Situation Epidémiologique Hebdomadaire Epidémie d Ebola en Guinée

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1 Situation Epidémiologique Hebdomadaire Epidémie d Ebola en Guinée Semaine 46, 215

2 Table des matières Table des matières...2 Note technique...3 Résumé Guinée Conakry Forécariah... 19

3 Note technique Définition de cas Cas Suspect d Ebola: o Toute personne vivante ayant été en contact avec un cas confirmé ou probable et ayant présenté l un des éléments ci-dessous: - L apparition soudaine de forte fièvre OU - Au moins trois des symptômes suivants: mal de tête, anorexie / perte d appétit, léthargie, douleurs musculaires ou articulaires, difficultés respiratoires, vomissement, diarrhée, mal de ventre, difficultés de déglutition, hoquets o Toute personne présentant des saignements inexpliqués Cas Probable d Ebola: cas décédé sans être prélevé avec lien épidémiologique Cas d Ebola Confirmé: cas suspect avec un résultat de laboratoire positif Décès communautaire : personne décédée en dehors d un CTE Lien épidémiologique (Circulaire 953/CNRE de 2 Mars 215): Un contact possède un lien prouvé avec un cas confirmé ou probable OU un patient est en résidence ou en provenance d une communauté dite active dans les 21 jours précédents et les personnels en charge de lutte contre la Maladie à Virus Ebola possèdent à son égard des éléments raisonnables pour suspecter la Maladie à Virus Ebola Sources de données Les données concernant les cas probables, suspects et confirmés sont recueillies par le biais de fiches de notification (remplies au CTE ou à la préfecture pour les décès communautaires) et de listes linéaires de laboratoire et de CTE (pour l issue). Les données concernant le suivi des contacts et les enterrements sont recueillies quotidiennement de façon agrégée auprès des préfectures. Dans la mesure où tous les décès communautaires ne font pas l objet d un remplissage de fiche de notification, des divergences entre les informations reportées par les données des rapports journaliers et les fiches de notification existent. La proportion de contacts suivis repose sur le nombre de contacts listés lors de l investigation de cas. Cette liste est sujette à des biais de mémorisation et d information. Données épidémiologiques et cartes disponibles sur

4 Résumé Au cours de la semaine 45 et 46 (2 15 Novembre 215), aucun nouveau cas confirmé d Ebola n a été notifié dans le pays, alors qu à la semaine 44 (26 Octobre 1 Novembre 215), un (1) cas confirmé a été notifié dans la préfecture de Forécariah (sous-préfecture de kaliah). Pendant la semaine 46, seule la préfecture de Forécariah est restée active (1 cas confirmé) ; aucune préfecture n est restée en «alerte». La médiane entre le début des signes de maladie et l isolement des cas confirmés est restée constante de zéro () jour par rapport à la semaine passée (figure 14). A noter que les données provenant des CTE, laboratoires et fiches de notifications sont régulièrement mises à jour. Les données présentées dans ce rapport peuvent donc différer des résultats présentés dans les rapports hebdomadaires précédents (ex: cas suspects devenus cas confirmés ou non-cas).

5 Tableau 1 : Nombre de cas confirmés et incidence par préfecture, Guinée, semaine 44-46, 215 Préfecture / Commune Nombre de cas confirmés Incidence cumulée (cas pour 1 habitants) Depuis le début de l épidémie Semaine 44 Semaine 45 Semaine 46 Semaine 46 Beyla 47 16,1 Boffa 36 17,1 Boké 32 7,1 Conakry ,4 Coyah ,7 Dabola 8 4,4 Dalaba 9 6,6 Dubreka ,8 Faranah 46 16,4 Forecariah , Fria 12 12,4 Gueckedou 27 92,5 Kankan 31 6,6 Kerouane 16 75,8 Kindia 78 17,8 Kissidougou 1 35,3 Kouroussa 18 6,7 Lola 93 53,1 Macenta ,4 Mali 5 1,7 NZerekore ,8 Pita 7 2,5 Siguiri 26 3,7 Telimélé 4 16,4 Tougue 2 1,6 Yomou 11 6,2 Total , 31,5 Depuis le début de l épidémie Communes de Conakry: Dixinn 67 48,8 Kaloum 49 78,2 Matam 7 48,7 Matoto 2 29,8 Ratoma , Total 573, 34,4 Données manquantes : 4 *Source pour les données de population : troisième recensement général de la population et de l habitation réalisé du 1 er mars au 2 avril 214, République de Guinée.

