DUT. Génie biologique option Bio-Informatique. Domaine : Sciences, Technologies, Santé. Mention : Génie biologique

Transcription

1 DUT Génie biologique option BioInformatique Domaine : Sciences, Technologies, Santé Mention : Génie biologique Organisation : Institut Universitaire de Technologie Lieu de formation : Aurillac Niveau d'entrée : Baccalauréat Durée des études : 2 ans

2 DESCRIPTION OBJECTIFS Former des techniciens supérieurs possédant une double compétence biologie/informatique, et pouvant intégrer toute structure travaillant sur la production et l'analyse de données biologiques telles que les laboratoires de recherche publics ou privés, les industries de biotechnologies, pharmaceutiques, les sociétés de service en informatique en lien avec le secteur de la santé et, plus généralement, pour toutes les entreprises utilisant les biotechnologies et la bioinformatique. COMPETENCES VISEES Les principales caractéristiques des diplômés sont l'autonomie, la polyvalence et l'adaptabilité. A l'issue de la formation, les étudiants seront capables de : Développer des logiciels sous la direction d'un cadre ou chercheur en biologie (applications bioinformatiques à façon, chaînage d'applications...) Concevoir des systèmes d'information dédiés à l'organisation, l'exploitation et l'analyse de données produites par les secteurs de la biologie et de la santé Administrer des ressources bioinformatiques (matériels et logiciels bioinformatiques, sites internet, bases de données,...) Réaliser la préparation du matériel biologique à analyser (extractions ADN, ARN, protéines.) Grâce à leurs connaissances en génomique et postgénomique, ils seront capables d'extraire les informations pertinentes de données de masse. Ce travail sera facilité par les connaissances théoriques et pratiques qu'ils seront capables de mettre en œuvre (séquençage, biopuces ADN, protéomique ), ainsi que par leur double compétence biologie/informatique. ADMISSION CONDITIONS D'ADMISSION Vous possédez la nationalité française ou êtes issus d'un pays de l'union Européenne, vous devez obligatoirement candidater sur le site Les candidats doivent justifier d'un des baccalauréats : S, STL, STAV ou d'un diplôme équivalent. Il peut s'agir de néobacheliers ou d'étudiants ayant déjà un cursus dans l'enseignement supérieur. Une commission pédagogique du département Génie Biologique procède à un classement des candidats en fonction des éléments figurant au dossier de candidature. Cette procédure est ensuite examinée pour validation par un jury désigné par le président de l'université, sur proposition du directeur de l'i.u.t.. L'admission peut se faire également, pour les non bacheliers, par validation des acquis de l'expérience (VAE). Prendre contact avec le responsable de la formation. Vous avez une nationalité étrangère (Hors Union européenne) : si vous résidez dans un pays disposant d'un espace Campus France à procédure CEF (Centre pour les Etudes en France), vous devez suivre la procédure Campus France. L'admission directe en 2ème année est possible pour les candidats ayant validés au moins une année dans l'enseignement supérieur (Licence générale spécialité Sciences de la vie ou informatique, PACES, CGPE ) ou après validation par un jury d'acquis antérieurs de modules ou ECTS et examen du dossier par le jury d'admission. Des notions de bases en informatique sont nécessaires. Les candidatures sont à déposer sur le site de l'iut via l'application Ciell² ( La formation est accessible en formation initiale et formation continue. Informations sur le site de l'iut : onglet "étudier à l'iut"

