Plateforme Transcriptome Végétale
|
|
|
- Amélie Crevier
- il y a 8 ans
- Total affichages :
Transcription
1 Plateforme Transcriptome Végétale INRA- Unité de Recherche en Génomique Végétale Journée «Plateformes Génopole», 25 juin Sandrine Balzergue,
2 Analyse quan8ta8ve de l expression des RNA de chaque gène.d une plante en8ère, d un 8ssu, d un organe, d une cellule ExtracRons des ARN totaux Comparaison starsrque de la quanrté respecrve des ARNm de chaque gène (perts ARN, ARN non codant ) Puce à ADN (hybridaron) Séquençage (NGS) Q- RT- PCR
3 Log2 Intensité moyenne Conseiller les collaborateurs et réaliser les expérimenta8ons sur des projets rela8fs à l analyse de l expression des gènes chez Arabidopsis et les plantes cul8vées. Choix méthodes transcriptomique Design experimental Library/Sequencing /Hybridizations Analyses statistiques Extrait de résultats : cinétique de culture de protoplastes P-Value Expertise/aide à l interprétation des résultats E I M V exon intron multiple virtual G good P primer dimers D B F double band blank wrong size ,E-08 5,E-02 ###### Log2 Ratio -2,5-1,5-1 non diff 1 1,5 2,5 0,00 pr0h pr0h pr0h pr0h pr24h pr24h pr24h pr24h pr48h pr48h pr48h pr48h pr96h pr96h pr96h pr96h plant IV plant IV plant IV plant IV pr0h pr0h pr0h pr0h pr24h pr24h pr24h pr24h pr48h pr48h pr48h pr48h ID Spec PCR_Result At1 1fonction 1Mol FoGO 1CellCompGO1BioProcGO Ired Igreen Rat Pval Ired Igreen Rat Pval Ired Igreen Rat Pval Ired Igreen Rat Pval CATMA5A50147 M1 G AT5G54280 myosin heavy chain, putative motor activity myosin No classification 8,00 14,03-6,03 0,00E+00 9,17 7,80 1,37 0,00E+00 10,71 10,71 0,00 1,00E+00 9,67 11,52-1,86 0,00E+00 CATMA1A30400 E1 G AT1G32060 phosphoribulokinase (PRK) phosphoribulokinase / phosphopentokinase chloroplast activity biosynthesis 8,38 13,82-5,44 0,00E+00 8,45 7,35 1,10 0,00E+00 11,65 10,91 0,74 1,57E-03 9,51 11,75-2,24 0,00E+00 CATMA2A05190 M1 G AT2G06520 membrane protein, putative molecular_function chloroplast unknown No classification 9,27 14,60-5,33 0,00E+00 11,41 9,56 1,84 0,00E+00 12,81 12,81 0,00 1,00E+00 12,82 12,82 0,00 1,00E+00 CATMA1A03520 E1 G AT1G04680 pectate lyase family protein pectate lyase activity endomembrane No system classification 7,35 9,20-1,85 No 6,62 6,62 0,00 1,71E-01 9,32 7,97 1,34 0,00E+00 12,54 10,46 2,07 0,00E+00 CATMA5A44810 E2 G AT5G48900 pectate lyase family protein pectate lyase activity endomembrane No system classification 7,35 9,20-1,85 0,00E+00 6,30 6,30 0,00 1,00E+00 7,21 7,21 0,00 1,00E+00 8,95 7,73 1,21 1,11E-11 CATMA3A17460 E1 G AT3G18000 phosphoethanolamine N-methyltransferase phosphoethanolamine No 1 classification / PEAMT N-methyltransferase 1 acetate (NMT1) biosynthesis activity from 7,48carbon 9,32 monoxide -1,84 0,00E+00 6,27 6,27 0,00 1,00E+00 8,09 8,09 0,00 1,00E+00 11,62 8,66 2,97 0,00E+00 CATMA1A01130 E1 G AT1G02130 Ras-related protein (ARA-5) GTP / small binding GTP-binding endomembrane protein, regulation putative system of transcription, 11,19DNA-dependent 0,00 1,00E+00 9,38 9,38 0,00 1,00E+00 11,89 11,89 0,00 1,00E+00 11,91 11,91 0,00 1,00E+00 CATMA1A01140 E1 G AT1G02140 mago nashi family protein No classification nucleus sex determination 8,71 8,71 0,00 1,00E+00 8,00 8,00 0,00 1,00E+00 9,39 9,39 0,00 1,00E+00 10,18 10,18 0,00 1,00E+00 CATMA1A05970 E1 G AT1G06910 myb family transcription factor transcription factor nucleus activity No classification 7,09 7,09 0,00 1,00E+00 5,89 5,89 0,00 1,00E+00 6,78 6,78 0,00 1,00E+00 7,10 7,10 0,00 1,00E+00 CATMA1A05980 E1 G AT1G06920 ovate family protein molecular_function mitochondrion unknown No classification 7,15 7,15 0,00 1,00E+00 6,06 6,06 0,00 1,00E+00 6,96 6,96 0,00 1,00E+00 7,29 7,29 0,00 1,00E+00 CATMA3A01030 E2 G AT3G02040 glycerophosphoryl diester glycerophosphodiester phosphodiesterase chloroplast family phosphodiesterase protein