Le plan de sélection s des. à foie gras. palmipèdes. Marie-Madeleine Mialon Richard

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1 Le plan de sélection s des palmipèdes à foie gras Marie-Madeleine Mialon Richard

2 Plan I - Organisation de la sélection et diffusion du progrès génétique II - Quelques rappels liés à la sélection - Estimation des valeurs génétiques : Le BLUP - Notion de progrès génétique III- Le plan de sélection - Contrôle de performances - Un schéma de sélection - Gestion de la variabilité génétique - Perspectives

3 I - Organisation de la sélection et diffusion du progrès génétique La sélection des palmipèdes à foie gras en France est essentiellement réalisée par 3 sélectionneurs privés : La S.A GOURMAUD Sélection Le groupe GRIMAUD OPTIONS La SEPALM

4 I - Organisation de la sélection et diffusion du progrès génétique Diffusion du progrès génétique Création du progrès génétique SELECTION Multiplication des reproducteurs améliorés Grands parentaux MULTIPLICATION Production animaux destinés au gavage Parentaux (animaux croisés) PRODUCTION Oisons canetons mulards d un jour

5 Plan I - Organisation de la sélection et diffusion du progrès génétique II - Quelques rappels liés à la sélection - Estimation des valeurs génétiques : Le BLUP - Notion de progrès génétique III- Le plan de sélection - Contrôle de performances - Un schéma de sélection - Gestion de la variabilité génétique - Perspectives

6 II - Quelques rappels liés à la sélection Démarche du sélectionneur Ecoute de la filière Production des parentaux Choix des caractères res à sélectionner Choix des reproducteurs Indexation Mesure des caractères res Méthode de sélection

7 II - Quelques rappels liés à la sélection Estimation des valeurs génétiques : indexation Intérêts du BLUP MODELE ANIMAL -Information de tous les apparentés prise en compte -Effets de milieu mieux estimés LES VALEURS GENETIQUES SONT ESTIMEES AVEC UNE PLUS GRANDE PRECISION -Sous réserve de liens de parenté entre les individus, les valeurs génétiques estimées sont toutes comparables dans l espace et dans le temps PROGRES GENETIQUE PLUS IMPORTANT

8 II - Quelques rappels liés à la sélection Estimation des valeurs génétiques : indexation de grandes quantités de données collectées des méthodes statistiques complexes utilisation d ordinateurs puissants et sophistiqués Mise en commun des compétences et des outils informatiques + Respect de la confidentialité = SYndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français cohérence des données et généalogies estimation paramètres génétiques calcul valeurs génétiques choix des meilleurs individus

9 II - Quelques rappels liés à la sélection Rappel : Notion de progrès génétique effectifs Génération n P performances effectifs Génération n+1 G G = A _ S A

10 II - Quelques rappels liés à la sélection Rappel : Notion de progrès génétique Le progrès génétique dépend de 3 paramètres : - intensité de sélection i qui dépend du % d individus retenus + % faible (sélection sévère) + i forte ex : 25% voie mère fille (1 mère : 4 filles) - précision de la sélection R² ou CD fonction durée et nombre contrôles - écart type génétique du caractère re sélectionn lectionné Le progrès génétique annuel E ( G) = ( i R σ A ) / t - le progrès génétique se cumule au fur et à mesure des générations de sélection

11 II - Quelques rappels liés à la sélection Effets de la sélection : mesure du progrès génétique Calcul Comparaison animal sélectionn lectionné vs animal non sélectionn lectionné Théorique, dépend de la connaissance a priori de tous les caractères res Nécessite de conserver un témoin t constant au cours du temps (lignée non sélectionn lectionnée), e), ou d une génération précédente Comparaison à un autre génotype Ne reflète pas uniquement la sélection lorsque les génotypes de référence rence évoluent également

