Epidémie Nationale à Salmonella Typhimurium multi-résistante aux antibiotiques. Le malheur est dans le pré?

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Hubert Lecours
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1 Epidémie Nationale à Salmonella Typhimurium multi-résistante aux antibiotiques Simon Le Hello C.N.R et C.C.O.M.S Salmonella Institut Pasteur, Paris, France Le malheur est dans le pré?

Base de la surveillance des salmonelles en France humaine Laboratoires médicaux (3375) souches CNR Salm données sérotypage Tiac Cas groupés DO

2 Base de la surveillance des salmonelles en France humaine Laboratoires médicaux (3375) souches CNR Salm données sérotypage Tiac Cas groupés DO données de sérotypage Laboratoires alimentaires (150) souches Vétérinaire et alimentaire sous-typage des souches Surveillance passive Investigation épidémie

Pré-alerte 19 février 2010 Animal/ aliment Type de prélèvement Dpt Profil ATB Date Réception Cheval 1 Biopsie foie 61 BMR2 06/11/2009 Cheval 1 Cheval 2 Autopsie, isolée d intestin Avortement,

3 Pré-alerte 19 février 2010 Animal/ aliment Type de prélèvement Dpt Profil ATB Date Réception Cheval 1 Biopsie foie 61 BMR2 06/11/2009 Cheval 1 Cheval 2 Autopsie, isolée d intestin Avortement, placenta 61 BMR1 21/01/ BMR1 15/02/2010 Cheval 3 Autopsie 61 BMR1 15/02/2010 Chevaux de course Lait cru Fromage au lait cru Troupeau 1 Lait cru 61 BMR1 16/02/2010 Fromagerie 1 Fromage au lait cru 61 BMR1 16/02/2010 D après S. Granier, ANSES-Maisons Alfort

4 Alerte : détection des cas humains Alerte simultanée au CNR-Salm fin mars 2010 d isolements à Salmonella Typhimurium résistantes aux C3Gs par des laboratoires des dpts 14, 49, 50, 80 et 22 Investigation épidémiologique et moléculaire CNR et Anses Comparaison des souches vétérinaires et humaines Sous-typage + caractérisation moléculaire Suivi de la souche épidémique InVS Enquête exploratoire à la recherche d exposition commune Déterminer l ampleur de l épidémie DGAL et Anses Enquête de traçabilité amont/aval: A partir des lieux d achat des cas Enseignes livrées et noms des sous-marques

FOX S K TOB GEN CHL SUL TMP TE (BMR 1 : CTX-M-1 et

5 Antibiogramme de la souche épidémique Antibiogramme par disque-diffusion selon CA-SFM 2010 AMX CRO CAZ FOX S K TOB GEN CHL SUL TMP TE (BMR 1 : CTX-M-1 et CMY-2) AMX CAZ FOX S K TOB GEN CHL SUL TMP TE (BMR 2 : CMY-2)

au CNR 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10111213141516171819202122232425 semaine de prˇl vemen

6 Courbes épidémiques Nombre de souches de ST re ues au CNR entre dˇcembre 2009 et ma nb souches ST BLSE ˇpidˇmiques re ues nb souches ST re ues au CNR semaine de prˇl vemen Pic épidémique semaine 11 Dernier cas semaine 17 D après N. Jourdan Da Silva, InVS

Investigations microbiologiques Résultats de sous-typages souches vétérinaires/souches humaines PFGE : 1 nouveau profil X-TYM-136 majoritaire et un dérivé 137 retrouvé sur une souche cheval Analyse

7 Investigations microbiologiques Résultats de sous-typages souches vétérinaires/souches humaines PFGE : 1 nouveau profil X-TYM-136 majoritaire et un dérivé 137 retrouvé sur une souche cheval Analyse des régions CRISPR : un nouveau type CT-62 MLVA : 1 profil dominant NA- 211 et d autres profils minoritaires très proches Dice (Opt:1.00%) (Tol 1.0%-1.0%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%] PFGE-XbaI PFGE-XbaI (10-CEB-186) (10-CEB-763) (10-CEB-765) (10-CEB-809) (10-CEB-810) (09-CEB-8063). STM

