Note sur la création de la base de données géographique

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1 Note sur la création de la base de données géographique Version Commentaires 1 Auteurs : Jean Christophe Desconnets ; Stéphane Clerc ) Date de création : 16/11/ :04:00 Date de modification : 20/02/ :39:00 Commentaires sur les modifications : relecture et reformatage du style pour la version 1.5

2 Préambule : Cette note détaille les opérations nécessaires pour créer une nouvelle base de données géographique et y insérer les couches vecteurs (shapefile) utilisées dans le client cartographique de MDweb. Elle donne aussi utiliser l éditeur de carte, notamment le choix des couches à afficher, leurs propriétés d affichage et leur légende. Quelques rappels... 2 Accès au module de gestion de la base de données géo... 3 Création d une base de données géographique... 4 Modification d une base de données géographique... 7 Suppression d une base de données géographique... 9 Configuration de la connexion à la base de données géographique... 9 Quelques rappels Utilité et utilisation de la base de données géographiques pour le client cartographique La base de données géographique qui est associée à MDweb héberge les couches d informations géographiques que l on souhaite visualiser dans le moteur de recherche et de saisie cartographique. Ces couches d information au sein du client cartographique sont le support : lors de la saisie d une fiche de métadonnées, donné à l utilisateur pour définir l emprise géographique et le toponyme du jeu de données qu il décrit et, en consultation, le moyen de définir une zone ou un toponyme sur lequel il souhaite faire porter sa recherche de données. Pour proposer à l utilisateur tant en saisie qu en recherche les objets géographiques pertinents, il est nécessaire de définir un ensemble de couches d information représentant les objets géographiques d intérêt du projet de catalogage sur lesquels pourront être référencés les jeux de données. A travers, son module de création et de gestion de la base de données géographique, MDweb permet lors de la mise en place de l outil, de créer une base de données, insérer les couches d informations sans avoir une connaissance de système de gestion PostgreSQL/PostGIS, puis de configurer le client cartographique. Limites actuelles Limites pour la construction de la base de données La création de la base de données géographiques doit être réalisée à partir de fichiers de forme (ou couche vecteur) au format shape d ESRI sur des données géoréférencées dans un système de projection. Les fichiers shapes doivent être accompagnés de leur fichier de définition de projection *.proj. Il faut garder à l esprit que le module cartographique de MDweb n est pas un module de navigation et de visualisation détaillée mais bien un support à la saisie d emprise spatiale et à la recherche de données par localisation. Ces deux dernières fonctions nécessitent bien de considérer les objets d intérêts nécessaires mais de rend pas indispensable une précision de représentation très élevée. Page 2 sur 14

3 Limites du module de gestion de la base de données géographiques La base de données géographiques est construite en s appuyant sur PostgreSQL/PostGIS. Lors de la création ou de la modification de la base de données géographiques, le serveur hébergeant MDweb et le serveur hébergeant la base de données doit être le même. Par, ailleurs, les bibliothèques GEOS et PROJ4 doivent être installées ainsi que l exécutable proj et invproj. En effet, les scripts qui assurent la création, la modification de la base de données sont réalisés par l exécution de commandes SQL à travers les scripts PHP. Le module a été implémentée et tester uniquement sur PostgreSQL/Postgis 8.1 et 8.2 sous Windows et sous linux. Il permet d insérer uniquement des fichiers shape projetés (utilisation de la fonction shp2psql). Du fait de l exécution des fonctions PostgreSQL par PHP, le temps d exécution des commandes postgres est tributaire de la directive php.ini max_execution_time que l on doit régler à 180 s. Pour cela, l insertion de fichier shape volumineux risque d être problématique. Accès au module de gestion de la base de données géo L accès au module de gestion de la base de données géographique n est possible que si vous êtes connecté dans MDweb en tant qu administrateur. Vous devez accéder au module d administration de MDweb. L ensemble des fonctionnalités du module sont accessibles par l élément BD Géo du menu administrateur Le module de gestion de la base de données géographiques propose cinq grandes fonctions : Ajouter : pour créer une nouvelle base de données géographiques Modifier : pour insérer ou supprimer des couches d information dans une base de données géographique existante Supprimer une base de données géographique Configuration de la connexion : assure le paramétrage de la connexion à un serveur PostgreSQL et à une base de données géographique qui sera utilisée pour le client cartographique Editeur cartographique : Editeur cartographique permettant de composer les couches qui apparaîtront (et leur légende) dans le client cartographique. Mise à jour BDs spatiale thésaurus : assure la mise à jour de la table hierarchiespatiale avec les termes de type «spatial» du thésaurus d application. Pour plus de précision, reportez vous à la note sur la gestion du thésaurus). Page 3 sur 14

