Instruction. Sous-plateau «chromatographie liquide spectrométrie de masse» du plateau technique analytique environnemental de recherche de l OSI-EGER

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1 Page 1 sur 1 Mots-clés : plateau technique, sous-plateau «chromatographie liquide spectrométrie de masse (LC-MS)» (anciennement plateau «chromatographie liquide»). Documents associés : Cahier de suivi de l onduleur (labo B19) Cahier de suivi du générateur d azote (labo B19) Cahier de suivi (maintenance) de l UPLC-TQD (labo B11) Cahier de suivi des manips (labo B11) Protocole d utilisation de l instrument (dont mise en route et arrêt) (labo B11) (SOL_CHI_ModOpUPLCTQD_MO_001.doc) Note importante : la Région Ile-de-France finance une partie de l équipement LC-MS-MS. Dans le cadre de la convention n I /R (SESAME 2006), l INRA s est engagé, pour une durée de 6 ans, à faire clairement apparaître la contribution régionale pour toutes les actions de communication et publications scientifiques liées à l équipement. L information relative à ce soutien devra prendre la forme de la mention «projet financé par la Région Ile-de-France» ou «this work was supported by grants from Region Ile-de-France» dans les publications françaises et internationales, et de l insertion du logotype régional conformément à la charte graphique régionale pour les présentations orales. La présence du logotype de la région est obligatoire, en 1 re de couverture ou en page de garde, sur tous les supports de promotion, d information, de publicité et de communication. La Région sera informée par écrit de toute demande de dépôt de brevet. Equipement : le plateau comprend (voir les détails en annexe) : - une chaîne de chromatographie liquide ultra performance (UPLC)* équipée d un détecteur UV double longueur d ondes (TUV)* et couplée à un spectromètre de masse triple quadripolaire* (MS-MS ou TQD), - un système de pré-concentration en ligne*, - un générateur d azote* (avec cuve), qui alimente le spectromètre de masse, - un poste informatique pour piloter les instruments et réaliser l acquisition et le traitement des données (imprimante incluse)* - un deuxième poste informatique pour le retraitement des données, - un onduleur pour protéger électriquement l installation. * tous ces équipements sont garantis 3 ans à compter de la date d admission du matériel ( ). Nom : Fonction : Visa : Rédacteur Vérificateur Approbateur Deschamps Marjolaine Comité de suivi Responsable du plateau Animateur Qualité

2 Page 2 sur 2 Contexte : l UPLC-MS-MS vient en appui à différents projets de recherche qui nécessitent d identifier et de quantifier des molécules organiques dans des matrices complexes à intérêt environnemental (sols, déchets, eaux, air, végétaux, milieux de culture, extraits fongiques, etc ), en particulier dans le domaine des faibles concentrations, de la recherche de produits de dégradation et de l analyse de polluants émergents. Les thématiques concernées par l utilisation de cet équipement sont 1) l étude du devenir et des impacts des pesticides et de leurs produits de dégradation et éventuellement de leurs adjuvants de formulation ; 2) le suivi d autres composés organiques souvent polaires, contaminant les agrosystèmes et souvent associés à des pratiques de recyclage de produits résiduaires organiques (par exemple des plastifiants, des agents tensio-actifs, des résidus médicamenteux ) ; 3) l établissement de profils et l identification de biomolécules, traceurs organiques de l évolution des matières organiques des sols et des déchets et traceurs de l évolution de la structure et de l activité des communautés microbiennes ; 4) l analyse de métabolites produits par les champignons phytopathogènes et l analyse de molécules issues de la métabolisation de fongicides par ces mêmes champignons. a) Identification des unités / équipes concernées et des responsables scientifiques du plateau - UMR 1091 (EGC) Grignon Enrique Barriuso (DU), tel : , enrique.barriuso@grignon.inra.fr Sabine Houot (responsable équipe Sol), tel : , sabine.houot@grignon.inra.fr - UMR 1122 Biogéochimie et Ecologie des Milieux Continentaux (BioEMCo) Grignon / Paris Luc Abbadie (DU), tel : , abbadie@wotan.ens.fr. Délégataire : Claire Chenu (responsable équipe MOS), tel : claire.chenu@grignon.inra.fr - UR 251 Physicochimie et Ecotoxicologie des Sols d Agrosystèmes contaminés (PESSAC) Versailles Christian Mougin (DU), tel : , christian.mougin@versailles.inra.fr - UMR 1290 Biologie et Gestion des Risques en Agriculture Champignons Pathogènes des Plantes (BIOGER-CPP) Versailles / Grignon Marc-Henri Lebrun (DU), marc-henri.lebrun@versailles.inra.fr b) Identification du responsable technique Marjolaine Deschamps, tel : , marjolaine.deschamps@grignon.inra.fr c) Identification du personnel technique impliqué EGC-sol : Marjolaine Deschamps (IR) est impliquée à 10% ETP pour la gestion du sous-plateau «LC- MS», notamment pour la maintenance de l appareil, son fonctionnement (budget, plannification), la coordination du plateau. Elle est également à 30% ETP pour les développements méthodologiques pour EGC-Sol, l interprétation des résultats et la formation des utilisateurs de cette unité. Nathalie Bernet (TR) est impliquée à 30% ETP pour pour la participation aux développements méthodologiques, la réalisation des analyses et éventuellement leur interprétation pour EGC-Sol. PESSAC : Cédric Repinçay (IE en CDD jusqu en août 2009) est impliqué à 25% ETP pour le développement méthodologique et la réalisation des analyses pour PESSAC et BIOGER, ainsi que pour la maintenance. Il intervient également dans l interprétation des résultats et la formation des utilisateurs de PESSAC. Rachid Benabdallah (TR) est impliqué à 20% ETP pour la réalisation des analyses pour PESSAC et BIOGER. BIOGER : L activité chimie analytique organique est commune aux unités Bioger et Pessac, en conséquence le personnel prévu dans Pessac intervient également pour le compte de Bioger (5-10%).