12 II - Quelques rappels liés à la sélection Les particularités des volailles Pression : bonne Population de petite taille Facile à élever Identification aisée Intervalle de génération Faible Reproduction rapide Précision : bonne Polygames Stockage des œufs :incubation et éclosion le même jour Beaucoup d individus par famille Peu d effets maternels Élevage d apparentés dans un milieu commun contrôlé La sélection a un coût, il faut donc optimiser la méthode

13 Plan I - Organisation de la sélection et diffusion du progrès génétique II - Quelques rappels liés à la sélection - Estimation des valeurs génétiques : Le BLUP - Notion de progrès génétique III- Le plan de sélection - Contrôle de performances - Un schéma de sélection - Gestion de la variabilité génétique - Perspectives

14 Le cycle de sélection Génération n MESURE des ANIMAUX Indexation TROUPEAU PEDIGREE SELECTION des MEILLEURS Génération n+1 REPRODUCTION pour le RENOUVELLEMENT Diffusion dans la population

15 Mesures des animaux : contrôle de performances -Troupeau pedigree : - identification des individus -cages individuelles numérotées, -bagues : canetons dès la naissance et adultes - enregistrement des généalogies - informatique : logiciel, saisie portable, automates

16 Mesures des animaux : contrôle de performances -Mesures sur les candidats : contrôle individuel caractères de croissance caractères de reproduction -Mesures sur les descendants : contrôle sur descendance (testage) -caractères exprimés par un seul sexe -mesures nécessitant abattage (découpe, foie gras ) -pour une meilleure précision (+ grand nombre de mesures)

17 Méthodes de mesure des caractères res de reproduction parquet avec N Animaux intra parquet (oies) cage individuelle = parquet avec un seul animal F F F F F F F F Pondus MEI Fécondés - Identification de l œ l œuf = (identité père mère) -Suivi jusqu à l é éclosion -Éclosion pedigree

18 Méthodes de mesure des performances de croissance et gavage Mesures de quantité Poids - Animal (12 semaines) - Foie (poids, rendement) - Paletot - Magret Mesures de qualité, de composition Foie Classement Taux de fonte lipidique Carcasse Composition magret Présentation carcasse

19 Sélection par seuils vs sélection sur indice multicaractère re Y t X t X : seuil de sélection sur X t Y : seuil de sélection sur Y t Y I : droite de seuil d indice X Seuils : moins lourde, pas nécessaire de contrôler tous les candidats pour tous les caractères Indice : tous les candidats conservés jusqu à la fin de tous les contrôles : plus coûteuse mais plus efficace I

20 Schéma de sélection d une souche de palmipèdes à foie gras Troupeau pedigree reproducteurs Renouvellement Naissance génération n Index reproduction Contrôle individuel de la reproduction ponte, fertilité, éclosabilité Production descendance TESTAGE croissance, gavage, éviscération RENOUVELLEMENT croissance Index gavage Classement des reproducteurs Choix des descendances

21 Stratégies de sélection : sélection de lignées sépar parées sélectionner les caractères de façon complémentaire sur des lignées séparées spécialisées croiser ces lignées au niveau de la multiplication avantages du croisement : - progression plus importante sur un nombre réduit de caractères dans chaque lignée - bénéficier de «l effet d hétérosis» obtenu avec les animaux croisés - protection des souches pures parentales qui ne sont pas commercialisées (aviculture)

22 Sélection de la cane Pékin mère à mulards Lignée Pékin A Lignée Pékin B Grands parentaux Barbarie AB : mère Pékin croisée parentaux MULARDS

23 Sélection de la cane Pékin mère à mulards Les principaux critères de sélection des lignées Pékin : - croissance : poids à un âge donné indice de consommation - reproduction : ponte (intensité, persistance) fécondit condité - gavage : poids 12 semaines poids foie gras poids magret Lignée mâle Pékin A Lignée femelle Pékin B Croissance X X Reproduction X Gavage X X