4 Création d une base de données géographique - Ce module permet de créer une nouvelle base de données géographique sous PostgreSQL/PostGIS. Pour permettre, l utilisation de ce module, la cartouche spatiale PostGIS doit être installée sur votre serveur PostgreSQL. Lors de la création d une base de données géographique, les scripts MDweb exécutent les commandes SQL et utilisent les fichiers lwpostgis.sql, spatial_ref_sys.sql de PostGIS. Table créées et utilité Les tables créées dans la base de données géographiques. Par défaut, lors de la création d une base de données hébergeant des objets géographiques de type GEOM, PostgreSQL créée deux tables : geometry_columns qui référence toutes les tables comportant de la géométrie (champ de type GEOM) et leurs caractéristiques spatial_ref_sys qui contient la définition des systèmes de projection. Pour les besoins de MDweb, trois autres tables sont créées : objet_geom : qui contient les objets géographiques servant à la définition des emprises des fiches de métadonnées de votre catalogue metadata_link : table qui permet de faire le lien entre les identifiants des fiches de métadonnées et les emprises (géométrie) stockées dans la table objet_geom hierarchiespatiale : table permettant de stocker la hiérarchie entre les couches contenues dans la base géographique. Cette hiérarchie sera utilisée pour visualiser les couches d information dans le module cartographique. Création de la base de données à partir du module BD Géo de MDweb 1. Accédez à la page Ajouter une base de données géographique à partir du menu du module administration 2. Compléter le formulaire proposé en contrôlant la validité des valeurs par défaut. Si ces valeurs ne conviennent pas, vous pouvez les modifier afin de permettre la bonne exécution de la création. Il faudra dans une deuxième étape, modifier la configuration par défaut de la connexion à la base de données géographiques en allant à la page Connexion à la BD Géo du même module. Page 4 sur 14

5 7 champs sont proposés pour permettre la création de la base de données : Adresse IP du SGBD : Nom ou adresse IP du serveur hébergeant la base de données géographique. Port TCP/IP du SGBD : Numéro du port d accès au serveur de base de données. Par défaut, le port est Compte utilisateur : Nom de l utilisateur pouvant accéder à la base de données géographique. Il doit avoir les droits en écriture sur la base de données. Il doit aussi pouvoir créer une base de données. Mot de passe : Mot de passe de l utilisateur. Nom de la base de données géographique : vous devez choisir un nom qui ne comporte pas d espace, ni de caractères spéciaux (? ; :! & etc.) Chemin absolu du fichier lwpsotgis.sql : le chemin absolu doit comporter le nom du lecteur pour une installation Windows. Normalement, ce fichier se trouve dans le répertoire share/contrib/ de votre installation PostgreSQL. Si ce n est pas cela signifie que la cartouche spatiale PostGIS n est pas installée. Ce fichier est strictement nécessaire à la bonne exécution des scripts de création. Chemin absolu du fichier spatial_ref_sys.sql : chemin absolu doit comporter le nom du lecteur pour une installation Windows. Normalement, ce fichier se trouve dans le répertoire share/contrib/ de votre installation PostgreSQL. Ce fichier est strictement nécessaire à la bonne exécution des scripts de création. 3. Après avoir compléter, Envoyer le formulaire, une nouvelle page apparaît pour finaliser la création de la base de données géographique. Page 5 sur 14

6 4. choix du srid ou identifiant du système de projection. Vous devez donner le srid du système de projection utilisé. Il s agit d un identifiant numérique unique. Ils sont définis dans la table spatial_ref_sys de votre base de données. a) Le champ identifiant du système de référence vous permet d accéder à la liste des srid stockés et de choisir celui qui est approprié (le même que celui de votre fichier *.proj). En cliquant sur un des élément de la liste, vous compléter automatiquement les deux champ identifiant du système de référence.. et description du système.. Ou b) charger le fichier de définition de projection de votre fichier shape à partir du bouton parcourir c) envoyer le formulaire Aide à l identification du srid : le srid n est pas contenu dans le fichier de définition de votre shape, par contre, il contient le nom du système de projection Vous pouvez chercher le srid du système de projection sur le site de OGP Surveying & Positionning Commitee ( rubrique EPSG Geodetic Parameter Dataset. Dans le cas, où votre système n est pas référencé dans cet organisme, il en existe d autres dont ESRI, nous fournissons un fichier srid.sql en téléchargement qui contient un complément de système. Une recherche textuelle avec le nom de votre système vous permettra sans doute trouver le srid correspondant dans ce fichier. Il est situé dans les scripts de MDweb: create_geo_db/srid.sql Page 6 sur 14

