Surveillance de l infection à Middle East Respiratory Syndrome (MERS) Coronavirus Bilan du dispositif de détection en Ile-de-France

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1 Surveillance de l infection à Middle East Respiratory Syndrome (MERS) Coronavirus Bilan du dispositif de détection en Ile-de-France Annie-Claude Paty CIRE Ile de France, Champagne Ardenne JRVS, 21 novembre 2013

2 22 septembre 2012: le Royaume-Uni informe l OMS d un cas de syndrome respiratoire aigu avec insuffisance rénale, chez un sujet ayant séjourné en Arabie saoudite et au Qatar. Identification d un nouveau coronavirus L OMS fait rapprochement avec un signal identique en avril 2012 chez un ressortissant Saoudian Mise en place d une surveillance internationale sous coordination de l OMS En France, à la demande de la DGS Surveillance spécifique coordonnée par InVS Avis HCSP pour gestion en mars mai 2013: 1 er cas confirmé en France 12 mai : 2 nd cas (par contamination nosocomiale du 1 er cas) => Vigilance renforcée en France CONTEXTE

3 Définition de cas de l OMS Cas possible : a) Toute personne ayant voyagé ou séjourné dans les pays à risque, qui, au cours des 14 jours après son retour, a présenté : des signes cliniques et/ou radiologiques de SDRA ou d infection du parenchyme pulmonaire, avec une fièvre 38 C et de la toux, sans autre étiologie identifiée pouvant expliquer la pathologie. Pour les personnes immunodéprimées ou présentant une pathologie chronique, considérer également la survenue d un syndrome fébrile avec diarrhée et/ou tableau clinique sévère. b) Tout contact (ex : famille, soignants) d un cas possible ou confirmé, ayant présenté une infection respiratoire aiguë quelle que soit sa gravité, dans les 14 jours suivant le dernier contact avec le cas possible/confirmé pendant que ce dernier était malade (i.e symptomatique). Pour les contacts immunodéprimés ou présentant une pathologie chronique, considérer également la survenue d un syndrome fébrile avec diarrhée et/ou tableau clinique sévère. Cas confirmé : Cas possible avec prélèvements indiquant la présence du nouveau coronavirus MERS-CoV.

4 CAS EXCLU Signalement d un cas suspect à Coronavirus sur plateforme ARS ARS/CIRE Evaluation du cas avec le clinicien Saisie de tous les signaux en base par InVS VALIDATION de la classification de cas CIRE/InVS InVS CAS POSSIBLE Mesures d hygiène Isolement du patient Prélèvements respiratoires et autres prélèvements pour diagnostic d exclusion Coordonnées d un référent proche du cas CLINICIEN Directeur d établissement EOH Référent infectiologie Médecin traitant Traçabilité des prélèvements CNR Laboratoires Référents Prévenir laboratoire du CH pour précaution hygiène Cas possible notifié aux référents InVS, DGS, ARS et cabinet

5 Prélèvements et Algorithme de décision Évaluation avec clinicien, ARS et CIRE Signal exclu d emblée quand Hors définition (sur clinique ou hors zone à risque) Pas de prélèvement Signal classé en cas possible : avec appui InVS si besoin Nécessite un prélèvement : prélèvement profond recommandé Lavage broncho-alvéolaire, aspiration, expectorations Autres prélèvements : naso-pharyngien, sang, selles Recherche d autres étiologies Envoi des prélèvements avec procédure sécurisée Aux laboratoires de référence franciliens en semaine (aux heures ouvrées) Pitié Salpétrière, Bichat, Necker, Paul Brousse, Begin A ce jour : uniquement pour les patients hospitalisés sur place Au CNR (demande faite obligatoirement par l astreinte de l InVS) La nuit et le week-end CNR sollicité sur demande InVS (en urgence avec la CIBU)

6 Prélèvements et Algorithme de décision Prélèvements profonds (LBA, aspiration, expectorations) Prélèvements rhino-pharyngiens < J4 des premiers signes J4 des premiers signes Résultat négatif Résultat positif Résultat négatif Résultat positif Pas d autres étiologies Pas d amélioration clinique Demander prélèvement profond J4 des premiers signes Cas confirmé Cas exclus Demander prélèvement profond J4 des premiers signes Cas confirmé

7 Bilan de la surveillance en Ile-de-France Bilan des 6 mois de surveillance en Ile-de-France Du 1 er mai au 3 novembre 2013 (semaine 18 à semaine 44) Aucun cas confirmé en IDF Signaux classés en cas exclu ou cas possible Analyse des signaux reçus : Hypothèse: évolution de la typologie des signaux Evolution au cours du temps: identification de 3 périodes 1) Mai: impact médiatique après les 2 cas confirmés à Lille 2) Juin à septembre: appropriation de la surveillance du coronavirus 3) Octobre: retour grand pèlerinage à la Mecque (Hadj) en Arabie Saoudite et impact du «cas probable» Évolution des signaux par les cliniciens : description des déclarants Evolution des signaux selon la population concernée: description des patients

8 Signalements Mers CoV en Ile de France cas possible cas exclu S18 S19 S20 S21 S22 S23 S24 S25 S26 S27 S28 S29 S30 S31 S32 S33 S34 S35 S36 S37 S38 S39 S40 S41 S42 S43 S signalements en Ile-de-France soit 40 % de la base national (n=431 sur la France entière) 43 classés en cas possibles (tous exclus après résultats biologiques) Soit 25 % des signalements en IDF Soit 38% des cas possibles de la base national (n=113, dont 2 confirmés, sur la France entière) Impact médiatique plus important en nombre de signaux (inverse pour les autres régions) effectif cas possible cas possible/période en % mai ,9 juin à septembre ,2 octobre ,6 Total ,1