glycerol metabolism activity 11,56 10,15 1,41 0,00E+00 8,25 10,81-2,56 0,00E+00 10,17 10,17 0,00 1,00E+00 10,09 10,09 0,00 1,00E+00 CATMA4A37505 M2 G AT4G35860 Ras-related GTP-binding GTP protein, binding putative No classification regulation of transcription, 9,45DNA-dependent 8,04 1,41 0,00E+00 8,03 8,73-0,70 5,77E-04 9,25 9,25 0,00 1,00E+00 9,39 9,39 0,00 1,00E+00 CATMA3A11740 E1 G AT3G12770 pentatricopeptide (PPR) repeat-containing electron transporter cellular_component protein activity electron unknown transport 9,56 8,15 1,41 0,00E+00 7,86 8,77-0,92 6,52E-09 9,00 9,00 0,00 1,00E+00 9,32 9,32 0,00 1,00E+00 CATMA1A17615 E1 G AT1G18570 myb family transcription factor transcription (MYB51) factor nucleus activity regulation of transcription, 8,71DNA-dependent 7,30 1,41 0,00E+00 No No $ No 8,31 8,31 0,00 1,00E+00 8,33 8,33 0,00 1,00E+00 CATMA1A36590 E1 G AT1G43160 AP2 domain-containing protein DNA binding RAP2.6 (RAP2.6) nucleus regulation of transcription, 13,41DNA-dependent 7,96 5,44 0,00E+00 9,55 12,45-2,89 0,00E+00 11,53 11,53 0,00 1,00E+00 9,19 11,49-2,30 0,00E+00 CATMA3A28035 E2 G AT3G28210 zinc finger (AN1-like) family molecular_function protein No unknown classification No classification 14,81 8,89 5,92 0,00E+00 12,54 13,58-1,04 0,00E+00 13,42 14,60-1,18 0,00E+00 12,45 14,03-1,58 0,00E+00
4 Nos offres system RNA- seq: Librairies RNA- seq BioinformaRque + Analyses starsrques Illumina HiSeq2000 (IG- CNS) TRU- seq classique TRU- seq stranded specific Small RNA- seq (Assemblage) + mapping+ comptage+analyse differenrelle (Deseq) Life Technologies Ion Proton (ouverture fin 2013) Ion Total RNA- Seq (stranted specific) (Assemblage) + mapping+ comptage+analyse differenrelle (Deseq) Nos offres system Puces à ADN: Espèces AFFYMETRIX NIMBLEGEN AGILENT (ouverture fin 2013) Plantes culrvées (catalogue+custom) Arabidopsis (CATMAv6) Plantes cul8vées Format/densité 1x500K 12x270K 4x180K Arabidopsis (CATMAv7) Plantes culrvées (catalogue + custom) Analyses starsrques gcrma, variance commune, Bonferonni Lowess, Limma Lowess, Limma
5 Quelques chiffres : pourcentage echanrllons 101 publicarons en co- auteurs depuis échanrllons traités par an en moyenne 35 projets par an en moyenne 50,00 40,00 30,00 31,32 48,76 20,00 15,14 10,00 4,78 Notre organisa8on : 0,00 «Fonc8onal Genomic of Arabidopsis», C. Lurin (DR) «plateforme transcriptome» C. Lurin (10%) E. Delannoy (50%) L. Soubigou- Taconnat S. Huguet S. Pateyron (50%) J. Caius (50%) R. Bounon (TR) J. Yansouni (CDD) S. Balzergue «Bioinforma8cs and predic8ve genomics» Team V. Brunaud (30%) J.P. Tamby (20%) G. Rigaill (10%) M.L. MarRn- Magnieme (20%) S. Aubourg (15%)
6 Merci de votre amenron! Contact : Equipe Génomique Fonctionnelle d Arabidopsis Plateforme Analyse Du Transcriptome Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) 2 rue Gaston Crémieux, CP Evry cedex, FRANCE Tel: balzerg@evry.inra.fr hfp://www- urgv.versailles.inra.fr/microarray/index.htm Stand Journée Plateforme Plateforme IBiSA Plateforme Stratégique INRA CerRficaRon norme ISO9001 Janvier 2012 Membre des plateformes de Genopole
Big data et sciences du Vivant L'exemple du séquençage haut débit
Big data et sciences du Vivant L'exemple du séquençage haut débit C. Gaspin, C. Hoede, C. Klopp, D. Laborie, J. Mariette, C. Noirot, MS. Trotard bioinfo@genopole.toulouse.inra.fr INRA - MIAT - Plate-forme
Biomarqueurs en Cancérologie
Biomarqueurs en Cancérologie Définition, détermination, usage Biomarqueurs et Cancer: définition Anomalie(s) quantitative(s) ou qualitative(s) Indicative(s) ou caractéristique(s) d un cancer ou de certaines
CATALOGUE DES PRESTATIONS DE LA
1/23 La plate-forme Biopuces et Séquençage de Strasbourg est équipée des technologies Affymetrix et Agilent pour l étude du transcriptome et du génome sur puces à ADN. SOMMAIRE ANALYSE TRANSCRIPTIONNELLE...