6 Base de données agrégées (sources: rapports journaliers préfectoraux) Base de données individuelles VHF (sources: CTE, labo et fiches de notification) 1. Guinée Dynamique de l'épidémie Tableau 2 : Nombre de nouveaux cas, décès communautaires, suivis des contacts, Guinée, semaine 44-46, 215 Cas Semaine 44 Semaine 45 Semaine 46 Nouveaux cas notifiés (Total) 1 Confirmés 1 Probables Suspects* Personnels de santé confirmés Issue parmi les confirmés Sortis guéris du CTE 1 3 Décès au CTE 1 Décès communautaires Enterrements (décès communautaires) Nombre de décès communautaires prélevés Nombre de décès communautaires avec enterrement sécurisé % de décès communautaires avec enterrement sécurisé ,6 98,3 Suivi des contacts A suivre Suivis % Suivis 99,7 1 Nombre de nouveaux cas confirmés/probables qui étaient des contacts enregistrés % cas confirmés/probables qui étaient des contacts enregistrés Nombre de cas confirmés/probables qui appartiennent à une chaine de transmission connue % cas confirmés/probables qui appartiennent à une chaine de transmission connue

7 Noms des chaînes de transissions actives 1-Aug Aug Aug Aug-15 7-Sep Sep Sep Sep-15 5-Oct Oct Oct Oct-15 2-Nov-15 9-Nov Nov Nov-15 1_15 11_15 12_15 13_15 14_15 15_15 16_15 17_15 18_15 19_15 2_15 21_15 22_15 23_15 24_15 25_15 26_15 27_15 28_15 29_15 3_15 31_15 32_15 33_15 34_15 35_15 36_15 37_15 38_15 39_15 4_15 41_15 42_15 43_15 44_15 45_15 46_15 Cas Confirmé et Probable Indicateurs généraux Figure 1 : Distribution hebdomadaire des cas confirmés selon le lien épidémiologique. Guinée, semaine Contact inconnu, ne faisant pas partie d une chaine Contact inconnu, faisant partie d une chaine Contact connu Semaine Figure 2 : Suivi des chaînes de transmission actives, Guinée (26 Octobre - 15 Novembre 215) Durée des chaînes et 21 jours de suivi Taille des clusters (cas probables et confirmés) RATOMA/KALIAH (Kindoyah) 75 13

8 ID de Cas Figure 3 Délais entre début des symptômes et isolement des cas confirmés des derniers 21 jours (26 Octobre - 15 Novembre 215) GUI-FOR oct nov nov nov nov.-15 Date début symptômes Délai (date d'isolement-date début symptômes) Période de Suivi Plus de 4 jours Entre 2 et 4 jours et 1 jour Figure 4 : Période de suivi des contacts après la date d'isolement des cas confirmés et probables d'ebola des derniers 21 jours (26 Octobre - 15 Novembre 215) GUI-FOR oct nov nov nov nov.-15 Date d'isolement-jour de Suivi (21) Cas Probable Décès Communautaire Cas Confirmé