24 Sélection de la cane Pékin mère à mulards Coloration des mulards : cane Pékin est blanche avec un mâle Barbarie blanc Canetons mulards colorés : présentation de carcasse Blanchiment des lignées Pékin pour répondre à la demande du marché industriel Relativement rapide (h² = 0.38, Huang 1985) Mesure précoce du caractère re (duvet à la naissance) Pour aller plus vite la sélection peut porter sur les mâles et femelles Pékin (couleur des canetons mulards et Hinny) Cependant, existence d une demande de mulards colorés pour le marché traditionnel (généralement mulards + lourds)

25 Sélection de la cane Pékin mère à mulards Types de femelles parentales présentes sur le marché : - femelle prolifique, médium, blanchie pour le marché industriel - femelle prolifique, + lourde, pour le marché traditionnel - éventuellement femelle intermédiaire

26 Sélection de la cane Pékin mère à mulards Prise en compte de nouveaux caractères : - Durée du gavage (diminuer progressivement la durée du gavage à chaque génération et mesurer le poids de foie - Homogénéit ité des produits : foie, magret (muscle / peau + gras) - Nervosisme des canards mulards blancs - Picage : comportement d animaux en groupes

27 - Un constat : Le comportement de nervosisme blanchiment des souches a augmenté le «nervosisme» -Les études : en cours = définition du caractère mise au point de mesures comparaison de souches/couleurs modes d élevage

28 Mesures du comportement Fuite à l homme : introduction de l animal dans un couloir. Observation de la direction par rapport à une personne qui se trouve à l extrémité?? Introduction Immobilité tonique : retournement du canard sur le dos Mesure du temps d immobilité

29 Résultats - Différences entre souches, mais dans une même souche pas de différence entre mulards blancs et mulards colorés - - Habituation des mulards si manipulations répétées Sélection : envisageable

30 Sélection du mâle Barbarie père à mulards -crit critères res de sélection : lignées mâles : croissance gavage lignées femelles : reproduction, autres caractères? - gène d autosexabilit autosexabilité des mulards : gène chocolat

31 Effets de la sélection : conséquences attendues - augmentation de la vitesse de croissance, - rajeunissement des animaux, - évolution de certains caractères res par rapport à la maturité Si on abat les animaux plus jeunes : Les masses musculaires sont moins développ veloppées es = pas assez de viande, pénalise la formation du foie L aptitude à déposer des lipides est limitée Problèmes de rendement à l abattage

32 Autre sélection : Sélection directe sur la qualité? Problème de définition : quel critère faut-il améliorer? Foie : coûteux, relativement difficile en raison de sa liaison génétique avec le poids du foie Viande : manque de critères objectifs fiables (technologique, organoleptique)

33 Sélection de l oie à foie gras : - Coût de la sélection + étroitesse du marché : une petite population en sélection - L intervalle de génération était initialement de 2 ans : - 1 ère année : test des reproducteurs - 2 ème année : sélection des 25% meilleurs couples jars oie pour produire le cheptel de renouvellement - Critères res de sélection : - croissance - ponte (1er cycle) - gavage : poids foie, poids paletot - Stratégie de sélection : croisement 2 voies - Évolution : sélection dans un système de reproduction contrôlé (SEPALM)

34 Gestion de la variabilité génétique Sélection forte réduction du nombre de reproducteurs risque de réduire la variabilité génétique gérer un compromis entre intensité de sélection et évolution de la variabilité génétique par la planification des accouplements

35 Perspectives de la sélection des palmipèdes à foie gras: L apport de la connaissance de la carte génétique : - utilisation de marqueurs détection de gènes à effet quantitatif fixer allèles favorables - intérêt caractères difficiles / coûteux à mesurer caractères peu héritables mulard la sélection assistée par marqueurs ne va pas se substituer à la sélection traditionnelle mais va la renforcer

36 Programme de réalisation de la carte génétique But : développer une carte génétique microsatellites (200) des canards Barbarie et commun dans le croisement BxC Chaque sélectionneur : 8 canetons F1 Barbarie mâles 8 canetons F1 Pékin femelles INRA 64 canetons mulard F2 par couple Prélèvements sanguins sur tous les animaux F0 F1 et F2 Extraction de l ADN du sang et typage Positionnement des marqueurs = CARTE