MASTER SCIENCES ET NUMERIQUE POUR LA SANTE

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1 MASTER SCIENCES ET NUMERIQUE POUR LA SANTE RÉSUMÉ DE LA FORMATION Type de diplôme : Master (LMD) Domaine ministériel : Sciences, Technologies, Santé Savoir faire et compétences Compétences communes à l'ensemble des parcours types de cette formation Certaines UE sont mutualisées sur 2 spécialités du Master STIC pour la santé mais aussi avec d autres masters de l Université Montpellier. Concernant les mutualisations au sein du Master STIC pour la santé, les étudiants disposent : En S1 : Anglais (5 ECTS), Structures et problématiques de Santé (5 ECTS) et Projet (5 ECTS) ; En S2 : Champs d'application des TIC en santé (2,5 ECTS), économie et organisation Santé (2,5 ECTS) et Projet/Stage (10 ECTS). En S3 : Projet (5 ECTS) En S4 : UE d Analyse bibliographique / veille scientifique (5 ECTS) et Introduction aux entreprises / à la recherche (5 ECTS). PLUS D'INFOS Crédits ECTS : 120 Nature de la formation : Mention De plus, sur les spécialités PhyMed et IDS, les UEs suivantes sont mutualisées : En S1 : Robotique médicale et Neuroprothèse 1 (5 ECTS) ; En S2 : Capteurs et images (5 ECTS) En S3 : Robotique médicale et Neuroprothèse 2 (5 ECTS). Organisation de la formation - Physique biomédicale - Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) - Bioinformatique, connaissances, données (BCD) Contrôle des connaissances Un diplôme intermédiaire est délivré au cours de cette formation Insertion professionnelle Page 1 / 16

2 * Physique biomédicale : L objectif est de former de biophysiciens capables de concevoir et d'appliquer les techniques physiques au diagnostic, thérapeutique, imagerie médicale. Les débouchés se portent sur des applications de la physique à deux grands domaines, la biologie et les sciences médicales, en répondant au besoin des professionnels en développement, utilisation et maintenance des instruments physiques dans le secteur médical et hospitalier. Cette formation peut également leur donner un accès au milieu hospitalier en tant que «personne spécialisée en physique biomédicale» et aux métiers de l imagerie médicale, avec pour charge le développement de méthodes d imagerie et d instrumentation adéquates. La poursuite des études par une thèse d'université est également possible donnant accès aux emplois de l enseignement supérieur et de la recherche publique. Des chercheurs ainsi formés à l interface physique/biomédical pourraient contribuer plus efficacement au développement de nouvelles technologies pour les sciences de la vie dans le secteur privé des biotechnologies, de l instrumentation biomédicale, ou de l industrie pharmaceutique. Les nombreux enseignements en radio--physique et radiothérapie offrent la possibilité de présenter le concours en physique radiologique et médicale avec examen de sortie permettant d'obtenir le Diplôme de Qualification en Physique Radiologique et Médicale (DQPRM). Cette voie peut ouvrir l accès au métier de Physicien médical travaillant en milieu hospitalier, universitaire ou industriel. * Bioinformatique, connaissances, données : Cette spécialité a pour objet d'offrir des connaissances pluridisciplinaires dans le domaine de la bioinformatique, des Systèmes d'informations, de l'extraction de Connaissances et de la modélisation du vivant. Ces compétences seront acquises par les étudiants en manipulant et en établissant les liens entre données de différentes natures (séquences biologiques, bases de données, ontologies, ) ; en maîtrisant les outils bioinformatiques et les banques de données publiques; en comprenant les problématiques liées à la santé ; en concevant et en gérant les architectures des systèmes Page 2 / 16

