Informatique. Initiation à Linux. Pasquale Sellitto LMD/ENS

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Jean-Noël Samson
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1 Informatique Initiation à Linux Pasquale Sellitto LMD/ENS

2 Pasquale SELLITTO Bureau E509 5ème étage Affiliation : Laboratoire de Météorologie Dynamique, École Normale Supérieure (depuis Avril 2013) Expériences professionnelle : Laboratoire Inter-universitaire des Systèmes Atmosphériques (Oct March 2013); Université de Rome ''Tor Vergata''/ESA-ESRIN/NASA-GSFC (Nov Sept. 2010) Études supérieurs : PhD en GéoInformation/Télédétection à l'université de Rome ''Tor Vergata''/NASA Goddard Space Flight Center (2009); MSc en Physique à l'université de Rome ''La Sapienza'' (2005) Thèmes de recherche : Télédétection de l'atmosphère, Transfert du rayonnement, Spectroscopie de l'atmosphère, Qualité de l'air, Ozone, Aérosols, Cirrus, Impact de l'activité volcanique sur la composition de l'atmosphère, Analyse de données par schémas d'intelligence artificielle, Études de sensibilité pour missions satellitaires futures

3 Pourquoi étudier l'informatique? L'informatique en géosciences : - Utilisation en TD: maths, sismologie, modélisation numérique - Optimisation de l'écriture des rapport scientifiques - Stage de recherche - En général : lecture/traitement de données. Plan du module : 2 semestres, 2*10*2-3h OUTILS - Les commandes consoles/shell (Bash) basiques - La représentation graphique: MatLab, Python, GMT... - Le processeurs de texte : LaTex PROGRAMMATION - Le langage FORTRAN

4 Donc...

5 Les systèmes UNIX/Linux UNIX : système d'exploitation (OS) libre (open-source), multitâche et multi-utilisateur Linux : OS UNIX-like très utilisé dans l'académie et la recherche Linux a une gestion de tâches à fenêtre et à ligne de commande (console)

6 Le système de fichiers du système UNIX

7 Fenêtres et console

8 Console, shell et BASH Console : terminal qui permet de communiquer avec l'ordinateur avec des commandes Shell UNIX : interpréteur de commandes destiné aux systèmes UNIX ou UNIX-like une shell interprète les commandes saisies avec la console et permet l'accès aux fonctionnalités du OS BASH (Bourne-Again SHell) : shell la plus utilisée dans les systèmes Linux BASH peut opérer de deux façons : - Mode interactif : il exécute les commandes saisies par un utilisateur en restant en attente - Mode batch : il exécute un fichier contenant une liste de commandes gestion automatique de tâches complexes

9 Quelques commandes de base Une commande est suivie de 0, 1 ou plusieurs arguments séparés par des espaces. Un argument est une chaîne de caractères représentant un chemin d'accès, un fichier ou une option de la commande - ls arg - pwd - cd arg - cp arg1 arg2 - mv arg1 arg2 - mkdir arg - rmdir arg - rm arg afficher le contenu du répertoire arg afficher le chemin absolu du répertoire courant se déplacer dans l'arborescence vers le répertoire arg copie arg1 vers arg2 déplace arg1 vers arg2 crée un répertoire arg dans le répertoire courant détruit le répertoire arg si il est vide détruit le fichier arg Chemin absolu : ls /home/user1 Chemin relatif : ls. Pointe vers le répertoire courant (ex user1) ls../user2 Pointe vers le répertoire user2 à partir de user1 ou de tout autre répertoire de même niveau cd tout seul pointe vers /home/user si vous êtes loggé en tant que user ~ remplace /home/user/ dans n'importe quelle commande. Les caractères spéciaux (voir le guide linux)

Les droits d'accès aux fichiers Ils existent 3 types de droits définis pour chaque fichier, chaque répertoire : - lecture (r) - écriture (w) - exécution (x) Ces 3 types de droits sont définis pour 3

10 Les droits d'accès aux fichiers Ils existent 3 types de droits définis pour chaque fichier, chaque répertoire : - lecture (r) - écriture (w) - exécution (x) Ces 3 types de droits sont définis pour 3 «entitées» dont chaque utilisateur fait partie ou pas : - l'utilisateur (le propriétaire du fichier) - le groupe (le propriétaire du fichier peut donner des droits à quiconque fait parti du même groupe que lui) - les autres (tous les autres)

11 Changer les droits d'accès chmod (-R) (option) fichier(s) option peut être : +r,+w,+x ou une combinaison (ex : +rw) pour ajouter des droits -r,-w,-x ou une combinaison pour supprimer des droits u (user), g (group) ou o (other) spécifie à quelle classe d'utilisateur sont attribués les droits. Ex : chmod g+r,o-r donne le droit de lecture au groupe et l'enlève aux 'autres'. Une combinaison en binaire : Les droits rwxrwxrwx peuvent êtres codés en binaire par soit 777 et : chmod 777 fichier donne tous les droits à tout le monde chmod 755 fichier rwxr-xr-x Seul l'utilisateur root (administrateur) peut changer qui est propriétaire d'un fichier : chown (-R) user:group fichier(s) Et pour changer seulement le groupe : chgrp group fichier -R effectue l'action pour tous les fichiers et sous répertoires d'un répertoire.

12 Exécuter un programme/batch script./executable_du_programme Pour être exécutés, les programmes ou les batch scripts doivent avoir le droit d'exécution. Sinon : chmod +x executable_du_programme Si besoin d'exécuter une longue série de commandes ou si besoin d'automation, on produit un batch script en forme de fichier texte : une liste de commandes chown (-R) user:group fichier(s) Normalement, l'extension de ces fichiers est.sh (sh=shell)

13 La gestion de tâches Pour les OS multitâches, on défini gestion de tâches (job control) l'orchestration des ces tâches (programmes, batch script de commandes, processus, etc...) top Affiche les programmes en cours d'exécution, leur utilisation mémoire et processeur ps -U user Affiche une photo instantanée des processus lancés par user kill -9 PID Stoppe brutalement le programme correspondant au PID renseigné pidof nom_du_programme Trouve le PID d'un programme & Après une commande, la place en background (permet d'en lancer une autre)

14 Redirections On peut lancer plusieurs commandes sur une seule ligne de commande avec '' ; '' commande1 ; commande 2 ;... La sortie d'une commande peut être redirigée vers l'entrée d'une autre commande avec '' '' commande1 commande 2... Au lieu d'apparaître à l'écran, on peut faire en sorte que le résultat d'une commande soit écrite dans un fichier grâce à '' > '' commande 1 commande 2 > fichier.out Au lieu de taper les arguments d'une commande au clavier, on peut introduire des arguments pré-enregistrés avec '' < '' commande < args.txt

15 Accès à distance SSH (Secure SHell) Pour accéder à distance à un compte sur un autre ordinateur de type Unix : ssh compte@machine.domaine ssh -X compte@machine.domaine permettra d'exécuter l'interface graphique depuis la machine distante. SCP (Secure CoPy) Pour copier des fichiers d'un compte d'une machine distante vers votre session locale et vice versa. scp compte@machine.domaine:/repertoire_distant/file /repertoire_local/file scp /repertoire_local/file compte@machine.domaine:/repertoire_distant/file FTP (File Transfer Protocol) Se connecter à un serveur de fichier ftp ftp.geosciences.ens.fr login/passwd put/mput file(s) get/mget file(s) copier un ou des fichiers du répertoire local vers le serveur télécharger un ou des fichiers du serveur vers le répertoire local

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