9 1_14 2_14 3_14 4_14 5_14 6_14 7_14 8_14 9_14 1_14 11_14 12_14 13_14 14_14 15_14 16_14 17_14 18_14 19_14 2_14 21_14 22_14 23_14 24_14 25_14 26_14 27_14 28_14 29_14 3_14 31_14 32_14 33_14 34_14 35_14 36_14 37_14 38_14 39_14 4_14 41_14 42_14 43_14 44_14 45_14 46_14 47_14 48_14 49_14 5_14 51_14 52_14 1_15 2_15 3_15 4_15 5_15 6_15 7_15 8_15 9_15 1_15 11_15 12_15 13_15 14_15 15_15 16_15 17_15 18_15 19_15 2_15 21_15 22_15 23_15 24_15 25_15 26_15 27_15 28_15 29_15 3_15 31_15 32_15 33_15 34_15 35_15 36_15 37_15 38_15 39_15 4_15 41_15 42_15 43_15 44_15 45_15 46_15 Nombre de cas 1_14 2_14 3_14 4_14 5_14 6_14 7_14 8_14 9_14 1_14 11_14 12_14 13_14 14_14 15_14 16_14 17_14 18_14 19_14 2_14 21_14 22_14 23_14 24_14 25_14 26_14 27_14 28_14 29_14 3_14 31_14 32_14 33_14 34_14 35_14 36_14 37_14 38_14 39_14 4_14 41_14 42_14 43_14 44_14 45_14 46_14 47_14 48_14 49_14 5_14 51_14 52_14 1_15 2_15 3_15 4_15 5_15 6_15 7_15 8_15 9_15 1_15 11_15 12_15 13_15 14_15 15_15 16_15 17_15 18_15 19_15 2_15 21_15 22_15 23_15 24_15 25_15 26_15 27_15 28_15 29_15 3_15 31_15 32_15 33_15 34_15 35_15 36_15 37_15 38_15 39_15 4_15 41_15 42_15 43_15 44_15 45_15 46_15 Nombre de cas Proportion de cas confirmés décédés (en %) Figure 5 : Notification hebdomadaire des cas confirmés (par date de confirmation), probables (date de décès) et suspects (date de notification) ainsi que le taux de létalité de la semaine. Guinée, semaines 1, , 215 confirmes (n=3351) probables(n=453) suspects (n=) Létalité (moyenne mobile sur 5 semaines) Semaine de confirmation/décès/notification Figure 6 : Cas notifiés confirmés, probables et suspects par semaine de début des signes. Guinée, semaines 1, , Guinee _onset confirmes(n=3351) probables(n=453) suspects(n=) Semaine de début des signes

10 1_14 2_14 3_14 4_14 5_14 6_14 7_14 8_14 9_14 1_14 11_14 12_14 13_14 14_14 15_14 16_14 17_14 18_14 19_14 2_14 21_14 22_14 23_14 24_14 25_14 26_14 27_14 28_14 29_14 3_14 31_14 32_14 33_14 34_14 35_14 36_14 37_14 38_14 39_14 4_14 41_14 42_14 43_14 44_14 45_14 46_14 47_14 48_14 49_14 5_14 51_14 52_14 1_15 2_15 3_15 4_15 5_15 6_15 7_15 8_15 9_15 1_15 11_15 12_15 13_15 14_15 15_15 16_15 17_15 18_15 19_15 2_15 21_15 22_15 23_15 24_15 25_15 26_15 27_15 28_15 29_15 3_15 31_15 32_15 33_15 34_15 35_15 36_15 37_15 38_15 39_15 4_15 41_15 42_15 43_15 44_15 45_15 46_15 Nombre depatients admis au CTE % Positif Carte 1 : Répartition géographique des cas confirmés et niveau d alerte par préfecture, Guinée, 26/1/215 au 15/11/215 (21 derniers jours) Figure 7 : Patients admis au CTE testés positifs ou négatifs par semaine de confirmation (positifs) ou de notification (négatifs) et moyenne mobile (sur 5 semaines) du pourcentage de cas confirmés. Guinée, semaines 1, , confiremes (n=2645) non_cas(n=3675) prop_confirmes 3 Moy. mobile sur pér. (prop_confirmes) Semaine de confirmation/notification