3 d'information ; en développant des logiciels, bases de données, outils web dédiés ; en analysant des données issues des disciplines en «omiques» (transcriptomique, génomique, ) ; en acquérant la maîtrise du processus d'extraction de connaissances et les techniques de fouilles de données dans un but d'aide à la décision ; en comprenant les enjeux sociétaux, éthiques et industriels liés à l'utilisation des TIC en santé. Les compétences acquises leur permettront de traiter et d'analyser des masses de données produites en santé et en agroalimentaire (dossier médical personnalisé, télésanté, imagerie médicale, données issues de capteurs, données de séquences,...). Dans le secteur privé, ils travailleront dans une équipe R & D pour l'industrie pharmaceutique ou agro---alimentaire, que ce soit dans de grands groupes ou dans des PME innovantes. Alternativement, ils pourront occuper des postes de cadre et à terme de chef de projet dans des Sociétés de Service en Informatique (SSII) pour la production d'outils logiciels dédiés. Dans le secteur public, les professionnels formés occuperont des emplois d'ingénieur hospitalier, ou d'ingénieur à l'interface entre l'informatique et la santé. La formation offre également la possibilité de poursuivre une thèse dans le domaine des TIC et de la santé Ingénierie des dispositifs pour la Santé. * La spécialité «Ingénierie des dispositifs pour la Santé» (en abrégé : IDS) vise à former les étudiants à la maîtrise théorique et pratique de concepts et dispositifs technologiques appliqués au biomédical. De manière à atteindre cet objectif, un socle de connaissances de base est dispensé à travers des enseignements d'électronique analogique, numérique ou de traitement du signal (analogique, numérique, image). Sur la première année, des parcours spécifiques sont aménagés en fonction de l'origine des étudiants, les spécialistes d'électronique s'intégrant dans des unités d'enseignement (UE) mutualisées avec le Master EEA et les spécialistes de biologie/santé dans des UE spécifiques d'électronique. Les notions abordées sont ensuite développées dans le cadre d'ue plus spécialisées et s'appuyant sur les compétences de plusieurs laboratoires de recherche montpelliérains. Ces modules concernent, entre autres, les capteurs et l'instrumentation biomédicale, la robotique médicale, les Page 3 / 16

4 neuro---prothèses ou la modélisation et régulation du mouvement humain. Quatre modules professionnalisants (deux projets et deux stages) permettent de plus aux étudiants d'acquérir des compétences en gestion de projets à caractère scientifique/médical et industriel ou de s'initier aux métiers de la recherche dans les domaines de la Santé. Les diplômés sont susceptibles de s'intégrer directement en tant que cadres dans des services de recherche et développement, de production ou de maintenance. Ils peuvent aussi assurer le conseil technique et la formation de l'équipe qui va commercialiser du matériel ainsi que la formation des utilisateurs (médecins, corps médical) lors de la mise en service du matériel (fonction d'ingénieur d'application). La proximité avec les laboratoires de recherche offre de plus des opportunités poursuite des études par une thèse d'université donnant accès aux emplois de l enseignement supérieur et de la recherche publique. Composante(s) Montpellier Responsable(s) LE CLEZIO Emmanuel emmanuel.le-clezio@umontpellier.fr Page 4 / 16

5 Physique biomédicale Organisation de la formation M1 - Physique biomédicale M1S1 - Physique biomédicale - profil Biologie Physique expérimentale Eléments de base en radioactivité Structures et problematiques de Sante Projet PhyMed Biochimie structurale Physique des systemes biologiques Conferences medecine et TIC Economie et organisation Sante Prolegomenes biologie cellulaire et fonctions biologiques Prolegomenes Physique Prolégomène de mathématiques Prolegomenes notions de bases de la sante Prolégomènes algorithmiques Physique experimentale 4 M1S1 - Physique biomédicale - profil Physique Physique expérimentale Eléments de base en radioactivité Structures et problematiques de Sante Projet PhyMed Biochimie structurale Physique des systemes biologiques Conferences medecine et TIC Economie et organisation Sante Prolegomenes biologie cellulaire et fonctions biologiques Prolégomène de mathématiques Prolegomenes Physique Prolegomenes notions de bases de la sante Prolégomènes algorithmiques Techniques de Biochimie 1 M1S2 - Physique biomédicale PLUS D'INFOS Nature de la formation : Parcours Page 5 / 16

