L ADN (DNA) Dans tous ses états. Présentation du TP

Transcription

1 L ADN (DNA) Dans tous ses états et Présentation du TP

2 Depuis quand est-il connu? Louis Pasteur Mendel

3 Depuis quand est-il connu? Friedrich Miescher Nucléine Richard Altman Nucléine Protéines + Substance acide

4 Depuis quand est-il connu? Albrecht Kossel Phoebus Levene Nucléine Découvre les bases azotées : A, C, T et G

5 Et sa fonction? Avery, MacLoed et McCarty Alfred Hershey et Marta Chase

6 Expérience de Avery, MacLoed et McCarty

7 Expérience de Avery, MacLoed et McCarty Observation préliminaire pour l expérience :

8 Expérience de Avery, MacLoed et McCarty Protéine ARN ADN Carbohydrate Lipide

9 Et sa structure? Watson et Crick

10 Et sa structure? Rosalind Elsie Franklin Rosalind Elsie Franklin

11 Nature chimique de l ADN

12 Quelle est la fonction de l ADN? L ADN est le support de l hérédité ***

13 Qu est-ce que l ADN: Quelle en est la nature chimique? Ou se trouve t-il dans la cellule? Quelles informations y sont stockées? Comment sont-elles organisées? Comment fonctionne t-il? Comment code-t-il les mécanismes de la vie? Comment évolue-t-il?

14 Ou trouve-t-on l ADN dans les cellules?

15 Ou trouve-t-on l ADN dans les cellules?

16 Ou trouve-t-on l ADN chez les végétaux?

17 Ou trouve-t-on l ADN chez les bactéries?

18 Ou trouve-t-on l ADN chez les phages et virus?

19 Quelle est la fonction de l ADN? L ADN est le support de l hérédité *** - Une molécule, présente dans toutes les cellules vivantes. - Elle renferme l'ensemble des informations nécessaires au développement et au fonctionnement d'un organisme

20 Qu est-ce que l ADN: Quelle en est la nature chimique? Ou se trouve t-il dans la cellule? Quelles informations y sont stockées? Comment l information y est-elle organisées? Comment fonctionne t-il? Comment code-t-il les mécanismes de la vie? Comment évolue-t-il?

21 Qu est-ce que l ADN?

22 Qu est-ce que l ADN? E%%#$6-6/-'0:FG%$4$4'##D$)B NOA*P%&Q,P#)A=&25/&P)++)#9'J&'%&L#)9%J&'%&8#J%&R&?/-&+)D9%J&'%&.111&L#$%J&

23 Dogme central de flux de l information en biologie moléculaire >?1 H>33IHH3I3>HIHI >*1& >JII3>>I3IJ>3>3 ".'0D-#$ E%"& C+#& %9& B#+& Q)J&

24 Un codon de 3 nucléotides code pour un amino-acide >JII3>>I3IJ>3>3 >*1& ".'0D-#$ E%"& C+#& %9& B#+& Q)J&

25 Qu elles sont les autres informations codées par les génomes? >*1& >*1. S)8*J*P%& >*10

26 Quelle est la taille du génome et est-elle l expression de la complexité d un organisme?

27 La taille du génome est-elle l expression de la complexité d un organisme?

28 Le paradoxe de la C-value

29 Complexité des séquences géniques

30 Comment les séquences codantes sont-elles organisées? EA8/6%&-#$

31 Comment les séquences codantes sont-elles organisées? >?1 XY*A&.& XY*A&/& ZA"9*A&.& >*19.D2&$))8=$. XY*A&2& ZA"9*A&/& XY*A&;& ZA"9*A&2& Transcription Processing (maturation) >*1&$))8=$. Traduction ".'0D-#$

32 Quelle est la taille du génome et est-elle l expression de la complexité d un organisme?

33 Comment les séquences codantes sont-elles organisées? >?1 XY*A&.& XY*A&/& ZA"9*A&.& XY*A&2& ZA"9*A&/& ZA"9*A&2& Transcription >*19.D2&$))8=$..& XY*A&;& /& 2& ;& Processing différenciel >*1&$))8=$..& /& ;& Traduction ".'0D-#$

34 Certaines séquences nucléotidiques ne codant pas pour des protéines sont répétées en tandem

35 Comment l ADN est-il organisé au niveau du chromosome?

36 Comment l ADN est-il organisé au niveau du chromosome?

37 Comment l ADN est-il organisés?

38 comment l ADN est-il compactés?

