La tumorothèque virtuelle. La tumorothèque virtuelle du canceropôle Nord-Ouest est composée de deux outils informatiques

Transcription

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2 La tumorothèque virtuelle du canceropôle Nord-Ouest est composée de deux outils informatiques Un Système de Gestion de Tumorothèque Un outil de tumorothèque virtuelle

3 Le système de gestion de tumorothèque

4 Le Système de Gestion de Tumorothèque Un système unique pour les établissements du CNO : TD Biobank de Technidata TD Biobank permet une gestion de qualité tout en tenant compte des aspects traçabilité des échantillons et prélèvements TD Biobank permet également d assurer les activités de gestion de collections en respectant les principes d éthique et les impératifs du management de la qualité

5 Le Système de Gestion de Tumorothèque Gestion et suivi des ressources biologiques Traçabilité (du prélèvement jusqu à la cession) Stockage (aide au placement ; réservation de place) Gestion des réseaux et des projets de recherche Requêtes multicritères et génération de courriers

6 Le Système de Gestion de Tumorothèque Information patient Filiation Traçabilité des actions Traçabilité des emplacements de stockage

7 Le Système de Gestion de Tumorothèque Espace de stockage du site courant Réservation de boites pour un protocole, une collection Ouvrir une boite Propriété d une ressource : click droit

8 Le Système de Gestion de Tumorothèque Valorisation des collections Suivi des demandes d échantillons Edition de catalogues Aide pour le retour d information au patient Annotation des collections en lien possible avec le dossier patient (clinique, génétique, généalogique, morphologique )

9 Le Système de Gestion de Tumorothèque Une assurance de qualité Gestion des consentements Gestion des non-conformités Historique des ressources biologiques (donneurs, prélèvements, échantillons, aliquots, produits ) Alertes (gestion des stocks, gestion des demandes)

10 Le Système de Gestion de Tumorothèque Base de données ergonomique à l utilisation intuitive Paramétrable et évolutive Interopérable Aide à la saisie (listes déroulantes, thésaurus ) Génération de requêtes

11 Le Système de Gestion de Tumorothèque Valorisation de l information médicale Modeleur de fiche d annotations biocliniques

12 Le Système de Gestion de Tumorothèque Sélection et mixage de requêtes Choix des critères de requête Choix des variables à exporter Prévisualisation des résultats Barre de statut

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14 La Tumorothèque Virtuelle est un catalogue consultable sur Internet et qui regroupe sous un format commun, définit par l INCa, des collections d'échantillons biologiques provenant de patients atteints de cancer, permettant ainsi aux chercheurs d identifier des groupes d échantillons homogènes pour la réalisation de projets scientifiques en cancérologie

15 La Tumorothèque Virtuelle repose sur les dernières technologies web ainsi qu une base de données Oracle

16 La description de l échantillon (et sa recherche) s appuie sur la classification internationale de l OMS - CIM 10 - CIM O et la classification française ADICAP

17 Deux modes d accès sont proposés aux utilisateurs : Une recherche utilisant la Classification Internationale des Maladies de l OMS La recherche multicritères est composée de formulaires d interrogations sur l intégralité des items du catalogue de l INCa (personnalisable par le super administrateur). Les classifications CIM- 10, CIM-O et ADICAP pourront être utilisées dans cette recherche

18 La recherche par arborescence de la classification CIM10 consiste à naviguer dans les chapitres et sous-chapitres de la classification, avec pour chaque niveau le nombre de prélèvements correspondants dans la base Un graphique est généré dynamiquement pour afficher la répartition des prélèvements au sein des différents chapitres Pour cette recherche le diagnostic principal est utilisé

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20 Une recherche multicritères Ce dernier type de requête est basé sur un moteur de recherche intuitif et rapide qui permet aux chercheurs de sélectionner parmi les ressources biologiques disponibles des échantillons répondant à des critères médicaux (type de cancer, taille de la tumeur ) pour ensuite en faire la demande auprès des sites possédant les prélèvements recherchés

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22 Caractéristiques de la solution Fusion des données d'import dans une même base de données (Oracle) Accès Internet (Internet Explorer, Mozilla) Accès sécurisé (type HTTPS/SSL) pour l'import et les fonctions de gestion

23 Proposition de différents profils de connexion : connexion publique connexion authentifiée (utilisateur simple, utilisateur simple avec droit d import, administrateur d établissement, super administrateur)

24 Accès hautement sécurisé : Identification des utilisateurs par tumorothèque Affectation des rôles des utilisateurs en fonction de leur groupe et de leur responsabilité Cryptage des NIP pour un total anonymat des NIP sur le serveur. Procédures d import et d export de données pour les différents établissements Multi langue (anglais et français)

25 Retrouver la TVCNO dès cet été à l adresse suivante :