6 Interactions rayonnement-matière. Radioprotection Physiologie cellulaire pour electronicien Anglais Physique et propagation des rayonnements Radiotherapie et dosimetrie des rayonnements Stage M1 PhyMed - Liste à choix S2 Physique médicale : 1 UE à choisir parmi Capteurs et Traitement d'image Robotique Médicale et Neuro-Prothèse Robotique médicale 1 Neuroprothèse 1 M2 - Physique biomédicale M2S3 - Physique biomédicale Imagerie médicale et 3D Physique de l'imagerie medicale Biophotonique et spectrometrie de masse Microscopies nano-sondes, champ proche et onde evanescentes Radioprotection Projet PhyMed - M2S4 - Physique biomédicale Introduction aux entreprises à la recherche Analyse bibliographique Veille scientifique Stage en entreprise, structure hospitaliere ou laboratoire Composante(s) Montpellier Page 6 / 16

7 Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) Organisation de la formation 1 2 M1 - Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) M1S1 - Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) profil Traitement du Signal Déterministe Génie Informatique 1 - Outils d'acquisition et de Mesure Electronique Analogique Math/Stat/Analyse de Donnees Structures et problematiques de Sante Conferences medecine et TIC Economie et organisation Sante Projet M1 IDS Prolégomène de mathématiques Prolegomenes biologie cellulaire et fonctions biologiques Prolegomenes notions de bases de la sante M1S1 - Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) profil Prolégomène de mathématiques Prolegomenes notions de bases de la sante Prolégomènes Electronique Chaîne d'acquisition / Traitement du Signal pour non EEA Électronique (niveau 1) Math/Stat/Analyse de Donnees Structures et problematiques de Sante Conferences medecine et TIC Economie et organisation Sante Projet M1 IDS M1S2 - Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) - Profil 1 Robotique Capteurs et Applications 1 PLUS D'INFOS Nature de la formation : Parcours Page 7 / 16

8 Capteurs et image Anglais Projet/ stage S2 IDS - Liste à choix S2 IDS : 1 UE à choisir parmi Robotique Médicale et Neuro-Prothèse Neuroprothèse 1 Robotique médicale 1 M1S2 - Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) - Profil 2 Robotique Imagerie Capteurs US pour le Biomédical Anglais Projet/ stage S2 IDS - Liste à choix S2 IDS : 1 UE à choisir parmi Robotique Médicale et Neuro-Prothèse Neuroprothèse 1 Robotique médicale 1 M2 - Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) M2S3 - Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) Thermographie IR, Detecteurs optiques et US Projet M2 IDS Microfabrication/Microfluidique Acquisition de données et traitement du signal pour le biomédical Modélisation/Régulation - Liste à choix S3 IDS : 1 UE à choisir parmi Neuro-prothèses et Robotique médicale 2 Robotique médicale 2 Neuroprothèse 2 M2S4 - Ingénierie des Dispositifs pour la Santé (IDS) Introduction aux entreprises à la recherche Stage en entreprise, structure hospitaliere ou laboratoire Analyse bibliographique Veille scientifique Composante(s) Page 8 / 16

9 Montpellier Page 9 / 16

10 Bioinformatique, connaissances, données (BCD) Objectifs L'objectif du parcours BCD est de permettre à des étudiants issus des licences sciences et numériques (informatique, mathématique,...), STAPS/Santé ou biologie de pouvoir acquérir les compétences liées à la bioinformatique comme aux systèmes d'information en santé, que ce soit du coté analyse des données du domaine, ou du coté intégration et gestion de ces données. Plus précisément : PLUS D'INFOS Nature de la formation : Parcours L' objectif scientifique du parcours est de former des scientifiques pluri-disciplinaires ayant des compétences approfondies en analyse (statistique, traitements algorithmiques, fouille) de données bioinformatiques (séquences, données génomiques, transcriptomiques, protéomiques,..., structures, données d'expression,...), en conception d'outils, de banques de données et de systèmes d'information pour ce type de données. Les professionnels formés acquièrent aussi une connaissance pratique du milieu médical tout en ayant une vision claire des enjeux en biologiesanté. L' objectif professionnel est de former des cadres qui exerceront le métier de bioinformaticien dans des équipes de R&D d'entreprises (domaine pharmaceutique de type Big Pharma ou start-up), dans des équipes de laboratoires (instituts de recherche, EPST), ou pourront intégrer des Sociétés de Service en Informatique (SSII) pour la production d outils logiciels dédiés. Les professionnels formés seront capables de remplir de multiples missions : * Développer des outils logiciels destinés à visualiser, filtrer ou extraire des connaissances des masses de données en usage dans le domaine, et dont le volume s accroît régulièrement en raison des progrès en biotechnologie (séquençage 454, etc) ; Page 10 / 16