39 Dans le noyau de la cellule interphasique, l ADN est-il organisé? \D0D.'(:.'&8<#$ 1%(/D'/$ [%(:.'&8<#$

40 Qu est-ce que l ADN: Quelle en est la nature chimique? Ou se trouve t-il dans la cellule? Quelles informations y sont stockées? Comment l information y est-elle organisées? Comment fonctionne t-il? Comment code-t-il les mécanismes de la vie? Comment évolue-t-il?

41 Notre perception de l ADN dans la biologie d aujourd hui? Un gène = une fonction? ou Gène = prédisposition? Tout évènement biologique (cellulaire) est multifactoriel

42 Pour comprendre comment fonctionne notre génétique Nouveaux types de connaissances & Génome transcriptome Protéome Interactome métabolome Nécessité d une interaction entre : biologie moléculaire/cellulaire et informatique

43 Exemple d interactome dans le cancer de la prostate

44 Transcriptomique, Protéomique Les laboratoires changent d aspect

45 Un mécanisme caché de la sélection génique transmissible: L épigénétique

46 Un mécanisme caché de la sélection génique transmissible: L épigénétique

47 Un mécanisme caché de la sélection génique transmissible: L épigénétique

48 Qu est-ce que l ADN: Quelle en est la nature chimique? Ou se trouve t-il dans la cellule? Quelles informations y sont stockées? Comment l information y est-elle organisées? Comment fonctionne t-il? Comment code-t-il les mécanismes de la vie? Comment évolue-t-il?

49 L ADN génomique une molécule possédant une plasticité: La transposition

50 L ADN génomique une molécule possédant une plasticité: La transposition

51 L ADN génomique une molécule possédant une plasticité: La transposition

52 Pour comprendre comment fonctionne notre génétique & Le séquençage

53 Historique et évolution de la détermination des bases LTMQB?D('%A$.0$4$/8)0.%(0%.$4$/5>?198.f.8#a/-#;3.-(a$0g80)'#&

54 Historique et évolution de la détermination des bases LTMQB?D('%A$.0$4$/8)0.%(0%.$4$/5>?198.f.8#a/-#;3.-(a$0g80)'#& LThhB".$&-F.$&D0:'4$4$)DG%$#i8=$98.f.$4$.-(a+8#=$. +DG%$#i8=$4%9.$&-$.'.=8#-)&$68(0D.-'9:8=$jLhSOMQTN96R&

55 Séquençage Séquençage par la méthode l ADN de Sanger Méthode Sanger

56 Séquençage Séquençage par la méthode l ADN se Sanger Méthode Sanger

57 Séquençage Séquençage par la méthode de l ADN de Sanger Méthode Sanger

58 Séquençage de l ADN Méthode Sanger TGTAAAGACTCATGCTCAGTAATGGAAAAGACAAGAAGGAAGCCCTCCCCACT CATGC

59 Historique et évolution de la détermination des bases LTMQB?D('%A$.0$4$/8)0.%(0%.$4$/5>?198.f.8#a/-#;3.-(a$0g80)'#& LThhB".$&-F.$&D0:'4$4$)DG%$#i8=$98.f.$4$.-(a+8#=$. +DG%$#i8=$4%9.$&-$.'.=8#-)&$68(0D.-'9:8=$jLhSOMQTN96R& VNNLB+DG%$#i8=$4%=D#'&$:%&8-#O&D0:'4$+8#=$.R 2Q;S&-//-8.4)4$68)$) 2LL8#)4$.$(:$.(:$)Ok#0$.#8<'#8/R 29/%)4$Q&-//-8.4)4$4'//8.)&

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68 Historique et évolution de la détermination des bases 1'%A$//$)9$.)9$(<A$)9'%./$)899/-(8<'#)4%)DG%$#i8=$ "[086/-))$&$#04$(808/'=%$)4$A8.-86-/-0D)=D#D<G%$)-#4-A-4%$//$) "[0%4$4$/8)0.%(0%.$_#$4%(:.'&')'&$ "[0%4$45%#$#)$&6/$4$&-(.'2'.=8#-)&$) "+DG%$#i8=$4$/5>?18#(-$# "+DG%$#i8=$4$/5>*1$b9.-&D48#)4-oD.$#0)<))%)