11 Proportion de patients admis au CTE (%) 1_14 2_14 3_14 4_14 5_14 6_14 7_14 8_14 9_14 1_14 11_14 12_14 13_14 14_14 15_14 16_14 17_14 18_14 19_14 2_14 21_14 22_14 23_14 24_14 25_14 26_14 27_14 28_14 29_14 3_14 31_14 32_14 33_14 34_14 35_14 36_14 37_14 38_14 39_14 4_14 41_14 42_14 43_14 44_14 45_14 46_14 47_14 48_14 49_14 5_14 51_14 52_14 1_15 2_15 3_15 4_15 5_15 6_15 7_15 8_15 9_15 1_15 11_15 12_15 13_15 14_15 15_15 16_15 17_15 18_15 19_15 2_15 21_15 22_15 23_15 24_15 25_15 26_15 27_15 28_15 29_15 3_15 31_15 32_15 33_15 34_15 35_15 36_15 37_15 38_15 39_15 4_15 41_15 42_15 43_15 44_15 45_15 46_15 Nombre depatients admis au CTE % Positif Figure 8 : Décès communautaires testés positifs ou négatifs par semaine de confirmation (positifs) ou de notification (négatifs) et moyenne mobile (sur 5 semaines) du pourcentage de cas confirmés. Guinée, semaines 1, , confirmes(n=76) non_cas(n=18488) prop_confirmes 3 Moy. mobile sur pér. (prop_confirmes) Semaine de décès Figure 9 : Symptômes rapportés parmi les patients admis dans un CTE testés positifs ou négatifs pour lesquels au moins un symptôme était rapporté*, Guinée, semaines 1, , Cas confirmés (n=21) Non cas (n=2321) Symptôme *Données manquantes (zéro symptômes reportés) : 362/2462 parmi les cas confirmés (15%) et 599/292 parmi les non cas (21%)

12 Nomnbre cumulé de cas Proportion de patients admis au CTE exposés (%) Figure 1 : Expositions rapportées parmi les patients admis dans un CTE testés positifs ou négatifs pour lesquels au moins une exposition n était pas manquante*, Guinée, semaines 1, , Cas confirmés (n=887) Non cas (n=1134) contact funérailles voyage Nature de l'exposition reportée *Données manquantes (toutes expositions manquantes) : 1575/ 2462 (64%) parmi les cas confirmés et 1786/292 (61%) parmi les non cas. Figure 11 : Incidence cumulée des cas confirmés (en nombre cas confirmés pour 1 habitants) par groupe d âge*, Guinée, semaines 1, , < >=6 Groupe d'âge (en années) *49 données manquantes pour âge. **Source population : Annuaire sanitaire : santé en chiffre 211, ministère de sante et de l hygiène publique, Bureau de stratégie et de développement (BSD), Système National d Information Sanitaire (SNIS) ;

13 Nombre de cas ou décès Proportion des cas confirmés admis au CTE guéris (%) Figure 12 : Proportion de cas confirmés d Ebola guéris aux CTE (n=2634) par groupe d âge, Guinée, semaines 1, , ,9 63, 6 56,5 5 49,2 48, ,8 35,4 38,3 31,3 1 <1 (n=72) 1-4 (n=96) 5-9 (n=13) 1-14 (n=131) (n=23) 2-24 (n=239) (n=1269) 5-59 (n=24) >=6 (n=227) Groupe d'âge (en années) Figure 13 : Cas confirmés ou probables et décès reportés parmi le personnel soignant en fonction de leur profession, Guinée, semaines 1, , Cas confirmés ou probables (n=211) Décès (n=115) Profession

14 12_14 13_14 14_14 15_14 16_14 17_14 18_14 19_14 2_14 21_14 22_14 23_14 24_14 25_14 26_14 27_14 28_14 29_14 3_14 31_14 32_14 33_14 34_14 35_14 36_14 37_14 38_14 39_14 4_14 41_14 42_14 43_14 44_14 45_14 46_14 47_14 48_14 49_14 5_14 51_14 52_14 1_15 2_15 3_15 4_15 5_15 6_15 7_15 8_15 9_15 1_15 11_15 12_15 13_15 14_15 15_15 16_15 17_15 18_15 19_15 2_15 21_15 22_15 23_15 24_15 25_15 26_15 27_15 28_15 29_15 3_15 31_15 32_15 33_15 34_15 35_15 36_15 37_15 38_15 39_15 4_15 41_15 42_15 43_15 44_15 45_15 46_15 Moyenne mobile de délai en jours Figure 14 : Délai moyen (jours) entre début des signes et isolement pour les cas confirmés d Ebola (n=1*) (Médiane: jour), par préfecture active, Guinée, 12/1/215 au 1/11/215 (21 derniers jours) Forecariah,2,4,6,8 1 1,2 Délai entre début des signes et isolement (jours) * 5 cas confirmés ou moins avec dates de début de signes et d'isolement renseignées Données manquantes: /1cas confirmés Figure 15 : Moyenne mobile (sur 3 semaines) du délai moyen (jours) entre le début des signes et l isolement des cas confirmés d Ebola par semaine de notification, Guinée, semaines 1, , Semaine de notification