Introduction à la Génomique Fonctionnelle
Introduction à la Génomique Fonctionnelle Cours aux étudiants de BSc Biologie 3ème année Philippe Reymond, MER PLAN DU COURS - Séquençage des génomes - Fabrication de DNA microarrays - Autres méthodes
Les bases de données transcriptionnelles en ligne
Les bases de données transcriptionnelles en ligne Différents concepts en régulation transcriptionnelle sites de fixation - in vitro/vivo? - quelle technique? - degré de confiance? facteur de transcription
Master de Bioinformatique et Biologie des Systèmes Toulouse http://m2pbioinfo.biotoul.fr Responsable : Pr. Gwennaele Fichant
Master de Bioinformatique et Biologie des Systèmes Toulouse http://m2pbioinfo.biotoul.fr Responsable : Pr. Gwennaele Fichant Parcours: Master 1 : Bioinformatique et biologie des Systèmes dans le Master
Hépatite chronique B Moyens thérapeutiques
Hépatite chronique B Moyens thérapeutiques Dr Olfa BAHRI Laboratoire de Virologie Clinique Institut Pasteur de Tunis INTRODUCTION Plus de 300. 10 6 porteurs chroniques de VHB dans le monde Hépatite chronique
Identification des protéines PPR impliquées dans l épissage des ARN messagers dans les chloroplastes et les mitochondries chez Arabidopsis Thaliana.
Ecole doctorale : «Des génomes aux organismes» School of Biomedical, Biomolecular and Chemical Sciences THESE EN COTUTELLE Présentée pour l obtention du grade de DOCTEUR DE L UNIVERSITE D EVRY VAL D ESSONNE
Université d Evry-Val d Essonne Ecole Doctorale des Génomes Aux Organismes. Thèse
Université d Evry-Val d Essonne Ecole Doctorale des Génomes Aux Organismes Thèse Présentée pour obtenir le grade de Docteur en sciences de l université d Evry-Val d Essonne Spécialité Bioinformatique par
GénoToul 2010, Hôtel de Région Midi Pyrénées, Toulouse, 10 décembre 2010
GénoToul 2010, Hôtel de Région Midi Pyrénées, Toulouse, 10 décembre 2010 Analyse de la diversité moléculaire des régions génomiques de 30 gènes du développement méristématique dans une core collection
TD de Biochimie 4 : Coloration.
TD de Biochimie 4 : Coloration. Synthèse de l expérience 2 Les questions posées durant l expérience 2 Exposé sur les méthodes de coloration des molécules : Générique Spécifique Autres Questions Pourquoi
Contrôle de l'expression génétique :
Contrôle de l'expression génétique : Les régulations post-transcriptionnelles L'ARNm, simple intermédiaire entre le génome et les protéines? gène protéine L'ARNm, simple intermédiaire entre le génome et
Introduction, présentation de la plateforme South Green. h"p://southgreen.cirad.fr/
Introduction, présentation de la plateforme South Green. h"p://southgreen.cirad.fr/ SupAgro, Montpellier, 10 février 2014 Le déluge de données NGS Next-generation sequencing Rappel: synthèse de l ADN 5
Gènes Diffusion - EPIC 2010
Gènes Diffusion - EPIC 2010 1. Contexte. 2. Notion de génétique animale. 3. Profil de l équipe plateforme. 4. Type et gestion des données biologiques. 5. Environnement Matériel et Logiciel. 6. Analyses
Dr E. CHEVRET UE2.1 2013-2014. Aperçu général sur l architecture et les fonctions cellulaires
Aperçu général sur l architecture et les fonctions cellulaires I. Introduction II. Les microscopes 1. Le microscope optique 2. Le microscope à fluorescence 3. Le microscope confocal 4. Le microscope électronique
Chapitre 7 : Structure de la cellule Le noyau cellulaire
UE2 : Structure générale de la cellule Chapitre 7 : Structure de la cellule Le noyau cellulaire Professeur Michel SEVE Année universitaire 2010/2011 Université Joseph Fourier de Grenoble - Tous droits
CHAPITRE 3 LA SYNTHESE DES PROTEINES
CHAITRE 3 LA SYNTHESE DES ROTEINES On sait qu un gène détient dans sa séquence nucléotidique, l information permettant la synthèse d un polypeptide. Ce dernier caractérisé par sa séquence d acides aminés
Mise en place de serveurs Galaxy dans le cadre du réseau CATI BBRIC
Mise en place de serveurs Galaxy dans le cadre du réseau CATI BBRIC {Sebastien.Carrere, Ludovic.Legrand,Jerome.Gouzy}@toulouse.inra.fr {Fabrice.Legeai,Anthony.Bretaudeau}@rennes.inra.fr CATI BBRIC 35 bioinformaticiens
Contrôle de l'expression génétique : Les régulations post-transcriptionnelles
Contrôle de l'expression génétique : Les régulations post-transcriptionnelles http://perso.univ-rennes1.fr/serge.hardy/ utilisateur : biochimie mot de passe : 2007 L'ARNm, simple intermédiaire entre le
Génétique et génomique Pierre Martin
Génétique et génomique Pierre Martin Principe de la sélections Repérage des animaux intéressants X Accouplements Programmés Sélection des meilleurs mâles pour la diffusion Index diffusés Indexation simultanée
Réunion des DU de Biogenouest 19 mars 2014
