Durée i1 24 h. TD 24 h Semestre 3 Objectifs. Savoir présenter un rapport de travail en anglais et commenter le déroulement d une expérimentation.

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1 SOM3AG23 scientifique 2 Le semestre 3 et 4 Maquette enseignements Intitulé ECTS Coeff. CM TD TP scientifique Biostatistiques Synthèse documentaire et projet stage Filières professionnelles Immunologie Thérapies innovantes Bioimagerie Ateliers technologiques Aspects génétiques pathologies Aspects stucturaux pathologies Option BMC (6 ECTS) Option TBI (6 ECTS) Techniques expérimentales Biotechnologies végétales Semestre 4 Stage Détail enseignements TD 24 h Savoir présenter un rapport travail en anglais et commenter le déroulement d une expérimentation. SOM3BO01 Maîtrise métho spécialisées la statistique couramment utilisées dans les Sciences la vie. Initiation à la modélisation. Responsable Lupka Mihajlovska Bon niveau d ordre général pratique, orale et écrite, assez bonne connaissance la langue spécifique son domaine scientifique et technique. Faire un bilan du stage l année passée et résumer les visites d entreprises en anglais. Commenter le déroulement d un atelier technologique en anglais. Se préparer à entretiens en anglais pour une embauche (thèse ou poste R&D). : DM + 15 min Oral + 1h30 Secon session : RNE et RSE : CT 1h30 Première session : 50% + Oral 50% Secon session : 100% Biostatistiques 2 : Modèle linéaire et analyses multivariées Responsable Franck Brignolas UE Biométrie licence 3 (ou équivalent) et master 1. Intérêts du modèle linéaire : modèles et sous-modèles, métho d estimations paramètres du modèle linéaire. - Modèles linéaires ne comportant que facteurs (ANOVA) : tests, interprétations et comparaisons multiples moyennes ; - Modèles linéaires ne comportant que régresseurs : tests, interprétations, choix régresseurs ; - Modèles linéaires combinant facteurs et régresseurs ; - Analyses factorielles (analyse en composantes principales, analyse factorielle correspondances, analyse discriminante). Première session : RNE et RSE : CT 1h Secon session : RNE et RSE : CT 1h Secon session : 100% 25 26

2 SOM3PJ02 Synthèse documentaire/bibliographique et projet stage SOM3BO02 Immunologie 3 Aptitu à situer son travail dans un contexte scientifique et à définir un programme recherche ; maîtrise l exposé oral et écrit, en français et en anglais. Responsables Chantal Pichon Steeve Thany Travail en liaison avec le maître stage du semestre 4 : Réalisation d une synthèse bibliographique ou documentaire situant le sujet du stage longue durée dans les programmes l équipe d accueil et le contexte international, et débouchant sur l élaboration du projet recherche/travail l étudiant. Oral Coefficient 2 ECTS 2 Première session : RNE et RSE : Oral Secon session : RNE et RSE : pas secon session Première session : Oral 100% Découvrir les nouveaux concepts en immunologie et les métho expérimentales utilisées pour analyser et influencer les réponses immunitaires. Responsable François Erard Notions d immunologie cellulaire et moléculaire. Divers aspects l immunologie cellulaire et moléculaire sont abordés sur la base d enseignements réalisés essentiellement sous forme conférences. Les intervenants sont chercheurs spécialisés dans diverses thématiques. Seront abordés les mo régulation et dérégulation du système immunitaire, les mécanismes défense et tolérance aux contacts microorganismes et signaux dangers... Première session : RNE et RSE : CT 1h Secon session : RNE et RSE : CT 1h Secon session : 100% SOM3BO03 Thérapies innovantes Responsable Chantal Pichon SOM3IP00 Durée i1 12 h Cours 12 h Filières professionnelles Responsable En attente non communiqué Coefficient 2 ECTS 2 Acquérir approfondies sur les nouvelles thérapies. Cycles conférences recherche. Première session : RNE et RSE : CT 1h 27 28

3 SOM3BO04 Bioimagerie Ateliers technologiques Bioingénierie moléculaire Responsable Chantal Pichon Responsable Richard Daniellou Maîtriser les nouvelles technologies d imagerie cellulaire et l imagerie in-vivo. Acquérir d analyse pour l évaluation qualitative et quantitative mécanismes cellulaires et du matériel biologique. Notions bases en biochimie, biologie moléculaire, biologie cellulaire et immunologie. Application la microscopie fluorescence dans la recherche fondamentale et biomédicale Microscopie confocale fluorescence mono et multiphotons,. F- (FRAP, FRET, FLIM, FCS et SPT) ; imagerie en temps réel, imagerie spectrale, TIRF. Imagerie in vivo : basée sur les Rayons-X (radiographie, tomonsitometrie) ; Imagerie radioisotopique (scintigraphie, tomographie à émission positon. Imagerie Optique (bioluminescence, fluorescence dans le champ visible et proche infra-rouge) ; Imagerie par résonnance magnétique, Imagerie par ultra-sons. Première session : RNE et RSE : CT 1h Maitriser les et l ADN recombinant : la séquence du gène à la fonction la protéine. Connaissance la biochimie, la biologie moléculaire et l enzymologie. Le génie génétique comme outil morne pour l amélioration biocatalyseurs Transformation d une enzyme hydrolytique en un outil performant synthèse - Applications dans les biotechnologies blanches. Exploiter et comparer différentes métho non virales pour transférer l ADN plasmidique ; production d une lignée génétiquement modifiée et validation la transformation. Ateliers technologiques Méthodologie Transfert gènes et Bioingéniérie cellulaire Responsable Patrick Baril Connaissance la biochimie et la biologie moléculaire. Acquérir la connaissance et maitrise utilisées en transfert gènes. Les expériences réalisées concerneront l exploitation vecteurs chimiques et métho physiques (électroporation et nucléofection) ; transformation d une lignée cellulaire et imagerie cellulaire. Connaissances et maîtrises mornes l approche génétique et génomique : l anomalie chromosomique à l intification séquences cibles. Ateliers technologiques Analyse génomique fonctionnelle Responsables Martine Decoville Arnaud Menuet ChIP : Immunoprécipitation la chromatine pontée. Cet atelier vise à initier les étudiants à nouvelles approches pour mettre en évince les sites fixation d un facteur transcription, protéines chromatiniennes, les modifications épigénétiques. Les différentes étapes du ChIP seront abordées avec leurs problèmes. FISH : De la cytogénétique conventionnelle à l approche génomique : cet atelier concernera la mise en œuvre d une analyse génétique du caryotype à l approche génomique