15 Nombre de cas confirmés Figure 16 : Délai (en jours) entre la date du dernier contact avec l exposition reportée* (n=333)** et la date de début des symptômes pour les cas confirmés (délai médian : 1 jours), Guinée, semaines 1, , Nombre de jours entre la première exposition connue et le début des symptômes *Expositions définies comme un contact avec un cas confirmé ou la participation à des funérailles, basées sur les informations fournies par les patients ou leurs proches. Pour les patients reportant plus d une exposition (n=1), l exposition la plus ancienne était retenue. **Parmi les 3351 cas confirmés notifiés depuis le début de l épidémie, 692ont reporté une exposition connue et 33 ont donné une date (antérieure à la date de début des (symptômes) pour cette exposition, Ici on présente seulement les cas avec un délai <26 jours.

16 Base de données agrégées (sources: rapports journaliers préfectoraux) Base de données individuelles VHF (sources: CTE, labo et fiches de notification) 2. Conakry Dynamique de l'épidémie Tableau 3 : Nombre de nouveaux cas, décès communautaires, suivis des contacts, Conakry, Guinée, semaine 44-46, 215 Semaine 44 Semaine 45 Semaine 46 Cas Nouveaux cas notifiés (Total) Confirmés Probables Suspects* Personnels de santé confirmés Issue parmi les confirmés Sortis guéris du CTE 1 Décès au CTE Décès communautaires Enterrements (décès communautaires) Nombre de décès communautaires prélevés Nombre de décès communautaires avec enterrement sécurisé % de décès communautaires avec enterrement sécurisé Suivi des contacts A suivre 43 Suivis 43 % Suivis 1 Nombre de nouveaux cas confirmés/probables qui étaient des contacts enregistrés % cas confirmés/probables qui étaient des contacts enregistrés Nombre de cas confirmés/probables qui appartiennent à une chaine de transmission connue % cas confirmés/probables qui appartiennent à une chaine de transmission connue

17 Nombre de cas ou décès 1_14 2_14 3_14 4_14 5_14 6_14 7_14 8_14 9_14 1_14 11_14 12_14 13_14 14_14 15_14 16_14 17_14 18_14 19_14 2_14 21_14 22_14 23_14 24_14 25_14 26_14 27_14 28_14 29_14 3_14 31_14 32_14 33_14 34_14 35_14 36_14 37_14 38_14 39_14 4_14 41_14 42_14 43_14 44_14 45_14 46_14 47_14 48_14 49_14 5_14 51_14 52_14 1_15 2_15 3_15 4_15 5_15 6_15 7_15 8_15 9_15 1_15 11_15 12_15 13_15 14_15 15_15 16_15 17_15 18_15 19_15 2_15 21_15 22_15 23_15 24_15 25_15 26_15 27_15 28_15 29_15 3_15 31_15 32_15 33_15 34_15 35_15 36_15 37_15 38_15 39_15 4_15 41_15 42_15 43_15 44_15 45_15 46_15 Nombre de cas Conakry n a pas de cas confirmé dans les 21 derniers jours Indicateurs généraux Figure 17 : Cas notifiés par semaine de confirmation (cas confirmés), de décès (cas probables) ou de notification (cas suspects), Guinée, semaines 1, , 215 (documentation non-exhaustive des décès communautaires non-prélevés (cas probables)) 4 35 Conakry confirmés (n=573) probables (n=38) suspects (n=) Semaine de confirmation/décès/notification Figure 18 : Cas confirmés ou probables et décès reportés parmi le personnel soignant en fonction de leur profession, zone de Conakry, semaines 1, , Cas confirmés ou probables (n=81) Décès (n=37) medecin infirmier ATS brancardier laborantin sage-femme hygieniste autre/non spécifié Profession