BILAN et PERSPECTIVES 2014-2017: Présentation du rapport d évaluation quadriennale de Biogenouest rendu par les experts extérieurs en janvier 2014. Point sur le bilan et les prospectives 2014-2017 Réunion
Réception du tissus documentation examens sérologiques inspection préparation façonnage
Déroulement du processus Tutoplast Don de tissus accord du patient questionnaire au patient (don vivant) questionnaire aux proches du défunt (don mort) prélèvement du tissus sur le patient (ou en pathologie)
UTILISATION DE LA PLATEFORME WEB D ANALYSE DE DONNÉES GALAXY
UTILISATION DE LA PLATEFORME WEB D ANALYSE DE DONNÉES GALAXY Yvan Le Bras yvan.le_bras@irisa.fr Cyril Monjeaud, Mathieu Bahin, Claudia Hériveau, Olivier Quenez, Olivier Sallou, Aurélien Roult, Olivier
Introduc)on à Ensembl/ Biomart : Par)e pra)que
Introduc)on à Ensembl/ Biomart : Par)e pra)que Stéphanie Le Gras Jean Muller NAVIGUER DANS ENSEMBL : PARTIE PRATIQUE 2 Naviga)on dans Ensembl : Pra)que Exercice 1 1.a. Quelle est la version de l assemblage
Spectrophotomètre double faisceau modèle 6800
Spectrophotomètre double faisceau modèle 6800 Spectrophotomètre double faisceau modèle 6800 Double faisceau avec optiques parfaitement stables. Bande passante 1,5 nm. Logiciel de navigation Jenway Flight
Principe de fonctionnement des batteries au lithium
Principe de fonctionnement des batteries au lithium Université de Pau et des pays de l Adour Institut des Sciences Analytiques et de Physicochimie pour l Environnement et les Matériaux 22 juin 2011 1 /
Y a-t-il une place pour un vaccin thérapeutique contre l hépatite B? H. Fontaine, Unité d Hépatologie Médicale, Hôpital Cochin
Y a-t-il une place pour un vaccin thérapeutique contre l hépatite B? H. Fontaine, Unité d Hépatologie Médicale, Hôpital Cochin Objectifs thérapeutiques Inhibition de la réplication virale Négativation
Cellules procaryotes Service histologie Pr.k.mebarek
Cellules procaryotes Service histologie Pr.k.mebarek I) Les cellules procaryotes II) Les cellules eucaryotes o 1) Caractéristiques générales des cellules eucaryotes o 2) Organisation des cellules eucaryotes
Diagnostic et suivi virologique des hépatites virales B et C. Marie-Laure Chaix Virologie Necker
Diagnostic et suivi virologique des hépatites virales B et C Marie-Laure Chaix Virologie Necker OUTILS DIAGNOSTIQUES VHC Transaminases Recherche des Anticorps! Tests indirects - Anticorps! ELISA! RIBA
Travaux dirigés de Microbiologie Master I Sciences des Génomes et des Organismes Janvier 2015
Andrew Tolonen atolonen@genoscope.cns.fr Travaux dirigés de Microbiologie Master I Sciences des Génomes et des Organismes Janvier 2015 A- Généralités I- La vie sur terre telle que nous la connaissons ne
Ingénieur R&D en bio-informatique
Ingénieur R&D en bio-informatique Spécialisé Bases De Données 33 ans, Célibataire. Biologie & Informatique gabriel.chandesris[at]laposte.net {06 56 41 97 37} Use the bipper! http://gabriel.chandesris.free.fr/
Depuis des milliers de générations, le ver à soie est l objet d une sélection
Production de soie et caractéristiques des glandes séricigènes de 13 races de ver à soie (Bombyx mori) J. M. FAYARD Laboratoire de biométvie, Dépavtement de biologie générale et appliquée Université Claude
La PCR quantitative (qpcr) et le guide de bonnes pratiques MIQE : adaptation et pertinence dans le contexte de la biologie clinique
Synthèse Ann Biol Clin 2014 ; 72 (3) : 265-9 La PCR quantitative (qpcr) et le guide de bonnes pratiques MIQE : adaptation et pertinence dans le contexte de la biologie clinique Quantitative PCR (qpcr)
Les OGM. 5 décembre 2008. Nicole Mounier
Les OGM 5 décembre 2008 Nicole Mounier Université Claude Bernard Lyon 1 CGMC, bâtiment Gregor Mendel 43, boulevard du 11 Novembre 1918 69622 Villeurbanne Cedex OGM Organismes Génétiquement Modifiés Transfert
EXERCICE 2 : SUIVI CINETIQUE D UNE TRANSFORMATION PAR SPECTROPHOTOMETRIE (6 points)
BAC S 2011 LIBAN http://labolycee.org EXERCICE 2 : SUIVI CINETIQUE D UNE TRANSFORMATION PAR SPECTROPHOTOMETRIE (6 points) Les parties A et B sont indépendantes. A : Étude du fonctionnement d un spectrophotomètre
ACIDES BASES. Chap.5 SPIESS
ACIDES BASES «Je ne crois pas que l on me conteste que l acide n ait des pointes Il ne faut que le goûter pour tomber dans ce sentiment car il fait des picotements sur la langue.» Notion d activité et
SÉQUENÇAGE DE TYPE RAD-SEQ, PRÉSENTATION ET TRAITEMENT ANALYTIQUE
SÉQUENÇAGE DE TYPE RAD-SEQ, PRÉSENTATION ET TRAITEMENT ANALYTIQUE Yvan Le Bras 1, Anthony Bretaudeau 1,2, Cyril Monjeaud 1 1 Plateforme GenOuest & CNRS UMR 6074 IRISA-INRIA, Rennes 2 INRA, UMR IGEPP &
