore (sang) 8h * * Phosphore (urines) Pas de mention (recueil dans un récipient avec 10 ml de12 M HCL ou acidifier à ph<3 avant analyse) dans l heure après le prélèvement (recueil dans un récipient avec 10 à 30 ml de 6M HCL ou acidifier à ph<3 avant analyse) C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 10 sur 15

11 CHIMIE (4) : RXL Protides (sang) 8h c 3j 2-8 C Protides (urines et 3500 rpm 15min 24h autres) Δ il n est pas 3j 2-8 C Transferrine recommandé de 8h recentrifuger un tube Paillasse chimie - Triglycérides avec gel séparateur 8h => passer Urée (sang) nécessairement par 3-5 j une étape de double (c'est-à-dire 2 Urée (urines) ème après 4j 2-8 C décantation C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 11 sur 15

12 AUTRE : chimie/ sérologies manuelles ELP et IT yphilis EBV c 3500 rpm 15min Δ ne jamais recentrifuger un tube avec gel séparateur => passer nécessairement par une étape de double (c'est-à-dire 2 ème après (tube commun) T T T i analyse à J0 : paillasse chimie- si analyse au-delà de J0 : - portoir dédié : réfrigérateur n F6 i analyse à J0 : paillasse préana- si analyse au-delà de J0 : - portoir dédié : congélateur n C2 i analyse à J0 : paillasse préana- si analyse au-delà de J0 : - portoir dédié : réfrigérateur n F6 10j 2-8 C (au-delà -20 C) (au-delà -20 C) érologie tétanos décantation paillasse préana - (au-delà -20 C) i sang total 3j 2-8 C MNI paillasse Préana - 3j 2-8 C (au-delà -20 C) Cryoglobulines Voir instruction D11 MA 02 impossible Drogues urinaires Paillasse chimie- 24h Nitrites urinaire Voir ECBU page suivante Δ mais dégradation du C3 pouvant générer une déformation en B2 avec diminution de la fraction B2 et petits pics en B1 et G +fraction A1 légèrement modifiée Possible sur sang total mais sensibilité < C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 12 sur 15

13 = volume non compatible avec analyse / tube 1 aire = sérothèque 1 an sauf si quantité insuffisante QI = tube sans gel séparateur et analyse au-delà de J0 BACTERIOLOGIE (1) Hémoculture <10 h Conservation des flacons positifs au moins 15 jours ouchothèque dans certaines situations Bactério sans milieu de transport Bactério avec milieu de transport Mycologie LCR thèque si volume suffisant. Voir C3 IN Bac 01- tri des prélèvements bactériologiques avant ensemencement - ECBU <4h <12h 2-8 C - Copro 12h 2-8 C - Peau/muqueuse <4h - LCR <30 -liquide de ponction/pus <2h - ECBC < 4h - spermoculture < 3h - autres prélèvements <2h - ECBU borate <24h ou 2-8 C - sur écouvillon <24h ouchothèque dans certaines situations ouchothèque dans certaines situations C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 13 sur 15

14 = volume non compatible avec analyse / tube 1 aire = sérothèque 1 an sauf si quantité insuffisante QI = tube sans gel séparateur et analyse au-delà de J0 BACTERIOLOGIE (2) VR paillasse Bactério - 3j 2-8 C (sinon congeler immédiatement) Légionelle U paillasse Bactério - 24h 14j 2-8 C Pneumocoque U paillasse Bactério - 24h 14j 2-8 C Ag grippe paillasse Bactério - - 8h ou 2-8 C sans milieu de transport - 72h 2-8 C avec milieu de transport Rota/adeno 1min 700g paillasse Bactério - (sinon congeler immédiatement) trepto A rapide paillasse Bactério C 4h 24h 2-8 C ang selles paillasse Bactério C 10h 2-8 C (dilution des selles 5j abri de la lumière) Toxine clostridium paillasse Bactério - <3j 2-8 C (préférence=24h) / écouvillon fourni dans le kit uniquement C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 14 sur 15

15 5. Classement et archivage Les échantillons 1aires, à l exception de la bactériologie, sont stockés dans la chambre froide n F0 dans des containers jaunes. Les échantillons 1aires de bactériologie sont stockés dans la chambre froide n F0 dans un semainier. Δ Tout tube redonné dans un service (cas des tubes EDTA pour transfusion) doit donner lieu à une annotation dans le dossier Biowin en question (rubrique «clinique»). Δ Toute NC bloquante, notamment d identitovigilance, ou toute autre particularité pouvant générer un résultat erronée en cas d ajout d examens à postériori, doit donner lieu à une annotation explicite sur le tube 1aire afin de ne pas rajouter d examens sur les prélèvements en question. Les positions de la sérothèque et de la LCR thèque sont archivées dans le IL dans le dossier du patient. Les boîtes se trouvent dans le congélateur n C2 et y sont conservées 1 année. Rq : le laboratoire sérothèque systématiquement tous les échantillons destinés à l examen «dépistage de la trisomie 21» et «HCG» La souchothèque est archivée sur le formulaire D4 ENR Bac 07 dans le tiroir «souchothèque» en bactériologie. Elle est conservée 1 année. Δ Toute sérothèque ou LCRthèque ne pouvant être traitée pour raison de volume insuffisant doit apparaître dans la boîte sous forme de tube vide identifié avec la mention QI (quantité insuffisante) Δ Toute sérothèque réalisée à partir d un échantillon autre que du sérum doit être clairement identifiée sur le tube à sérothèque avec la mention de la nature de l échantillon (héparine,..) Le laboratoire Biomnis sérothèque les prélèvements que nous lui adressons conformément à l annexe C du GBEA (voir attestation dans le dossier Biomnis bureau bio n 1), sous réserve de volumes suffisants. Il sérothèque également, sous réserve de volumes suffisants, les sérums adressés pour tests d exploration de l allergie, permettant ainsi de s affranchir d un nouveau prélèvement en cas de tests complémentaires ajoutés à postériori. C3-IN PA 02 conservation des echantillons biologiques Page 15 sur 15