18 1_14 2_14 3_14 4_14 5_14 6_14 7_14 8_14 9_14 1_14 11_14 12_14 13_14 14_14 15_14 16_14 17_14 18_14 19_14 2_14 21_14 22_14 23_14 24_14 25_14 26_14 27_14 28_14 29_14 3_14 31_14 32_14 33_14 34_14 35_14 36_14 37_14 38_14 39_14 4_14 41_14 42_14 43_14 44_14 45_14 46_14 47_14 48_14 49_14 5_14 51_14 52_14 1_15 2_15 3_15 4_15 5_15 6_15 7_15 8_15 9_15 1_15 11_15 12_15 13_15 14_15 15_15 16_15 17_15 18_15 19_15 2_15 21_15 22_15 23_15 24_15 25_15 26_15 27_15 28_15 29_15 3_15 31_15 32_15 33_15 34_15 35_15 36_15 37_15 38_15 39_15 4_15 41_15 42_15 43_15 44_15 45_15 46_15 Nombre de cas Figure 19 : Cas notifiés par semaine de confirmation (cas confirmés), de décès (cas probables) ou de notification (cas suspects), parmi le personnel soignant, Conakry, semaines 1, , 215 Conakry 4 35 confirmés (n=76) probables (n=5) suspects (n=) Semaine de confirmation/décès/notification

19 Base de données agrégées (sources: rapports journaliers préfectoraux) Base de données individuelles VHF (sources: CTE, labo et fiches de notification) 3. Forécariah Dynamique de l'épidémie Tableau 3 : Nombre de nouveaux cas, décès communautaires, suivis des contacts, Conakry, Guinée, semaine 44-46, 215 Semaine 44 Semaine 45 Semaine 46 Cas Nouveaux cas notifiés (Total) 1 Confirmés 1 Probables Suspects* Personnels de santé confirmés Issue parmi les confirmés Sortis guéris du CTE 3 Décès au CTE 1 Décès communautaires Enterrements (décès communautaires) Nombre de décès communautaires prélevés Nombre de décès communautaires avec enterrement sécurisé % de décès communautaires avec enterrement sécurisé Suivi des contacts A suivre Suivis % Suivis 99,7 1 Nombre de nouveaux cas confirmés/probables qui étaient des contacts enregistrés % cas confirmés/probables qui étaient des contacts enregistrés Nombre de cas confirmés/probables qui appartiennent à une chaine de transmission connue % cas confirmés/probables qui appartiennent à une chaine de transmission connue

20 1_14 2_14 3_14 4_14 5_14 6_14 7_14 8_14 9_14 1_14 11_14 12_14 13_14 14_14 15_14 16_14 17_14 18_14 19_14 2_14 21_14 22_14 23_14 24_14 25_14 26_14 27_14 28_14 29_14 3_14 31_14 32_14 33_14 34_14 35_14 36_14 37_14 38_14 39_14 4_14 41_14 42_14 43_14 44_14 45_14 46_14 47_14 48_14 49_14 5_14 51_14 52_14 1_15 2_15 3_15 4_15 5_15 6_15 7_15 8_15 9_15 1_15 11_15 12_15 13_15 14_15 15_15 16_15 17_15 18_15 19_15 2_15 21_15 22_15 23_15 24_15 25_15 26_15 27_15 28_15 29_15 3_15 31_15 32_15 33_15 34_15 35_15 36_15 37_15 38_15 39_15 4_15 41_15 42_15 43_15 44_15 45_15 46_15 Nombre de cas Indicateurs généraux Figure 2 : Cas notifiés par semaine de confirmation (cas confirmés), de décès (cas probables) ou de notification (cas suspects), Guinée, semaines 1, , 215 (documentation non-exhaustive des décès communautaires non-prélevés (cas probables)) Forecariah confirmés (n=433) probables (n=52) suspects (n=) Semaine de confirmation/décès/notification Carte 2 : Répartition géographique des cas confirmés et probables d Ebola par sous-préfecture pour la semaine 46, 215, notifiés dans les 21 derniers jours et depuis le début de l épidémie

21 Décès/alertes Figure 21 : Nombre de décès attendus, notifiés, prélevés et sécurisés Forecariah alertes décès communautaires décès prélevés décès sécurisés décès attendus