Biochimie I. Extraction et quantification de l hexokinase dans Saccharomyces cerevisiae 1. Assistants : Tatjana Schwabe Marcy Taylor Gisèle Dewhurst
Biochimie I Extraction et quantification de l hexokinase dans Saccharomyces cerevisiae 1 Daniel Abegg Sarah Bayat Alexandra Belfanti Assistants : Tatjana Schwabe Marcy Taylor Gisèle Dewhurst Laboratoire
OUTILS DE FINANCEMENT DE L INNOVATION TECHNOLOGIQUE ET DE LA VALORISATION DE LA RECHERCHE
OUTILS DE FINANCEMENT DE L INNOVATION TECHNOLOGIQUE ET DE LA VALORISATION DE LA RECHERCHE Un exemple de Projet PNRI Pr. Ahmed Noureddine HELAL 11 Mars 2015, Hôtel Monastir Center, Monastir Notre Projet
Végétaux Exemples d individus
Végétaux Formation Biologie 2011 2012 Végétaux Exemples d individus Végétaux Embranchement Classification Description Reproduction Mode de vie Exemples d individu Végétaux Règne > Etymologie «Végetaux»
I. La levure Saccharomyces cerevisiae: mode de vie
LES LEVURES UE «levures» -5 avril: généralités (MN Simon) -6 avril: analyse génétique (MN Simon) -6 avril: Cycle cellulaire I: la réplication (E. bailly) -7 avril: Cycle cellulaire II: la mitose (E. Bailly)
BASE. Vous avez alors accès à un ensemble de fonctionnalités explicitées ci-dessous :
BASE BioArray Software Environment (BASE) est une base de données permettant de gérer l importante quantité de données générées par des analyses de bio-puces. BASE gère les informations biologiques, les
Rôle des acides biliaires dans la régulation de l homéostasie du glucose : implication de FXR dans la cellule bêta-pancréatique
Rôle des acides biliaires dans la régulation de l homéostasie du glucose : implication de FXR dans la cellule bêta-pancréatique Tuteur : Anne Muhr-Tailleux cardiovasculaires et diabète (Equipe 1) Institut
Module 5 La maturation de l ARN et le contrôle post-transcriptionnel chez les eucaryotes
Module 5 La maturation de l ARN et le contrôle post-transcriptionnel chez les eucaryotes Où trouver l'information complémentaire? MCB -11, GVII-5, 22, 23. La maturation des ARNm chez les eucaryotes Les
Rapport Scientifique Seine-Aval 3
Rapport Scientifique Seine-Aval 3 Séminaire Seine-Aval 2008 Fiches de synthèse des propositions SA4 THEME 3 : TABLEAU DE BORD ET INDICATEURS OPERATIONNELS PUCES A ADN CHEZ MYTILUS EDULIS - 2005 - Danger
ULBI 101 Biologie Cellulaire L1. Le Système Membranaire Interne
ULBI 101 Biologie Cellulaire L1 Le Système Membranaire Interne De la nécessité d un SMI Le volume augmente comme le cube de la dimension linéaire, alors que la surface n'est augmentée que du carré Une
Logiciel Libre & qualité. Présentation
Logiciel Libre & qualité Alain RENAULT Grégory SERONT Présentation Alain RENAULT Cetic (2001) Responsable des projets Qualité micro-évaluation évaluations OWPL accompagnements en entreprise FUNDP (1998-2001)
Le grand écart de la recherche fondamentale vers l application biomédicale
Le grand écart de la recherche fondamentale vers l application biomédicale Ludger Johannes «Chemical Biology of Membranes and Therapeutic Delivery» unit U1143 INSERM UMR3666 CNRS «Endocytic Trafficking
Plateforme. DArT (Diversity Array Technology) Pierre Mournet
Plateforme DArT (Diversity Array Technology) Pierre Mournet Lundi 8 avril 203 Pourquoi des DArT? Développement rapide et peu onéreux de marqueurs : Pas d information de séquence nécessaire. Pas de pré-requis
Mise en place d une solution automatique de stockage et de visualisation de données de capture des interactions chromatiniennes à l échelle génomique
Rapport de stage de deuxième année de DUT Génie Biologique option Bioinformatique Mise en place d une solution automatique de stockage et de visualisation de données de capture des interactions chromatiniennes
GMIN206 Info. Biologique et Outils bioinformatiques. Elodie Cassan
M Bioinformatique, Connaissances et Données Année 24-25 GMIN206 Info. Biologique et Outils bioinformatiques Banques de données biologiques (3h de Cours +,5h de TD + 4h de TP) Elodie Cassan Anne-Muriel
Formats 3D Critères d utilisation dans les échanges Frédéric CHAMBOLLE PSA Peugeot Citroën Direction des Systèmes d Information
Formats 3D Critères d utilisation dans les échanges Frédéric CHAMBOLLE PSA Peugeot Citroën Direction des Systèmes d Information Atelier Ingénierie GALIA 30 novembre 2010 Introduction Les travaux de ce
Marie Curie Actions Marie Curie Career Integration Grant (CIG) Call: FP7-People-2012-CIG
Marie Curie Actions Marie Curie Career Integration Grant (CIG) Call: FP7-People-2012-CIG Genomerge : role of genome merger and redundancy in plant evolution and adaptation Mathieu ROUSSEAU- GUEUTIN UMR-
Quantification de l AgHBs Pouquoi? Quand?
