Recherche et bibliographie

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1 Recherche et bibliographie Université Pierreet-Marie-Curie

2 Les quatre étapes de la démarche documentaire Formuler les questions : synonymes, Indexation mots-clés (fr et angl), métatermes Choisir ses sources : Livres? Thèses? Review? Essais cliniques? Articles en libre accès? Français? Anglais? Conférences? Résumé? Peer review? Evaluer les résultats : suite à la 1 ere recherche > Préciser / élargir les termes (bruit / silence) Citer les documents

3 Le site de la BUPMC Accès aux catalogues Accès identifiés UPMC aux BDD, e-books et e-revues Guides de recherche

4 Elaborer une stratégie de recherche

5 1. Les catalogues

6 La recherche sur le catalogue Une recherche avancée pour travailler sur un sujet : Utiliser l indexation (mots-sujets) Combiner et cibler des éléments (ET, OU, SAUF) Une recherche simple pour retrouver une référence Astuces : La troncature : $ Titre des revues, (pas titre des articles)

7 Catalogue de la BUPMC

8 Le catalogue de la BUPMC

9 Le catalogue SUper : Sorbonne Université

10 Le SUDOC

11 Le SUDOC, catalogue national de toutes les BU

12 Exercices d application Dans le catalogue de l UPMC : combien de document sur le «Sujet» : «grossesse à haut risque»? Faites la même recherche dans le SUDOC ( : combien de résultats? dans «la recherche avancée» trouver le filtre «localisation» et choisissez le [75] combien de résultats? Et dans SUper

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14 Accès hors UPMC : passer par le site de la BUPMC

15 Trouver des revues, journaux, articles

16 Trouver des revues, journaux, articles 1/ Je veux accéder au texte intégral d un article d une revue dont je connais le titre 2/ Je veux faire une recherche thématique sur différentes revues Catalogue BUPMC (revues imprimées) Ressources en ligne (@revues) Bases de données texte intégral Bases de données bibliographiques

17 2/ Je veux faire une recherche thématique sur différentes revues

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19 / MedLine PubMed = interface de consultation de Medline (90% des références) Medline = données bibliographiques 23,5 millions de références d articles, revues, depuis les années Depuis Base gérée et mise à jour par la NLM et le NIH (National Institute of Health) 19

20 Une centaine de titres français DONC l interrogation se fait TOUJOURS EN ANGLAIS Savoir si une revue est dans PubMed : Source : 20

21 Quels journaux d obstétrique dans Medline?

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23 BUPMC - Ressources en ligne PubMed

24 PubMed-UPMC PubMed est accessible gratuitement sur Internet mais PubMed-UPMC, accessible depuis le site de la BUPMC et sur vous permet d afficher le bouton SFX (résolveur de liens) de l UPMC

25 Liste de résultats PubMed-UPMC Le mode d affichage Abstract permet d afficher dès la liste de résultats le bouton SFX

26 L indexation MESH MEdical Subject Heading = Mot-sujet médicaux

27 PubMed : pourquoi le MeSH? MeSH = Medical Subject Headings Ajoutés sur les articles de la base Medline par les documentalistes de la NLM. Recherchez dans Pubmed les termes suivants : «Dystocie» : combien de résultats? «Dystocia» : combien de résultats? Dystocia/surgery[Majr] : combien de résultats? 27

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29 Qu est-ce que le MeSH? - Plus de termes, hiérarchisés entre eux, répartis en 16 grandes catégories - Mise à jour annuelle - Traduction française par l INSERM récupérable Via le Cismef 29

30 PubMed : pourquoi le Mesh? MeSH : gère les synonymes (Trisomy 21 = Down Syndrome = Mongolism) pas la revue Cell ou du docteur Cell mais sur le sujet «cellule» Possibilité de travailler que sur un aspect : Dystocia/surgery[Majr] = recherche sur les articles dont le sujet principal Mesh concerne la dystocie dans ses aspects chirurgicaux

31 Un même terme peut appartenir à plusieurs arborescences 31

32 Les qualificatifs du MeSH Le MeSH comprend 83 qualificatifs Chaque mot-clef du MeSH ne peut être associé qu avec certains nombre de qualificatifs (variables) AB AD AE AG AA AN AH AI BI BS BL CF CS CI CH CL CO CN CT CY DF DI DU DH DE DT EC ED Abnormalities Administration and Dosage Adverse Effects Agonists Analogs and Derivatives Analysis Anatomy and Histology Antagonists and Inhibitors Biosynthesis Blood Supply Blood Cerebrospinal Fluid Chemical Synthesis Chemically Induced Chemistry Classification Complications Congenital Contraindications Cytology Deficiency Diagnosis Diagnostic Use Diet Therapy Drug Effects Drug Therapy Economics Education EM EN EP ES EH ET GE GD HI IM IN IR IS IP LJ MA ME MT MI MO NU OG PS PY PA PK PD PH Embryology Enzymology Epidemiology Ethics Ethnology Etiology Genetics Growth and Development History Immunology Injuries Innervation Instrumentation Isolation and Purification Legislation and Jurisprudence Manpower Metabolism Methods Microbiology Mortality Nursing Organization and Administration Parasitology Pathogenicity Pathology Pharmacokinetics Pharmacology Physiology PP PO PC PX RE RA RI RT RH SC SE ST SN SD SU TU TH TO TM TR TD US UL UR UT VE VI Physiopathology Poisoning Prevention and Control Psychology Radiation Effects Radiography Radionuclide Imaging Radiotherapy Rehabilitation Secondary Secretion Standards Statistics and Numerical Data Supply and Distribution Surgery Therapeutic Use Therapy Toxicity Transmission Transplantation Trends Ultrasonography Ultrastructure Urine Utilization Veterinary Virology 32