3 Page 3 sur 3 BioEMCo-MOS : Cyril Girardin (IE) est impliqué à 5% ETP pour la réalisation des analyses pour BioEMCo, leur interprétation et la formation des utilisateurs de BioEMCo. Ces temps seront adaptés annuellement en fonction des projets de chaque unité. d) Règles de fonctionnement Par expérience, on considère que les pannes et la maintenance représentent 10 à 20% du temps machine. On se réserve 10% du temps machine pour la réalisation d analyses pour des laboratoires extérieurs au plateau. Ce temps d utilisation est modulé en fonction des projets de chaque unité membre. Le comité de pilotage est informé des nouveaux projets devant utiliser l instrument Il doit les valider, que ces projets soient pour des laboratoires extérieurs ou pour les laboratoires membres. Gestion de planning : mise en place d un planning en ligne (voir l informaticien EGER pour la réalisation). Un planning d utilisation de l instrument est affiché dans le laboratoire et est disponible auprès de M. Deschamps et N. Bernet. En cas de besoin simultané de l appareil par deux unités membres, la négociation pour les priorités d utilisation se fera entre le personnel technique de chaque unité, voire entre les responsables scientifiques de chaque projet pour lequel les analyses sont réalisées, avec la coordination et l arbitrage de Marjolaine Deschamps. Frais fixes : ces frais correspondent à la maintenance des instruments (jusqu en 2012, pièces d usure non prises en compte dans la garantie. Après 2012, contrat de maintenance). Les subventions des départements INRA pour la maintenance des instruments (crédits «installations expérimentales») sont employées pour payer ces frais. A partir de 2012, si ces subventions ne sont pas suffisantes, les reliquats de dépenses sont payés par chaque unité membre du plateau, au prorata du temps d utilisation annuel (avec un minimum de 5%). Voir le tableau en annexe concernant les garanties et les contrats de maintenance des appareils. Facturation des analyses : chaque analyse réalisée sur l UPLC-MS-MS est facturée à l unité la réalisant. Le coût comprend les consommables (solvants, filtres), le papier et l encre d impression, l enlèvement et le traitement des déchets chimiques générés. Le coût réel est majoré de 10% afin de faire face aux imprévus (changement de pièces non comprises dans la garantie). Une fois par an, le coût de l analyse est revu en fonction des dépenses de l année antérieure. Les laboratoires ayant payé des analyses à un coût supérieur au coût réel (s il s avère que les recettes ont été supérieures aux dépenses de fonctionnement et de maintenance) bénéficient d un avoir correspondant au surcoût payé. Dans le cadre des analyses qui sont réalisées par des laboratoires extérieurs au plateau, les analyses sont facturées à leur coût réel (voir la procédure d acquisition du système). Ce coût comprend les consommables (vials, solvants, filtres, colonnes), le papier et l encre d impression, l enlèvement et le traitement des déchets chimiques générés, le coût du personnel pour la réalisation des analyses et l interprétation des données ainsi que les frais de maintenance (calculés au prorata du temps d utilisation de l appareil). Remarque : les colonnes et les vials sont fournis par chaque unité. Cependant, un pool de colonnes de greffages variés est mis à disposition des utilisateurs pour les premiers tests, afin de déterminer quelle colonne est la plus adaptée aux échantillons. Coordination du sous-plateau comité de pilotage : il est composé d un représentant de chaque unité membre, avec capacité de décision ainsi que des correspondants qualité et hygiène et sécurité du sousplateau ; les responsables des projets utilisant le sous-plateau, ainsi que le personnel technique impliqué dans le fonctionnement sont invités à participer aux réunions du comité de pilotage. Il se réunit au moins

