Atelier de l Ecole doctorale : Latex, Lyx, and friends Chapitre 2 : Gestion de la bibliographie

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1 Connection Open/Libre/MS Office Atelier de l Ecole doctorale : Latex, Lyx, and friends Chapitre 2 : Gestion de la bibliographie Murat Yıldızoğlu GREΘA Université de Bordeaux bibtex &

2 Sections : bibtex Connection Open/Libre/MS Office 1 bibtex et L A TEX 2 3 Petite introduction au 4 Connection Open/Libre/MS Office bibtex &

3 bibtex Connection Open/Libre/MS Office bibtex est le moteur qui extrait de la base de données (BDD) bibliographiques (le fichier.bib) les références citées dans votre document à partir des pointeurs que le L A TEX inclut dans le fichier.aux. LYX gère tout cela en arrière plan : 1 Il compile une première fois mondocument.tex avec pdflatex pour générer le fichier mondocument.aux, en même temps que le fichier mondocument.pdf ; 2 Compile avec bibtex pour extraire, dans le fichier mondocument.bbl, les références citées 3 Recompile avec pdflatex pour les insérer dans le fichier mondocument.pdf bibtex &

4 Connection Open/Libre/MS Office Rappel : le système L A TEX Le système LyX - LaTeX LyX.lyx BibDesk, Jabref,.tex.bib.aux.toc.log.idx (pdf)latex.aux.bbl.blg bibtex.pdf.html bibtex &

5 Connection Open/Libre/MS Office Fichier bibtex Pour l étape (2.) (l extraction), bibtex doit pouvoir lire un fichier.bib qui contient la base de données bibliographiques où chaque élément apparaît avec une clé unique, celle que nous utilisons pour introduire des citations dans le document (via les commandes \cite{clé}) La mise en forme des références dépend du style de bibliographie qu on utilise (les styles sont définis dans des fichiers.bst et bibtex vient avec un ensemble de styles déjà créés) Nous allons nous limiter au style authordate3, combiné avec le type de bibliographie natbib. Les revues utilisent souvent leur propre feuilles de style pour les articles et pour la bibliographie. bibtex &

6 Sections : bibtex Connection Open/Libre/MS Office 1 bibtex et L A TEX 2 3 Petite introduction au 4 Connection Open/Libre/MS Office bibtex &

7 Connection Open/Libre/MS Office Contenu du fichier bibtex Une BDD bibtex est un fichier très simple qui contient du texte pur qui mélange, comme un fichier L A TEX, du texte et des balises Son contenu est organisé en «fiches» donnant des informations bibliographiques sur chaque document répertorié Selon le type du document (article, livre, miméo, thèse, etc.) certaines données (champs en langage de BDD) doivent être renseignées pour que bibtex puisse composer la référence correspondante Les balises servent à distinguer les différentes fiches et les différents champs d une même fiche Chaque fiche est déclarée par un ensemble de balises du bibtex &

8 Connection Open/Libre/MS Office Exemples de Author = {Arthur, Brian W.}, Journal = {American Economic Review}, Pages = { }, Title = {Inductive Reasoning and Bounded Rationality}, Volume = {84}, Year = {1994} Author = {Hommes, Cars}, Publisher = {Cambridge University Press}, Title = {Behavioral rationality and heterogeneous expectations in complex economic systems}, Year = {2013} } bibtex &

9 Connection Open/Libre/MS Office Comprendre une fiche bibtex &

10 Connection Open/Libre/MS Office Types de documents La liste complète de types de documents : article, book, incollection inproceedings, phdthesis, techreport, et autres moins courants : booklet, inbook, manual, mastersthesis, misc, proceedings, unpublished Nous allons considérer ici quelques types de documents les plus couramment utilisés dans nos disciplines Le champ obligatoire pour tout type de documents est la clé unique : un nom d auteur + l année de publication + des caractères («aa», «ab», etc.) bibtex &

11 @article bibtex Connection Open/Libre/MS Office Ce type de document sert a répertorier un article dans une revue scientifique Champs obligatoires : author, journal, title, year Champs optionnels : volume, number, pages, month, note, key bibtex &

12 @book bibtex Connection Open/Libre/MS Office Ce type de document sert à répertorier un ouvrage complet écrit ou édité par les auteurs cités Champs obligatoires : author/editor, title, publisher, year Champs optionnels : volume, series, address, edition, month, note, key, isbn bibtex &

13 Connection Open/Libre/MS Ce type de document sert à répertorier un chapitre dans un ouvrage collectif qui possède son propre titre Champs obligatoires : author, title, booktitle, year Champs optionnels : editor, pages, organization, publisher, address, month, note, key bibtex &

14 Connection Open/Libre/MS Ce type de document sert à répertorier un article dans une conférence Champs obligatoires : author, title, booktitle, year Champs optionnels : editor, pages, organization, publisher, address, month, note, key bibtex &

15 Connection Open/Libre/MS Ce type de document sert à répertorier une thèse Champs obligatoires : author, title, school, year Champs optionnels : address, month, note, key bibtex &

16 Connection Open/Libre/MS Ce type de document sert à répertorier un document de travail publié par une institution Champs obligatoires : author, title, institution, year Champs optionnels : type, number, address, month, note, key bibtex &