3 INSCRIPTION Candidature : Vous avez la nationalité française : les modalités de candidature suivent les procédures Post Bac sur le site suivant : Vous possédez la nationalité d'un pays de l'union Européenne : vous devez obligatoirement candidater sur le site Vous avez une nationalité étrangère (Hors Europe) : si vous résidez dans un pays disposant d'un espace Campus France à procédure CEF (Centre pour les Etudes en France), vous devez suivre la procédure Campus France. Si vous résidez en France, vous devez suivre la procédure DAP verte. Enfin, si vous résidez dans un pays ne possédant pas de procédure CEF, vous devez suivre la procédure DAP blanche. Procédure DAP (blanche ou verte) sur le site du MEN : Procédure CEF : Informations sur le site de l'iut : onglet "etudier à l'iut" ORIENTATION POURSUITE D'ETUDES De nombreuses poursuites d'études sont possibles selon le niveau : accès direct aux écoles d'ingénieurs du domaine (INSA, Polytech, UTC...) par dépôt de dossier de candidature les écoles d'ingénieurs du Ministère de l'agriculture (ENSA, Vetagro Sup, AgroParisTech, Agrocampus Ouest...) sont accessibles par le concours C2 licences professionnelles dans diverses spécialités (biologie cellulaire, biotechnologies, génomique...) pour compléter votre formation dans un programme court (Bac+3) licence générale (biologie, bioinformatique ou informatique) pour intégrer ensuite un master voire doctorat (L3 si résultats satisfaisants) les études à l'étranger dans les Universités partenaires : un partenariat avec des universités anglaises, américaines et canadiennes a été établi. Il est possible de continuer son cursus par un Undergraduate Studies Program (USP) pour obtenir un Bachelor of Science (BSc) avec la possibilité de poursuivre en Postgraduates Studies pour réaliser un Master of Science. DEBOUCHES PROFESSIONNELS Recherche, développement et production dans les laboratoires de recherche publics ou privés (laboratoires universitaires, CNRS, INSERM, INRA, Institut Pasteur ), les industries de biotechnologies, les entreprises de séquençage, génotypage et diagnostic moléculaire..., les groupes industriels agrochimiques, pharmaceutiques ou cosmétiques, les sociétés de service en informatique en lien avec les secteurs de la santé, de la pharmacologie et des biotechnologies. Après poursuites d'études : assistant ingénieur, ingénieur, chercheur, enseignantchercheur. Pour accéder aux enquêtes portant sur le devenir des diplômés, rendezvous sur le site de l'université d'auvergne : Chaque semestre validé représente 30 ECTS, la validation du DUT 120 ECTS.

4 PROGRAMME DE LA FORMATION Volumes Horaires Crédits ECTS UE 1.1 : Bases scientifiques et technologiques Outils mathématiques Bases de physique Outils informatiques Enseignement différencié d'adaptation CM 1h TD 54h TP 42h UE 1.2 : Sciences chimique et biochimique Bases de chimie générale et organique Biochimie Chimie et biochimie : Techniques analytiques CM 34h TD 40h TP 62h UE 1.3 : Sciences du vivant Biologie et physiologie générales Biologie et physiologie cellulaires Bases de microbiologie et d'immunologie CM 4h TD 20h TP 60h UE 1.4 : Communication et conduite de projets Langue vivante 1 : Anglais Expression Communication Projet personnel et professionnel (PPP) Projet tuteuré CM 4h TD 36h TP 32h 6 Volumes Horaires Crédits ECTS UE 2.1 : Sciences physique, chimique et biochimique Chimie générale et organique Physique appliquée Biochimie et biologie moléculaire CM 55h TD 2h TP 46h 7 UE 2.2 : Sciences biologiques Microbiologie et immunologie Biologie et physiologie appliquées Enseignement d'adaptation au milieu professionnel CM 2h TD 34h TP 62h 7 UE 2.3 E : Enseignements spécifiques à l'option bioinformatique Systèmes d'exploitation Algorithmique Traitement de données Enseignement d'adaptation professionnelle TD 64h TP 72h UE 2.4 : Enseignements transversaux Outils statistiques Langue vivante 1 : Anglais Expression Communication Projet personnel et professionnel (PPP) Projet tuteuré TD 69h TP 52h Semestre 1 Semestre 2

