PLAN DE COURS Automne 2011

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1 PLAN DE COURS Automne 2011 MCB Microbiologie générale Informations générales Crédits : 3 Temps consacré : Mode d'enseignement : Présentiel Site Web : Intranet Pixel : Enseignant(s) : Frenette, Michel michel.frenette@bcm.ulaval.ca Responsable : Frenette, Michel michel.frenette@bcm.ulaval.ca Description sommaire Rappel des notions de classification des microorganismes et de microscopie. Étude de la morphologie, de la nutrition, de la culture et de la génétique des bactéries. Introduction à la microbiologie des microorganismes eucaryotes, à la virologie, à l'immunologie et à l'écologie microbienne. Horaire et disponibilités Cours en classe : Mardi 09h30 à 10h20 VCH-2850 Jeudi 08h30 à 10h20 CMT-2105 Objectifs Ce cours a pour but de familiariser l'étudiante ou l'étudiant aux principaux domaines de la microbiologie, soit: la bactériologie, la mycologie, la protistologie, la virologie et de l'immunologie. Les principales notions de base, la méthodologie et quelques applications pratiques de la microbiologie seront présentées. Du point de vue spécifiquement pédagogique, à la fin du cours de Microbiologie Générale l'étudiant(e) devrait connaître et maîtriser: les points saillants des thèmes suivants: l'historique de la microbiologie; les différentes techniques de microscopie, leurs principes et leurs applications; la structure des cellules bactériennes ainsi que la composition biochimique et les fonctions de leurs structures cellulaires; les principes de la nutrition bactérienne et leurs applications dans la culture des bactéries; les différentes caractéristiques identifiables dans une culture bactérienne; les processus de division cellulaire retrouvés chez les bactéries; la dynamique d'évolution d'une population bactérienne; les méthodes 1/8

2 employées pour quantifier les populations bactériennes, les notions de base de la génétique bactérienne, les différents types de caractéristiques qui peuvent être déterminés chez les microorganismes; la classification des microorganismes; les caractères distinctifs des grands groupes bactériens; les caractères distinctifs des microorganismes eucaryotes (i.e. champignons microscopiques, algues microscopiques et protozoaires); les caractéristiques propres aux virus ainsi que les notions élémentaires de l'immunologie. De plus, l'étudiant(e) devrait être capable de faire des liens entre les différentes notions acquises. Contenu CALENDRIER DES ACTIVITÉS Mardi 6 septembre 1. Introduction et Historique de la microbiologie. Jeudi 8 septembre 2 et 3. Historique de la microbiologie (suite). Mardi 13 septembre 4. L'examen microscopique des microorganismes. Jeudi 15 septembre 5 et 6. L'examen microscopique des microorganismes (suite). Mardi 20 septembre 7. Morphologie et structure des bactéries. Jeudi 22 septembre 8 et 9. Morphologie et structure des bactéries (suite). Mardi 27 septembre 10. Morphologie et structure des bactéries (suite). Jeudi 29 septembre 11 et 12. Nutrition bactérienne. Mardi 4 octobre 13. Culture des bactéries. Jeudi 6 octobre Examen I (cours 1 à 13 inclusivement, valeur 30%). 2/8

3 Mardi 11 octobre 14. Culture des bactéries. Jeudi 13 octobre 15. Cultures pures et caractères culturaux. 16. Croissance et division des cellules bactériennes. Mardi 18 octobre 17. Dynamique d'évolution des populations bactériennes. Jeudi 20 octobre 18 et 19. Dynamique d'évolution des populations bactériennes (suite). Mardi 25 octobre 20. Dynamique d'évolution des populations bactériennes (suite). Jeudi 27 octobre 21 et 22. Génétique bactérienne. Mardi 1 er novembre - Jeudi 3 novembre : Semaine de lecture. Mardi 8 novembre 23. Génétique bactérienne (suite). Jeudi 10 novembre Examen II (cours 14 à 23 inclusivement, valeur 30%). Mardi 15 novembre 24. Génétique bactérienne (suite). Jeudi 17 novembre 25. Caractérisation et classification des microorganismes. 26. Diversité du monde bactérien. 3/8

4 Mardi 22 novembre 27. Diversité du monde bactérien. Jeudi 24 novembre 28 et 29 Les microorganismes eucaryotes (mycètes et protistes). Mardi 29 novembre 30. Les microorganismes eucaryotes (protistes). Jeudi 1 er décembre 31 et 32. Introduction à la virologie. Mardi 6 décembre 33. Introduction à virologie (suite). Jeudi 8 décembre Fête de l'université. Mardi 13 décembre 34. Introduction à virologie (suite). Jeudi 15 décembre Examen III (valeur 40% : cours 24 à 34 inclusivement: 30%,plus 10% sur l'ensemble de la matière). Modalités d'évaluation Examen Date Heure Pondération de la note finale Document(s) autorisé(s) Examen 1 Jeudi 6 octobre h30 à 10h % Aucun Examen 2 Jeudi 10 novembre h30 à 10h % Aucun Examen 3 Jeudi 15 décembre h30 à 10h % Aucun 4/8