17 Connection Open/Libre/MS Office Edition/création d une BDD bibtex Vue sa structure très simple, on peut créer une BDD bibtex dans n importe quel éditeur de text : Bloc-notes ; TEXMaker, etc. Gare aux erreurs de syntaxe! et aux caractères mal codés (les lettres accentués, par exemple, des caractères bizarres qui proviennent des copier/coller à partir d Internet ou de fichiers PDF) Il y a plus simples : Les logiciels d édition des BDD bibtex, avec une interface graphique (voir le lien web) Deux logiciels libres majeurs : Jabref, qui est multi-plateforme, car sous Java, mais nécessité l installation d un Java Runtime Environment (JRE) BibDesk sous OSX pour les Macs bibtex &

18 Connection Open/Libre/MS Office Jabref-1 : Ouvrir une BDD bibtex &

19 Connection Open/Libre/MS Office Jabref-2 : Fenêtre de la BDD bibtex &

20 Connection Open/Libre/MS Office Jabref-3 : AJouter une fiche bibtex &

21 Connection Open/Libre/MS Office Jabref-4 : Choix de type de document bibtex &

22 Connection Open/Libre/MS Office Jabref-5 : Fiche article bibtex &

23 Connection Open/Libre/MS Office Pièges à éviter Bien coder les caractères en fonction de l option choisie dans LYX : Soit avec le codage en 7 bits (\ {e}) et compilation avec bibtex Soit le codage en 8 bits (é) et compilation avec bibtex8 Vérifier les caractères de ponctuation (types tirets) en cas de copier/coller à partir du Web ou d un fichier PDF Bien formuler les noms des auteurs bibtex &

24 Connection Open/Libre/MS Office Format des noms d auteurs dans bibtex On sépare les noms des différents auteurs par des «and» author={jean Tirole and Jean-Jacques Laffont and Patrick Fève}, Mais quand le nom est composé de plus de termes que juste Prénom et Nom, cela peut être mal interprété Exemples : Johann Heinrich von Thünen ou John Kenneth Arrow ou John Maynard Keynes Un auteur, pour bibtex, contient quatre composantes potentiellement vides, sauf la dernière (Last) First, von, Last, et Jr Dans ces cas, le mieux est d adopter un autre formatage : von Last, First author={arrow, John Kenneth and Keynes, John Maynard}, sera correctement interprété par bibtex de même que author={von Thünen, Johann Heinrich}, bibtex &

25 Connection Open/Libre/MS Office Mais il y a encore plus simple! Une manière bien plus simple de composer/enrichir une BDD bibtex est de récolter les références directement sur Internet : Science direct, Jstor, GoogleScholar, GoogleBooks en laissant à ces services le soin de formuler correctement les références (donc en réduisant le travail et les risques d erreur) Un outil permet de faire cela très simplement et efficacement : Notamment quand il est utilisé comme une extension de Firefox ce qui permet de capturer directement des informations (et les fichiers PDF associés) pendant la navigation bibtex &

26 Sections : bibtex Connection Open/Libre/MS Office 1 bibtex et L A TEX 2 3 Petite introduction au 4 Connection Open/Libre/MS Office bibtex &

27 Connection Open/Libre/MS Office Installation s installe comme une extension de Firefox Visiter le lien «Installer l extension Firefox» sur la page web de l atelier Cliquer sur le bouton «4 pour Firefox» sur la colonne de gauche Suivre les instructions Redémarrer Firefox après l installation. bibtex &

28 Connection Open/Libre/MS Office Configurer Activer le panneau en choisissant Menu Outils / Le panneau s ouvre normalement en bas de l écran de Firefox bibtex &

29 Connection Open/Libre/MS Office Le panneau de bibtex &

30 Connection Open/Libre/MS Office : Capturer une référence - 1 A partir d une recherche sur GScholar, par exemple : Cliquer sur l icône de dossier qui apparaît car a reconnu des références bibliographiques sur la page bibtex &

31 Connection Open/Libre/MS Office : Capturer une référence - 2 Cliquer sur OK pour insérer dans la BDD les références cochées bibtex &

32 Connection Open/Libre/MS Office : Exporter des références - 1 On choisit des références dans la liste Et on clique le bouton droit pour avoir le menu contextuel bibtex &

33 Connection Open/Libre/MS Office : Exporter des références -2 bibtex &

34 Connection Open/Libre/MS Office : Exporter des références - 3 bibtex &

35 Connection Open/Libre/MS Office : Exporter des références - 4 Sauvegarder le fichier.bib exporté On peut maintenant l ouvrir dans Jabref et Copier-Coller les références qu elle contient dans notre BDD bibtex bibtex &

36 Sections : bibtex Connection Open/Libre/MS Office 1 bibtex et L A TEX 2 3 Petite introduction au 4 Connection Open/Libre/MS Office bibtex &

37 Connection Open/Libre/MS Office : Connection avec Open/Libre/MS Office bibtex &

38 Connection Open/Libre/MS Office - Office -1 bibtex &

39 Connection Open/Libre/MS Office - Office -2 bibtex &

40 Connection Open/Libre/MS Office - Office -3 bibtex &

41 Connection Open/Libre/MS Office - Office - 4 bibtex &

42 Connection Open/Libre/MS Office - Office 5 bibtex &

43 Connection Open/Libre/MS Office - Office -6 bibtex &

44 Connection Open/Libre/MS Office - Office -7 bibtex &

45 Connection Open/Libre/MS Office Autres fonctionnalités de Possibilité de sauvegarder/synchroniser avec le site web de (avec un compte gratuit ou payant) Possibilité de partager une collection avec d autres chercheurs via le serveur web de Facilité de collaboration dans la rédaction d un article de recherche L extension Firefox Zotfile permet de mieux gérer les fichiers attachés aux références dans la base les renommer automatiquement en fonction des champs de la référence les synchroniser avec une tablette et récupérer le fichier commenté via la tablette. bibtex &

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