7 Modification d une base de données géographique 1. Accédez à la page Modifier la base de données géographique à partir du menu du module administration Insertion d une nouvelle couche d information géographique 2. cliquez sur le bouton Modifier pour accéder aux champs qui vous permettront de charger le fichier shape et ses fichiers associés (shx, dbf) 3. insérer les chemins du shapefile que vous souhaitez insérer dans la base. Trois fichiers sont nécessaires à l importation : Le fichier de forme shp Le fichier d index shx Le fichier contenant les attributs dbf. Page 7 sur 14

8 Note : Le fichier dbf doit présenter obligatoirement une colonne appelée toponyme de type text de 50 caractères maximum. Cette colonne est utilisée pour l affichage du toponyme. 4. Vous devez ensuite définir un nom pour la table qui sera créée dans la base de données. Ce nom de table sera ensuite utilisé lors de l édition du client cartographique. 5. Envoyez votre formulaire complété. Remarque : L insertion d une couche d information est permise pour une couche d information déjà projetée dans un système et accompagné de son fichier de définition de projection *.proj Suppression d une couche d information géographique La suppression d une table dans une base de données se fait par l intermédiaire de la même page que l insertion 1. Accédez à la page Modifier la base de données géographique à partir du menu du module administration 2. Choisir la base de données sur laquelle vous souhaitez réaliser la suppression 3. Supprimer la table que vous souhaitez. La suppression est définitive. Page 8 sur 14

9 Suppression d une base de données géographique 1. Accédez à la page Supprimer la base de données géographique à partir du menu du module administration 3. Choisir la base de données que vous souhaitez supprimer. 3. Valider. La suppression est définitive Configuration de la connexion à la base de données géographique Page 9 sur 14

10 Ce module assure le paramétrage de la connexion à un serveur PostgreSQL et à une base de données géographique qui sera utilisée pour le client cartographique. Son exécution réécrit les valeurs des variables de connexion contenues dans le fichier config/config.inc.carto.php. Vous y accéder par l élément BD Géo > Configuration > Connexion BD Géo Vous accéder à un formulaire qui va vous permettre de modifier la configuration courante ou par défaut. 7 champs permettent le paramétrage de la connexion à la base de données géographique : Adresse IP du SGBD : (voir p.5) Port TCP/IP du SGBD : (voir p.5) Compte utilisateur : (voir p.5) Chemin du script d inversion de projection (invproj) : chemin de l exécutable d'inversion de projection. Par défaut, la valeur invproj.exe est proposé pour une installation sous Windows et /usr/local/bin/invproj sous Linux. Si vous donnez un chemin relatif pour accéder à cet exécutable, son chemin absolu doit être mis dans la variable PATH de votre système. Si ce n est pas le cas, sous Windows, vous devrez modifier votre variable système PATH et redémarrer le serveur (OS Windows). Chemin du script de projection (proj) : chemin de l exécutable de projection. Par défaut, la valeur proj.exe est proposé pour une installation sous Windows et /usr/local/bin/proj sous Linux. Si vous donnez un chemin relatif pour accéder à cet exécutable, son chemin absolu doit être mis dans la variable PATH de votre système. Si ce n est pas le cas, sous Windows, vous devrez modifier votre variable système PATH et redémarrer le serveur (OS Windows). Nom de la base de données géographique : une liste déroulante vous permet de choisir la base de données géographique présente sur votre serveur PostgreSQL sur laquelle sera utilisée le client cartographique. Page 10 sur 14