4 Page 4 sur 4 une fois par an. A l ordre du jour doivent figurer à minima : le budget (année écoulée et prévisionnel), le coût des analyses pour l année à venir, le bilan des expérimentations (année écoulée) et les expérimentations à venir (pré-planification), l animation. Il doit également s assurer du bon fonctionnement du sous-plateau et veiller à l actualisation et à l application des règles de fonctionnement. Animation scientifique et technique : le plateau est générateur d animations essentiellement méthodologiques autour de l UPLC-MS-MS. Des animations autour des projets utilisant l appareil peuvent également avoir lieu. Qualité : dans le cadre de la démarche qualité, un cahier de suivi des analyses et des cahiers de suivi des matériels sont mis en place (suivi de l onduleur, suivi du générateur d azote, suivi des maintenances de l UPLC-TQD). Chaque utilisateur doit noter dans le cahier de suivi des expériences : son nom/unité, la date, le projet Masslynx, le nombre d analyses réalisées, le type d analyses (analytique/pré-concentration en ligne), la nature et les volumes de phases mobiles utilisées, la colonne, le nom de la liste d injections. Tout dysfonctionnement doit être inscrit dans le cahier de suivi de l appareil, ainsi que les démarches qui ont été réalisées pour résoudre le problème. Un protocole de mise en route de l instrument, d optimisations des conditions MS, de réalisations d injections et d arrêt de l appareil est à disposition des utilisateurs. Les protocoles de validation seront standardisés avec des éventuelles adaptations des protocoles normalisés. Des fiches «méthodes» sont élaborées systématiquement et archivées. Chaque unité est responsable de la sauvegarde de ses analyses. e) Besoins complémentaires financiers et humains Actuellement, il n y a pas de besoin complémentaire en personnel. En revanche, une participation à l achat des pièces et aux contrats d entretien (frais fixes) sera demandée annuellement aux départements EA et SPE pour la maintenance des appareils.

5 Page 5 sur 5 Annexe 1 : matériel faisant partie du plateau LC-MS Matériel Plateau LC-MS-MS Bât EGER Désignation Fournisseur Fabriquant n serie n inventaire INRA Localisation garantie Acquity UPLC : B11 solvent binary pump Waters Waters J08UPB236M 3 ans sample manager Waters Waters H08UPA625M 3 ans column heater Waters Waters K08UPH554M 3 ans TUV detector Waters Waters J08UPT450M 3 ans Waters, colonnes de tests Thermo Waters, Thermo contrat maintenance MS-MS : TQD Waters Waters QBA 200 B11 3 ans pompe primaire Waters Leybold B11 3 ans générateur d'azote Zefiro 35 Waters F-DBS Z3508A00092 B19 2 ans cuve d'azote F-DBS F-DBS B19 SPE online : B11 pompe 515 Waters Waters A 3 ans vanne haute pression Waters Cluzeau /Rheodyne ans degazeur Waters Waters J08DGZ936M 3 ans Ordinateur de pilotage : B11 unité centrale Waters IBM LMFNP42 3 ans écran plat 19" Waters IBM 3 ans imprimante laser Waters HP CNK1B ans masslynx 4.1 licence Waters Waters 3 ans support Masslynx Waters Waters MS8DN ans

6 Page 6 sur 6 Désignation Fournisseur Fabriquant n serie n inventaire INRA Localisation garantie* Ordinateur de retraitement : B36 unité centrale DELL DELL 1 an écran plat 19" DELL DELL 1 an Western Disque dur amovible Digital Western Digital 1 an masslynx 4.1 licence Waters Waters MS8KN ans support Masslynx Waters Waters MS8NN ans contrat maintenance Onduleur ASTRO SAEI SAEI IN5J44010 B19 1 an

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