11 * Analyser les données par des méthodes algorithmiques et statistiques reposant si besoin est sur une modélisation probabiliste des phénomènes du Vivant ; * Assurer la maîtrise d œuvre de banques et entrepôts de données génomiques et moléculaires, de systèmes d information intégrant des données de natures hétérogènes, tout en mettant en place des moyens d accès adéquats (interfaces web, LIMS,...). Les emplois types vont de l ingénieur R&D au chef de projet en passant par la maîtrise d œuvre pour des organismes de Santé. Savoir faire et compétences L'objectif du parcours BCD est de permettre à des étudiants issus des licences sciences et numériques (informatique, mathématique,...), STAPS/Santé ou biologie de pouvoir acquérir les compétences liées à la bioinformatique comme aux systèmes d'information en santé, que ce soit du coté analyse des données du domaine, ou du coté intégration et gestion de ces données. Plus précisément : L' objectif scientifique du parcours est de former des scientifiques pluri-disciplinaires ayant des compétences approfondies en analyse (statistique, traitements algorithmiques, fouille) de données bioinformatiques (séquences, données génomiques, transcriptomiques, protéomiques,..., structures, données d'expression,...), en conception d'outils, de banques de données et de systèmes d'information pour ce type de données. Les professionnels formés acquièrent aussi une connaissance pratique du milieu médical tout en ayant une vision claire des enjeux en biologiesanté. L' objectif professionnel est de former des cadres qui exerceront le métier de bioinformaticien dans des équipes de R&D d'entreprises (domaine pharmaceutique de type Big Pharma ou start-up), dans des équipes de laboratoires (instituts de recherche, EPST), ou pourront intégrer des Sociétés de Service en Informatique (SSII) pour la production d outils logiciels dédiés. Page 11 / 16

12 Les professionnels formés seront capables de remplir de multiples missions : * Développer des outils logiciels destinés à visualiser, filtrer ou extraire des connaissances des masses de données en usage dans le domaine, et dont le volume s accroît régulièrement en raison des progrès en biotechnologie (séquençage 454, etc) ; * Analyser les données par des méthodes algorithmiques et statistiques reposant si besoin est sur une modélisation probabiliste des phénomènes du Vivant ; * Assurer la maîtrise d œuvre de banques et entrepôts de données génomiques et moléculaires, de systèmes d information intégrant des données de natures hétérogènes, tout en mettant en place des moyens d accès adéquats (interfaces web, LIMS,...). Les emplois types vont de l ingénieur R&D au chef de projet en passant par la maîtrise d œuvre pour des organismes de Santé. Organisation de la formation M1 - Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) M1S1 - Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) Projet M1 BCD Structures et problematiques de Sante Economie et organisation Sante Conferences medecine et TIC - Liste à choix 1 S1 BDC : 1 UE à choisir parmi Réseaux et communication Systeme - Liste à choix 2 S1 BDC : 1 UE à choisir parmi Système d'information et bases données Bases de données avancées - Liste à choix 3 S1 BDC : 1 UE à choisir parmi Programmation Page 12 / 16