33 Le MeSH est accessible via PubMed 33

34 Le MeSH est aussi accessible via «HeTop» sur le site Cismef 34

35 Exercice Rendez-vous sur et consultez dans le «Portail Terminologique de Santé HeTOP» en bas le terme utilisé dans l indexation MESH de PubMed pour : La grossesse précoce L accouchement avant terme Infection nosocomiale Grossesse extra-utérine

36 Cismef : Traduction du Mesh et détails

37 Arborescence du Mesh

38 Major Pas les articles indexés sous la hiérarchie de ce terme

39 Rechercher dans PubMed Étape 1 : trouver le mot-clef de départ en français Étape 2 : choix des qualificatifs (subheadings) Étape 3 : soit on lance directement la recherche dans PubMed ; soit on souhaite combiner des concepts > retour à l étape 1 ; la combinaison se fait sur PubMed, le Cismef ne le permet pas.

40 Recherche MeSH à partir de l interface Pubmed OU

41 Détail d un terme MeSH Terme et champ d application Qualificatifs possibles Explosion et pondération Permettent de préciser la recherche Synonymes Termes associés Hiérarchie

42 Choix du qualificatif et construction de la requête 42

43 Combinaison avec un autre terme PubMed retient l historique de votre recherche 43

44 Changer d affichage Par défaut : Summary = auteurs + titre + PMID + niveau d indexation Abstract : résumé + lien vers PDF MEDLINE : export vers bibliographie (EndNote, Zotero ) 44

45 Les limites / Filtres additionnels Revue systématique, essai clinique Disponibilité du texte intégral Date de publication D autres paramètres comme la langue, les tranches d âges visées, etc. 45

46 Accéder aux articles Résolveur de lien accès ou non au texte intégral 46

47 Résolveur de lien UPMC

48 Accédez à la version sur le site de l éditeur de la revue où l article est publié

49 Chercher un auteur Rentrer son nom et l initiale de son prénom PubMed comprend qu on cherche une personne 49

50 «Single Citation Matcher» Recherche par auteur / revue / date Pour retrouver une référence d article précise

51 «Single Citation Matcher» Recherche par auteur / revue / date Pour retrouver une référence d article précise 51 Utilisation optimale documentation médicale 51

52 Recherches avancées

53 Exercice sur PubMed Recherchez sur PubMed des review des 5 dernières années sur complications de la grossesse liée au cordon ombilical.

54 Création de compte gratuit : My NCBI Intérêts : Appliquer des filtres automatiques sur les résultats Sauvegarder ses résultats Sauvegarder ses recherches habituelles Créer des alertes (RSS ou courriel) 54

55 Création de compte gratuit : My NCBI 55

56 Création de compte gratuit : My NCBI 56

57 Création de filtres pour les recherches 57

58 On choisit PubMed dans la liste 58

59 On cherche le filtre BUPMC Attention de bien sélectionner «LinkOut» 59

60 Les résultats sont triés Cela permet de n accéder qu au titre dont vous aurez accès au texte intégral (via les abonnements UPMC) 60

61 Alertes et historiques Fil RSS sur une recherche Historique automatique, conservé 8 heures, accessible via la recherche avancée 61

62 Les résultats sont triés JUBIL : articles parus dans des revues accessibles en ligne via JUBIL (7 000 revues) ifrhplib : articles parus dans des revues accessibles via l APHP (300 revues) ifrbinslib: articles parus dans des articles accessibles sur biblioinserm 62

63 Liens vers les PDF Ne fonctionnera que si vous êtes sur un ordinateur de l université ou de l APHP (de l extérieur repasser par l accès distant BUPMC) 63

64 Google scholar

65 Google Scholar Possibilité de pointer vers le résolveur de lien de l UPMC de chez soi : En haut à droite dans l option «Paramètres» > «Lien vers les bibliothèques»

66 Rappel sur les bases de données D autres bases de données sur disponibles via le site de la BUPMC : EM-Premium, qui comprend des revues en français et l EMC (encyclopédie médicochirurgicale) La Cochrane Library : accès à des revues systématique et à de la méta-analyse

67 Rappel sur les bases de données Les bases de revues multidisciplinaires ont aussi des articles sur la médecine ScienceDirect Springer Ovid Web of Knowledge Ainsi que les bases documentaires, celle de la BDSP et du Cismef (Doc cismef)

68 FIN DE LA PREMIERE PARTIE Merci de votre attention