Panels de PCR multiples (par TEM PCR TM ) pour la détection de maladies infectieuses
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- Bénédicte Duquette
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1 s de PCR multiples (par TEM PCR TM ) pour la détection de maladies infectieuses La précocité et la précision du diagnostic permettent la mise en place d une thérapeutique anti infectieuse rapide et adaptée. La technique de TEM PCR TM de Diatherix offre la possibilité d identifier simultanément la majorité des bactéries, virus, parasites et levures ainsi que certaines résistances aux antibiotiques, en un jour, à partir d un échantillon unique. Elle permet aux cliniciens de : o ne pas administrer d antibiotiques en cas de détection de virus o administrer l antibiotique et/ou le traitement antiviral adapté o améliorer la qualité, la précocité et le rapport coût efficacité de la prise en charge des patients. Liste des panels par TEM PCR proposés par Infection sexuellement transmissible Atopobium vaginae Chlamydia trachomatis Gardnerella vaginalis Mycoplasma genitalium Mycoplasma hominis Neisseria gonorrhoeae Trichomonas vaginalis Ureaplasma urealyticum STD endocervical vaginal urétral Échantillon d urines Kit de K28 : Kit de Vaginose bactérienne Atopobium vaginae Gardnerella vaginalis Mycoplasma genitalium Mycoplasma hominis Ureaplasma urealyticum BVP vaginal ou échantillon d urines K28 : Kit de Candidose Candida albicans Candida glabrata Candida krusei Candida parapsilosis Candida tropicalis CANDP vaginal endocervical ou échantillon d urines K28 : Kit de Eurofins Juin /5
2 Liste des panels par TEM PCR proposés par Typage des HPV de haut grade Types à haut risque de VPH : 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 59, 67, 68 HPVP endocervical de gorge Kit de Streptocoque du groupe B Streptocoques groupe B (Streptococcus agalactiae) GBS vaginal/rectal Typage des staphylocoques Staphylococcus aureus MRSA 1 Gène PVL 2 Staphylocoques à coagulase négative Staphylococcus epidermidis MRCoNS 3 + Gènes de résistance des staphylocoques* SDP général nasal Liquide synovial Infection des voies urinaires Acinetobacter baumannii Citrobacter freundii Enterobacter aerogenes Enterobacter cloacae Enterococcus faecalis Enterococcus faecium Entérocoques résistants à la vancomycine Escherichia coli Klebsiella spp. Morganella morganii Proteus mirabilis Proteus vulgaris Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus saprophyticus UTI Échantillon d urines Infection gastro intestinale Campylobacter jejuni Clostridium difficile (gène toxine B) E. coli entérohémorragique (EHEC) Gène de la Shiga toxine (stx1) Gène de la Shiga toxine (stx2) E. coli/shigella entéroinvasive (EIEC) E. coli entéropathogène (EPEC) E. coli entérotoxigène (ETEC) Salmonella enterica Vibrio parahaemolyticus Adénovirus types 40, 41 Norovirus Rotavirus Cryptosporidium parvum Giardia lamblia GP rectal de selles Eurofins Juin /5
3 Liste des panels par TEM PCR proposés par Pneumonie atypique Legionella pneumophila Mycoplasma pneumonia APP Kit de Pharyngite PHP de gorge Infection respiratoire Acinetobacter baumannii Klebsiella pneumoniae Legionella pneumophila Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus MRSA 1 Gène PVL 2 + Gènes de résistance des staphylocoques* RES de gorge Eurofins Juin /5
4 Liste des panels par TEM PCR proposés par Infection respiratoire pédiatrique PRP Kit de Infection respiratoire haute IRH de gorge 1 Staphylococcus aureus résistant à la méticilline 2 Leucocidine de Panton Valentine 3 Staphylocoques à coagulase négative, résistants à la méticilline Gènes de résistance des staphylocoques : Aminosides, Céphalosporines, Érythromycine/clindamycine, Méticilline et Tétracycline Eurofins Juin /5
5 À propos de Diatherix et la technologie TEM PCR TM Diatherix est un laboratoire américain de diagnostic moléculaire multiplex agréé par le CLIA (Clinical Laboratory Improvement Amendments) utilisant une technologie innovante de TEM PCR (Target Enriched Multiplex Polymerase Chain Reaction) pour la détection précise et précoce de maladies infectieuses. La technologie TEM PCR TM La TEM PCR TM est une technologie innovante, performante et très rapide basée sur une PCR multiplex en 1 temps, utilisant 3 paires d amorces. La première phase est une PCR nichée (nested PCR) multiplex comportant 2 couples d amorces spécifiques pour chaque cible du panel, permettant l enrichissement de chaque cible et l augmentation de la spécificité de détection. Un de ces couples d amorces comprend une séquence d adaptateurs qui permettent de fixer la troisième paire d amorces. Ce troisième couple d amorces, appelé superprimer, est ensuite utilisé pour marquer et amplifier toutes les cibles. Les produits de PCR marqués sont ensuite hybridés sur des plaques de microarrays (puces ADN). Cette technologie brevetée est validée par le Clinical Laboratory Standards Institute. «SuperPrimer» sens Amorces sens CIBLE Amorces antisens «SuperPrimer» antisens Les avantages de la TEM PCR o Identification simultanée des bactéries, virus, parasites et gènes de résistance aux antibiotiques o Possibilité de détecter des bactéries si le patient est sous antibiothérapie o Sensibilité et spécificité accrues o Simplicité d un unique Eurofins Juin /5
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