5 Volumes Horaires Crédits ECTS UE 3.1 : Informatique Systémes d'exploitation et architecture réseaux Algorithmie pour la bioinformatique Programmation orientée objet CM 39h TD 62h TP 52h 9 UE 3.2 : Biologie Physiologie et biologie moléculaire Génomique Bioinformatique appliquée CM 51h TD 47h TP 60h 9 UE 3.3 : Formation générale pour l'entreprise Economie des entreprises Analyses de données Gestion de projet CM 20h TD 55h TP 44h 6 TD 45h TP 25h 6 Volumes Horaires Crédits ECTS UE 4.1 BI : Bioinformatique Bases de données développement Web Bibliothèques de programmation dédiées à la bioinformatique Statistiques Métagénomique Postgénomique Phylogénie évolutive CM 60h TD 79h TP 112h 10 UE 4.2 BI : Compléments de formation pour l'entreprise Qualité hygiène développement durable brevetabilité bioéthique Langue vivante 1 : anglais Expression communication Projet tutoré (70h) CM 12h TD 4h TP 20h 12 Semestre 3 UE 3.4 : Outils de communication projets Langue vivante 1 : anglais Expression communication Projet personnel et professionnel Projet tuteuré (0h) Semestre 4 UE 4.3 BI : Stage(s) Stage LES PLUS DE LA FORMATION Cette formation est la seule dans ce domaine au niveau national. Les étudiants acquièrent une double compétence très appréciée par les professionnels. Cette formation s'appuie sur le développement des techniques biologiques et bioinformatiques dans le domaine. Diplôme professionnel, 33 % des enseignements sont assurés par des professionnels du secteur (enseignantchercheur, chercheur, ingénieur de recherche du secteur public ie université, CNRS, INRA). Dans cette formation professionnalisante, chaque enseignement intègre intimement la biologie et de l'informatique à travers des enseignements théoriques et pratiques (40%). Au cours de la formation, il est proposé aux étudiants de passer le TOEIC et le C2i afin de faire certifier leurs compétences dans les domaines de la communication en anglais et de l'informatique.

6 Un stage de fin d'études de 10 semaines minimum est obligatoire. Il permet de mettre en situation et en application les connaissances acquises dans un environnement professionnel. Il peut avoir lieu en France ou à l'étranger (PaysBas, NouvelleZélande, Angleterre...). Les thématiques abordées au cours des stages sont très variées : Développement d'un pipeline d'annotation des génomes microsporidiens Reconstruction de génomes ancestraux de levures Intégration des méthodes de prédiction de la structure secondaire des protéines au sein du serveur NPSA Mise en place d'une stratégie de fouille de données appliquée à l'analyse de l'effet du stress sur le transcriptome musculaire Développement de méthodes d'analyses bioinformatiques d'amplicons issus des nouvelles techniques de séquençage Intégration de programmes bioinformatiques pour la phylogénie dans le gestionnaire de workflow Galaxy Développement d'outils d'aide au stockage de données issues de technologies NGS Développement d'outils pour l'analyse de données métagénomiques et métatranscriptomiques dans le contexte de l'étude de l'écosystème microbien fromager étude par phylogénie moléculaire du profil évolutif de gènes impliqués dans la fonction testiculaire en vue d'accroître les données chez une espèce d'intérêt agronomique, le coq

7 NOTES

8 CONTACTS CHEF DE DÉPARTEMENT RESPONSABLE 2EME ANNÉE Chef de département Biologie Valérie POLONAIS Tél IUT de ClermontFerrand, 100 rue de l'egalité, Aurillac Tél Secrétariat de département Biologie Tél SCOLARITÉ Service scolarité Relations internationales IUT Campus universitaire des Cézeaux 5 avenue Blaise Pascal CS AUBIERE CEDEX Tél /01/02 scola.iut@udamail.fr Institut Universitaire de Technologie 5 avenue Blaise Pascal CS AUBIERE Tél. : iutweb.uclermont1.fr