Investigations microbiologiques Résultats de l étude des mécanismes de résistances aux antibiotiques Nucléase S1 Présence concomitante des gènes bla CTX-M-1 et bla CMY-2 sur souches vétérinaires et

8 Investigations microbiologiques Résultats de l étude des mécanismes de résistances aux antibiotiques Nucléase S1 Présence concomitante des gènes bla CTX-M-1 et bla CMY-2 sur souches vétérinaires et humaines conférant la résistance aux béta-lactamines H V TC1 à 4 Supports génétiques de ces gènes Plasmide conjugatif de 90 kb Inc I1 pour bla CMY-2 Plasmide probable de 250kb Inc HI1 pour bla CTX-M-1 250Kb Inc HI1 90Kb Inc I1

9 Investigations post-alerte D après S. Granier, ANSES-Maisons-Alfort Animal/ aliment Type de prélèvement Dpt Profil ATB Date Réception Cheval 1 Biopsie foie 61 BMR2 06/11/2009 Cheval 1 Cheval 2 Autopsie, isolée d intestin Avortement, placenta 61 BMR1 21/01/ BMR1 15/02/2010 Cheval 3 Autopsie 61 BMR1 15/02/2010 Troupeau 1 Lait cru 61 BMR1 16/02/2010 Fromagerie 1 Fromage au lait cru 61 BMR1 16/02/2010 Cheval 4 Fécès 61 BMR1 05/05/ seul cheval était encore en vie lors de l investigation Cheval 5 Autopsie, contenu digestif 14 BMR1 29/04/2010 Cheval 6 Contenu intestinal 14 BMR1 05/05/2010 Cheval 7 Fécès 61 BMR1 19/05/2010 Cheval 2 Liquide articulaire 14 BMR3 14/06/2010

10 Identification de 8 lieux de passage des chevaux Centre équestre C3 Naisseur (+séjour) Propriétaire C4 Clinique A Eleveur Haras C2 Entraineur Haras C6 Haras C1 250 prélèvements (environnement, feces), mai à juillet 2010

11 Lieux positifs pour S. Typhimurium BMR1, X-TYM-136, CT-62 MLVA Type identique Centre équestre C3 Naisseur (+séjour) Propriétaire C4 Clinique A Eleveur Haras C2 Entraineur Haras C6 Haras C1 2 sites positifs, feces et environnement 2 campagnes de nettoyage / désinfection (+fumigation) à deux reprises pour la clinique

12 Résultats entérobactéries C3G R 33% Haras C2 83% Centre équestre C3 Clinique A 75% Naisseur (+séjour) Propriétaire C4 54% Eleveur Entraineur 100% 8% Haras C6 Haras C1 7% 50% Tous les sites positifs, 43% des chevaux testés positifs

13 Etudes de portage des salmonelles dans la filière équine dans la région Basse-Normandie + étude des pratiques vétérinaires Histoire de l épidémie et perspectives Salmonellose chez les bovins et les chevaux Salmonellose équine est rare et très souvent létale Portage asymptomatique de Salmonella chez bovins et chevaux est faible, de 1 à 22% selon la littérature. Infection nosocomiale vétérinaire +++ Filière équine peu surveillée en France Prévalence de 43% d entérobactéries résistantes aux C3Gs Facteur de prescription d antibiotiques à large spectre? Présence des Salmonella Typhimurium BMR1 Caractérisation moléculaire des mécanismes de résistances aux C3Gs des entérobactéries isolées de l enquête : comparaison des profils plasmidiques

14 Histoire de l épidémie - le pré comme lieu de contamination? Passage dans l environnement Clinique vétérinaire spécialisée +++ favorisant la dissémination ou lieu de contamination Lieu de convalescence post chirurgical dans pré avec des vaches - transmission? Passage dans l aliment Procédés de nettoyage défaillants ou insuffisants Contamination du lait Epidémie nationale de salmonelloses à Salmonella Typhimurium multi-résistantes aux antibiotiques Production de fromages au lait cru à grande échelle Contamination humaine par consommation de fromages Quelques cas de contamination par contact direct cheval-homme

15 S. Le Hello FX. Weill S. Granier A. Brisabois J. Tapprest N. Jourdan Da Silva V. Vaillant N. Pihier Merci de votre attention!

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