Quantification de l AgHBs Pouquoi? Quand? Michelle Martinot-Peignoux Service d Hépatologie Hôpital Beaujon Université Paris-Diderot INSERM U-773/CRB3 Clichy-France Plan Introduction Applications Cliniques
Nicolas Géraud CXO dasein interactions. Extraits de l intervention de
Les technologies clés, horizon 2015 Une synthèse de trois rapports de prospective technologique, et une exploration de l imaginaire du public des entretiens de la cité. Extraits de l intervention de Nicolas
DÉFIS DU SÉQUENÇAGE NOUVELLE GÉNÉRATION
DÉFIS DU SÉQUENÇAGE NOUVELLE GÉNÉRATION PRINCIPES DE BASE SUR LES DONNEES ET LE CALCUL HAUTE PERFORMANCE Lois de Gray sur l ingénierie des données 1 : Les calculs scientifiques traitent des volumes considérables
Comment suivre l évolution d une transformation chimique? + S 2 O 8 = I 2 + 2 SO 4
Afin d optimiser leurs procédés, les industries chimiques doivent contrôler le bon déroulement de la réaction de synthèse menant aux espèces voulues. Comment suivre l évolution d une transformation chimique?
document proposé sur le site «Sciences Physiques en BTS» : http://nicole.cortial.net BTS AVA 2015
BT V 2015 (envoyé par Frédéric COTTI - Professeur d Electrotechnique au Lycée Régional La Floride Marseille) Document 1 - Etiquette énergie Partie 1 : Voiture à faible consommation - Une étiquette pour
Le ph, c est c compliqué! Gilbert Bilodeau, agr., M.Sc.
Le ph, c est c pas compliqué! Gilbert Bilodeau, agr., M.Sc. Conseiller en serriculture Des réponses r aux questions C est quoi et pourquoi c est c important? Conséquences d un d débalancementd? Comment
Séquence 2. L expression du patrimoine génétique. Sommaire
Séquence 2 L expression du patrimoine génétique Sommaire 1. La synthèse des protéines 2. Phénotypes, génotypes et environnement Synthèse de la séquence 2 Exercices de la séquence 2 Glossaire des séquences
Eco-système calcul et données
Eco-système calcul et données M. Daydé Dr du Comité d'orientation pour le Calcul Intensif (COCIN) Délégué Scientifique INS2I en charge HPC / Grille / Cloud Calcul / données : un enjeu stratégique Calcul
Luca : à la recherche du plus proche ancêtre commun universel Patrick Forterre, Simonetta Gribaldo, Céline Brochier
MEDECINE/SCIENCES 2005 ; 21 :???-??? > L application des méthodes de la biologie moléculaire à l étude des premières étapes de l évolution a montré que le monde vivant pouvait être divisé en trois domaines
MABioVis. Bio-informatique et la
MABioVis Modèles et Algorithmes pour la Bio-informatique et la Visualisation Visite ENS Cachan 5 janvier 2011 MABioVis G GUY MELANÇON (PR UFR Maths Info / EPI GRAVITE) (là, maintenant) - MABioVis DAVID
Annales du Contrôle National de Qualité des Analyses de Biologie Médicale
Annales du Contrôle National de Qualité des Analyses de Biologie Médicale ARN du virus de l hépatite C : ARN-VHC ARN-VHC 03VHC1 Novembre 2003 Edité : mars 2006 Annales ARN-VHC 03VHC1 1 / 8 ARN-VHC 03VHC1
Mise en place d une plateforme de gestion de matériels biologiques : quels avantages pour les chercheurs?
Mise en place d une plateforme de gestion de matériels biologiques : quels avantages pour les chercheurs? Dr Xavier Manival, Laboratoire IMoPA, CR, CNRS Françoise Tisserand-Bedri, Documentaliste, Inist-CNRS
Galaxy Training days. Liste des sessions disponibles : http://bioinfo.genotoul.fr. Les formateurs :
-- 1 -- Galaxy Training days Durée / Programme : 3 journées. Galaxy : First step. Galaxy : Reads alignment and SNP calling. Galaxy : RNAseq alignment and transcripts assemblies. Public : Personnes souhaitant
Présentation d une offre harmonisée de Numéros Courts Mobiles pour SVA au niveau de la sous-région Afrique Centrale
Présentation d une offre harmonisée de Numéros Courts Mobiles pour SVA au niveau de la sous-région Afrique Centrale par : Dr. Ing. Pierre-F. KAMANOU Directeur Général GTS AFRICA Douala, le 31 Octobre 2008
Suivi d une réaction lente par chromatographie
TS Activité Chapitre 8 Cinétique chimique Suivi d une réaction lente par chromatographie Objectifs : Analyser un protocole expérimental de synthèse chimique Analyser un chromatogramme pour mettre en évidence
ELUCIDATION OF THE METABOLIC NETWORK TOPOLOGY IN METHYLOBACTERIUM EXTORQUENS AM1 AND ITS OPERATION UNDER PURE AND MIXED SUBSTRATE CONDITIONS
Diss. ETH N 19955 ELUCIDATION OF THE METABOLIC NETWORK TOPOLOGY IN METHYLOBACTERIUM EXTORQUENS AM1 AND ITS OPERATION UNDER PURE AND MIXED SUBSTRATE CONDITIONS DISSERTATION Submitted to ETH ZURICH For the
PLATE-FORME DE MICROSCOPIE ÉLECTRONIQUE À TRANSMISSION
PLATE-FORME DE MICROSCOPIE ÉLECTRONIQUE À TRANSMISSION Dr. Mohamed SENNOUR Responsable de la plate-forme JOURNÉE PLATES-FORMES EVRY, GÉNOCENTRE 25 juin 2013 Contexte et historique 2000 : constitution du
Imagerie de la paroi
Imagerie de la paroi immunohistochimie des polysaccharides de paroi chez les végétaux Cécile Hervé UMR8227, Roscoff Atelier GlycoOuest, Interactions sucres-protéines 14-18 Avril 2014, Roscoff I. Sondes
SERVICES DE SEQUENÇAGE
MARCH 16, 2014 SERVICES DE SEQUENÇAGE Centre d innovation Génome Québec et Université McGill Services de Validation et détection de SNP Technologie de Séquençage de Nouvelle Génération Guide de l utilisateur
The new consumables catalogue from Medisoft is now updated. Please discover this full overview of all our consumables available to you.
