TP 1.2 : SYNTHESE DE LA PROTEINE HEMOGLOBINE

Transcription

1 Le cytoplasme des hématies contient de l hémoglobine, protéine constituée d une chaîne de 144 acides aminés. Le gène de l hémoglobine β se localise dans le noyau, au niveau du chromosome 11 (HB α sur le chromosome 16). Comment le gène HBβ détermine-t-il la séquence d acides aminés de l hémoglobine β? SUIVI DU TP TP 1.2 : SYNTHESE DE LA PROTEINE HEMOGLOBINE Un brin d ADN est transcrit en ARNm dans le noyau : le gène de l hémoglobine β permet la fabrication d une chaîne d ARNm correspondant au gène HBβ. TRANSCRIPTION PROTOCOLE ANAGENE L ARNm de HBβ migre par les pores nucléaires dans le cytoplasme où elle est traduite en hémoglobine β. Chaque triplet de l ARNm correspond à 1 acide aminé. Le tableau de correspondance entre triplets d ARNm et acides aminés est le code génétique. CODE GENETIQUE L ARNm de HBβ est traduit en séquence d acides aminés constituant l hémoglobine HBβ, grâce à la machinerie du cytoplasme : ribosome et adaptateur. TRADUCTION COMPTE-RENDU 1) Représentez dans un tableau les variations de transcription et de traduction des 3 allèles de HB : A, var, THA1 : les premiers et derniers triplets d ADN, d ARNm, les premiers et derniers acides aminés, les variations de nucléotides ou de triplets d ADN et d ARNm avec celles de la séquence d acides aminés. 2) Expliquer, dans un texte court, pourquoi les informations génétiques de l ARNm et de l ADN sont les mêmes. 3) Expliquer, dans un texte court, pourquoi l information génétique contenue dans la protéine correspond à celle contenue dans l ARNm.

2 TRANSCRIPTION HBβ Le logiciel ADNARN visualise le mécanisme de transcription : Chemin dans le réseau : classe, SVT, TP 1.2 Dans ANAGENE (chemin : programmes, anagène), sélectionner les séquences betacod.adn, betavar.adn, tha1cod.adn Comparer les séquences d ADN de ces 3 allèles du gène de l hémoglobine β Convertir les séquences d ADN en séquences d ARNm. Relever les longueurs, les 1 et derniers triplets de nucléotides, ainsi que les nucléotides différents.

3 CODE GENETIQUE Pour comprendre la traduction de la séquence d ARNm en séquence d acides aminés, il faut comprendre le fonctionnement du code génétique. Rechercher le fonctionnement du code génétique en associant quelques triplets successifs d ARNm aux acides aminés correspondant, avec l animation «CODE GENETIQUE». Chemin dans le réseau : classe, SVT, TP 1.2

4 TRADUCTION EN SEQUENCE D ACIDES AMINES Dans le logiciel TRANSTRAD, traduire le début de la séquence d ARNm de l hémoglobine β en acides aminés. Copier cette séquence puis la coller dans le logiciel TRANSTRAD ATGGTGCACCTGACTCCTGAGGAGAAGTCT Dans ANAGENE, convertir les séquences d ADN en séquences peptidiques : betacod.adn, betavar.adn, tha1cod.adn.

5 VARIATIONS DE SEQUENCES : Pour comprendre l importance de la séquence de nucléotides et du code génétique, il faut comparer les séquences protéiques produites : Afficher les séquences suivantes : tha1.pro et beta.pro (beta.pro est la séquence d acides aminés produite par betacod.adn comme par betavar.adn). Comparer ces deux séquences. La comparaison de ces deux séquences fera apparaître les conséquences de la présence d un codon stop dans la séquence d ARNm (et donc dans l ADN à l origine). Repérer la position de ce codon stop dans l ARNm et dans l ADN.

6 PROTOCOLE ANAGENE Les icônes de la barre d outils Les bulles d aide Effacer Coller Copier Couper Imprimer Enregistrer Classeur Documents Thèmes d étude Banque de séquences fermer curseur code génétique information dot plot enzymes de restriction comparer. convertir Pour vous aider, une bulle d aide s affiche sur l objet pointé par le curseur de la souris Editer une séquence Sélectionner cette séquence dans l un des répertoires d Anagène : - Banque de séquences - Thèmes d étude - Programmes et documents ou par Fichier/ Ouvrir Traiter une séquence Utiliser pour cela le menu traiter. On peut comparer les séquences ou convertir ces séquences. Pour traiter une séquence, elle doit être au préalable sélectionnée. INFORMATIONS SUR LA SEQUENCE SELECTIONNEE Utiliser le menu informations / informations sur la ligne pointée pour obtenir des informations sur la séquence sélectionnée par rapport à la séquence choisie comme référence. ATTENTION : la séquence de référence est toujours placée en premier. Les flèches permettent de déplacer la séquence sélectionnée (vers le haut, vers le bas). Sélectionner une séquence Le bouton de sélection affiche une flèche rouge. Cliquer sur le bouton de sélection. La séquence sélectionnée s inscrit sur fond blanc. Elle est qualifiée de ligne pointée. Comparer des séquences La comparaison des séquences ne peut se faire que sur des séquences de même nature. La séquence référence sera toujours placée en premier. La comparaison simple est utilisée pour comparer deux allèles d un même gène ou des séquences homologues.