13 Algorithmique du texte - Liste facultative S1 BCD : 2 UE à choisir parmi Prolégomènes algorithmiques Prolegomenes notions de bases de la sante Prolegomenes biologie cellulaire et fonctions biologiques M1S2 - Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) Stage M1 BCD Anglais Analyse et conduite de projet - Liste à choix 1 S2 BCD : 1 UE à choisir parmi Introduction Algorithmique pour la bioinformatique Telemedecine Bases moleculaires de l'expression genique - Liste à choix 2 S2 BCD : 1 UE à choisir parmi Info. Biologique Outils bioinformatiques Systemes d'information en Sante - Liste à choix 3 S2 BCD : 1 UE à choisir parmi Alignement et phylogenie Extraction des connaissances dans les données M2 - Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) M2S3 - Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) - profil Formation continue Prolégomènes algorithmiques Projet M2 BCD Système d'information et bases données Programmation Systeme Analyse de donnees - Liste à choix 1 S3 BCD profil 1 : 1 UE à choisir parmi Modelisation Informatique pour les medicaments Structures de molecules Omique Analyse du proteome et de l'interactome SI en industrie pharmaceutique Page 13 / 16

14 - Liste à choix 2 S3 BCD profil 1 : 1 UE à choisir parmi Elements de biologie des systemes Complexité algorithmique Théorie de l'information Méthodes et algorithmique probabilistes E-applications Nouvelles approches pour la persistance des données Gestion des connaissances pour l'aide à la décision Imagerie médicale et 3D Jeux sérieux Logiciel embarqué Fouille de données Programmation avancée Administration de bases de données Algorithmique et complexite Optimisation combinatoire Graphes, algorithmique et complexité Math/Stat/Analyse de Donnees Technologies du web Habitat intelligent pour la sante Algorithmique et optimisation pour la bioinformatique avanc. M2S3 - Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) - profil Formation initiale Projet M2 BCD Analyse de donnees Modelisation Informatique pour les medicaments - Liste à choix 1 S3 BCD profil 2 : 1 UE à choisir parmi Elements de biologie des systemes Habitat intelligent pour la sante - Liste à choix 2 S3 BCD profil 2 : 1 UE à choisir parmi Algorithmique et optimisation pour la bioinformatique avancees Extraction de connaissances avancée - Liste à choix 3 S3 BCD profil 2 : 1 UE à choisir parmi Complexité algorithmique Théorie de l'information Méthodes et algorithmique probabilistes E-applications Page 14 / 16

15 Nouvelles approches pour la persistance des données Gestion des connaissances pour l'aide à la décision Imagerie médicale et 3D Jeux sérieux Logiciel embarqué Fouille de données Programmation avancée Administration de bases de données Algorithmique et complexite Optimisation combinatoire Graphes, algorithmique et complexité Math/Stat/Analyse de Donnees Technologies avancees du web Technologies du web - Liste à choix 4 S3 BCD profil 2 : 1 UE à choisir parmi Structures de molecules Omique Analyse du proteome et de l'interactome SI en industrie pharmaceutique M2S4 - Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) profil Formation continue Stage court BCD S4 profil 1 Alignement et phylogenie Introduction Algorithmique pour la bioinformatique Info. Biologique Outils bioinformatiques Analyse et conduite de projet - Liste à choix S4 BCD profil 1 : 1 UE à choisir parmi Développement logiciel pour mobiles Ingénierie des connaissances Analyse et traitemen des images Structures de donnees Systemes d'information en Sante Extraction des connaissances dans les données Telemedecine Introduction aux entreprises à la recherche M2S4 - Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) profil Formation initiale / Bi-diplomation Introduction aux entreprises à la recherche Page 15 / 16

16 Stage en entreprise, structure hospitaliere ou laboratoire Analyse bibliographique Veille scientifique M2S3 - Bioinformatique, Connaissances, Données (BCD) - profil Bi-diplomation Projet M2 BCD Analyse de donnees Modelisation Informatique pour les medicaments Conferences medecine et TIC Structures et problematiques de Sante - Liste à choix 1 S3 BCD profil 2 : 1 UE à choisir parmi Elements de biologie des systemes Habitat intelligent pour la sante - Liste à choix 2 S3 BCD profil 2 : 1 UE à choisir parmi Extraction de connaissances avancée Algorithmique et optimisation pour la bioinformatique avanc. Composante(s) Montpellier Contact(s) Claudie FABRY claudie.fabry@umontpellier.fr Page 16 / 16