General information 120426_CCD_EN_FR Dear Partner, The new consumables catalogue from Medisoft is now updated. Please discover this full overview of all our consumables available to you. To assist navigation
N Objet Montant Plafond
PRIME ÉNERGIE B5 TOITURE VERTE (décision du 14 juillet 2011 du Gouvernement de la Région de Bruxelles-Capitale d approbation du programme triennal d utilisation rationnelle de l électricité et du gaz au
Réunion du réseau de génétique du Département EFPA
17 19 novembre 2014 Centre INRA de Nancy Lorraine Programme Lundi 17 novembre Salle Tilleul 13:00 Bus pour l'inra depuis la gare de Nancy 14:00 14:30 Introduction de la réunion tour de table 14:30 14:45
Analyse d échantillons alimentaires pour la présence d organismes génétiquement modifiés
Analyse d échantillons alimentaires pour la présence d organismes génétiquement modifiés Module 4 Extraction et purification de l ADN M. Somma WORLD HEALTH ORGANIZATION REGIONAL OFFICE FOR EUROPE ORGANISATION
présentée DEVANT L UNIVERSITÉ DE RENNES 1 pour obtenir le grade de : DOCTEUR DE L UNIVERSITÉ DE RENNES 1 PAR Emilie GUÉRIN TITRE DE LA THÈSE :
N Ordre de la Thèse 3282 THÈSE présentée DEVANT L UNIVERSITÉ DE RENNES 1 pour obtenir le grade de : DOCTEUR DE L UNIVERSITÉ DE RENNES 1 Mention : BIOLOGIE PAR Emilie GUÉRIN Équipe d accueil : École Doctorale
ANTICORPS POLYCLONAUX ANTI IMMUNOGLOBULINES
L OUTIL IDEAL POUR TOUTES LES DETECTIONS IMMUNOCHIMIQUES pour toutes les techniques immunodosages (EIA/ELISA) dot/ westernblot immunohistochimie immunocytochimie cytométrie en flux quel que soit le système
MAB Solut. vos projets. MABLife Génopole Campus 1 5 rue Henri Desbruères 91030 Evry Cedex. www.mabsolut.com. intervient à chaque étape de
Mabsolut-DEF-HI:Mise en page 1 17/11/11 17:45 Page1 le département prestataire de services de MABLife de la conception à la validation MAB Solut intervient à chaque étape de vos projets Création d anticorps
TABLE DES MATIÈRES. Bruxelles, De Boeck, 2011, 736 p.
STATISTIQUE THÉORIQUE ET APPLIQUÉE Tome 2 Inférence statistique à une et à deux dimensions Pierre Dagnelie TABLE DES MATIÈRES Bruxelles, De Boeck, 2011, 736 p. ISBN 978-2-8041-6336-5 De Boeck Services,
ICOS BELGIUM CONSORTIUM STUDY DAY
ICOS BELGIUM CONSORTIUM STUDY DAY 22 avril 2015 Bergmans, Beaumont, Lenartz. ISSEP : CORE BUSINESS ENVIRONMENTAL MONITORING RISK EVALUATION RESEARCH & TECHNOLOGY 2 ISSEP : ENVIRONMENTAL MONITORING ENVIRONMENTAL
Exemple PLS avec SAS
Exemple PLS avec SAS This example, from Umetrics (1995), demonstrates different ways to examine a PLS model. The data come from the field of drug discovery. New drugs are developed from chemicals that
Compression Compression par dictionnaires
Compression Compression par dictionnaires E. Jeandel Emmanuel.Jeandel at lif.univ-mrs.fr E. Jeandel, Lif CompressionCompression par dictionnaires 1/25 Compression par dictionnaire Principe : Avoir une
Insert System. BRANDplates. Un design intelligent et innovant jusque dans les moindres détails
Un design intelligent et innovant jusque dans les moindres détails BRANDplates Insert System H I G H - T E C H D I S P O S A B L E S Plaques de culture cellulaire et inserts innovants de BRAND pour la
PEINTAMELEC Ingénierie
PEINTAMELEC Ingénierie Moteurs de productivité Drivers of productivity Automatisation de systèmes de production Informatique industrielle Manutention Contrôle Assemblage Automating production systems Industrial
Détection des duplications en tandem au niveau nucléique à l'aide de la théorie des flots
Université Toulouse 3 Paul Sabatier(UT3 Paul Sabatier) Informatique Spécialité Bioinformatique Eric AUDEMARD lundi 28 novembre 2011 Détection des duplications en tandem au niveau nucléique à l'aide de
e-biogenouest CNRS UMR 6074 IRISA-INRIA / Plateforme de Bioinformatique GenOuest yvan.le_bras@irisa.fr Programme fédérateur Biogenouest co-financé
e-biogenouest Coordinateur : Olivier Collin Animateur : Yvan Le Bras CNRS UMR 6074 IRISA-INRIA / Plateforme de Bioinformatique GenOuest yvan.le_bras@irisa.fr Programme fédérateur Biogenouest co-financé