5 Détails sur les modalités d'évaluation MÉTHODOLOGIE Le cours est constitué de trois heures de cours magistraux par semaine. L'étudiant(e) est responsable de la matière exposée durant les heures de cours ainsi que de la lecture des chapitres pertinents dans le volume obligatoire. ÉVALUATION DES APPRENTISSAGES Les examens seront en partie objectifs et en partie à développement court. Les examens I et II sont partiels, i.e. ils couvrent la matière des cours 1 à 13 et 14 à 23 respectivement. L'examen III couvre la matière des cours 24 à 34, plus une revue de l'ensemble de la matière du cours. Les examens I et II seront disponibles pour consultation et révision au cours des deux semaines suivant l'examen, selon des périodes de disponibilité qui seront communiquées aux étudiants. Politiques sur les examens Les étudiants qui ont une lettre d'attestation d'accommodations scolaires obtenue auprès d'un conseiller du secteur Accueil et soutien aux étudiants en situation de handicap (ACSESH) doivent rencontrer leur professeur au début de la session afin que des mesures d'accommodation en classe ou lors des évaluations puissent être prévues et planifiés suffisamment à l'avance puis mises en place. Échelle des cotes (cycle 1) Échelle des cotes A+ [ ] A [ ] A- [ ] Réussite B+ [ ] B [ ] B- [ ] Réussite C+ [ ] C [ ] C- [ ] Réussite D+ [ ] D [ ] Réussite E [ ] X Échec Abandon sans échec (dans les délais prévus) Bibliographie 5/8

6 Volumes Obligatoires: MICROBIOLOGIE, 3 e édition, Prescott, L.M., Harley, J.P. Klein, D.A., DeBoeck eds, Cahier de notes, Microbiologie Générale MCB Références Générales en réserve: MICROBIOLOGIE, 2 e édition, Prescott, L.M., Harley, J.P. Klein, D.A., DeBoeck eds, 2003 QW4 P F MICROBIOLOGIE, 1 ere édition, Prescott, L.M., Harley, J.P. Klein, D.A., DeBoeck eds, QW4 P F MICROBIOLOGY, 6 th édition, Prescott, L.M., Harley, J.P. Klein, D.A., McGraw-Hill eds,2004. QW 4 P MICROBIOLOGY, 5t h édition, Prescott, L.M., Harley, J.P. Klein, D.A., McGraw-Hill eds,2002. QW 4 P MICROBIOLOGY, Prescott, L.M., Harlein, J.P. Klein, D.A., Brown eds,1999. QW4 P MICROBIOLOGY: Concepts and Applications Pelczar, Chan et Krieg, McGraw-Hill, QW4 P MICROBIOLOGIE GÉNÉRALE, Regnault J.P., Décarie Vigot eds., 1ere ed., 1990 QW 4 R /8

7 MICROBIOLOGY - PRINCIPLES AND APPLICATIONS,J.G. Black, Prentice Hall eds., 2e ed., QW4 C MICROBIOLOGY - FUNDAMENTALS AND APPLICATIONS, Atlas, R.M., 1995, QW 4 A881p THE MICROBIAL WORLD, Stanier, Adelberg and Ingraham, 5th ed., Prentice-Hall, 1986 QW 4 M BIOLOGY OF MICROORGANISMS, Brock, T.D., Madigan, M.T. Martinko, J.M., Parker, J. 7th ed., Prentice-Hall, QW4 B864b 1994 BERGEY'S MANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY, 9e ed. N.R. Krieg et J.G. Holt eds William & Wilkins, Baltimore, 1993 QW 4 B DIFCO MANUAL : dehydrated culture media and reagents for microbiology, 11 e ed. QW 25 D Politique sur l'utilisation d'appareils électroniques pendant une séance d'évaluation L'utilisation d'appareils électroniques (cellulaire ou autre appareil téléphonique sans fil, pagette, baladeur, agenda électronique, etc.) est interdite au cours d'une séance d'évaluation et de toute autre activité durant laquelle l'enseignant l'interdit. De plus, seuls certains modèles de calculatrices sont autorisés durant les séances d'évaluation. Pour l'année , les modèles suivants sont autorisés : Hewlett Packard HP 20S, HP 30S, HP 32S2, HP 33S, HP 35S Texas Instrument TI-30Xa, TI-30XIIB, TI-30XIIS, TI-36X, BA35 Sharp EL-531*, EL-546*, EL-520* Casio FX-260, FX-300 MS, FX-300W Plus, FX-991MS, FX-991ES * Calculatrices Sharp: sans considération pour les lettres qui suivent le numéro Dans tous ces cas, la calculatrice doit être validée par une vignette autocollante émise par la COOP 7/8

8 étudiante ZONE. Information spécifique aux étudiants de l'école d'actuariat Les calculatrices autorisées lors des examens sont uniquement les modèles répondant aux normes de la Society of Actuaries et de la Casualty Actuarial Society pour leurs examens, soit les modèles Texas Instruments suivants : BA-35 (solaire ou à pile) BA II Plus BA II Plus Professional TI-30Xa TI-30X II (IIS ou IIB) TI-30X MultiView (XS ou XB) Politique sur le plagiat et la fraude académique Règles disciplinaires Tout étudiant qui commet une infraction au Règlement disciplinaire à l'intention des étudiants de l'université Laval dans le cadre du présent cours, notamment en matière de plagiat, est passible des sanctions qui sont prévues dans ce règlement. Il est très important pour tout étudiant de prendre connaissance des articles 28 à 32 du Règlement disciplinaire. Celui-ci peut être consulté à l'adresse suivante: Plagiat Tout étudiant est tenu de respecter les règles relatives au plagiat. Constitue notamment du plagiat le fait de: i) copier textuellement un ou plusieurs passages provenant d'un ouvrage sous format papier ou électronique sans mettre ces passages entre guillemets et sans en mentionner la source; ii) résumer l'idée originale d'un auteur en l'exprimant dans ses propres mots (paraphraser) sans en mentionner la source; iii) traduire partiellement ou totalement un texte sans en mentionner la provenance; iv) remettre un travail copié d'un autre étudiant (avec ou sans l'accord de cet autre étudiant); v) remettre un travail téléchargé d'un site d'achat ou d'échange de travaux scolaires. 8/8

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