9 Typologie des déclarants Département Effectif en % cas possible /total IDF, en % cas possible /sur total dép, en % PARIS 60 35,1 51,2 36,7 VAL-DE-MARNE 30 17,5 9,3 13,3 HAUTS-DE-SEINE 21 12,3 11,6 23,8 SEINE-ST-DENIS 20 11,7 9,3 20,0 YVELINES 17 9,9 7,0 17,6 VAL-D'OISE 8 4,7 4,7 25,0 SEINE-ET-MARNE 7 4,1 ESSONNE 7 4,1 7,0 42,9 Département inconnu 0,6 Total ,1 Nombre de signalements différents par période et département: Paris : de 24 % en période 1 à 46 % des signalements en période 2, puis 36 % Hauts de Seine, plutôt en période 1 et 2, Seine-St-Denis et Val de Marne : période 1 et 3. Effectif en % Mai Juin à septembre Octobre Service d'urgence 85 49,7 46,3 44,6 64,1 Service infectieux 27 15,8 13,4 20,0 12,8 Autres services hospitaliers 19 11,1 9,0 16,9 5,1 Réanimation 10 5,8 10,4 4,6 Médecin Généraliste 13 7,6 7,5 6,2 10,3 Centre ,1 6,0 4,6 Autre 6 3,5 4,5 3,1 Inconnu 4 2,3 3,0 5,1 Total

10 Description des patients signalés Mai Juin à septembre Octobre Total Total sex ratio H/F 0,9 1,6 0,8 1,1 Effectif en % Sex ratio Nb cas possible/total en % possible / classe âge en % < 5 ans 12 7,5 1,0 4,7 16, ans 6 3,8 2,0 7,0 50, ans 14 8,8 0,8 7,0 21, ans 66 41,3 1,5 41,9 27, ans 37 23,1 0,8 11,6 13,5 > 65 ans 25 15,6 1,1 25,6 44,0 âge inconnu 11 6,9 2,3 9,1 Total 171 1, ,1 Age médian : 40 ans pour ensemble des patients signalés (vs 47 ans niveau national) De 1 à 91 ans Age médian des cas possibles : 41 ans (vs 58 ans niveau national) Age médian par période : Mai : 35 ans pour cas exclu versus 48 ans pour cas possible Juin à sept : 40 ans pour cas exclu versus 31 ans pour cas possible Octobre : 54 ans pour cas exclu versus 69 ans pour cas possible

11 Critères d inclusion et exclusion Pays visités Effectif en % ARABIE SAOUDITE 64 37,4 ÉMIRATS ARABES UNIS 59 34,5 KOWEÏT 7 4,1 QATAR 7 4,1 Autre 13 1,8 Pays hors zones 10 5,8 Radiographie Pulmonaire Cas possible en % Pas de Rx 0 Rx normale 4,7 Rx anormale 74,4 dont syndrome interstitiel 43,8 Informations manquantes 21 Pas de notion de voyages 11 6,4 Cas exclu en % Cas possible en % Total en % Hospitalisation 19,5 62,8 30,4 IRA grave 3,1 14,0 5,8 SDRA 3,9 16,3 7,0 Fièvre 46,1 93,0 57,9 Signes digestifs 11,7 27,9 15,8 Comorbidités 27,0 51,0 33,0

12 Discussion/conclusion Pas d épidémie à Mers CoV en France Importance de l impact médiatique sur la surveillance Dispositif de surveillance francilien repose sur: Signalement à la plateforme ARS Classification des signalements par InVS Dispositif national mis en place par l InVS Retour expérience en NPDC (2 cas confirmés) Retard au diagnostic car syndromes atypiques Investigation et mesures préventives auprès de l entourage proche (n=48), des personnes ayant pris l avion (n=37)et personnel soignant (n=112), soit au total 197

13 Bibliographie Surveillance OMS: situation au 18 novembre 157 cas confirmés dans le monde dont 66 décès 81% en Arabie Saoudite Epidémiologie des cas confirmés : Âge moyen: 51,5 ans (14 mois à 94 ans) 53 ans chez homme / 49 ans chez femme Sex ratio H/F: 1,6 (mais cas asymptomatiques chez entourage et personnel soignant font diminuer ratio) Tous les patients ont eu des signes respiratoires (fièvre, toux, dyspnée) Comorbidité fréquente: insuffisance rénale, pathologie respiratoire, diabète Tableau atypique possible chez immunodéprimés Signes digestifs pour 8 cas sur 23 dans cluster saoudien La plupart des patients ont été hospitalisés Formes asymptomatiques ou bénignes: 22 % (23 sur les 104 décrits)

14 Bibliographie Connaissance sur le virus Virus à ARN simple, Béta coronavirus (idem SRAS) Proche coronavirus chauve-souris Survie pendant 48h dans milieu stable à 20% C (et basse température) Perte de son pouvoir infectant (-30%) après 3h de dissécation Sensible à l eau de Javel à 0,5% Durée incubation: en moyenne 5,2 jours, maxi 14 jours Intervalle intergénérationnel: 7,6 jours IC 95% [ 2,1j: 23j ] Taux de reproduction: R0= 0,6 à 0,69 (SRAS était à 0,89) Transmission: Un virus apparenté au MERS-CoV avait déjà été détecté dans les déjections de chauves-souris Une étude sérologique a été réalisée chez 50 dromadaires d Oman (100% anti-mers-cov positifs) et 105 dromadaires autochtones des Iles Canaries (14% positifs), mais échec de la mise en évidence du virus MERS-CoV chez ces animaux Un chameau a été retrouvé infecté par le MERS-CoV (PCR positive) et cet animal appartenait à un cas confirmé d infection à MERS-CoV. Les séquences virales sont en train d être comparées.