L immunoenzymologie. Technique puissante couramment utilisée e en recherche et en diagnostic cificité des anticorps pour leurs nes
L immunoenzymologie Technique puissante couramment utilisée e en recherche et en diagnostic Basée e sur la très s grande spécificit cificité des anticorps pour leurs antigènes nes Test qualitatif Détection
Big Data: développement, rôle des ARS?? Laurent Tréluyer, ARS Ile de France Alain Livartowski Institut Curie Paris 01/12/2014
Big Data: développement, rôle des ARS?? Laurent Tréluyer, ARS Ile de France Alain Livartowski Institut Curie Paris 01/12/2014 1 Classiquement, le Big Data se définit autour des 3 V : Volume, Variété et
THEME 2. LE SPORT CHAP 1. MESURER LA MATIERE: LA MOLE
THEME 2. LE SPORT CHAP 1. MESURER LA MATIERE: LA MOLE 1. RAPPEL: L ATOME CONSTITUANT DE LA MATIERE Toute la matière de l univers, toute substance, vivante ou inerte, est constituée à partir de particules
IMMUNOLOGIE. La spécificité des immunoglobulines et des récepteurs T. Informations scientifiques
IMMUNOLOGIE La spécificité des immunoglobulines et des récepteurs T Informations scientifiques L infection par le VIH entraîne des réactions immunitaires de l organisme qui se traduisent par la production
Université de Montréal. Développement d outils pour l analyse de données de ChIP-seq et l identification des facteurs de transcription
Université de Montréal Développement d outils pour l analyse de données de ChIP-seq et l identification des facteurs de transcription par Eloi Mercier Département de bioinformatique Faculté de médecine
Article. Sylvie Le Laidier. M/S : médecine sciences, vol. 20, n 1, 2004, p. 105-108. Pour citer cet article, utiliser l'information suivante :
Article «La couverture maladie universelle : l apport de la protection complémentaire / The universal health insurance coverage established in France in 2000» Sylvie Le Laidier M/S : médecine sciences,
Présentation du programme d automatisation du bâtiment
Présentation du programme d automatisation du bâtiment Conditions de participation Programme Office fédéral de l énergie OFEN Conditions de participation >= une période de chauffage >=80% mazout / gaz-naturel
UFR Sciences Fondamentales et Appliquées Université de Poitiers. Se réorienter à l UFR Sciences Fondamentales et Appliquées en janvier 2013
Se réorienter à l UFR Sciences en janvier 2013 Communément appelée «Faculté des Sciences» l Unité de Formation et de Recherche Sciences (UFR SFA) est une des 14 composantes de l Passerelle PACES Faculté
Catalogue 2014 OFFRE DE SERVICES. Solutions de services CVC complètes et sur-mesure pour vos installations SERVICE
Catalogue 2014 OFFRE DE SERVICES Solutions de services CVC complètes et sur-mesure pour vos installations SERVICE 1 Sommaire Vous êtes entre de bonnes mains! Un service de proximité Une équipe à votre
Structure quantique cohérente et incohérente de l eau liquide
Structure quantique cohérente et incohérente de l eau liquide Prof. Marc HENRY Chimie Moléculaire du Solide Institut Le Bel, 4, Rue Blaise Pascal 67070 Strasbourg Cedex, France Tél: 03.68.85.15.00 e-mail:
Article225: Guide sectoriel CNCC Audition plateforme RSE, 20 février 2014
Article225: Guide sectoriel CNCC Audition plateforme RSE, 20 février 2014 Jean-Michel Silberstein Délégué Général CNCC Christophe Garot CNCC UNIBAIL-RODAMCO Le CNCC Le CNCC, Conseil National des Centres
COUSIN Fabien KERGOURLAY Gilles. 19 octobre 2007. de l hôte par les. Master 2 MFA Responsable : UE Incidence des paramètres environnementaux
COUSIN Fabien KERGOURLAY Gilles 19 octobre 2007 Inhibition des défenses de l hôte par les bactéries pathogènes Master 2 MFA Responsable : UE Incidence des paramètres environnementaux Gwennola ERMEL I Détection
Commentaires sur les épreuves de Sciences de la Vie et de la Terre
Commentaires sur les épreuves de Sciences de la Vie et de la Terre Épreuve ÉCRITE de BIOLOGIE A...2 Épreuve ÉCRITE de BIOLOGIE B...9 Épreuve ORALE de BIOLOGIE...13 ANNEXE 1 : LISTE DES SUJETS D ORAL PROPOSÉS