4 SOM3BO06 Aspects génétiques pathologies SOM3BO09 Biotechnologie végétale Option Biologie Moléculaire et Cellulaire Option Techniques Bio-Industrielles Acquérir approfondies sur problématiques recherche utilisant une approche génétique. SOM3BO07 Responsable Martine Decoville Notions bases en génétique et biologie moléculaire. Conférences recherche portant sur les applications la génétique dans différents domaines la biologie. Les principales thématiques abordées sont : l épigénétique, l utilisation outils génétiques (exemples : le système Cre/lox pour la bio-mimagerie, UAS/Gal4 et l IRM....), la génétique humaine, la génomique et transcriptomique. Le contenu peut varier d une année sur l autre pour être au plus près rniers résultats la recherche dans le domaine. Première session : RNE et RSE : CT 1h Aspects structuraux pathologies Option Biologie Moléculaire et Cellulaire Cours 8 h TD 4 h TP 12 h cquisition théoriques et savoir-faire technologiques nécessaires à la mise en œuvre d un protocole transformation génétique visant à la régénération plantes transgéniques. SOM3CH01 Responsables Stéphane Maury Eric Lainé les principales transgénèse végétale (Agrobacterium tumefaciens, métho directes par électroporation ou biolistique), applications à l amélioration plantes et à la production molécules d intérêt industriel, stratégies (gènes homologues ou hétérologues, sens antisens RNAi cosuppression, unigènes, multigènes, types caractères introduits : agronomiques, qualitatifs, molecular Pharming),, et applications la transgénèse végétale). Les plantes OGM dans le mon, Transformation génétique du tabac via Agrobacterium tumefaciens (gène rapporteur gus), mise en évince l expression du gène rapporteur, extraction d ADN et détection d un transgène par PCR. Réalisation transgénèse tabac avec une construction promoteur rapporteur Gus. (confection milieux et solutions, co-culture, repiquage, observation, test X gluc). /TP Première session : RNE et RSE : CT 2h + CT Oral + CC TP Secon session : RNE et RSE : CT (2h + 2h TP) Première session : 40% + Oral 20% + TP 40% Secon session : 50% + TP 50% Techniques analyse chimique : applications instrumentales Responsable Rachid Rahmouni Option Techniques Bio-Industrielles Acquérir une connaissance approfondie mécanismes moléculaires par lesquels les machineries cellulaires performent les fonctions biologiques. Notions base en biochimie, biologie moléculaire et génétique moléculaire. Etu gran fonctions biologiques la cellule et mécanismes moléculaires à la base leurs régulations : réplication et réparation l ADN, transcription et régulation l expression génique, régulations post-transcriptionnelles et export ARNs messagers. Implication différentes régulations fonctions biologiques dans les dysfonctionnements cellulaires à l origine pathologies. Première session : RNE et RSE : CT 1h Cours 12 h TP 12 h Acquérir les compétences théoriques et en analyse chimique. Responsables Emilie Destandau Caroline West Techniques base chimie analytique. Approche théorique et pratiquemétho chromatographiques : chromatographie d échange d ions, chromatographie paires d ions. Electrophorèse capillaire. Traitement l échantillon. Couplages métho chromatographiques et la spectrométrie masse.travaux Pratiques : métho séparatives (GC, HPLC, HPTLC), métho spectrales (IR, UV, SM) et traitement l échantillon (ASE, SPME). /TP Première session : RNE et RSE : CT 1h30 + Rapport TP Secon session : RNE et RSE : CT 1h30 Première session : 50% + TP 50% Secon session : 100% 31 32

5 SOM4ST02 Semestre 4 Initiation à la recherche dans les domaines la spécialité ; Mettre les étudiants en contact avec le mon professionnel par la pratique d une activité scientifique au sein d un laboratoire (public ou privé). Stage - Spécialité BBMB Responsables Chantal Pichon Daniel Hagège Unité SOM3PJ02 "Synthèse bibliographique et projet recherche". Stage recherche 4,5 mois dans un laboratoire (labo + terrain) ou en entreprise, dans les domaines spécialités : réalisation d un petit programme recherche ( l hypothèse à l interprétation). 0 0 Première session : RNE et RSE : Secon session : Pas secon session 33

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