11 Après modification et vérification des valeurs saisies dans les champs, valider avec le bouton création du fichier de configuration du module géographique Après cette opération, le fichier config/config.inc.carto.php sera modifié. Remarque : pour que cette opération s effectue correctement, il est indispensable que l utilisateur apache (utilisateur du service httpd) ait les droits en écriture sur le répertoire où sont stockés les scripts de MDweb En cas de problèmes lors de la création ou l exploitation de la base par WMS a) Vérification de la cohérence de votre base de données Afin d éviter les incohérences et les erreurs lors de l utilisation de la base par le serveur cartographique notamment lors de l édition du contexte (module d administration > BD Géo > Configuration > Editeur cartographique), plusieurs points sont à vérifier : Avant l importation des shapes : - Vos shapes doivent être projetés et tous dans la même projection. - La table attributaire du shape doit contenir une colonne toponyme de type texte. Si ce champ n existe pas vous devez le crée puis insérer les libellés des entités de votre couche dans ce champ. Après l importation des shapes, dans la base créée : - Présence des couches importées dans la table geometry_columns : Vous devez trouver le nom des couches importées dans la geometry_columns. Ainsi qu une table par couche dans le schéma public de votre base. - Présences des tables metadata_link et objet_geom : ces deux tables doivent être créées lors de la création de la base de données. Si ce n est pas le cas, les scripts sont données dans le paragraphe «Création d une base de données par ligne de commandes». - La table objet_geom stocke les emprises des données cataloguées. Elles sont insérées lors de la validation d une fiche. Le srid de cette table doit être identique à celui des couches importées. Si ce n est pas le cas, la table doit être supprimer et recrée avec le bon srid. Le script est donné dans le paragraphe «Création d une base de données par ligne de commandes». - SRID identiques : tous les couches importées doivent être importées dans le même système de projection afin de pouvoir construire par la suite un serveur WMS fonctionnel. La valeur du champ srid de la table geometry_columns doit être le même pour toutes les couches. Si ce n est pas le cas. Vous devez effacer la couche en question de la base et de la table geometry_columns et la réimporter. b) Cas de la réutilisation de la base de données geo demo15 Si vous souhaitez réutiliser la base fournie avec mdweb : geo demo15, vous devez veiller à : Page 11 sur 14

12 - Supprimer les couches existantes world et ocean de la base et effacer les lignes correspondantes de la table geometry_columns, - Modifier une des contraintes de vérification de la table objet_geom de sorte que le srid de cette table correspond à celui des nouvelles couches que vous insérez. Dans un éditeur SQL, exécutez la commande suivante : ALTER TABLE objet_geom DROP CONSTRAINT "enforce_srid_the_geom"; ALTER TABLE objet_geom ADD CONSTRAINT "enforce_srid_the_geom" CHECK (srid(the_geom) = [srid]); [srid] a la valeur du srid de vos nouvelles couches c) Création d une base de données par ligne de commandes Si vous souhaitez crée manuellement une nouvelle base de données géographique : Via un shell, exécutez les commandes suivantes : shell> Createdb [nom_bd] E LATIN1 O [owner] U postgres T template0 shell> createlang plpgsql [nom_bd] U postgres shell> psql d [nom_bd] U postgres < [path\to\lwpostgis.sql]" shell> psql d [nom_bd] U postgres < "[path\to\spatial_ref_sys.sql]" le contenu du fichier table_mdweb.sql est le suivant. Copiez coller ce qui suit dans un éditeur texte en veillant à mettre la valeur du srid lors de la création de la table objet_geom (en rouge dans les clauses SQL): début du script CREATE TABLE hierarchiespatiale ( libelle_terme text NOT NULL, pere_terme text, info_couche boolean ) WITHOUT OIDS; Structure for table objet_geom (OID = 81999) : CREATE TABLE objet_geom ( id_geom integer NOT NULL, toponyme character varying(100) NOT NULL, n real, s real, e real, w real, the_geom geometry, style integer, toponyme_2 character varying(100), CONSTRAINT enforce_dims_the_geom CHECK ((ndims(the_geom) = 2)), CONSTRAINT enforce_srid_the_geom CHECK ((srid(the_geom) = [votre_srid])) ) WITHOUT OIDS; Structure for table metadata_link (OID = 82017) : Page 12 sur 14

13 CREATE TABLE metadata_link ( id_geom integer NOT NULL, id_metadata integer NOT NULL, gabarit_name character varying(50), code_observatoire character varying(100) NOT NULL, private character varying(5) ) WITHOUT OIDS; fin du script,sauvegarder le sous le nom table_mdweb.sql et exécutez la commande shell> psql d [nom_bd] U postgres < "[path\to\table_mdweb.sql]" d) Importation des shapes via un shell L importation d un fichier de forme projeté via un shell se fait en deux étapes en exécutant les deux commandes suivantes : # créer un fichier d instruction SQL avec votre shape shell>shp2pgsql s [srid] f [path\to\shape.shp] c [nom_table_creer] > [nom_insert_sql].sql # Insère le fichier SQL créée dans votre base de données géographique shell> psql d [votre_bd_geo] < [nom_insert_sql].sql Exécutez ces commandes autant de fois que vous souhaitez importer de shapes Page 13 sur 14

14 Contacts IRD / US ESPACE (US 140) 500, rue Jean François Breton, Montpellier Cedex 05 TEL : +33 (0) J.C Desconnets Site du projet MDweb : project.org Démonstrateur en ligne : demo16.mdweb project.org Page 14 sur 14

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