Grippe, Paramyxoviridae et autres viroses respiratoires

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1 Grippe, Paramyxoviridae et autres viroses respiratoires ECN :Q82 Deux articles accessibles en ligne - Epidémiologie des infections virales aiguës des voies respiratoires hautes et basses de l enfant. Brouard J et al. Revue du Praticien 2007 ; 57 : La grippe saisonnière. Vabret A et al. Pathologie Biologie 2010 ; e51-e57. marie-edith.lafon@u-bordeaux2.fr

2 Comment télécharger les articles de la Revue du Praticien?

3 Principales étiologies virus familles virales Chez l enfant, la personne âgée et l immunocompétent : grippe (influenza A, B et C) orthomyxoviridae virus respiratoire syncytial (RSV) paramyxometapneumovirus humain (hmpv) virus parainfluenza (PIV) rhinovirus, echovirus, coxsackievirus picornacoronavirus (classiques, SARS, HCoV EMC) coronaadenovirus adenobocavirus humain parvo- VZV (pneumonie varicelleuse) herpes- De plus, en réanimation et chez l immunodéprimé : HSV, CMV, EBV, HHV6, herpes-

4 Viroses respiratoires : domaine en pleine évolution Au moins 11 nouveaux virus décrits depuis 2001! données épidémiologiques incomplètes Co-infections fréquentes interprétation? D après F. Freymuth et al. Pathologie Biologie 2009;57:

5 La grippe et les virus influenza - la grippe : épidémiologie signes cliniques et évolution diagnostic virologique organisation du suivi en France - virus, épidémies et pandémies : virus influenza : structure, multiplication mécanismes de variation et conséquences facteurs de pathogénicité informations AH5N1 - vaccin et anti-viraux Les infections à VRS et Métapneumovirus Autres virus

6 La grippe et les virus influenza 30

7 La grippe Un fléau trop familier... La grippe est hautement contagieuse La grippe cause une morbidité importante et coûte cher

8 Epidémiologie de la grippe Virus Influenza A, B, C Transmission : aérienne directe (gouttelettes) et indirecte (mains) Epidémies hivernales (novembre à avril) de grippe A, B et plus rarement C avec basculement hémisphérique Pandémies de grippe A Réservoir : - pour B et C : humain - pour A : humain et animal

9 Transmission : aérienne directe / mains sales Distance : 2 mètresm Distance : 2 mètres Concentration Le virus se répand par les gouttelettes de Pflüge (toux, éternuement) Le virus pénètre par le nez, la bouche et les yeux 2

10 Réplication : rapide et intense Concentration en particules virales et sévérité des symptômes Pic de la réplication virale Apparition rapide des symptômes Charge virale Sévérité des symptômes Temps (jours) D après Oxford JS et al. Drugs Discovery Today, 1998 ; 3 (10) :

11 Signes cliniques et évolution - Incubation : brève (2 jours) - Début brutal : syndrome grippal - V grippal au troisième jour Nombreuses complications - pneumopathies grippales - surinfections bactériennes (otites...) - «grippes malignes» - pandémies : atteintes neurologiques, cardiaques Mortalité estimée # - 1 p 1000 pour une épidémie habituelle France : 200 à morts par an USA : hospitalisations et morts / an - pandémie de : 2,5% pandémie de : ~1p1000

12 Diagnostic : écouvillon de nez / gorge, LBA Détection de l ARN viral par amplification génique (PCR) +++ (ou culture virale) A B Détection de protéines du virus de la grippe (tests rapides, immunofluorescence, ELISA)

13 Organisation de la surveillance de la grippe en France Centres Nationaux de Référence de la grippe France-Nord (Paris) et Sud (Lyon) 1984 : - Réseau National des Laboratoires (RENAL) - Réseau «Sentinelles» de l unité 444 de l INSERM - Groupes Régionaux d Observation de la Grippe (GROG)

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15 Virus, épidémies et pandémies

16 Structure des virus Influenza A, B et C Hémagglutinine Génome : 8 segments d ARN (-) d après le Traité de Virologie médicale, Huraux et al, ESTEM, Neuraminidase

17 Cycle de multiplication d après le Traité de Virologie médicale, Huraux et al, ESTEM, 2003.

18 Différents virus influenza : A, B, C H7N7 H9N2

19 Nomenclature des virus grippaux

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21 1889 Pandémies... et menaces Avant l automobile : chevaux? 1918 : grippe espagnole A(H1N1) > : grippe asiatique A(H2N2) : grippe de Hong Kong A(H3N2) 0, A/Duck/Ukraine/1/63 (Hav7=H3) 1976 incident de Fort Dix A(H1N1) : réservoir porcin 1997 Hong Kong A(H5N1) : transmission directe poulet-homme 2005 : AH1N séquencé : mutations suffisantes pour adaptation rapide à l homme 2009 : grippe mexicaine A(H1N1) 18,000 (été?) 2013 : A(H7N9) Morens DM, Taubenberger JK. Rev Med Virol Jun 27. doi: /rmv.689.

22 Mécanismes de variation des virus grippaux Mutations ponctuelles glissements antigéniques virus A, B et C Réassortiments cassures antigéniques virus A

23 Réassortiment des virus influenza A Réservoir : oiseaux aquatiques - 17 types d HA - 10 types de NA d après le Traité de Virologie médicale, Huraux et al, ESTEM, 2003.

24 Belshe RB. NEJM 2005 ; 353:

25 Pandémie A(H1N1)v 2009 : Origine des différents segments d ARN génomique D après R Garten et al. Science 2009 ; 325 :

26 Pathogénicité d un virus influenza A Nouveauté dans la population humaine : immunité relative conférée par les infections et vaccinations antérieures Déterminants viraux :

27 Immunité relative Incidence de la grippe Taux moyen d anticorps dans la population anti-a HxNx Taux moyen d anticorps dans la population anti-a HyNy Incidence de la maladie Pandémie Epidémie Période interpandémique Pandémie Epidémie Niveaux moyen d anticorps dans la population Temps en années Introduction d un virus A HxNx Variation mineure mais significative des virus A HxNx Introduction du virus A HyNy (nouveau sous-type). Disparition de A HxNx. D après Mandell, Douglas and Bennett s Principles and Practice of Infectious Diseases,5 th ed :

28 Pathogénicité d un virus influenza A Nouveauté dans la population humaine : immunité relative conférée par les infections et vaccinations antérieures Déterminants viraux : mutations clés - HA - protéines de structure ARN polymérase,

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31 Migrations aviaires... et humaines

32 Vaccin et anti-viraux

33 La fabrication du vaccin anti-grippal J Treanor, NEJM 2004, nov 11

34 Le vaccin anti-grippal : plus que jamais d actualité! Virus grippal fragmenté et inactivé 2 souches A, 1 souche B Contenant des antigènes analogues à des souches ayant récemment circulé vaccin antigrippal : A/California/7/2009 (H1N1)pdm09 - inchangée A/Texas/50/2012 (H3N2) nouvelle souche vaccinale antigéniquement inchangée B/Massachusetts/2/2012 (Yamagata) - nouvelle Taux de protection variable ~ 50% chez les personnes âgées Personnes cibles : personnel de santé, femmes enceintes, personnes âgées et porteuses de maladies chroniques...

35 Une épidémie «banale» de grippe : amplification et transmission par les enfants scolarisés mortalité chez les personnes fragilisées! D après J Cartwright, Usborne Eds D après W. Glezen, J Clin Virol 2006 ; 37 :

36 On n a encore rien trouvé de mieux qu un vaccin pour protéger contre une maladie infectieuse D après Iturria, Sud Ouest, 2009

37 amantadine rimantadine Anti-viraux zanamivir oseltamivir d après le Traité de Virologie médicale, Huraux et al, ESTEM, 2003.

38 Inhibiteurs de la proteïne M2 Amantadine (Mantadix ) Rimantadine (Roflual ) Actifs uniquement sur le virus de type A Effets secondaires importants (neurologiques ++) Emergence de résistances (>35%) Inhibiteurs de la neuraminidase ++ Zanamivir (Relenza ) Oseltamivir (Tamiflu ) Actifs sur les virus de type A et B Administration précoce + + (48 h suivant le début des symptômes) Emergence de résistances

39 Etiologies principales La grippe et les virus influenza Les infections à VRS et MPV classification des paramyxoviridae structure épidémiologie signes cliniques et virologiques évolution traitement et prévention Autres virus Coronavirus

40 Les infections à virus respiratoire syncytial (hrsv) et métapneumovirus (hmpv)

41 Famille des Paramyxoviridae : parainfluenza 1 et 3 (hpiv1 et 3) oreillons, hpiv 2 et 4 rougeole virus respiratoire syncytial (hrsv), métapneumovirus humain (hmpv)

42 Structure des particules virales ARN monobrin, négatif, non segmenté, environ nt nucléocapside hélicoïdale enveloppe avec des spicules : F (fusion) (ni hémagglutinine, ni neuraminidase) taille : 150 à 250 nm, assez polymorphes virus très fragiles : traiter les prélèvements destinés au diagnostic direct en moins de 4 heures

43 VRS Metapneumovirus Chan PKS, Tam JS, Lam C-W, Chan E, Wu A, Li C-K, et al. Human metapneumovirus detection in patients with severe acute respiratory syndrome. Emerg Infect Dis [serial online] 2003 Sept [date cited]. Available from: URL:

44 Epidémiologie Réservoir humain, virus ubiquitaire A 5 ans, 90% des personnes sont séropositives. Transmission aérienne directe Epidémies - hivernales (octobre à mars), collectivités de nourrissons et de personnes âgées - hospitalières (mains et vêtements) Facteurs de gravité : - âge +++ (nourrissons, personnes âgées) - immunodépression (greffe de moelle)

45 Signes cliniques et virologiques Clinique - Incubation : 4-5 jours - Bronchiolite aiguë pneumopathie «asthmatiforme» contagiosité majeure pendant 6-7 jours - Autres formes Examens virologiques : directs détection d antigènes (service d urgence pédiatrique) ou PCR sur prélèvements naso-pharyngés ou lavage broncho-alvéolaire

46 Evolution Complications : - emphysème, broncho-pneumonie, détresse respiratoire - à distance: hyperréactivité bronchique et manifestations allergiques

47 - Pas de vaccin disponible Traitements et Prévention - Traitement symptomatique : humidification et kinésithérapie - Ribavirine en aérosols (VRS) : greffe de moelle - Règles d'hygiène en milieu hospitalier (lavage des mains et des appareils en passant d'une chambre à l'autre!!!)

48 Autres virus

49 Homme : HCoV-229 E, HCoV-OC43, HCoV-NL63, CoV-HKU SARS-CoV : Coronavirus civette 2012 HCoV-EMC/ MERS devenir??? Animal : porc, chien, chat (péritonite infectieuse), souris, vache, poulet, dinde.

50 Double tropisme chez l homme Respiratoire : rhume, bronchite, bronchiolite, pneumopathie Digestif : diarrhée aiguë

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52 D après Rappole G et al., EID 2006 ; 12 : 1577